| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-111M15.T7 (MSMg01no111_m15.b1) | MSMg01-111M15.TJ (MSMg01no111_m15.g1) |
|---|
| ACC | AG324371 | AG324372 |
|---|
| length | 1,188 | 1,178 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 607 (130 - 736) | 486 (119 - 604) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_m15.b1 PHD_FILE: MSMg01no111_m15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:16:33 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no111_m15.g1 PHD_FILE: MSMg01no111_m15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:16:33 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CGTTTTGTTTNNNGGCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXCGCGGAATTCTGGCAACCTTGGTAGCTTTTAAAGGCACAGAATGGGCT
TCCCTGCCCTTCAGCCTACCTTAAGAAGCAGTCTGGTGACACCTCGGCTC
TTGCCAAATGTGACTCGTTTCAAGATTCTGACCTCCAGAGCTGAGCAGGA
GAAGTTTGGTAGCTGGGTGTGGCCAGGTCGATGATAATCTGTTCCAGGAG
TGAGAGGAGAGTGAGTCTTAGGTTCCCAGGCTCTGGTTTGTTCCTGATGC
TAAAGGGTTGTCCTTGCTGGGCAGATGGCTCAGTTTGATGAAGCACCTGT
TGTGCCAGCTGGAGGACCTGAGTTCCAGTCTCCAGCACCCAAATAAAGCT
GGTTGTGCTGACATGTAATTACCAGCACTGGAAAGGTGGAGGCAGGAGGA
TTCCTGGGACTTGCTGCTCAGCCAGTTTAGCTGAACAAGAGCTTCAGATT
CAGAAAGAGCCTGCCTCAAAACATAAGATGCAGCGTGAGTGAGGAGGACA
CCGTGGGCTGACCACTGCTGTGCACACTGGTGTACACACACACACACACA
CACACACACACACACACACTGTCCTCTGCCCTTCACAGGCATATGTTTTC
GTTTGCCTTCCATTGCTCTGATAAAACATTGACTCAAAGCAACCTGGGGA
GGAAAGAGTTTGCTTGGCTCACGTTTCTCCATAACTGTCCCTTCACACCG
TCAAGGCAAGAACGGTGGAATGATGCTTACAGGCTTGCTCTTCCTCTGTC
GCTCCCTCCTCAGCTTGCTCTTCTTATACTACTCCGGACGACCTATGCCG
GGTTGGTCCCACCCACCGGGAGCCCCGCCCTCATGCCTCATTCATTAAAA
AAATGCCTCACATTGCTTCTAGGCCATCCCTAAAGAAGCATTTTCTCCGT
TGAAGTGCCCTCTTTTCCCTGAAGAAGGTAGCTTGTGTCCAACCCATACT
ATCTATCAAACCATACCATAAAACCCAATCCACCCACCCTATACATTATT
ATCCTACCCGCCAAACATTGTTAAACCCTGTGTGGCAAACATTCAATTTC
GGAAAACTTCCTTTTATATTCTTAAGGGCCTTTGTAAAAGGGGAAGAAAA
TGACTTTTACTCCCTAATATTTCTGGGTATATTGGGTT
| TTCTCCCCTATGGAGCCGGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAAAAGGCACCTCTTAGGCAGAATGCACTGT
CAAGACCTTACACAAGAGAGAGAATCATAAACTGCAGTGGTGTTTAAAGG
TACTGGGAGGGGCTGGAGAGATGGCTCAGCAGTTAAAGATGCTTGCTGTT
CTTTTGGAGGTCACAGGTTCAGTTCTCAGCACCCTCATGACAGCTTAAAA
ACATCCTTAACTCCATCCAGATTCAGGGGATCGTATGCCTTCTTCTTGCT
CTGTGGGCTCCAGGCACTTGCCAGTGCACAGACACACACACACAGGGAAA
ATGCATATGCATAAAATAAAAATGCATAACTCTTTGAATATTAATGATTT
ATAAGTAGAAAACACACACACACATGCATGCACAAGTGCATGTGTTGGCA
CATGCACCCTCATACACACTTCCCTGTAGAAGCATACAATGCACCTGTAA
GAACTGACAAAAAACCTACCCAGTGGGATGCCTGTGCAGAAGAAGCTGCA
GCAATATCTGCATGCTGCAGAGAGAGCTACCTGCCTTGAGTTCTTTTCCC
AATCGGCTCCGGGAGGGACTCTCTGGCAACCCAGACACACCTCTGGCCCA
AATGACAAGAATTTACAAATTGAGCAATTGCAGTAAGCATAGCTCCTAAG
CACAGCTCATATTGAGGGCTTAGATCTCACCCGGATGGTGTCCCAGCTTT
CTGTGCCTGGTGAGCCAAGCAGTCCAGCCATGTGCCTATTAGGGATGAGG
ACCATGAAGATAGTGACCTCTTGGTGACTGTTCCTGGGAGCTGGCGCCAG
TGAGCAAGTAATAGCTTGCTTCCTTCACCTTATGTCTTTCTCCATAAAGA
CCCGGGGGAAGATTGTGTAGCTATTGGTCTTTTCCGGGGGAAACAAAAAC
CCCCCCCCTTTTCTAAGTTGAGCCCCCGTGACCACGAATGATGCCCATAC
CGCATTCTACCGTTTCCCTACCCAGGAACTTGCCCAAGGTCCAAACCCGT
CTCGCTTTTCCACACCGGTTCATGGTAAAAAATTGCTTTATAAAATCCCC
CCGTCCCCAAATTTAACGTGGCTATTTGAAATATCCACAACTTGTCTTTT
AATGTTAAACCACTCCCTTTCTTATAGG
|
|---|
| quality values | Open.Hide.10 10 10 13 8 8 7 9 17 3 0 0 0 3 7 8 8 10 8 8 8 10 16 14 13 8 8 8 8 8 8 15 19 27 25 16 14 12 13 14 19 19 35 36 36 36 37 37 37 40
40 40 43 48 47 47 43 50 42 42 50 50 47 47 47 47 53 33 33 31 30 28 25 19 11 9 9 9 9 9 12 12 12 22 12 12 9 8 8 8 8 10 22 33 41 50 39 44 44 53
53 50 36 36 36 36 38 38 38 36 36 33 41 30 21 15 13 13 14 15 11 11 10 11 12 17 25 25 23 22 20 23 31 36 36 33 32 30 39 36 37 37 47 47 40 42 37 48 48 50
50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 48 46 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68
57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 57 59 59 68 68 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 62 62 62 62 62 68
68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 68 68 62 62 62
62 47 59 26 39 18 14 14 14 26 15 13 26 39 44 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 62 62 62 43 39 39 43 62 62 62 62 62 62 52 43 43 27 27 43 44 62 62 62 62 62 62 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 54 57 57 57 57
57 57 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 45 45 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 43 43 31 43 43 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52
57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 48 57 57 57 57 57 57 57 59 44 57 44 48 48 57 57 43 43 43 44 44 57 57 44 43 43 43 43 43 43 43 43 44 44 44 44 43 43
43 43 43 39 37 28 23 20 21 21 15 30 23 18 18 20 19 32 31 43 43 43 42 47 48 43 48 43 40 40 43 43 48 48 48 39 36 33 25 25 34 28 30 25 30 30 37 34 37 37
32 37 37 41 41 41 39 40 35 31 31 39 39 39 39 46 40 41 33 33 33 33 33 33 43 47 43 43 48 57 57 40 34 23 15 14 15 15 21 21 11 11 11 23 25 25 28 25 28 28
32 32 43 43 43 46 43 43 46 46 40 37 37 37 24 13 13 19 19 23 30 40 37 37 37 44 37 37 37 37 37 35 17 15 9 9 9 14 11 10 10 10 19 11 11 15 24 24 34 27
24 16 16 24 26 28 20 19 12 21 12 12 12 22 19 33 25 25 25 37 37 46 46 46 48 42 38 36 38 33 37 23 21 11 11 12 22 24 12 16 13 15 17 37 37 30 27 22 18 18
10 10 10 21 10 10 10 8 8 10 10 8 8 8 6 6 8 10 11 21 22 37 30 29 12 10 10 8 8 8 16 12 15 11 10 10 10 22 10 12 8 8 8 12 15 12 9 9 9 9
10 9 9 9 6 6 6 6 8 8 17 11 11 11 18 18 14 13 11 11 10 9 11 10 12 9 9 9 9 14 22 26 26 18 10 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9
9 9 16 14 23 24 22 21 11 11 11 11 10 13 13 15 12 15 13 12 9 9 8 8 11 10 10 12 8 8 8 8 12 8 10 9 8 8 8 8 8 11 10 10 10 9 10 9 12 9
8 8 8 8 8 8 8 11 19 12 19 14 14 11 14 14 12 13 12 15 10 9 9 8 8 8 8 8 8 9 11 15 10 12 11 10 8 8 8 8 11 10 9 8 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 9 11 10 12 11 11 11 10 8 8 8 8 13 11 13 11 10 9 10 9 9 8 8 9 9 9 9 11 10 8 8 12 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 10 8 8 8 8 10 9 12 11 11 11 11 11 9 9 10 10 10 11 14 14 19 15 15 13 10 10 10 8 6 8 6 6 6 6 10 11 12 12 12 10 12 10 9 9 8 10 6 6
8 8 10 11 11 12 11 11 11 12 15 12 15 12 10 8 6 7 7 10 10 10 6 6 8 8 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 10 13 13 9 9 8 8 8 8 10 10 8 8
8 8 8 8 13 16 8 8 7 7 8 8 9 16 8 8 6 6 8 8 19 19 13 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 7 8 8 6 6 6 6 7 7 6 8 8 8 12 9 7 7 13 8 8 8 17 19 8 9 9 16 13 24 17 19 9 9 10 19 21 29 30 30 35 53 36 36 42 43 36 36 36
34 36 36 47 48 48 50 50 50 42 47 31 27 9 9 9 9 9 9 12 12 11 11 10 10 10 10 12 16 29 37 33 36 36 38 53 50 50 57 57 53 50 50 57 36 36 33 33 33 33
33 21 21 11 11 13 9 9 9 9 9 14 22 24 15 13 13 13 15 26 31 34 28 28 28 30 28 28 43 43 47 48 48 48 43 43 43 57 57 57 54 57 42 51 51 51 50 50 57 57
48 48 48 46 46 48 48 54 59 57 57 47 47 57 47 57 48 54 54 57 57 57 57 57 57 44 44 32 33 25 36 33 57 57 57 57 57 59 59 57 54 57 57 57 57 57 57 57 50 48
57 57 57 57 59 57 57 52 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 52 57 50 50 50 52 52 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 59 57 54 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 44 44 35 43 47 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62
62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 44 39 21 11 11 11 14 39 39 43
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 52 62 52 52 52 52 52 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 44 39 39 31 39
43 62 43 62 39 39 39 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 39 39 39 38 34 31 43 43 57 52 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 44
44 35 43 43 57 57 43 39 43 43 52 52 43 43 39 42 43 57 59 57 43 43 43 42 42 42 35 35 43 44 57 57 57 57 57 50 43 38 33 33 27 27 27 43 43 52 57 57 52 43
43 52 52 52 59 59 59 59 57 57 54 43 44 43 43 43 32 27 20 20 32 32 35 43 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 46 46 40 32 32 24 28 33 48 48 57 57 57 57
28 26 11 10 8 12 15 13 10 10 8 14 15 37 40 33 25 19 27 24 39 43 41 41 39 36 36 36 33 33 31 31 15 15 14 18 18 24 24 14 17 16 30 25 32 32 22 22 28 24
28 37 34 26 26 14 14 15 22 34 37 37 37 37 37 35 28 28 30 29 20 19 11 11 13 17 18 34 34 34 25 20 23 19 16 16 19 19 21 31 21 12 11 13 17 19 17 12 13 21
22 28 30 40 39 37 24 15 8 8 8 17 22 39 28 28 25 25 25 28 25 14 11 11 19 16 18 13 22 19 22 18 23 22 22 13 10 8 8 8 15 16 29 20 22 12 12 13 15 20
20 20 20 37 32 26 22 15 19 10 10 10 12 12 11 11 13 19 19 19 11 11 10 11 11 13 16 19 15 15 13 18 18 14 14 13 11 12 10 10 9 10 10 13 17 25 25 16 16 14
18 20 19 19 12 13 10 9 9 10 14 10 9 9 9 10 9 11 10 12 9 9 8 8 8 11 14 17 15 9 9 13 9 8 10 8 8 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 10 15
10 13 10 10 10 17 18 19 15 11 11 9 14 14 18 22 24 32 20 19 17 18 21 19 16 12 11 10 13 13 15 12 10 9 9 9 8 9 8 8 8 8 9 7 7 9 10 8 10 9
12 9 9 9 9 12 13 11 9 8 8 9 9 13 11 13 8 8 8 8 8 8 8 8 12 9 9 9 9 10 10 16 13 23 21 21 20 12 13 12 10 10 10 10 11 16 13 13 10 10
10 16 12 17 18 20 20 14 12 8 8 9 8 10 10 7 8 9 9 9 9 8 8 11 9 8 8 8 10 10 10 10 8 10 10 8 11 11 11 12 11 11 11 10 10 12 8 8 10 8
8 8 8 11 8 9 9 15 12 11 10 10 9 9 9 11 9 10 12 10 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 10 8 8 10 12 20 28 14 16 13 12 9 9 9 9 9 10 8
8 6 6 8 8 11 7 9 9 9 8 8 6 6 6 6 6 12 10 10 11 10 9 9 9 9 10 10 11 10 10 10 10 10 10 11 8 8 8 8 12 12 10 8 10 9 9 10 11 11
8 6 6 6 6 13 11 12 12 11 12 11 11 15 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 11 12 16 15 10 9 8 8 10 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 13 16 11 10 6 8 6 6 8 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 |
|---|
