BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161A04.T7 (MSMg01no161_a04.b1) | MSMg01-161A04.TJ (MSMg01no161_a04.g1) |
ACC | AG360526 | AG360527 |
length | 1,213 | 1,212 |
length of high quality (start - end) | 426 (29 - 454) | 382 (69 - 450) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_a04.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_a04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:08 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_a04.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_a04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:08 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (30,822,018 - 30,822,397) | (30,989,327 - 30,989,706) |
---|
sequence | NNNCCGCATTGGGCCTATAGACTCACTAAGGGAGAGGATCCGCGGAATTC
TCTCCCCTTTCTCCACTCCTTTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCT
CTCTCTCTGAAGTCTCTCCTTGACCATAATTACCATCCTCCTGTCTCAGT
CTCCTAAATATGGACACTGCCGGCACATGCTACCAGGCCTGGGTTAAGAG
TTCTATCTTACAATTCCTACTAACAAATGATATTGGAAATCTGTTACTGT
TCATAGAGCCACAATCAGAGTGGTAAGAAAAAGAAGGAGTTGTCTGAGCC
CAGGGAGAGGTGGAGCCATGGGGGTCGGGCATCCAACAGGGATGTCAGTC
ATAAAGAAGTGTAGCTGCATATGGCAGAAGCAGAGGTGAAAGCAGAGATT
GTGTGGGAGTGCTGAAGACCACACCTTCCTTCTTCTCTCTCTCCCCCTGC
CTTTTTTCTCCCCCCCCAATTTTTGGTATTTTCATGAGCAAGAATACAAA
TCCAGGTCTTTGTTCCTCTTTCTCTTCTTGCCCCTAAGAGCTTCATTTCT
ACTGTCCCTGAAATCGAGGAAGATTAGCATAGATCAATTGTCCAGTCTGC
CATGATGCTAAAGCTTCCTGTCACTAATCGGGCAGAGGGTCATGGGCCTA
GAATTCCGGTACTCAATCCACAGAAGATTGTAAGTTTAAGGTCAGCCTGG
ACAACTTTACATGACTATTGTTTCAAAATAAAAATCTTAACAACAAAAAA
AGAAGCAAGATAGTTTAGCAGTTTAAGAGATGTATTGTTTGTGCAGAGGA
CCTGGACTTGGCTCCCAACACCAACACTGGGTCCCACATAACCATCTGTA
ACTCTAGTTGCAGGGGATCTAAAGTCCTCTTCTGACTTCCACTGGGATAC
CCCCACACACCACCTCTCTCTCTCTTCCCTTTTTTATATTTTTATATCAT
AAATTATAATTGTTAATGTGTATAGCATTTTTTTCTTCTTTTTTTGGAAT
GTATAGAAATATCCTCAAATATTATATATTTATTCGTTTTTTTGTGTACG
TGTATTATTCTCTTTTTTCTTGAAAACCTTGTATATTAACCTCCCTTTCA
ACTCACTTGTAAAACAATACCCCTTATCATATGAATTGTCCCTTCCTACA
TCTTTTTTTTCTAATTGCATCATTCTCTCGTTTTTCCTTCTCTTTTTATA
ATTTAATCTCTAT
| NNNAAGACAGTGAGCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCTGAGCCAAATTAATGAAATGGGATTTCT
TATTAAGAATGAATTATTAAGTAAGTGGAGGCACTGGCTAGGAAAGCAGT
TGATGCAGCTTGTTTTCAAAGCCTTGAAAGTGCTACCACATGTGTGCATA
GATCACAGGGCCTGCTGAAGTGCCAGTGTGTGGGTGGGGCATTCATTTTC
TTTCGTAGAGCATTCCAGTTCACAGGATATCAGAAGTGCTGACTTGGCAG
TGAAGTCCCATTTGTAACATGGTAGTTTAGGAAGCAGATTGATTTATGTG
TTGAAGTAATGGGTCGAGGCGCTGACGGTGCTTAAGAAAATGGCGAGCAC
ATTAAATAGCAGCATTTCTAAGGAAAGAAGCACAGACATCATACAGCATT
TTTTTTCCCCCCCCCACTGAGGTCGGGTATGTTTGATTAAAAGGATCCTA
CATGTGGCCCACAGAGGCCTTTTATATTTCAGAGGATACTGTCTTGAGAG
TCTCTCATGACCACAAGGATTAATCTTTCTGAACTCAGAAGTGAATCACT
GTATTCTATTAGCTGTCTGGATTGATTCCAGTTACGCTCTTTCTTGGTGG
TAACTGATGTGAGATCTGGCTGTTTCGCTCTCCTTCCTGTTGCTTTAACC
TCTGATACTTTAGACTCTTTAGGGAAGATAGCACTGACCATCTCACTGCA
GAAATCAAATGCACTTACACTGATGTATTGACCTCCGCGGTTGACCCATT
AACTGAGCATTTATCCAGTTGAACCTCTTGTGGTCTTTTAGCCAGCAACC
ATAATGAGTAACATGTGTAACATACTCTTGTTTGAAATATGCCCTAAAAC
CTACCCCTTTCATGTTTTTGTTTTATTGGTTTTTTCATAACTATTTATAC
CTTTTTTATCTTTGTTTATTCTTAATCATTTTAAGTCTCATTCTTTTTTC
CCCCCCCTATTTTCTATTGTAATCTATATAAATTACATATTCCTTACTCT
CCTTTTCTTTATTAATACTTTCTCACTTTTTTGTTATCATTATCTTTCCT
TTCTATTCTTATTACTTTTCTATCATTATTTTTTCCTTTTATCTTATCTT
CTAGTCTTCTTTATAAATTATCTTTATATTATAATNTATTCTCTCTCTAT
CTTTTCTTTATA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 15 30 28 19 15 8 8 8 15 21 47 37 37 37 36 42 48 48 48 53 48 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 68 25 25 10 13 15 24 15 15 12 24 24 35 37 42 48 50 51 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 51 51 51 51 51 51 51 68 68 68
68 68 68 68 57 57 44 43 43 32 30 30 35 42 42 50 50 50 50 50 50 50 68 51 57 50 43 52 37 37 37 50 50 50 51 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 43 43 39 43 43 43 43 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 59 59 57 59 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 48 48 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 54 54 54 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 43 34 24 16 12 11 11 11
11 11 11 9 12 12 18 28 34 42 50 59 59 59 59 50 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 25 16 11
11 11 11 13 16 15 16 15 15 15 27 21 22 11 10 8 8 8 8 21 30 36 59 59 59 59 48 48 59 59 59 47 41 41 25 25 11 11 9 11 9 10 10 10 10 11 13 15 23 20
24 30 30 37 59 59 59 59 48 48 50 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 57 39 39 28 32 28 35 39 47 47 59 59 59 59 59
59 59 59 47 47 47 59 44 44 44 41 41 34 34 25 25 25 34 34 48 37 37 28 28 28 28 30 43 59 39 40 43 39 44 44 50 50 48 57 48 48 48 48 57 57 57 48 57 48 48
48 48 48 48 48 46 43 40 39 37 47 47 39 32 28 28 32 32 37 47 47 46 46 48 59 59 59 57 48 48 59 59 43 29 29 17 22 22 41 34 41 43 41 37 37 43 59 43 59 41
37 37 37 37 47 47 48 59 57 57 57 57 57 48 48 59 48 47 47 43 43 36 32 32 24 24 11 22 17 23 23 30 35 35 36 36 33 33 37 46 46 41 41 41 41 36 37 43 31 31
35 35 31 30 39 39 33 33 33 37 37 37 43 34 39 30 33 33 59 47 57 57 57 48 48 48 57 48 59 59 59 50 39 39 35 37 37 25 21 12 12 12 12 12 12 25 24 37 37 39
39 47 47 39 39 39 39 39 46 41 39 37 43 34 34 34 28 28 28 36 27 30 19 22 15 19 24 17 17 17 25 25 20 20 13 23 10 8 8 10 10 17 17 32 21 21 12 18 18 17
17 17 23 14 14 10 11 10 18 11 8 8 8 8 9 15 30 37 37 37 31 31 31 22 28 28 28 32 22 18 20 20 28 30 30 18 12 8 8 8 13 12 20 20 20 23 18 18 12 12
8 8 16 15 15 10 11 22 21 28 17 16 10 10 11 11 12 10 10 10 10 9 9 15 14 13 15 12 10 15 15 12 12 15 10 9 9 19 19 10 10 10 11 9 9 8 10 8 8 8
8 8 9 9 16 11 12 14 12 8 8 8 8 8 12 10 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 11 8 22 22 22 9 9 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 14 13 12 11 10
9 9 9 8 10 10 10 10 12 12 10 11 11 9 9 11 10 8 8 8 8 10 8 8 8 7 7 17 16 20 12 18 10 10 7 8 8 8 8 9 14 16 15 12 9 10 12 10 11 10
8 8 8 6 6 6 6 8 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 13 16 18 15 10 7 8 8 12 12 10 10 10
9 8 10 6 6 8 8 8 9 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 10 8 9 10 8 10 10 8 8 6 6 6 8 10 13 13 10 10 10
6 6 8 10 10 12 12 11 9 9 11 13 11 9 9 8 8 8 8 8 10 18 13 11 10 10 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 9 7 10 10 15 10 13 8 8 8 6 6
8 8 8 9 9 13 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 13 12 12 13 9 8 8 8 7 6 6 6 6 8 7 12 11 11 9 9 11 8 8 8 8 8 8 10 16 10 10 10 10
8 12 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 8 10 7 7 7 9 15 7 8 8 15 9 8 9 8 11 12 19 19 19 9 9 10 21 21 31 24 28 30 23 21 12 12 14 26 21 53 53
53 50 57 50 57 57 57 68 68 57 59 59 43 26 28 24 35 39 47 59 48 48 42 47 39 48 48 50 50 50 50 68 57 57 57 57 57 44 43 42 42 35 33 42 42 44 40 48 48 57
57 68 68 48 48 37 37 37 44 44 57 57 57 68 68 68 68 68 50 50 50 50 38 38 28 27 27 29 33 43 43 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 57 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 43 43 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52
52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 59 59 59 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 43 43 39 43 43 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 44 27 27 27 44 44 54 57 59 57 59 54 54 50 59 43 59 59 59 59
57 57 59 57 54 54 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 44 43 47 47 48 46 46 57 57 47 47 47 48 48 47 47 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59
59 54 57 59 59 59 59 48 47 47 43 59 46 46 43 43 43 59 59 57 48 48 48 48 48 48 43 48 48 48 57 57 59 59 48 48 48 44 44 43 43 43 41 34 28 19 15 12 12 12
12 12 29 25 41 39 47 47 47 48 59 59 48 47 47 59 59 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 50 50 50 57 57 53 59 59 59 59 59 59 30 26 17 15 12 11
12 12 17 14 15 15 16 16 23 28 29 17 8 8 6 6 6 8 17 21 36 59 59 59 59 48 48 43 47 47 47 47 47 25 23 12 12 12 12 20 15 11 10 9 10 10 13 26 28 30
36 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 48 57 57 59 59 59 59 57 57 54 54 54 54 59 41 41 23 23 23 36 36 37 39 39 44 47 48 48 48 59 43 43 30 30 30 39
37 37 40 37 43 43 43 43 57 57 57 43 43 39 47 43 47 47 50 50 47 43 43 37 39 39 59 47 47 43 41 37 37 37 34 32 32 28 35 47 37 46 46 47 59 59 40 40 37 43
37 48 48 59 59 48 48 48 40 40 39 41 43 47 43 48 48 48 48 59 48 48 43 47 39 39 39 39 35 47 47 48 39 39 30 30 30 37 37 46 59 59 47 41 39 27 26 32 29 29
37 37 37 33 33 33 37 37 37 37 37 30 30 30 37 37 43 36 36 41 25 27 12 12 11 17 17 20 24 22 37 43 41 41 59 59 34 34 28 22 22 30 31 37 39 47 47 39 30 30
30 37 37 39 36 36 36 43 43 35 34 20 17 17 30 30 48 48 43 43 35 35 35 42 25 22 11 12 21 23 23 28 33 33 34 39 39 39 39 39 35 37 37 37 28 28 29 26 24 14
12 12 15 19 19 17 10 10 10 19 23 48 43 43 37 32 25 15 13 13 21 28 19 19 12 10 10 12 26 22 23 22 28 23 22 21 21 11 8 8 6 8 8 12 12 27 24 28 22 19
12 12 14 16 19 11 11 11 10 10 13 15 12 10 9 9 14 12 9 9 8 15 8 8 8 8 10 8 9 10 10 8 8 8 10 9 9 8 11 8 10 10 10 15 17 12 13 13 21 19
15 15 14 14 16 21 9 8 8 8 8 8 10 11 13 13 10 10 9 9 10 10 12 9 13 9 9 9 16 8 8 8 8 12 8 8 12 12 12 15 12 11 10 8 8 8 8 11 8 8
8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 11 8 8 8 8 8 10 11 10 12 11 11 11 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8
10 12 15 13 13 8 9 8 10 6 6 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 15 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 15 12 11 10 10 10 9 10 10
9 10 12 10 11 8 7 8 8 11 11 8 10 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 9 8 8 6 6 8 8
8 10 11 11 16 15 16 8 11 8 8 8 8 10 8 8 11 9 8 10 8 8 8 9 9 9 9 8 8 12 12 9 9 6 8 8 8 8 8 9 9 11 12 21 8 8 6 6 6 9
13 10 10 10 10 8 10 12 12 8 8 8 8 8 8 8 9 14 10 10 10 9 9 10 10 11 14 16 16 16 11 12 16 8 8 8 8 8 8 8 11 10 12 14 10 15 13 11 12 11
11 9 9 9 9 13 9 8 8 8 8 8 9 10 8 8 6 6 6 7 8 10 10 9 8 8 9 8 8 12 10 8 8 9 3 0 3 6 6 8 8 8 15 14 9 9 10 9 8 8
6 6 10 10 8 6 6 10 6 6 6 6 |