BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-048F23.T7 (MSMg01no048_f23.b1) | MSMg01-048F23.TJ (MSMg01no048_f23.g1) |
ACC | AG278156 | AG278157 |
length | 1,171 | 1,245 |
length of high quality (start - end) | 425 (71 - 495) | 353 (79 - 431) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_f23.b1 PHD_FILE: MSMg01no048_f23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:09:13 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no048_f23.g1 PHD_FILE: MSMg01no048_f23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 12:09:13 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTATGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATTCTTTTG
TTCATGACCCCCCTTAAAGCTGGCACCTAGCTAAAGTTTTTAAAAATGTC
TTTTCGGCTAGGGAGAAAAGCCATTTCAACCACAATGAGCTTTAACATTC
CTAATGATGGTACGAAGACACTGAGAAATTGAATATCTATTGGTGGATAA
AGATGGGTATAGCCTGTCGTGTATAGTAGAAAGCCAAGACTCTTGATTTA
GGGTCACAAAGGAGGGTACGATTCATTCTTGCTAATATGAAGATGGTCCT
TTCAAGGCAGAAGCAGTCTTACTGGGGTCTGAACTCAGTTAGAGGAAGCA
TCTGAAGCTGCTTGTGGTTGTGTGGTTGCCAGCCATGATATTCACTCACA
GTGATTGCAAAGTATTTTAGTTGTCCTGTCAACCACTCGCTCATAGGAGA
TCCCCAGCATTCTGGGAAATTGCTTTCTGGAGCAACCGAGTCAACAGAAA
GCCAGACATTGGAGAAAGATGCTACAAAACCTCTAACATGTGGGAAGTGT
GTCAGAGGTTACTGAATTTCTATTTAAAATTTACAGAGTTGAAACAAAAA
AAATGAAACAATCCACTCATTCTTTATGTGTCAACTGGTTGGAAATTAGT
GAACATTTAATAATAGTCACCGAAGGTGGGTGGGATACAGGTAAGCCAGG
AGGAGAGAGAGAGTCAGGCACGTCATAGGCTCTGGAGAGGAGGAGACAGC
AGTTCTCCCAGAGCAAGCACTAAGTCTTTCGTTTAGGGTTTCAATTTCTG
ATAGGAACATGAATGGTTTTTCTGAAGTGAACATTACATATTCCTACTAT
GAATTATATTTTGATAAGTGTGAAATTTCTATCCGTTGTAATAGCACCAG
CCCATAATTAGTAATCTTTTTCTCCTGGCCACATTCCTACTTATTCCCCC
CCAAATTTGAACCCGCTATGGCTGGCCCTCTTCTGTCAAGAATTTTTTTT
ATTAACCTTAATTTCCATCCCCGTTTTCTTTGGTTTTCCAGGGTCCTGCA
TTCACCCCGGGTTCTGTACCTATTCCTCCAGTCTTTGTACCATTTTCAAT
CCCCATTATAAATTGTTTCAGAAAGTTTATATTTCATTTTCTTTACATTG
TTTTATAAATTTCTCTCCTTG
| AAACATAGGTAGCGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXCACCTTTATAGCGGCTGTGGTAAGCTACGCAGGACCAAG
CTAGCCCGTACACTCAACATTCCAATAGGCAGCACTAACTGGACTCAATA
GATTTGAAGAAGAAAAAAAAAATAGAGGATATGGAGGTGAAAAGGAGGTG
TTGGAGAGGCTCCTGGGATAGTTAGTAATAGATAAGATCAAGATGCACTG
TCAACAACTACATAAAAGACGTTTTTAAGCCACTGTGGGTCTGTAATTCA
GCCCTGGGGAAGCTGATAAAAGCCAGTTTACCAGAATCAGTGAGCAACAA
GTTTGATAAGAGACCCTGTCTCACAAATCGGGTAGGGAGTGATAGAGGAA
ATCTATGGTCTACACACACACACACACACTCACACACACACACACACACA
CACACACCCACACGAGAACATAAAACTATATATTAAGTCTATTTTTTATG
TGAACTCTCGAAGACCTATAGAAGACCTATCGTGTATGCCTTTGAGATGT
AACAACAGCAATGATTAATACAAAGGTAACAAATGCAGCAGATACCTTGC
CGTATTGAATTAAGTCTAATGGATTAGAAAAAGATTATTGGCAAGCACTA
AAAAAAATCATTTATTAGGAAAACAAAGTTCAGAGGATCCGGAAGTAAAC
TTTGTAGGAGACGCTGAGAGAACACAGGTCTCTTAATACTGAATCCCCAG
AATAACTCTCAATTTTCATGGCTATTCCTGGAAACAACGCTTTTGTTTGT
CTGCTAAGCTGTACTATAATAACAGGCTGATGGTCTGATTCCTAACAGGT
TTATTTTGAAGTTGAAAATATTTCAATGGTTGCCATTCCGTATTTCATGG
AAGGAACTGAATAAACATCCCAATTTCTCCCTTGTTCATTACAAATATTG
GTTTTTTGGTCCATATTTTAAGAAAGGGTGAAATACTTGGGGGCCCCCTT
GTTCTTTTCCATTTAATATCCTATACCCCTGTCCGGTTTAAAATACTCCT
GTTCCGCTAAATAGGCTACGGTTATTTTCTTTCTTAAGTGAAAAATCTAT
ATTTCCCCAATAATAATATTCCCTATGGGTTCCTCTCTCTCTCCCTTTTC
CGTGGTAATATGCGCCTTCCCTGGGATACACTCTTTTGTGTGTTTTCTAC
ATCTCCGCGCCTAAATTGGTAATAACTCTCGTACTTTTGCTCTTN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 8 10 8 8 11 14 25 22 13 10 8 8 8 15 19 9 8 8 19 19 28 37 35 36 36 36 36 36 36 37 37 37 37 42 33 47 39 37 30 30 37 44 44 59 59 41 41 27
22 11 10 10 23 23 21 21 9 11 11 11 12 12 12 10 10 12 16 21 21 20 22 30 34 44 44 47 36 28 28 19 26 25 36 48 57 57 43 50 43 48 43 39 43 48 48 42 27 21
18 16 21 22 12 11 10 10 13 19 24 33 28 28 15 15 20 20 23 32 44 37 43 43 48 48 37 43 43 43 43 44 43 43 43 43 43 43 43 43 48 48 47 47 47 47 57 44 57 50
50 50 50 41 50 57 57 57 46 43 46 46 59 47 43 35 35 35 44 35 32 43 43 23 38 27 27 27 35 43 43 43 59 57 52 57 57 57 57 57 57 43 43 23 27 27 44 44 57 57
57 57 57 57 57 57 39 39 43 57 57 57 57 42 57 39 39 43 43 52 43 44 39 43 36 35 35 39 39 39 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 38 38 32
32 35 43 43 33 43 43 57 57 57 52 52 52 52 37 43 52 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 59 57 57 57 44 44 35 35 24 34 24
24 24 38 38 44 44 43 43 43 57 57 57 57 57 48 48 46 48 44 47 54 46 42 42 33 42 42 44 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 57 43 43 39 46 46 47 47 47
59 57 57 54 54 54 46 47 43 43 48 47 47 59 34 34 17 17 22 34 32 43 47 39 39 30 32 37 39 43 43 43 39 39 36 36 37 37 37 34 28 22 12 12 12 12 12 12 13 30
28 13 13 13 28 27 59 57 57 48 48 48 59 59 59 59 59 34 28 13 13 15 34 23 30 37 43 43 57 46 46 43 43 43 48 48 57 57 57 57 57 57 59 46 43 43 43 43 37 37
43 44 57 44 42 35 35 42 43 57 57 57 44 44 31 28 28 36 36 44 57 57 59 59 59 59 57 59 43 43 31 31 29 42 42 43 42 42 33 33 25 21 21 13 13 12 13 13 15 12
17 27 27 18 12 9 9 9 21 21 37 37 37 37 39 40 40 43 43 43 43 43 44 40 30 28 21 28 18 26 30 37 37 33 37 37 43 42 43 43 37 26 22 17 17 30 30 39 48 43
34 25 12 12 12 25 25 37 37 32 39 37 39 39 41 41 43 59 37 36 37 59 59 59 43 31 31 27 32 33 33 30 34 28 28 28 37 33 43 43 43 39 39 39 35 35 35 35 37 37
47 47 47 41 39 29 29 30 34 28 28 31 37 37 37 37 37 37 43 43 43 43 43 47 47 48 48 30 28 17 17 17 22 28 37 39 31 20 24 14 14 10 19 20 27 27 27 20 23 23
32 30 37 37 37 37 43 37 20 18 12 13 13 17 15 18 23 23 23 30 34 37 31 22 22 22 24 24 24 18 15 21 12 12 12 22 22 19 16 16 17 17 13 18 15 20 19 24 13 15
16 11 11 11 12 18 22 22 16 16 15 11 12 12 13 13 20 12 8 8 10 10 10 10 19 15 14 14 11 15 12 21 21 10 9 9 9 9 9 10 10 10 10 12 12 13 19 21 15 15
11 10 8 7 6 6 6 10 8 10 10 17 21 21 30 21 21 12 12 12 13 9 9 9 9 9 12 10 12 10 10 10 13 15 22 22 22 30 18 16 19 16 18 18 24 21 18 17 11 11
10 10 9 9 9 9 13 17 22 13 13 13 13 15 11 13 13 28 25 30 21 10 10 10 10 8 8 8 10 10 19 15 10 11 10 8 9 8 8 11 8 9 9 8 10 8 8 8 10 8
8 10 9 8 8 8 10 10 12 12 12 14 11 13 11 14 10 10 10 10 10 16 10 10 10 15 8 6 6 8 8 9 11 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 8 8
9 9 11 12 11 9 9 9 10 9 10 11 11 12 10 10 17 13 12 10 10 8 8 8 8 9 10 11 10 11 11 12 14 15 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9
9 10 10 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 10 8 8 9 10 8 8 9 9 9 13 10 10 11 10 10 10 10 10 10 11 13 13 17 13 10 8 8 8
8 8 8 8 8 11 12 9 11 9 11 16 12 13 13 10 10 9 12 10 10 10 14 21 21 13 11 9 10 12 12 10 10 12 12 12 15 12 11 11 11 11 10 8 8 8 8 6 8 9
9 9 10 11 11 10 10 13 13 10 12 15 12 8 8 8 8 7 6 8 8 10 8 8 8 8 10 13 9 9 8 8 8 9 12 10 10 9 9 9 12 11 11 10 10 10 9 10 10 10
13 13 8 8 8 8 8 8 9 10 11 10 8 10 8 8 8 8 9 9 11 11 11 11 8 8 10 12 12 13 8 10 8 8 6 6 8 8 8 10 6 6 8 8 6 6 6 8 6 7
9 9 11 14 9 9 12 12 9 7 12 8 8 8 8 7 10 9 9 10 9 | Open.Hide. 8 8 7 7 6 6 6 6 6 6 6 11 8 8 8 8 8 8 8 14 12 12 11 10 12 13 10 8 9 10 10 10 15 22 28 17 17 12 25 13 20 20 29 36 34 37 31 31 37 47
47 47 50 50 50 50 47 59 29 12 8 6 6 6 7 12 12 7 7 6 7 8 8 11 10 14 15 19 19 26 24 35 35 35 35 38 36 37 37 37 37 28 28 28 34 34 41 50 41 41
34 37 22 19 12 12 12 10 13 12 14 19 23 30 26 28 28 24 26 21 28 28 28 18 18 18 21 21 30 40 42 48 57 43 43 42 39 39 39 39 35 36 43 42 48 48 43 33 33 33
33 37 47 47 43 41 41 41 41 47 41 32 18 20 18 20 24 20 20 20 24 17 22 17 17 18 32 34 37 43 42 44 42 35 35 35 42 33 33 35 43 43 43 33 33 28 43 43 36 38
19 19 18 32 32 52 52 52 57 57 57 57 57 57 43 43 35 35 43 44 43 43 32 43 23 43 44 57 57 54 57 57 52 52 52 52 52 57 57 52 52 52 57 43 43 20 20 17 34 16
24 14 14 14 30 27 52 52 43 43 35 35 35 43 38 38 20 23 26 44 43 57 54 57 57 57 57 57 57 62 38 38 16 32 14 21 15 12 13 18 38 44 43 52 52 52 38 38 13 13
13 29 38 44 62 43 43 20 20 20 35 35 35 62 62 43 43 41 35 35 35 43 43 43 43 45 45 57 57 57 57 43 39 33 31 39 39 39 39 39 38 38 19 19 17 32 38 57 43 36
32 19 19 24 34 33 33 33 23 33 33 43 43 52 52 57 57 59 59 52 43 27 12 12 12 27 38 43 32 23 15 16 15 32 18 20 18 38 36 52 52 57 57 54 43 43 28 20 16 14
11 11 11 20 18 15 12 12 32 32 32 32 20 32 32 40 29 33 29 41 41 43 42 42 30 32 12 11 11 11 11 13 12 14 15 15 20 20 20 20 20 20 23 24 18 18 12 12 11 12
11 11 12 15 12 13 13 17 19 18 19 11 11 13 11 11 11 21 19 24 24 28 24 20 16 12 16 19 32 32 43 43 43 43 37 28 28 28 28 28 34 37 38 23 22 22 24 24 28 24
22 18 18 12 8 10 8 8 8 8 26 22 31 23 28 28 32 26 15 12 12 12 12 14 17 20 24 30 26 17 12 11 11 11 11 18 25 32 37 30 39 39 30 30 15 12 18 19 19 15
16 11 11 11 12 12 15 13 16 13 17 19 30 30 32 23 16 11 11 11 21 21 30 24 25 12 11 11 18 16 15 18 18 11 11 15 12 12 12 18 11 11 11 20 22 29 33 30 24 23
28 28 28 27 18 18 15 13 8 8 8 11 10 16 18 18 23 19 18 24 21 28 30 25 26 14 14 12 24 21 30 32 32 39 39 37 37 37 23 18 15 15 10 10 15 16 12 12 18 24
17 17 10 10 13 17 22 23 20 17 16 21 11 12 10 21 16 16 11 15 16 21 21 13 13 13 15 10 8 8 8 8 12 14 14 10 8 8 8 8 9 9 9 9 9 16 15 12 8 8
8 8 15 10 12 13 18 19 12 10 10 12 12 16 13 23 11 11 11 12 10 11 10 9 9 9 10 13 10 13 15 12 10 10 8 8 10 14 18 20 20 18 22 19 11 8 8 9 9 9
11 14 11 11 10 8 8 6 6 8 8 10 10 15 17 23 23 24 12 14 12 12 12 15 14 10 9 6 11 6 6 8 8 10 10 11 19 12 11 10 11 12 21 25 19 14 9 8 10 10
12 16 13 13 12 12 11 11 11 11 11 11 11 11 15 16 15 10 10 8 8 8 8 9 8 10 10 11 12 8 9 9 10 9 9 9 9 8 10 9 9 9 9 11 11 11 11 12 10 10
10 15 15 8 8 9 9 9 11 11 6 6 6 6 10 12 10 11 8 8 8 10 10 10 9 9 8 8 8 10 10 12 11 8 8 8 11 8 8 8 8 8 12 15 15 8 8 8 8 8
8 11 11 11 11 12 10 8 8 8 8 8 9 10 9 9 9 11 11 9 10 10 10 10 10 10 10 9 10 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 6
6 6 8 8 17 15 24 14 11 13 10 10 8 8 8 8 8 8 11 8 9 8 8 8 8 11 11 11 15 11 11 10 8 8 8 7 8 9 12 11 11 12 12 11 9 7 8 8 8 8
7 6 8 8 10 13 10 10 10 10 10 12 12 9 7 10 10 15 13 12 8 8 8 8 8 8 8 13 8 8 6 6 6 8 8 10 13 12 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 11 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 9 8 10 8 8 6 6 6 8 8 10 17 11 8 8 8 6 6 8
8 8 10 10 8 10 10 9 9 9 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 15 15 15 12 11 10 10 11 12 10 9 9 9 10 10 9 9 11 10 10 9 9 8 8 11 12 8 13 10 8
8 6 6 6 6 11 13 11 11 15 8 8 7 6 6 6 8 8 8 9 10 9 8 8 8 8 6 10 6 6 8 8 8 8 11 15 7 7 6 8 7 7 8 8 8 10 10 7 6 6
8 8 8 9 9 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 11 8 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 3 0 |