BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-141K08.T7 (MSMg01no141_k08.b1) | MSMg01-141K08.TJ (MSMg01no141_k08.g1) |
ACC | AG346466 | AG346467 |
length | 1,271 | 1,293 |
length of high quality (start - end) | 261 (467 - 727) | 646 (133 - 778) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_k08.b1 PHD_FILE: MSMg01no141_k08.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:00:17 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no141_k08.g1 PHD_FILE: MSMg01no141_k08.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:00:17 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CATTCCCTGNNNNNACATTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATC
CGCGGAATTCTAGGTCCTAGTAGAAACCAATCAGGTCTCCCNAAANNNGA
ANAGNGNNNGNANNCCNACTTTAAAGCTCCCCTNGGNNNNAANAAAAAGA
AGNCNNNCNNNANAGGGAGGGAGANGAAGGCAGAGACNCAGGGCGGCNCA
AAGGGNNGAGAANAAGGGACNANAGAGGGNNCAGCCNNNAGGNNANANAC
NANAAGGNNCAGGAAGCANCCCAGAAAAGAGGNCAGAAAAAAAAGGGGAG
AGCNGAAANCAGAGAGAAGGANANCGGCCANNCAGAAACAGAACAGNCNA
GAAGCCAANCAACAGGAACNGGNNGGCAAGGAGAGGAAGGGACNNNCCAA
NANCACGGCTCTTTTTTGGGATTTTATTTCTTAGTCTCTAAGTGTTTTAT
TTAGGTTAGCCTAACCATGATTCTGAAGGAAAAACATAACCATTGCAATC
TTAAATTCACAACTGCTATGGTTAGCTGTATTGGGTCTATACAAGACTGA
CCCTGTTAATAATCAGTCATATATGAGGAGGGCTCACAGGATCCTCCTTC
TCCCTGCAAAGCTATTGATATTGAACCAATCTAAGACAGGAAGATCTTTA
CTTGTGCACCCACCAGGGAGCTCACTAAGCTCCACTGGATAATTTCAAGT
CCATGGTCACACAAATGTCCTCGGCTAAACTCAGTGGGTCAAAACAGCAA
ATAAAAACATATGAATATGAGAAAAAAATATGTGAGATCCCTTATTGTTG
GATATTAGAAGTTTGTGAGCTTCCTGAATTGAGTTTCAGAAACTCAAATT
GGGTTCTCTGGAAGAGCAGCACTCTTTACTATTCAGCCAACTCTTTTTTC
CAGGTAATTTATTACAATACAAGTTCCAATGGAAAACCAGGTAAGTTCCT
ATGGTTAATCAACCGGGTTTCCTGGAATTATAGAAGTATGTATATTAGAA
ATGAATTAACTTTTTCTTAATGGGCTTAAGTTTATAGGTATGACCTGTTT
ATTTTGTTTCTCNCTGATACTTAATTGGAAACTTACTCCTCTGAATTCTT
TTCCTCGCCTCGGGGATCTAACGGGCTTTACTTTTCTTTATATTCACGGA
AATGGTTTTATTTTTCTAATATTATAAATTATTCTATAACTGTGGTTTAT
CAATTGGTTAATGTTATTTTTTTTTACTATGAAAGATTGGTTCANCTATC
CTTCTCGGGTATATATGGGCA
| NCCATCCCTTTNTNTTACATGGNATGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTATAAGCATCTAAAATGGA
GACCCACAGGGGATTAAGCCCCCTATAAGAAACATGTTAAATATGAAGGT
CAATATAAAAACTGCATTAGTAAGTTTTTTGTAGACAGATGACTTTTTCA
AAGCACAAATAGGATTGTAAGGTAGAGAATTTAATGCATTGAAGTAAAAG
GTATAAATCAGGAATACAATACATGGAACCTCACAAGCAAAGTGCCACCC
TTTGAAAACATAAAGTATTAAGGGTGAAGTGCCCAGTGTGAGTGATGTAA
TATTATTTCAGTGTTTCCTAAATCAGTCTCTGGAGTAACTACCAGTATAC
TTTCACTATATTGATATTTCTTTATCTGGAGTTCTTGAGATCAGAAATAC
TTTGGATTTCAAAGTTTTTAGTTTGGAACATTTGCATACATATGAGATGA
CTTGAGGATAAGACCCAAGTACAAATATGAAATGGATTATATTTCACATG
TGCCTTATAAATGGAGCCTGGAGATAAGTTTATATGCTATTTTAGTTTGC
CTATGTTTTGACTGCAGCTCAACATATGAAATCAAGTGTGGGATTTTCTA
CTTAGTATATAATGGTGCTACCAAATATGTTGGATTTTGTACCATTTTGG
AGTTACATTTTCAACAACTACAATGACAAAAGCCATAGTGATAACGGCAA
CAACAACTACAACAACAACAGTGCCTAGCTTTAAAACCCCTAGGATAGCT
GTTCTTAACCTGTGTGTTTTGACCACATAGAGGTGGCATATCAGATATCC
TGCAAGTCAGAAATTAAAATTATGATTAATAACTATCGTCAAATTACCGT
TTATCATGAAAGTTACCAAAATATTTTTTGTGTTTATGTTTGCCACTACC
ATGAGGAACTTGTATTTAATGGGTTGTCTCCTTCCATATGTTTGTAAAAC
TCTTTTCTTTACGTTAATTTCTTATTATATGCTATTCTATTCCTCTTTGA
TCTCTTATTAAGGTCCCTTATGTCGTTTTAGATTTACTATTACTTTTCCT
TGTTTTTTTCTTATTATTTCCCACTCTTTTTTTGTTTATATCCTACTTCT
ATCTTTTCTATTCTTTATTATTGTGCNTTTCCTTTTCTTATTTAATCTAC
TTACTATATTTTTTTCTACTCTCTCTTTCTGTTATATTTCCCTTACTTAC
TTTGTCTTTCTTTTCCTATGATTCTCTCTCTTAATTTATATAT
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 11 11 11 9 9 3 0 0 0 0 0 3 6 7 7 7 7 8 9 10 11 8 8 8 8 8 8 15 15 8 8 8 10 15 10 24 24 37 33 33 36 36 36 36 42 48 48
47 39 39 40 40 43 23 22 18 18 18 24 24 35 36 31 31 31 30 28 27 23 21 11 9 7 7 7 7 7 9 9 9 10 10 10 10 10 9 10 3 0 3 23 3 0 0 0 3 10
3 0 3 3 0 3 0 0 0 3 0 3 0 0 3 3 0 3 9 12 12 11 11 10 10 8 8 8 8 8 11 18 3 0 3 3 0 0 0 0 3 3 0 3 29 29 59 59 59 27
25 3 0 3 0 0 0 3 0 0 0 3 0 3 7 7 9 9 9 9 9 14 27 3 0 3 14 7 9 9 9 22 44 44 27 27 3 0 3 25 12 9 8 7 7 7 3 0 3 23
19 18 7 7 3 0 0 3 29 29 29 3 0 3 14 7 9 7 7 3 0 3 0 3 17 14 7 7 3 0 0 3 27 27 27 3 0 0 0 3 7 3 0 0 3 0 3 0 3 3
0 3 0 3 27 29 3 0 0 3 27 27 59 59 59 27 27 3 0 3 27 27 59 59 59 59 59 59 59 27 27 3 0 3 27 27 44 59 59 59 59 24 24 9 9 9 9 9 19 24
27 27 3 0 3 27 27 3 0 3 25 27 44 59 59 59 59 59 29 29 3 0 3 0 3 7 7 7 14 3 0 0 3 14 7 9 7 6 6 6 6 6 6 7 10 3 0 3 0 3
27 27 44 47 44 23 23 3 0 3 27 27 59 47 47 39 25 17 3 0 3 3 0 0 3 7 7 19 44 39 41 42 50 42 47 59 23 24 9 9 7 7 3 0 0 0 3 27 27 3
0 3 0 3 14 7 9 6 6 6 9 9 16 15 14 12 9 9 9 9 18 25 41 47 59 59 59 59 59 59 59 59 43 39 39 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 34 30 16 12 11 11 11 11 22 22 12 12 12 12 12 18 28 34 33 37 30 24 24 14 15 18 24 28 43 43 43 43 43 44 44 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 43 47
57 59 57 57 54 48 57 48 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 52 52 52 59 59 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 57 59 43 35 35 43 43 68 68 68 68 59 59 50 50 48 57 57 57 57 54 54 54 54 41 34 19 24 19 18 14 32 32 57 57 57 57 32 40 25 25 25 44 44 57 48 48
48 48 48 47 47 47 50 57 59 57 68 68 50 53 48 48 41 41 41 41 36 42 37 36 33 43 43 39 36 36 44 43 47 42 42 47 47 48 39 29 22 23 23 22 26 43 27 23 13 13
14 23 26 30 26 17 17 17 24 24 30 33 33 34 24 15 10 10 10 21 25 47 37 28 28 16 15 11 11 10 10 22 22 19 9 9 6 6 8 8 11 19 10 9 10 8 8 10 8 9
9 9 9 9 10 10 10 15 15 8 21 21 19 14 21 21 31 31 25 18 18 24 25 21 19 9 9 10 13 16 30 30 34 34 21 21 8 11 8 8 8 8 10 8 8 6 6 7 10 9
6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 9 14 16 11 11 10 11 11 12 12 17 8 8 8 8 8 11 18 15 15 12 19 14 8 8 8 9 10 12 7 6 6 6 6 6 6 6 8 8
8 7 7 10 9 16 15 15 15 14 12 21 19 24 18 14 16 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 12 12 20 11 11 11 23 12 10 10 15 10 12 10 11 11 11 10 10 10
10 9 9 10 11 8 8 8 9 8 8 11 11 13 10 12 9 10 10 13 12 9 9 9 9 9 10 12 10 9 9 10 10 8 8 9 10 8 8 6 6 6 8 8 10 9 9 10 12 9
9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 23 28 10 10 10 8 8 8 13 19 10 8 8 6 6 8 8 6 8 6 6 6 6 8 8 12 12 12 9 12 10 10 11
11 11 10 9 10 10 17 13 15 9 9 10 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 10 10 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8
9 9 9 9 9 9 8 8 8 8 8 3 0 3 8 8 7 7 8 8 10 10 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 11 11 10 10 11 11 11 14 12 14 10 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 18 13 11 8 8 8 8 6 6 8 8 6 9 9 9 9 8 8 6 6 10 15 8 6 6 11 10 8 8 8 8 8 8 10 12 8 10 10
8 8 6 6 8 10 8 10 8 9 15 19 16 18 11 10 8 8 6 7 10 12 8 7 8 8 11 9 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 9 9
9 9 8 8 7 6 8 8 8 10 10 9 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 6 8 8 8 8 7 6 8 10 10 17 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 3 0 3 8 6 7 8
6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 7 | Open.Hide. 0 3 9 9 8 8 8 6 8 17 3 0 3 0 3 8 6 7 8 8 8 3 0 3 6 6 8 6 6 6 6 11 9 12 13 8 8 9 8 11 10 16 16 15 8 9 9 17 13 15
8 10 19 26 35 35 36 36 36 37 34 35 34 38 38 47 53 50 50 50 50 59 47 27 27 9 6 6 6 6 7 6 9 9 12 10 10 8 8 6 6 8 8 13 21 41 50 50 50 44
53 53 53 53 57 59 57 53 53 44 44 50 30 28 27 33 22 19 8 8 8 9 8 8 9 10 12 15 15 18 19 19 22 21 21 31 32 38 36 42 24 22 22 25 33 37 43 44 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 48 48 48 43 48 50 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 68 57 57 57 57 57 46 57 44 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 57 59
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 59 59 57 57 59 59 54 54 47 57 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 54 54 54 57 48 48 48 57 48 50 47 50 50 50 57 57 59 59
59 59 57 50 50 50 50 50 59 59 36 34 20 13 9 9 9 12 10 14 18 31 31 59 59 59 59 50 57 57 57 57 57 59 57 50 50 50 50 50 48 57 48 48 48 43 43 48 48 48
57 48 57 48 48 50 50 44 32 23 20 20 20 20 21 24 41 44 59 57 57 59 57 57 42 42 30 42 42 47 47 57 59 57 54 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 43 33 15 15 15 30 42 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 47 43 43 43 44 44 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68
68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 54 54 54 54 57 57 59 54 59 59 59 59 57 57 57 43 43 43 57 57 57 59 59 59 59
59 57 53 47 41 44 39 37 41 47 44 39 39 34 32 43 41 59 59 59 59 46 48 48 59 59 59 59 59 57 48 48 48 57 57 59 59 59 53 48 48 41 37 33 30 29 29 28 23 31
32 32 33 33 33 33 47 42 43 43 39 37 31 34 29 25 14 14 13 21 16 25 30 37 34 34 23 23 23 34 32 35 25 21 24 24 28 28 24 20 20 24 24 24 37 37 43 39 39 39
39 37 24 21 8 8 6 6 8 8 24 28 35 35 36 37 39 37 32 30 30 37 37 43 34 30 16 16 22 22 21 14 10 10 10 12 15 9 10 10 19 17 19 19 10 10 10 10 10 11
22 21 14 14 9 10 9 15 20 22 18 12 12 12 16 21 37 37 37 33 47 19 15 8 8 8 10 10 8 11 11 19 21 21 17 18 13 16 15 24 18 15 15 15 10 19 10 12 8 8
8 8 8 9 9 10 13 8 8 8 8 8 11 13 8 8 8 9 9 10 10 11 12 19 21 16 16 12 12 12 9 9 11 12 16 10 15 10 6 6 8 7 9 9 8 8 9 10 10 8
10 8 8 8 8 11 9 18 16 21 15 10 9 10 10 8 8 8 8 15 12 11 9 9 11 13 15 10 13 11 12 10 12 8 8 8 8 8 9 9 17 13 13 9 9 9 9 9 10 9
8 8 11 10 11 10 18 13 9 11 9 9 10 8 8 7 8 8 8 8 8 6 8 8 11 7 6 8 6 9 9 13 10 8 8 6 6 8 8 8 10 10 8 8 9 9 9 8 8 8
8 8 8 8 9 10 12 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 12 12 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 9 8 8 8 8 11 6 6 6 6 8 8 14 12 10 10
9 8 8 10 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 9 9 7 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 13 10 10 10 9
9 9 9 9 9 11 14 13 10 9 9 9 9 9 10 14 15 15 13 10 10 8 9 10 10 12 12 14 14 13 17 12 11 11 10 17 9 14 9 9 9 8 8 8 6 6 10 8 10 10
10 10 10 10 14 12 8 8 6 6 8 10 18 10 8 7 6 10 10 8 9 9 9 9 9 3 0 3 10 7 7 7 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 9 9 9 9 13 8 8 8
10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 21 11 11 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 7 8 6 6 8 8 10 12 11 11 12
12 10 8 6 6 7 7 13 12 9 9 10 13 10 10 8 8 8 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 8 8 8 10 8 9 10 11 8 8 8 8 8 |