BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-124K08.T7 (MSMg01no124_k08.b1) | MSMg01-124K08.TJ (MSMg01no124_k08.g1) |
ACC | AG333946 | AG333947 |
length | 1,302 | 1,315 |
length of high quality (start - end) | 368 (31 - 398) | 663 (80 - 742) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_k08.b1 PHD_FILE: MSMg01no124_k08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:01 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no124_k08.g1 PHD_FILE: MSMg01no124_k08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 18:36:01 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (118,838,802 - 118,839,154) | (118,999,833 - 119,000,485) |
---|
sequence | NNCCGGCTATGGGCGCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CCCTCTCTACGCAGCATGTGTGGAGGCACACCGGTGGCTCAGAGACGAGT
GTCACTGTCATTAGCCTGTGGCTCTGGCTCATTGCTTCCAGCTGTGTTTG
ATTGGATTGATAGTGTGAGGCTACAGAGAACAGTCCCCCGCAGTGAACTG
TTCCTGCCTTGCTCTCACACAGCCCTTAGGAAAAGAGACCAGAGATGGGA
ACCAGAAAGTCGTAGAAGAGGAAAACGGAACGACTTCTGAGTCTGTGAGT
TACCATTCCCATGTCACTTCTAAGCACTTCAGTGACTTCCGGTGTCCAAA
GCGGACAGATGTTTGGAAAATGGCTCCTCCCAGTAGACTTGGGAGAAGAT
TTTTAGAAATAGTACAAACTTTTCGTGTTGTTAGGATTTATTTATTTTTA
TTTTTTTTTCTCCCCCCCCCCCTTTGCCGGCATGTCTCATGTATAAAAAT
GGGACCTGTAGAGGCCAGAAGAGGCTGTTTGGTTCCCTGGAACTGGGGTT
ACAGATGGTTGTGAACCACCATATGGGTGCTGGAACTGAACCCCAGGCCT
TTCTAGGAACAGTCAGTGTTCTTAACCATTTATCCCTCTCTCCATCCCCA
GGAGTGCAAGCGTTCTAAAGAGTAATCTTAGTACTTAATGCGTGAGCTGA
TACTTTTGGCCGCAAGTATCATAAAACCCCCCTTCATGCAGCCTGAGCCA
GGCTCCTGTAGATTGACTGCTCTGGCTCTCCTTGCACTGCCCCGATGTTT
TGCTAACCCAGCAGTTCTCTTGGCTTCTCCACCCCCCATGTTGCTTCCTG
TCTGAAACCTCTCTATTTCCCTTGTCCTCCTCCCGGCGCAAAATGACACC
GAGTCCGGTCAATCTTCCCCCCTCATATCTATAAAGTAGACCCTTCCCTA
GTATCTCTCCATAACTCTTTGTTCCTGTTTAATTTTCCCACAACTGGGTT
CCTATTCCCTCCCCCCCCCCTCAACTTAACATTTTCTATTTCTACCTCCC
CCGCTATGTTTTCTCCCCCTCCTCTTAAATAATCTCGCTANTTATATTGT
CCTTATCTTTGTTTCTTACTTTTTCCCTTTTTCTCTCATTCTTCTTTTTC
ATTCCTTTACTTCCCCCCTCTTATTTTTTTCTGACATTACAATCTCCTCC
TATGATTCTACTCAATCCTCCTCTCTCACTTTTCCTTTATAATCTACCAC
TTCCATGTCTTTTTCTCCTATCTTCTCTCCTCTTCTCTTATTTTTCTCTT
TT
| CTTTTTTTAACATTGGAGCATGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTCTTAGGAGAAGTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTCTCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACTCACACACACACA
CACACACACACACACACGCTCGTGTGCCCACAAGCCGGGAGTTGTCTGGC
AGAGTGGCTAGATGATGGGACAGAACCAAGGGCAAATGTAGCTGGATTTG
GATGCAAGGACCAAGGGGCTCTTTCTACCACTGAAGCCTGCTAATTGATA
CTATAGTTGCCATCTTCCCCTCCTACACCACCCCTCTCTATTTTAACTAA
GCCTGGACTGGCATCCCCAGCAGGGCCCTGAAAAGACATTACTTCCCAGG
ACCTTTTCCTTCACTGAAGACAGTCACCACACTGACTTGCCCTGCACCTG
GCCCATCTGCCCTATTGCCCAAGCCGGCAGTCTGTAAAAGGGACAGGGAG
CCCCTAGAGCCACAGGCTCCAACTCTAGCTTTGCCATTTGCTGTGTAGCT
GTGGCCTTTCTGAGCCCTTTTCTCATCCATGGGATTGCAATATATTTTTC
CACAGAGGATGTTGCCAGGATAAAATACTAGTGGGGGCTGGGGACTTAAC
TTCAGCAAAGTAGCTCGGCGGGCACACATTCCTGGGTTTAGTCCGCACCA
CCTTATAAGCCTGGCACAGTGGCACAAGATTACAATTTTAGCATTTGGAA
GTTGCCAACCATTAGTTCAAGAAGTAGCAGCCCTCAGCGGCACAGGGTGT
TGGAGGTCAGCCTATGACACACAAGATCCTCTCTCAGACATACAAAATCA
TTGTGCTTGGGAGTTCAAATTCCCTTCGGAAGTCCAGAGACCCTAATAAA
AGTGAACCACAGAATGTAAGTGTGCCCCTGCCCCCCCATGCAGGGAAGTT
AATGCCTCCAAAGCTATCTGCCTTTGAAGGGCTCTGGGTCCCCAGGAAAC
ACACATCATTGGCCCCAGGTTGCTAACCCTCTTTTGTGTTTAAGGTTCCT
CCAATGATTAAGAAACCCTTCTCTAAATCTGCCTTCCGGTTCTTTGTGAT
TCCTTCTCCCACTCTGTTGTCTGATTGGAAGTCATTTTACATGTTTTCTG
TTTTAGCATACAATACACTCACTTCTATCTCTCTTATTCTAACTATACTT
TCCATTTTTCCCCCCTCTTTTCTTGATNCACCATTTCTTTTTTATCCTTC
TTTCCTTCATCTAGCTTTTCTGTCTCCACTAGCTTATCCTTACTTCTTCA
TTCCTCATCTTCTCA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 7 8 6 6 8 11 10 12 12 17 12 8 8 8 10 15 19 23 14 14 8 8 8 19 21 36 33 36 33 36 33 33 33 33 33 37 30 18 18 21 21 22 41
37 47 46 46 47 33 33 36 33 28 21 34 34 37 43 23 24 30 30 28 33 32 32 39 39 39 39 36 36 39 36 37 37 37 37 32 32 32 32 32 25 25 29 37 39 47 47 41 41 41
41 41 41 50 50 50 38 38 26 17 19 32 29 37 37 46 40 41 41 35 35 37 57 57 57 38 25 15 10 10 10 17 30 32 50 51 51 51 68 50 57 44 44 52 57 57 57 68 57 59
59 57 57 52 57 57 59 59 68 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 50 50 57 57 41 37 52 52 52 36 38 32 27 27 29 39 44 57 59 59 44 43 35 35 35 42 42 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 45 57 57 59 57 57 57 57 59 52 52 57 43 35 35 35 43 43 57 59 43 42 42
44 44 43 35 33 44 35 35 35 43 42 27 24 12 12 15 26 38 38 50 43 52 52 52 59 59 52 52 47 47 47 43 43 50 50 54 57 50 59 35 35 35 43 44 54 47 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 68 68 68 57 59 57 57 54 48 48 54 54 54 57 57 57 59 43 43 43 43 48 57 57 57 57 59 68 57 54 54 54 54 50 53 57 59 48
47 47 47 47 39 47 39 43 43 47 59 59 41 34 28 28 28 34 34 39 21 13 8 8 8 13 18 37 47 34 28 25 21 26 18 20 28 31 31 32 28 20 23 23 34 28 23 10 10 10
10 10 8 10 10 10 15 24 28 34 35 35 35 39 39 46 48 59 47 57 57 47 47 43 43 48 48 48 48 48 48 59 48 48 48 48 48 48 48 57 57 44 43 36 36 39 41 41 27 23
11 13 18 14 15 34 21 17 10 10 10 10 11 17 22 28 24 30 21 14 11 11 15 16 25 15 23 28 26 37 30 30 17 26 26 28 28 28 28 28 21 21 11 10 10 15 12 15 14 11
10 10 10 10 15 21 26 22 25 24 28 22 30 25 28 28 20 15 26 21 25 18 23 16 22 23 31 40 34 26 17 17 19 29 40 42 40 34 32 20 20 28 31 30 22 17 17 24 30 32
37 28 28 23 24 15 11 11 24 24 32 37 35 33 38 30 32 32 37 36 47 44 44 32 21 14 16 15 34 32 43 33 32 35 43 43 50 57 50 43 43 43 43 38 32 16 16 19 36 38
57 57 50 38 38 20 20 20 38 38 43 38 35 35 35 43 43 52 57 57 57 57 57 52 43 43 32 32 33 44 44 57 36 24 15 16 18 36 40 57 43 43 32 44 35 43 43 43 36 32
35 37 37 40 28 28 19 24 12 12 14 24 24 28 27 27 32 32 37 35 32 42 23 35 26 32 25 19 19 10 19 31 34 26 30 21 14 14 15 28 19 22 23 36 28 32 32 47 42 43
43 43 39 39 39 32 29 15 15 9 9 11 15 20 12 12 12 30 23 32 19 15 12 10 10 13 15 8 8 8 8 11 11 10 10 10 12 20 15 12 12 12 18 25 25 11 13 11 19 18
16 16 10 10 10 10 13 11 11 11 11 11 18 18 28 33 31 33 22 15 10 10 10 11 11 19 11 22 16 23 22 19 19 9 9 9 12 19 30 20 18 19 15 21 21 24 26 33 33 26
19 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 10 9 9 10 10 10 10 10 10 9 9 7 9 10 9 9 9 18 13 12 18 18 19 13 10 9 10 13 13 15 14 9 9 9 9 14 21 11
11 11 18 17 13 10 9 9 10 12 12 19 16 10 10 9 9 9 10 11 16 15 11 11 11 18 18 12 16 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 10 13 11 10 10 8 10 8 8 10
10 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 9 23 14 10 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 15 15 8 10 8 8
8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 13 12 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 9 9 10 11 11 11 10 13 13 16 10 8 10 8 10 9 9 11 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 15 19 17 15 12 11 11 15 12 16 11 9 9 8 10 8 6 8 6 6 8 8 10 8 9 9 9 9 9 11 18 17 13 12 12 15 15 13 13
8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 10 13 23 13 24 16 12 9 9 9 9 9 13 13 11 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 3 0 3 10 10 10 12 10 10 10 8
8 8 10 8 9 9 10 8 8 6 6 6 10 10 6 6 8 8 6 8 10 10 12 10 10 8 12 12 7 6 13 10 10 12 12 14 9 9 9 10 15 21 19 23 14 9 10 9 9 10
15 15 12 12 7 7 8 8 7 7 8 8 10 9 11 10 8 8 19 8 8 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9
9 9 8 10 8 8 8 8 8 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 10 10 10 8 8 10 8 8 8 7 7 9 10 8 8 8 8 8 6
7 7 6 8 6 6 8 8 7 7 8 6 8 10 15 11 10 10 8 6 6 6 6 8 8 8 11 11 12 13 10 9 9 10 10 10 7 7 6 6 8 6 9 17 16 15 12 13 11 11
12 9 | Open.Hide. 8 8 8 12 22 23 15 6 6 6 6 6 7 7 8 10 10 8 6 6 6 6 6 7 9 15 13 8 8 9 9 9 10 17 19 19 9 10 10 15 15 21 13 16 18 33 34 36 34 37
34 34 25 29 19 28 37 39 48 48 50 48 41 40 46 28 21 11 11 12 13 13 8 6 6 6 6 6 9 19 18 29 29 31 31 31 31 36 36 36 36 50 50 42 37 36 36 36 36 36
36 36 33 33 31 31 31 30 21 21 10 13 13 12 10 10 15 15 15 21 23 29 30 31 35 35 35 35 35 35 29 29 14 14 14 23 23 43 48 37 43 43 43 57 59 68 59 57 48 48
48 57 57 59 47 41 32 30 30 31 44 44 42 42 32 35 35 37 42 37 42 35 37 35 35 35 43 44 68 68 57 57 21 19 8 8 8 8 13 24 39 39 35 35 35 42 50 43 43 33
27 27 24 32 43 43 50 43 50 43 52 52 52 57 52 52 52 52 52 43 52 52 59 57 52 52 52 57 57 52 52 43 43 43 59 43 43 35 35 35 35 35 42 57 57 57 57 57 57 39
39 39 43 42 41 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 57 57 59 57 52 52 57 57 57 57 54 52 52 57 52 52 52 52 62 52 62 62 62 62 52 43 43 39 39 39
62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 62 62 52 52 52 52 52 52 52 52 62 62 62 62 62 68 62 62 45 45 45 62 62 47 47 39
39 43 44 44 52 52 52 62 39 39 17 17 17 39 39 62 62 62 39 39 39 44 43 45 45 52 47 44 43 62 52 62 62 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 52 52 43 39
15 11 11 13 39 39 29 23 23 39 39 39 39 39 43 39 62 39 39 39 43 43 43 43 39 39 39 62 62 62 62 62 62 62 52 52 43 62 41 41 62 43 43 23 23 21 43 43 62 62
62 45 39 39 11 11 11 24 12 13 13 39 39 39 39 31 35 35 43 39 62 52 52 52 43 43 35 35 43 43 62 62 62 62 62 62 62 43 43 43 27 27 21 26 26 32 17 17 23 38
43 39 43 43 43 44 43 52 52 62 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 44 26 26 43 43 43 43 35 35 35 35 43 43 43 57 43 52 52
57 52 34 34 18 28 38 44 44 52 43 43 43 43 52 52 57 59 59 59 57 52 52 52 52 57 57 57 57 43 43 21 21 15 32 32 38 38 20 20 24 32 33 52 57 57 59 52 52 52
52 44 44 42 42 33 35 35 37 43 43 43 38 43 42 42 42 29 29 29 35 32 43 32 32 17 17 18 27 24 24 11 11 11 26 24 43 43 43 42 42 37 37 32 36 35 35 32 30 30
30 32 24 15 10 10 10 20 18 16 16 12 12 13 24 28 36 35 28 28 23 31 31 41 41 37 36 34 34 36 37 43 39 39 35 35 30 33 33 29 32 20 20 28 25 25 22 17 17 29
24 24 34 34 25 18 18 18 18 20 20 32 29 25 21 19 13 17 15 21 12 15 30 30 34 30 26 18 17 24 30 33 36 36 39 37 39 26 24 15 12 12 12 11 11 11 22 18 30 22
20 16 16 10 10 10 17 17 28 28 22 21 16 11 11 20 20 32 37 40 23 25 11 11 11 11 11 11 14 11 11 18 22 20 26 14 18 18 17 13 15 12 12 12 21 19 15 14 14 14
21 12 12 9 9 9 12 18 18 21 22 12 16 10 10 10 10 12 14 18 15 15 15 15 15 13 12 10 10 10 14 16 14 12 12 10 11 6 8 6 6 8 10 11 10 10 10 13 17 11
11 11 10 8 7 8 7 10 8 11 11 15 16 16 11 9 7 7 8 8 8 8 8 8 13 10 12 12 12 10 6 8 7 7 10 7 7 7 6 12 11 10 8 8 8 8 8 8 8 14
9 9 9 12 11 9 10 10 10 11 8 11 11 11 11 9 8 8 8 8 8 8 8 10 12 10 17 17 21 19 23 28 28 25 24 11 9 8 8 8 8 10 6 10 8 8 8 12 13 10
12 9 9 10 8 8 8 10 12 24 32 24 21 16 12 8 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 10 10 11 10 9 9 9 10 10 10 8 8 10 10 8 8 10 8 9 9 9 10 9 9
9 9 9 13 9 9 9 9 9 14 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 10 10 10 8 8 8 6 6 8 12 15 10 9 10 10 8 9 10 11 11 12 13 12 8 8 8 8 8
11 8 10 8 8 10 8 9 10 9 9 11 8 8 8 8 8 10 21 16 15 8 8 8 6 6 6 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 11 15 19 12 16 11 11 9 9 12 12
12 14 12 8 6 6 6 8 8 8 7 8 7 9 7 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8
8 8 12 12 11 10 10 10 8 8 8 10 10 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 6 6 8 10 8 8 8 13 8 8 8 8 8 6 7 10 10 13 8 8 6 6 8 8 9
8 8 10 13 10 11 12 16 19 28 9 9 9 9 9 10 14 9 10 10 12 10 13 8 7 7 3 0 3 8 8 8 8 10 10 8 7 7 8 8 10 8 8 6 6 8 8 12 10 7
6 8 8 10 8 8 8 8 13 13 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 9 6 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 10 6 7 13 8 8 8 8 10 10 10
12 8 8 8 8 8 6 6 6 8 15 10 9 9 9 |