BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-109D20.T7 (MSMg01no109_d20.b1) | MSMg01-109D20.TJ (MSMg01no109_d20.g1) |
ACC | AG322475 | AG322476 |
length | 744 | 732 |
length of high quality (start - end) | 152 (54 - 205) | 339 (82 - 420) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no109_d20.b1 PHD_FILE: MSMg01no109_d20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:12:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no109_d20.g1 PHD_FILE: MSMg01no109_d20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:12:23 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ACTCCCCCCCTCTATAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXCGCGGAATTCACTATGTATTCACAGGTGACCTTCTACTCCTGCTGCC
ACTCCAGGCAGAGAAAGAACAAGTGTATACCACTAATGCATTATTATTAT
TATTATTATTATTACTATTATTATTATTATTATTATTATTATTATTTTGA
TTTTACTCTGTTCCTTGCGACAGTCCTGCTAAGTAGCCTCACCAGACCTA
GCCCTAGCTACTCACCCCATGTTTGCCTCCTACTGGCGGCCATCCTCCTA
CCCCAGACTCCCACATTCCGGGACCCCAGCCCCTGCTATGGCTCCCGTGC
TCTTATCTTCCCCAAGTGCCCATTTCTCCCTGCCCCGCCCCCCCTTCATC
TTAGTTGAACTCTCGCGCTCCCTGACCCCCCCCTTTGTTTACTCGCCCCC
CCCCTTCTCCTTCCCCCTTTCCCTTGCTCGCCTTTTACCCCTCTTTACCC
CGCTTCCCCTCCTTCCCCGGTTGTTTGTTTTAACCCCGCTTCCCTGTCTT
TCCCTTCTTTCCGATTCCCCATCGCTCCCTTCTTCCTCTTCCCCCCCCCC
CCCTTTTCCCGTTCCTCCCCCTTTCCCCCTTCGTTTCCCCTTCCCCTCCC
CCCCTTTCCCTATCCCCCTTTCTCTTTTTCCCTTTCCCTTTCCTGTTTCC
CCCCCCCCCCCTTTCTCCTTTTCCCCCCCCCCTTTCCTTCCCCG
| TTTNNNTTACGATGCTGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTATGGAAAGAAGGCA
GAAATGGCATTCTGGGGGTGGGGTAGAGGAAATAGCTTATTAGGTAAAGC
ATGAATGTGCTTGGTGCATTGAGGTGCAACTGAGTAGTGTGGTAGGAGTG
GTGGGCAGTCAGGAGAAAGATGCAGGCTGTTTGAAGTCATAGTACCAAGA
TCCTTGAGGCAGAACAGGCACTGAGCTCTCTTCTTGGGCTTCAGGATACC
CCTATGGGGTTCATTTGCAGTGTTGACTATTGGCATGTTATGGAAATGTA
TAGTATGGTTATACAGACATTTTTTTTTACAAACCCAAACGAGGCAAGCT
CCACTTGTTTGAAATTAGCTATAGGAAACTAGTTTCATTTCTATTTTTGT
GTGTGCACACGTGTACATGACTGTGCACATCCATGATATACTCAGAGGAA
GACATCAGGTGTCCCTGTCTATCACTCTTTATTCCCTTGAGACAGTCTCT
CGCTGAACCTGGAGCTAGACTGGCTACCAGTAAGCCCCAGCAATTCCCCA
GACTCCATGGCATTGGTTCACAGGTCTTATCATCCCTGCCCACCTTTTGA
TGTGAGTGCTGGCTATTCCAACTCACGCCCCTACGTCTGTAAAAACAAAA
TTCTTACCCCGCCTGAGTCTTCTCCTGCCCCT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 10 8 9 9 6 8 8 9 9 12 10 12 22 8 8 8 19 16 20 17 18 17 22 28 22 19 8 8 8 23 31 30 27 19 18 18 22 21 21 11 9 11 9 9 9 18 17 21
28 24 24 28 37 44 34 35 30 35 35 35 30 30 30 30 41 41 27 23 11 11 11 9 9 9 9 9 17 17 28 30 33 37 37 48 48 48 57 57 57 57 57 57 47 47 47 34 42 37
57 57 48 42 42 42 42 42 36 36 46 46 43 41 20 20 20 19 20 24 24 36 29 37 37 37 37 30 30 26 24 24 11 13 12 12 12 23 21 42 35 32 32 35 37 37 37 42 42 48
47 57 43 43 28 28 28 30 37 32 37 22 17 10 10 10 17 23 40 30 28 28 43 43 54 54 54 57 57 57 57 50 43 43 43 43 33 36 28 28 28 28 33 33 48 48 37 34 24 23
21 24 25 15 8 8 8 8 10 12 26 19 20 20 16 20 10 8 8 8 8 8 15 23 12 12 11 11 11 12 12 19 22 12 12 10 10 12 10 10 10 11 11 11 13 19 26 32 32 43
39 39 37 34 34 25 28 31 28 22 15 11 10 9 9 9 9 10 10 11 12 12 25 15 8 9 9 7 7 8 11 11 18 18 16 11 11 11 11 11 11 11 11 23 21 32 34 34 25 25
25 28 28 23 12 11 12 12 25 23 26 12 12 11 12 12 26 24 24 15 8 8 8 8 10 19 14 34 22 14 10 10 13 10 10 10 10 10 10 10 12 13 21 19 15 15 15 21 21 28
33 29 29 21 21 13 12 10 10 10 8 8 8 8 8 10 11 19 19 20 15 12 10 7 8 6 6 8 6 12 15 13 14 15 10 8 8 8 10 11 19 7 7 6 6 8 8 10 10 12
10 10 9 11 9 11 8 10 9 13 8 6 6 8 10 8 8 9 11 12 12 12 11 8 8 8 10 13 22 12 12 10 10 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 8 11 10
11 14 12 19 23 21 13 13 8 8 8 10 10 10 12 12 10 9 9 9 9 15 17 22 14 11 10 13 9 8 8 10 8 12 12 10 10 11 15 15 18 25 26 19 15 9 9 9 19 10
10 11 10 10 11 11 14 21 21 18 16 11 8 8 10 12 10 12 12 8 8 8 8 8 10 8 7 7 11 13 16 8 8 8 8 10 8 11 11 17 12 11 10 9 9 9 9 9 15 15
23 25 30 21 26 16 11 11 12 12 11 8 8 8 8 10 8 12 15 8 6 6 7 6 6 6 9 9 10 6 7 7 10 13 9 8 8 8 8 8 10 15 10 17 17 18 21 19 25 22
15 15 10 10 9 9 9 6 6 6 6 6 7 10 8 8 10 12 19 11 18 17 12 11 11 13 14 13 19 17 23 21 19 15 9 12 10 8 15 8 8 8 13 17 12 15 18 13 13 22
22 19 19 14 10 10 8 8 8 8 7 7 9 12 9 11 11 8 8 8 8 8 11 12 12 14 12 10 16 15 15 10 11 11 11 8 10 6 6 8 11 10 10 7 7 7 12 15 17 19
12 12 14 15 15 23 32 37 33 30 22 28 19 17 9 11 11 9 9 12 10 10 11 18 23 31 37 37 35 29 25 19 22 22 18 22 14 14 14 14 8 10 8 8 | Open.Hide. 8 8 3 0 0 0 3 6 6 6 8 10 10 10 9 9 9 12 15 10 10 10 22 32 42 36 36 48 48 39 37 48 40 40 47 59 27 19 8 6 6 7 7 6 10 9 12 12 16 17
16 18 32 32 33 36 36 50 36 33 48 42 42 30 27 18 10 10 10 12 21 14 16 16 20 15 20 24 29 31 31 48 47 47 39 36 38 38 50 50 47 57 57 40 40 36 36 36 39 39
39 33 36 30 34 34 41 48 57 42 43 42 42 37 39 42 46 47 47 47 48 48 54 57 57 54 48 47 42 37 44 37 42 42 48 57 48 57 57 50 50 47 47 47 50 57 68 68 57 57
57 57 50 50 50 50 50 50 50 50 57 50 44 37 35 35 43 44 52 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 52 44 43 43 43 37 37 41 41 50 50 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52
52 43 43 37 39 43 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 52 57 52 57 57 57 57
57 57 57 59 59 47 43 35 32 41 32 43 37 43 43 52 52 52 52 43 43 47 47 35 43 47 59 52 54 54 59 59 59 59 50 43 43 59 59 68 59 59 59 57 43 50 50 57 57 57
68 68 68 59 59 44 43 43 44 47 57 57 57 46 57 42 42 30 44 36 43 43 59 57 57 57 57 57 57 41 30 18 18 18 20 32 44 48 57 57 57 54 54 48 43 43 48 48 48 43
42 37 30 30 30 42 39 43 43 43 47 47 47 43 43 43 43 40 40 43 59 59 59 59 59 41 22 19 10 10 10 15 19 35 34 34 35 35 35 37 47 47 48 48 48 48 43 43 43 43
47 47 43 48 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 28 30 14 14 14 28 28 30 21 12 12 10 12 9 10 10 12 27 30 42 47 48 54 54 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 44 33
27 27 28 28 35 42 42 43 57 40 44 44 44 43 43 32 32 32 44 44 57 48 47 44 39 37 32 32 32 40 44 48 47 47 43 43 47 47 54 54 57 44 42 30 30 30 42 42 42 39
39 44 44 44 44 39 30 30 32 37 37 43 43 46 42 42 37 35 42 43 59 59 54 54 54 59 59 48 48 48 47 47 47 47 47 47 57 28 28 13 13 13 24 24 25 25 19 32 31 35
35 35 35 30 28 19 18 15 22 22 13 13 18 21 28 37 24 24 17 15 15 14 12 11 11 9 15 15 10 10 10 12 11 12 12 11 17 13 10 10 12 16 17 19 21 19 19 22 19 13
13 18 25 19 24 14 28 28 18 15 14 13 12 18 11 11 12 11 11 12 15 15 19 10 10 10 10 8 8 8 8 8 6 7 7 14 21 28 23 28 28 30 30 37 37 37 32 30 30 28
22 21 19 19 15 15 14 15 14 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 10 10 10 11 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 10 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9
8 9 8 8 8 8 9 10 15 9 9 9 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 |