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8 9 10 8 8 8 8 8 10 10 10 8 10 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 10 10 10 9 9 10 13 15 10 17 12 12 19 19 14 11 11 10 8 8 8
10 13 12 16 11 9 9 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 13 18 12 12 9 9 10 13 9 9 12 10 9 8 6 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 8 10 17 12 12 |