BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-099A23.T7 (MSMg01no099_a23.b1) | MSMg01-099A23.TJ (MSMg01no099_a23.g1) |
ACC | AG315084 | AG315085 |
length | 752 | 1,156 |
length of high quality (start - end) | 466 (43 - 508) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no099_a23.b1 PHD_FILE: MSMg01no099_a23.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:56:21 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no099_a23.g1 PHD_FILE: MSMg01no099_a23.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 17:56:22 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAAT
TCATTGACTTCCTGTTGCACATCATAGAATGTAAAATAACAAAGGGAAAT
ACAATAACATAACTTAAAAATCGTGATTTTTTTAATTGAATGAATGAAGC
CTATCTTAAAGGAGAGCATATTTTTGTAGAAAACTCTGGCTCTTTTCAAA
ATAGAAAACTAAAGGACCATGAAAATGTTAGAGATCACAAGGAGTTTGAG
GATATCAGCTAACAAAAACAATGACTTTATGAAATTGGATGACACTAGAA
AATATCATCCTGAGTGAAGTAACCCAGTCACAAAAGAACACACATAGTAT
GTACTCACTGATAAGTGGATATTCGACAAAAAGTTCAGAATTACCTAGAT
ACAGCTCACACACCATATGAAGCTCAAGAAGAAGGAAGAACAAAGTGTGA
ATGCTTCAGTCATACTTAGAAGGGGGAACAAAATAATCTACAGAGGGAGG
AAGGGATAGTAGAGGGAGAGAGGAGGGGGTGGTTCACCCTCCCCCCTTCT
TTTTCTTCTCTTTTCCCCCCCCCCCCTTTTTTTTCTCCCCCGCCCTCTCG
TTCCTTTTTTCCCCTTCTCCCTTCCTTTCTCTTCTTCCCCCCTCTCTTCT
CCCTTTCCTTTCCCCTCTATTCTTCTCTCTTCCCCACTCCCCTCCTCTTC
TTCTTCTCCCCCCATTTTCCTCTCCTCTCCCGTTCTCACTTATTCCTTTC
CN
| GGCTTCTCCTTCCCGCGCGCGTTTTTTTTTGGGCTCGCGGCTGCTGTGGC
GCCCTCTCGCCTTGGTGGCCCTATTTCGTTGGCCCCATATCTATTCGGGG
TTCCGGGAGGGATTGTACCGCAACGGTGGTGGTCCAAATATTTAACGCGG
CGGATAATAAAATAAAGCTGGACCATAAAAAAACAATTAAGGGCAAATTT
ACGCCGCATAACACCAACACTTGGTTGTATTATTACGGGTGGAATAACTG
AGGGCCGGATTCGCGTGTTTTATGCTGTCCTCCCCACCGGTTCGGTCGTT
GCGCCCTAATATCGATCTGCTCCTGTCTTATTTCTTTATTATCACGCCGG
TAAACATAATTCCATATCGGCATAATATATAGCTGCGGCCCGCCCCCCGC
ATATTATTCTTTTACCCCCCACGAGCTCTTATATATTCATGTTATCCTCA
TTAATAATTTACCCGCGCCCACACTCTCGTGTATACAACCACGCATCCGC
CCTATTATTTAACGGATCGTATATATTAAAATTACAGAGTTACGGCATAA
TATCTGTACTGCGCAGCAGTTCTTGCTATGTACATATCATGCACGCGTCG
GGTTTTAACTCCGACTCATACGGTGTTTTATTTGTTCGCATAAAAAACCT
CGCTTGGTTAGACGCTCACGCGTGGTTTGCCCGTTATTCGAACATGCTCT
GCCTCTAATGCCGTAGAGCGAATTTTCGGACGATATTATCCTCCGCATCC
GTTATAATTTCCATTTCCACACTATAAACGCCCCCGGTATTTATGGCGCC
GGCGGACGCGACCGAATTTATTAGGCTGCCCGCCATATACACCCCCTCAC
ATCATTACATCAGACGCCAACAAAAAAACTACCATATTCTGGTTACATTC
CACACCAATTCTTAAAGCACACCAAATGAATTCGGTTCTCACGAAGGTGT
ATGAACGCTATTTTAAATTATTTCGCGGCAAGGGGAAAGGAGATATATGA
TACGAAGTAAGCGGCTGTTTTCCCGCGCTCAATTTATCCCCCTTTATTTA
TTTTTTTTGTCGCCATAATATTATACTAACCGCTGCCCGCTAATTTATAT
TTTTGTGCGGCCGCATGCACAACCTTATATATTATGCACACGCACTGCCT
TGTATG
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 16 29 59 47 37 37 37 31 31 28 30 28 24 24 28 37 37 41 47 30 28 22 17 16 9 10 9 10 9 9 9 11 16 16 27 25 22 22 24 27 30 47 48 36 36 36 33
50 37 37 37 29 17 10 10 8 8 8 8 8 9 13 23 34 37 37 33 33 33 36 36 38 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 43 48 42 39 39 48 48 54 59 57 43 42 46 46 46
48 47 47 47 48 48 50 47 48 48 48 54 54 57 57 46 41 26 21 21 28 28 28 28 42 43 57 57 57 59 59 59 57 54 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48
57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 59 52 43 52 52 52 57 57 57 68 59 59 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57
43 43 35 43 57 57 57 57 57 57 52 45 45 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 43 43 57 57 52 57 57 57 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 52 62 62 62 62 43 43 62
43 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 35 35 20 20 20 23 23 35 43 43 43 43 45 45 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 43 43 35 35 43 44
59 57 57 57 57 52 43 43 39 43 39 44 44 43 47 35 35 35 39 43 43 43 43 35 35 35 35 35 35 43 44 57 57 57 57 57 45 45 52 57 59 59 68 68 59 59 52 52 43 59
50 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 50 50 43 43 52 52 52 52 52 52 54 57 52 57 52 43 44 43 35 35 47 35 35 35 43 35 37 37 44 41 33 33 33 27 27 27 40 40 44
37 39 39 39 37 32 36 28 35 30 32 32 44 44 57 32 32 17 17 30 30 37 31 31 27 23 23 36 32 42 32 30 28 28 23 23 25 41 40 57 43 43 43 40 34 30 25 25 28 33
37 31 28 16 14 14 23 19 19 22 12 12 12 21 13 14 13 21 18 22 22 17 17 31 19 15 12 11 11 15 12 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 12 16 19 10 14 10 10 10
10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 11 15 10 10 10 10 11 11 11 10 10 10 14 12 9 10 10 10 10 24 21 16 10 8 8 8 8 8 11 10 6 6 6 7 6 8 10 13 8 6
6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 12 15 15 15 8 8 8 8 8 16 9 9 9 9 9 13 13 9 9 9 10 8 8 8 8 10 8 9 9 8 10 10 10 10 9 9 12 11 6 6
8 8 10 8 15 15 20 20 17 14 14 18 18 20 21 19 12 9 9 9 10 8 12 13 8 8 8 11 8 8 9 10 6 8 6 6 8 12 8 8 8 8 10 10 8 9 9 8 11 12
13 10 10 8 10 10 12 12 11 9 10 6 6 6 6 8 8 8 10 10 12 8 8 9 20 13 11 11 11 11 6 6 6 6 8 8 8 9 6 15 8 8 6 7 7 7 6 8 8 9
3 0 | Open.Hide. 9 9 9 9 10 10 11 12 10 10 10 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 6 8 12 12 16 12 8 8 11 8 8 8 8 10 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9
10 9 9 8 8 8 10 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 6 6 6
8 8 8 8 6 10 6 6 8 8 10 6 7 10 8 8 8 10 10 11 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 9 8 9 9 9 9 9 8 8 9 8 8 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 10 8 8 6 6 12 8 8 8 10 12 15 12 12 12 12 15 11 11 11
10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 9 9 8 8 8 6 6 6 6 11 12 12 12 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10
11 11 11 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 13 10 10 10 10 9 8 8 6 6 8 8 8 8 9 8
8 10 8 8 8 9 9 9 9 12 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 9 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 8 8 9 10 10 14 13 12 10 10 8 8
8 10 10 12 16 14 17 19 16 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 11 11 15 18 10 12 8 8 8
8 8 8 6 6 6 8 8 10 8 8 13 9 9 9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 17 12 8 8 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10
10 10 10 10 11 11 11 11 10 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 9 8 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 6 6 6
8 8 6 7 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 12 10 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 6
6 8 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 11 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 10 10 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 6 6
8 8 10 8 8 10 10 8 8 9 10 8 8 8 8 8 9 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 14 13 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 8 12 6 6 8 8 8 6 6 6 6 9 9 10 9 11 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 11 10 10 8 8 8 8 8
8 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 11 12 12 15 11 12 12 11 11 10 9 8 12 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 10 11 15 12 12 8 8 8
8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 10 9 10 10 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 10 8 11 9 8 8 8 7 6 8 8 10 10 8 8 9 8 8 6
6 6 6 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 10 10 8 7 7 10 8 7 6 8 8 8 9 9 8 8 11 8 8 8 8 8
8 8 9 10 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 10 8 15 13 15 10 8 8 6 6 8 8 8 11 12 10 10 9 9 9 9 9 10 8 8 6 6 10 8
9 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 7 7 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 10 11 11 10
8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 11 10 11 8 8 6 6 8 8 13 13 13 13 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 6
8 8 10 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 8 7 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 11 12 16 8 8 8 8 8 12 8 8
8 11 10 14 10 11 10 10 10 11 10 10 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 11 11 11 10 11 11 9 8 11 10 7 6 6 7
6 11 12 11 11 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 6 7 8 8 8 8 8 8 9 9 12 8 7 8 8 10 9 8 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8
8 8 9 10 9 9 |