BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-054E10.T7 (MSMg01no054_e10.b1) | MSMg01-054E10.TJ (MSMg01no054_e10.g1) |
ACC | AG282258 | AG282259 |
length | 758 | 705 |
length of high quality (start - end) | 285 (126 - 410) | 514 (72 - 585) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no054_e10.b1 PHD_FILE: MSMg01no054_e10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:55:25 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no054_e10.g1 PHD_FILE: MSMg01no054_e10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 16:55:25 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TGGGTGTGGTGTTGGGTTTNNNNCCGCCCCCCCACCTCTCCTCCGTGCGC
NNNGGGTCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAAAGAGGAT
CCGCGGAATTCTTTTTTTCTTTAGATATAAGTCCTCTATCAGATGTGGGG
TTAGTGAAAATTTTTTCACAATTTGTAGGTTGCCGATTTGTCTTATTGAC
TATGTACTTTGCCTTACAGAAGCTTTCCAGTTTCCTGAGGTCCCATTTAT
CAATTTTTGATCTTAGAGCATGAACCACTGGAGTTCTGTTTAGGAAATTT
CCCCTTGTGTCAATGAGTTCAAGACTCTTTACCACTTTCTTTTCTATTAG
ATTCAGTGTATCTGGTTTTATTTTGAGGTCCTTTATCCACTTGGACTTGA
GCTGTGTACAAGGTGACCCCTATGGCCCTATTTTCATTTTTCTATATACA
GACATTCAGTTAGACTAACCCTCTTTATTGAAGATGTTTTCTTTTTTCTA
TTGTATATTTTTGGCATCTTTGTCAAAGAGAAAGTGTCCATAAGTGTGTG
ATTTTACTTCTGGGTCTTTAATTCTATTCCATTGATCAACCTGCCTGTCT
CTGCGATAATACCATGCAGTTTTATCACTATTGCTCAGTATTAAAGCTTG
AGGTCAGGGATGGTGATTCCCCCAGTTTTTCTTTTATTGTGAGGAATTAT
TTGTTTTTATTCTGGGTTACCCCCAGATACAGTCCACAAGAACTCTAACA
GCGTCAAG
| CATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXTTCCCCGCGAAATTCATATCATGATTTTGATAACATCTCT
CACCTCTTTGTACTCCTGAATAATTTGAGTGGTTATTCCAGGAATGTTGA
CATATAATCATCATGTACTAAGATTTATTTCAGGGAGTTTTGTCATTATG
GATTCAATCTCCTTTCTAATTATTTATTTGTTTATGCTATTTATATTCTC
TTGATTTAATTTTGATTGGTGCAGGAATTTATTCTTTTTTATCCACAACA
ATTTCCAGTTTGAAGAATATTTGTCTTTAAAATATTGCTTCATAATCACA
AGGTTTTGTTGGTTCCAGGTAGACTACTAACTTTTCTTCTTTAATAGCAT
CAGGGTAGGTGCTCCCTCCCTCATTCTCTGCCTCTGCCTTCTCTCTCATT
TCCTTAGTTTATCTAAGAGCTTGTTAACCTTGTCTGTCTTTGGATTTGGT
AACTGAGGAGTTAATATACTTTAGTGGAGGCATGCCTTGCTTTTCATGTT
TTTTGTTTGATTTTTTGTTTGTTTGTTACTATGTTGTGTCTTAGACATCT
ATTGGATGGATATTTCTTATAATTTTATTTGGGTAACTCAGCAAAACAGT
TCTCACATTTGCTGGGCCCGCAAAGGTGCTTTCTGCCATCCTGACTAGCT
GAGTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 22 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 21 8 8 8 3 0 0 0 0 3 23 23 19 19 9 8 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 9 9 3
0 0 0 3 8 6 6 10 13 9 14 14 14 14 21 30 31 33 32 21 17 15 18 17 19 10 10 10 19 19 33 28 25 29 17 15 9 9 9 9 10 10 13 13 16 15 12 12 13 10
12 17 26 33 33 30 30 28 28 28 25 23 22 10 9 9 9 12 11 9 12 12 11 12 12 24 24 24 30 28 47 59 59 59 59 53 53 50 50 50 47 47 47 47 47 47 47 43 43 43
43 43 57 57 57 57 57 42 36 47 42 36 36 59 48 48 48 47 47 41 30 25 18 15 12 12 11 11 21 30 59 59 47 48 48 48 48 50 57 59 59 59 57 57 57 50 50 50 47 53
53 50 59 57 57 57 54 54 54 57 54 54 54 59 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 59 57 57 57 57 57 57 54 59 59 59 57 57 43 43 43 47 47 57 48 48 48 59 59 57 42
42 35 42 42 59 59 68 68 57 57 57 57 57 59 50 43 43 43 43 48 57 57 52 52 57 57 43 43 42 35 35 42 43 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 47 47 48 57 57 48
43 43 37 43 42 44 42 43 37 42 57 57 57 41 57 43 40 57 57 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 59 59 59 54 50 50 53 43 43 39 35
35 40 39 43 43 43 39 39 35 35 39 39 39 43 39 39 23 23 11 10 10 11 11 10 11 11 18 23 32 39 46 46 48 48 48 48 57 48 48 48 48 57 48 48 48 57 48 57 46 43
43 37 37 30 28 28 31 22 19 13 12 15 16 21 20 23 11 8 8 8 9 9 9 12 12 14 17 15 19 20 20 28 30 37 43 43 57 48 48 48 57 48 50 50 48 48 48 43 46 46
43 43 43 39 34 34 25 25 34 34 37 39 32 25 20 12 11 11 11 20 20 37 37 41 41 41 48 48 48 39 39 32 32 39 43 43 48 48 48 48 48 48 48 48 47 47 47 48 42 42
37 37 28 33 33 42 42 48 48 48 43 43 39 37 32 32 32 42 42 40 40 28 25 24 25 25 24 24 20 28 28 27 36 30 22 12 12 12 18 32 32 39 28 28 23 28 28 35 42 59
59 59 57 57 57 37 37 37 43 37 37 36 30 32 41 41 37 41 42 42 42 31 29 28 32 28 37 31 37 35 35 35 42 39 30 22 18 13 13 13 27 21 13 13 19 28 23 33 25 28
18 19 10 10 10 15 26 32 35 35 32 22 18 22 22 23 19 14 14 14 14 18 22 28 28 31 33 33 37 37 33 28 30 14 14 10 10 10 10 15 15 11 11 11 10 16 12 15 15 12
11 11 11 11 11 13 13 10 8 8 10 11 10 10 10 16 10 11 13 30 15 18 19 19 18 17 11 10 8 15 10 12 12 12 13 12 8 6 6 6 6 8 8 11 14 11 23 17 23 16
15 8 8 8 8 8 10 14 21 21 22 23 21 15 15 13 15 11 12 15 16 16 13 11 13 10 15 10 10 10 10 10 10 13 8 10 8 8 8 8 11 8 8 8 12 8 8 6 6 8
6 6 6 10 10 8 8 8 | Open.Hide. 7 12 8 8 8 6 6 8 6 7 9 9 15 16 26 27 41 39 39 34 34 28 28 28 34 37 47 39 25 23 15 11 10 9 7 8 8 9 9 12 12 24 22 26 15 28 32 37 36 36
33 33 33 33 47 43 27 23 9 11 11 11 11 11 12 20 20 18 11 8 8 19 19 31 36 47 38 38 42 42 42 43 50 53 53 50 50 50 53 53 53 50 57 43 43 43 43 57 47 47
42 42 42 47 48 59 59 59 59 59 59 46 46 43 48 48 57 42 37 35 28 37 37 42 42 50 57 57 57 57 57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 47 47 50 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 57 52 52 43 50 37 47 47 50 50 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 59 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52
57 57 59 57 57 57 57 52 52 52 57 44 38 16 12 11 15 15 27 27 32 32 52 57 57 57 57 43 43 57 57 57 57 57 52 52 52 59 57 57 44 44 32 43 43 43 43 43 57 57
52 52 52 52 43 44 43 52 43 43 23 23 23 43 38 36 23 17 12 24 12 17 17 32 32 48 47 44 44 46 46 54 59 59 59 59 59 59 54 54 48 57 57 44 44 35 35 35 42 47
47 44 39 37 37 37 37 39 39 36 36 37 37 37 44 32 32 32 42 42 46 46 39 43 43 47 47 47 47 43 43 37 39 39 43 43 43 43 47 43 46 46 46 46 48 48 48 50 48 48
47 46 46 34 36 34 37 31 34 40 39 39 39 34 34 23 23 23 34 34 47 38 34 34 33 34 34 36 39 47 48 48 28 30 18 13 13 28 28 28 24 13 13 24 28 34 32 20 18 22
24 33 33 39 39 35 35 35 37 24 24 28 24 24 22 30 32 33 33 39 36 27 22 11 11 11 15 22 37 30 30 24 29 24 28 28 36 37 47 39 39 32 32 28 28 19 22 12 13 18
28 28 29 30 17 17 15 17 11 11 11 19 25 39 33 33 28 28 28 37 35 35 23 19 15 13 17 18 33 36 33 33 19 17 11 11 11 12 16 18 28 28 15 12 11 11 11 21 21 30
35 35 39 37 37 37 32 21 21 19 16 15 25 21 30 33 37 37 28 18 17 17 18 18 37 39 39 37 25 28 12 12 15 16 20 25 30 31 10 8 6 6 8 15 14 25 28 33 33 33
37 28 24 15 13 10 10 12 23 23 11 11 9 10 10 11 15 10 10 10 14 13 13 20 15 22 22 24 19 18 20 15 14 14 9 10 10 10 10 8 8 8 13 8 8 11 9 12 12 11
16 11 11 11 11 |