BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-322M22
Chromosome9 (Build37)
Map Location 73,824,077 - 73,993,006
singlet/doubletdoublet
Overlap geneWdr72
Upstream geneEG546143, Ccpg1, LOC100041896, Pigb, Rab27a, 2410004A20Rik, BC003885, EG436081, Unc13c
Downstream geneNr1h2-ps, LOC100040764, Onecut1, BC031353, Arpp19, LOC100040812, Myo5a, LOC677501
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-322M22.bB6Ng01-322M22.g
ACCGA111554GA111555
length1,1271,058
definitionB6Ng01-322M22.b B6Ng01-322M22.g
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,991,874 - 73,993,006)(73,824,077 - 73,825,130)
sequence
gaattctcacggagtgaacgatgcacatgcatttcatccagtcgggcgac
tgtaaagaggtgaaggtatgcaggacagccagagttccagcatcaaggac
gagaacatcttgatattccccacagcacagcagccagccctctccagtca
tccggaaggagcagtggtagtactatgggatggaattccaagaacagcac
ctcagagatggataacattgacacccttctagctgtgtaaagacctctct
ctcccttgaattccagccagcctctcctcagtgaaccctccgatctaggt
aacacctcaaattcccttcattaaccccagactcttgtcatgttgacttt
tcagcttagcttcaaccacaccccatcccccaggtaaaaggagagttctt
tttaaaagacacactgtaagtcatgggacagcaataggtatattatttct
gcaatgttattcagagctaaacagtaacaacctgaattctctgcttccag
tagtactgctaaaaattggtaagaaatgaaagtgtttcaagagtactggg
gaagtattcttgtaccaaatacattttggaagtattttctattagagacc
aggttatccattctacttcaaccctgagctctgcatctgggttctgatcc
caagacaagaggagagagtgggtgagtgttgctgtatgaggttccagcat
ggacaatgggaaaaatataaagacatatgggtggtgaaattaccccttca
tttttaatctgtctgtcataatccagaagctacttaaaaatcagaaagta
tggctaagataaagttcaggtgaggccctgggctccacctctgatactgg
gggaaacaagaaagccccttaattggaaaatgattatagaaattataact
aggcttctttatcatttacaagttaagaaaaagtaaaagagaaacaaata
aacccaccagaagactagttaagattttaaacatgggcctgagctttact
gtttcttgagagtttacacttttaattatgggcatgtgtgcatcaatgta
ggtcggtatgtgcacatgattgcaccgcctgcagcaggtagtacaggcag
catctctccttggagctgctgttagag
gaattcaggtgagtgaggaaagtctactgtgccttcagtggcatttgact
cagcttaccttggctcttttaaattactaatggtaatctcatttgggtca
tctgaggtataatcccaagtcagtgtcccaaagggatcagctgtaaagaa
attggacaaatgtatttcctccgtgggttttctgtcctccagaggaattt
tgtttgtgggtggggccgttgcttgtagcataccatcagcaaattggtct
attttgcttagtggacctctgggtagattaggtattcactgtagcagaac
tgccatgtcactgacattgcagcaggcacagcaagagagcttgtgcctcc
tagtcccaaatgtcagggacaggggtttagaatgtaggttggatggttag
ctcctttgcagcttatcagagtttcctgtcctgattgggtgtactaatgc
gcctctgttgcttggatttgatattgttcctttgtagaattccattacct
tgttagcgtatttgtgaattgcaagtgctttttcttacacgtccctctta
gtctcatgggcagcagaataactctcattaatgtaaaagtgtcatgctgc
ccacagccactccgaaagtgatgacagggtgtttgggaagaatcttcatt
cgaaatagtttatttttggtaggattaatcactagtatatgagacacagg
catgatgcttgccaatctcccaaactgtttcaaagaaggcatctacttct
gaatggagaccctggcttgttttaatttttaaatgatgtttatctctgtg
tgagtatgtacatttaagtatgggtacctgatgaggcagaagaaggcatt
agattcctttgggctgaaactacagatagttgtgaaccaccccatgtggg
ttgcttatcttcagtaagagcagcaagcatgctaaacaactgaaggcatc
ttctctatccatccctctcaagactctgacttcttaccaaagaatgaacc
tctactcttttctcctctcacaaatagataattcaaaggaacatttgaac
acttagca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr9_73991874_73993006
seq2: B6Ng01-322M22.b_45_1171 (reverse)

seq1  CTCTAACAGCAGCTCCAAGGAGATGCCCTGCCCTGTACTACCTGCTGCAG  50
      |||||||||||||||||||||||    ||| |||||||||||||||||||
seq2  CTCTAACAGCAGCTCCAAGGAGAGATGCTG-CCTGTACTACCTGCTGCAG  49

seq1  GCGGTGCACTCATGTGCACATACCCGACCCTACATTGATGCACACATGCC  100
      |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||
seq2  GCGGTGCAATCATGTGCACATA-CCGA-CCTACATTGATGCACACATGCC  97

seq1  CATAATTAAAAGTGTAAAACTCTCAAGAAAACAGTAAAGCTCAGG-CCAT  149
      ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||
seq2  CATAATTAAAAGTGT-AAACTCTCAAG-AAACAGTAAAGCTCAGGCCCAT  145

seq1  GTTTTAAAATCTTAACTAGTTCTTCTGGTGGGTTTATTTGTTTCTCTTTT  199
      | ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-TTTAAAATCTTAACTAG-TCTTCTGGTGGGTTTATTTGTTTCTCTTTT  193

seq1  ACTTTTTCTTAACTTGTAAATGATAAAGAAGCCTAGTTATAATTTCTATA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTTCTTAACTTGTAAATGATAAAGAAGCCTAGTTATAATTTCTATA  243

seq1  ATCATTTTCCAATTAAGGGGCTTTCTTGTTTCCCCCAGTATCAGAGGTGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATTTTCCAATTAAGGGGCTTTCTTGTTTCCCCCAGTATCAGAGGTGG  293

seq1  AGCCCAGGGCCTCACCTGAACTTTATCTTAGCCATACTTTCTGATTTTTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGGGCCTCACCTGAACTTTATCTTAGCCATACTTTCTGATTTTTA  343

seq1  AGTAGCTTCTGGATTATGACAGACAGATTAAAAATGAAGGGGTAATTTCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGCTTCTGGATTATGACAGACAGATTAAAAATGAAGGGGTAATTTCA  393

seq1  CCACCCATATGTCTTTATATTTTTCCCATTGTCCATGCTGGAACCTCATA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCATATGTCTTTATATTTTTCCCATTGTCCATGCTGGAACCTCATA  443

seq1  CAGCAACACTCACCCACTCTCTCCTCTTGTCTTGGGATCAGAACCCAGAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAACACTCACCCACTCTCTCCTCTTGTCTTGGGATCAGAACCCAGAT  493

seq1  GCAGAGCTCAGGGTTGAAGTAGAATGGATAACCTGGTCTCTAATAGAAAA  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCTCAGGGTTGAAGTAGAATGGATAACCTGGTCTCTAATAGAAAA  543

seq1  TACTTCCAAAATGTATTTGGTACAAGAATACTTCCCCAGTACTCTTGAAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTTCCAAAATGTATTTGGTACAAGAATACTTCCCCAGTACTCTTGAAA  593

seq1  CACTTTCATTTCTTACCAATTTTTAGCAGTACTACTGGAAGCAGAGAATT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTTTCATTTCTTACCAATTTTTAGCAGTACTACTGGAAGCAGAGAATT  643

seq1  CAGGTTGTTACTGTTTAGCTCTGAATAACATTGCAGAAATAATATACCTA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGTTGTTACTGTTTAGCTCTGAATAACATTGCAGAAATAATATACCTA  693

seq1  TTGCTGTCCCATGACTTACAGTGTGTCTTTTAAAAAGAACTCTCCTTTTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTGTCCCATGACTTACAGTGTGTCTTTTAAAAAGAACTCTCCTTTTA  743

seq1  CCTGGGGGATGGGGTGTGGTTGAAGCTAAGCTGAAAAGTCAACATGACAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGGGATGGGGTGTGGTTGAAGCTAAGCTGAAAAGTCAACATGACAA  793

seq1  GAGTCTGGGGTTAATGAAGGGAATTTGAGGTGTTACCTAGATCGGAGGGT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTCTGGGGTTAATGAAGGGAATTTGAGGTGTTACCTAGATCGGAGGGT  843

seq1  TCACTGAGGAGAGGCTGGCTGGAATTCAAGGGAGAGAGAGGTCTTTACAC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGAGGAGAGGCTGGCTGGAATTCAAGGGAGAGAGAGGTCTTTACAC  893

seq1  AGCTAGAAGGGTGTCAATGTTATCCATCTCTGAGGTGCTGTTCTTGGAAT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTAGAAGGGTGTCAATGTTATCCATCTCTGAGGTGCTGTTCTTGGAAT  943

seq1  TCCATCCCATAGTACTACCACTGCTCCTTCCGGATGACTGGAGAGGGCTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATCCCATAGTACTACCACTGCTCCTTCCGGATGACTGGAGAGGGCTG  993

seq1  GCTGCTGTGCTGTGGGGAATATCAAGATGTTCTCGTCCTTGATGCTGGAA  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGCTGTGCTGTGGGGAATATCAAGATGTTCTCGTCCTTGATGCTGGAA  1043

seq1  CTCTGGCTGTCCTGCATACCTTCACCTCTTTACAGTCGCCCGACTGGATG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGCTGTCCTGCATACCTTCACCTCTTTACAGTCGCCCGACTGGATG  1093

seq1  AAATGCATGTGCATCGTTCACTCCGTGAGAATTC  1133
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCATGTGCATCGTTCACTCCGTGAGAATTC  1127

seq1: chr9_73824077_73825130
seq2: B6Ng01-322M22.g_69_1126

seq1  GAATTCAGGTGAGTGAGGAAAGTCTACTGTGCCTTCAGTGGCATTTGACT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGTGAGTGAGGAAAGTCTACTGTGCCTTCAGTGGCATTTGACT  50

seq1  CAGCTTACCTTGGCTCTTTTAAATTACTAATGGTAATCTCATTTGGGTCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTACCTTGGCTCTTTTAAATTACTAATGGTAATCTCATTTGGGTCA  100

seq1  TCTGAGGTATAATCCCAAGTCAGTGTCCCAAAGGGATCAGCTGTAAAGAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGGTATAATCCCAAGTCAGTGTCCCAAAGGGATCAGCTGTAAAGAA  150

seq1  ATTGGACAAATGTATTTCCTCCGTGGGTTTTCTGTCCTCCAGAGGAATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGGACAAATGTATTTCCTCCGTGGGTTTTCTGTCCTCCAGAGGAATTT  200

seq1  TGTTTGTGGGTGGGGCCGTTGCTTGTAGCATACCATCAGCAAATTGGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTTGTGGGTGGGGCCGTTGCTTGTAGCATACCATCAGCAAATTGGTCT  250

seq1  ATTTTGCTTAGTGGACCTCTGGGTAGATTAGGTATTCACTGTAGCAGAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTGCTTAGTGGACCTCTGGGTAGATTAGGTATTCACTGTAGCAGAAC  300

seq1  TGCCATGTCACTGACATTGCAGCAGGCACAGCAAGAGAGCTTGTGCCTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATGTCACTGACATTGCAGCAGGCACAGCAAGAGAGCTTGTGCCTCC  350

seq1  TAGTCCCAAATGTCAGGGACAGGGGTTTAGAATGTAGGTTGGATGGTTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCCCAAATGTCAGGGACAGGGGTTTAGAATGTAGGTTGGATGGTTAG  400

seq1  CTCCTTTGCAGCTTATCAGAGTTTCCTGTCCTGATTGGGTGTACTAATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTTTGCAGCTTATCAGAGTTTCCTGTCCTGATTGGGTGTACTAATGC  450

seq1  GCCTCTGTTGCTTGGATTTGATATTGTTCCTTTGTAGAATTCCATTACCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTGTTGCTTGGATTTGATATTGTTCCTTTGTAGAATTCCATTACCT  500

seq1  TGTTAGCGTATTTGTGAATTGCAAGTGCTTTTTCTTACACGTCCCTCTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGCGTATTTGTGAATTGCAAGTGCTTTTTCTTACACGTCCCTCTTA  550

seq1  GTCTCATGGGCAGCAGAATAACTCTCATTAATGTAAAAGTGTCATGCTGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCATGGGCAGCAGAATAACTCTCATTAATGTAAAAGTGTCATGCTGC  600

seq1  CCACAGCCACTCCGAAAGTGATGACAGGGTGTTTGGGAAGAATCTTCATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGCCACTCCGAAAGTGATGACAGGGTGTTTGGGAAGAATCTTCATT  650

seq1  CGAAATAGTTTATTTTTGGTAGGATTAATCACTAGTATATGAGACACAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAAATAGTTTATTTTTGGTAGGATTAATCACTAGTATATGAGACACAGG  700

seq1  CATGATGCTTGCCAATCTCCCAAACTGTTTCAAAGAAGGCATCTACTTCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGATGCTTGCCAATCTCCCAAACTGTTTCAAAGAAGGCATCTACTTCT  750

seq1  GAATGGAGACCCTGGCTTGTTTTAATTTTTAAATGATGTTTATCTCTGTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGGAGACCCTGGCTTGTTTTAATTTTTAAATGATGTTTATCTCTGTG  800

seq1  TGAGTATGTACATTTAAGTATGGGTACCTGATGAGGCAGAAGAAGGCATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGTATGTACATTTAAGTATGGGTACCTGATGAGGCAGAAGAAGGCATT  850

seq1  AGATTCC-TTGGGCTGAAACTACAGATAGTTGTGAACCACCCCATGT-GG  898
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  AGATTCCTTTGGGCTGAAACTACAGATAGTTGTGAACCACCCCATGTGGG  900

seq1  TTGCTTATCTTCAGTAAGAGCAGCAAGCATGCTAAACCACTG-AGGCATC  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||
seq2  TTGCTTATCTTCAGTAAGAGCAGCAAGCATGCTAAACAACTGAAGGCATC  950

seq1  TTCTCTATCCATCCCTCTCAAGACTCTGACTTCTTACCAAAGAATGAACC  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTCTATCCATCCCTCTCAAGACTCTGACTTCTTACCAAAGAATGAACC  1000

seq1  TCTACTCTTTTCTCTCTCCAACAAAATAGATAAT--CAAGGAACATTTG-  1044
      |||||||||||||| |||  || |||||||||||   |||||||||||| 
seq2  TCTACTCTTTTCTC-CTCTCAC-AAATAGATAATTCAAAGGAACATTTGA  1048

seq1  ACACTTAGCA  1054
      ||||||||||
seq2  ACACTTAGCA  1058