BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-244E19
Chromosome9 (Build37)
Map Location 12,421,674 - 12,596,514
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039989, LOC622505
Downstream geneLOC100039680, LOC665285, LOC100039729, LOC100039758, Maml2, Mtmr2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-244E19.bB6Ng01-244E19.g
ACCGA053468GA053469
length9461,060
definitionB6Ng01-244E19.b B6Ng01-244E19.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(12,595,921 - 12,596,514)(12,421,674 - 12,422,740)
sequence
gaattcttagtaatttaatactatttttataatttttaaagacaatactg
taaaaggtgacttactcaggagccccaaagaacctataaatcattcttgt
atacacttaccaagaacatacagtcaccatcttagaatagcatgattaaa
ctcatgacttctgtgtgaaggttctataggtgtggttgtttgaataagag
tggtccccataggcacatatgtttgaatgctaggtccctagttcacatat
tgtttggggagagttaggaggtgtagccttgtagaaggaggtaagtcctt
gaggtttcaaaagcccacaccatttcctgtaaatctccctctccctgtcc
ctttccatctccctcccctcctattgtccctctccatctccacttcactc
ttcatctccctccccatttcatctgtcttctattccgtttttctccctcc
ctcctgctttctcattctctgattctctcttgctctctgagatgtaagct
caatgctgtcccagctgtcatgccttcactccaccaccatggactctaaa
ggtttaaccatctgcaactgtaaaatctaagttaaacaatttattctata
agttgcattggtcatagtgtttcatcagaatcaaaaaaatgtaactatgg
caatagtcttcagtagaaagatctctttagaaaaacctgcaagggaggct
gctaccttaatggcacattcattgcctctccatttgggaaggaaaacatc
agaagatgtaaatgttgtggaccccagctctatgtacctgtgaagtcagg
acttgttcaggccttgttcatactgtcatggtccatggatacataacata
agatgggactttcttggttttatttatttatttttgtttgttttgttttg
ttttgagacagggtttcgctgtatagtcctggctgtcctggaaact

gaattcaatatctaggagctacatggtataaaaaggaaactaactgcccc
taattgttatttaatctcttcatgcatgccatggcatgcacatgcccaca
atcacatacacataaactaaataaaacataaaaccgaaaaaataccttag
tacttatgataagatgtcaataaatgcacactatgatttgctagtaattt
tttattatgggcaagtctaggactctttattaacatgacaattaatatga
atgatatagaattgtcatttaataagattcccatgtacttggtgtcgcat
ctcaaagttgagcaacaggtggtaaaatgtttacaaaatagagaacagct
tgaagataaagtgcaaatggctactgtcatcatgacaaaattatgatcac
agaattgaaattaaaattaaccagcaagtgccatatgcaggcatatttgt
atttgaacacagtaaccacccacacacattgctacattttaatcttgtgt
gtgccaattgttcctgtccccagacattctattgttttagtttaaataag
aattactgctgagcttaaactagcaagttattttaggtgttgctttaaga
taagtctcatctggtgtagacttacattttgaactgtcatgctctttaac
ctcagtggttggatattctttgataatttaaacatttctaaactctctag
aatgtcggaccatatatatttcaaatgtactaaaaccagttaggcatttt
ctctttactagttgagtaaataccatatcttggaggtagtagcattaggg
tttcatagccccatttaccttggatgtcagctcactttattgctgacgtt
aggaggcaataatacagccgtcagaagcatctgccagtctctctctctct
ctctctctctctctctctctctctctcattgttttgtttagttggagcac
aggaactgattactgtgtacagtctgaattgcagctaatctattcttcac
cccataaaatgccacaggaacacaagttatagcggttccttaatgatatt
ctgtagctta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_12595921_12596514
seq2: B6Ng01-244E19.b_44_637 (reverse)

seq1  ATAAATTGTTTAACTTAGATTTTACAGTTGCAGATGGTTAAACCTTTAGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATTGTTTAACTTAGATTTTACAGTTGCAGATGGTTAAACCTTTAGA  50

seq1  GTCCATGGTGGTGGAGTGAAGGCATGACAGCTGGGACAGCATTGAGCTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCATGGTGGTGGAGTGAAGGCATGACAGCTGGGACAGCATTGAGCTTA  100

seq1  CATCTCAGAGAGCAAGAGAGAATCAGAGAATGAGAAAGCAGGAGGGAGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCAGAGAGCAAGAGAGAATCAGAGAATGAGAAAGCAGGAGGGAGGG  150

seq1  AGAAAAACGGAATAGAAGACAGATGAAATGGGGAGGGAGATGAAGAGTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAACGGAATAGAAGACAGATGAAATGGGGAGGGAGATGAAGAGTGA  200

seq1  AGTGGAGATGGAGAGGGACAATAGGAGGGGAGGGAGATGGAAAGGGACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAGATGGAGAGGGACAATAGGAGGGGAGGGAGATGGAAAGGGACAG  250

seq1  GGAGAGGGAGATTTACAGGAAATGGTGTGGGCTTTTGAAACCTCAAGGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAGGGAGATTTACAGGAAATGGTGTGGGCTTTTGAAACCTCAAGGAC  300

seq1  TTACCTCCTTCTACAAGGCTACACCTCCTAACTCTCCCCAAACAATATGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTCCTTCTACAAGGCTACACCTCCTAACTCTCCCCAAACAATATGT  350

seq1  GAACTAGGGACCTAGCATTCAAACATATGTGCCTATGGGGACCACTCTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACTAGGGACCTAGCATTCAAACATATGTGCCTATGGGGACCACTCTTA  400

seq1  TTCAAACAACCACACCTATAGAACCTTCACACAGAAGTCATGAGTTTAAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAACAACCACACCTATAGAACCTTCACACAGAAGTCATGAGTTTAAT  450

seq1  CATGCTATTCTAAGATGGTGACTGTATGTTCTTGGTAAGTGTATACAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTATTCTAAGATGGTGACTGTATGTTCTTGGTAAGTGTATACAAGA  500

seq1  ATGATTTATAGGTTCTTTGGGGCTCCTGAGTAAGTCACCTTTTACAGTAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATTTATAGGTTCTTTGGGGCTCCTGAGTAAGTCACCTTTTACAGTAT  550

seq1  TGTCTTTAAAAATTATAAAAATAGTATTAAATTACTAAGAATTC  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTTAAAAATTATAAAAATAGTATTAAATTACTAAGAATTC  594


seq1: chr9_12421674_12422740
seq2: B6Ng01-244E19.g_66_1125

seq1  GAATTCAATATCTAGGAGCTACATGGTATAAAAAGGAAACTAACTGCCCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATATCTAGGAGCTACATGGTATAAAAAGGAAACTAACTGCCCC  50

seq1  TAATTGTTATTTAATCTCTTCATGCATGCCATGGCATGCACATGCCCACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTGTTATTTAATCTCTTCATGCATGCCATGGCATGCACATGCCCACA  100

seq1  ATCACATACACATAAACTAAATAAAACATAAAACCGAAAAAATACCTTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCACATACACATAAACTAAATAAAACATAAAACCGAAAAAATACCTTAG  150

seq1  TACTTATGATAAGATGTCAATAAATGCACACTATGATTTGCTAGTAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTATGATAAGATGTCAATAAATGCACACTATGATTTGCTAGTAATTT  200

seq1  TTTATTATGGGCAAGTCTAGGACTCTTTATTAACATGACAATTAATATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTATGGGCAAGTCTAGGACTCTTTATTAACATGACAATTAATATGA  250

seq1  ATGATATAGAATTGTCATTTAATAAGATTCCCATGTACTTGGTGTCGCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATAGAATTGTCATTTAATAAGATTCCCATGTACTTGGTGTCGCAT  300

seq1  CTCAAAGTTGAGCAACAGGTGGTAAAATGTTTACAAAATAGAGAACAGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAGTTGAGCAACAGGTGGTAAAATGTTTACAAAATAGAGAACAGCT  350

seq1  TGAAGATAAAGTGCAAATGGCTACTGTCATCATGACAAAATTATGATCAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAGATAAAGTGCAAATGGCTACTGTCATCATGACAAAATTATGATCAC  400

seq1  AGAATTGAAATTAAAATTAACCAGCAAGTGCCATATGCAGGCATATTTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATTGAAATTAAAATTAACCAGCAAGTGCCATATGCAGGCATATTTGT  450

seq1  ATTTGAACACAGTAACCACCCACACACATTGCTACATTTTAATCTTGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTGAACACAGTAACCACCCACACACATTGCTACATTTTAATCTTGTGT  500

seq1  GTGCCAATTGTTCCTGTCCCCAGACATTCTATTGTTTTAGTTTAAATAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCCAATTGTTCCTGTCCCCAGACATTCTATTGTTTTAGTTTAAATAAG  550

seq1  AATTACTGCTGAGCTTAAACTAGCAAGTTATTTTAGGTGTTGCTTTAAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTACTGCTGAGCTTAAACTAGCAAGTTATTTTAGGTGTTGCTTTAAGA  600

seq1  TAAGTCTCATCTGGTGTAGACTTACATTTTGAACTGTCATGCTCTTTAAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGTCTCATCTGGTGTAGACTTACATTTTGAACTGTCATGCTCTTTAAC  650

seq1  CTCAGTGGTTGGATATTCTTTGATAATTTAAACATTTCTAAACTCTCTAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGTGGTTGGATATTCTTTGATAATTTAAACATTTCTAAACTCTCTAG  700

seq1  AATGTCGGACCATATATATTTCAAATGTACTAAAACCAGTTAGGCATTTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTCGGACCATATATATTTCAAATGTACTAAAACCAGTTAGGCATTTT  750

seq1  CTCTTTACTAGTTGAGTAAATACCATATCTTGGAGGTAGTAGCATTAGGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTACTAGTTGAGTAAATACCATATCTTGGAGGTAGTAGCATTAGGG  800

seq1  TTTCATAGCCCCATTTACCTTGGATGTCAGCTCACTTTATTGCTGACGTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATAGCCCCATTTACCTTGGATGTCAGCTCACTTTATTGCTGACGTT  850

seq1  AGGAGGCAATAATACAGCCGTCAGAAGCATCTGCCAGTTCTCTCTCTCTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AGGAGGCAATAATACAGCCGTCAGAAGCATCTGCCAG-TCTCTCTCTCTC  899

seq1  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTTGTTTTTGTTTTTTATTTTG  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||    || |||| ||  
seq2  TCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCATTGTT----TTGTTTAGTT--  943

seq1  TGAGCACAGGAACTGATTACTGTGTAACAGTCTGAAATGCAGCCAAACTA  1000
       |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| || |||
seq2  GGAGCACAGGAACTGATTACTGTGT-ACAGTCTGAATTGCAGCTAATCTA  992

seq1  TTCCTCCACCCCAT-AAATGCCACA-GAACACCAGTTATTAGC-GTTCCT  1047
      || || |||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||| ||||||
seq2  TT-CTTCACCCCATAAAATGCCACAGGAACACAAGTTA-TAGCGGTTCCT  1040

seq1  TAATGATATTCTGTAGCTTA  1067
      ||||||||||||||||||||
seq2  TAATGATATTCTGTAGCTTA  1060


| Home | SequenceCutter | Blast | Download |