BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-161F05.T7 (MSMg01no161_f05.b1) | MSMg01-161F05.TJ (MSMg01no161_f05.g1) |
ACC | AG360757 | AG360758 |
length | 1,251 | 1,258 |
length of high quality (start - end) | 420 (29 - 448) | 380 (72 - 451) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_f05.b1 PHD_FILE: MSMg01no161_f05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:48 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no161_f05.g1 PHD_FILE: MSMg01no161_f05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:27:48 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNNAAACACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGATCCGCGGAATT
CTCAGAATTTCCCGAACCATTCAGATCTGTCAAAGATGATTATATGCAGT
TTGTTTGTGCTTATTTTGCAAAAACTTGCCTCTGTGGTATATTATTAATA
AACCATGGCCTCTTGGCATACACCTCTATATTACGTTGATATGGCTCTGA
AATCTGGTTGCCCATCATTGACTAACTGGCCCTCATAGCACACCTTATTC
TCAAATCAGACCAAAGCCACAATATATATATTGAATATGCTTCTTCATAT
TGATTAATTTCTACCACCTGCGCTTGCTAGAGGTGAGGCTGCACACTTGC
TGAAATCAGACTGTGAGGCATTGACTGACCTGCTTGAAAAACAAAGCTTT
TTTTCTGAAAAGCAACAGGATAAAAGCTTCTTTGTGGAAGCCCAGGTACT
TTTTTTTCCCCCCCCCCCAGNAANAACCAAGCTCAGGCTCAAAAAAAGCG
GTGTGGTGGAGCTGGCTTTGAGAATTAGCAGAAAGGCCAGATATTCTCTG
GAAGTCAAGGCTGTGCTCCAAATTAACTTTGCTAGGTAATTAAGATTTTT
AGCAATCTTCGATAGGAATCTCTTATATTGGAATTATTACTAGACCAGTC
CAAGATTGAGTTAGAATAACTGGTCACATTGAAGAAAAGAGAAGAATCAT
TACAGCTCTTTCTTATGACTAATCTTTCTAACTCAGATTCCACAGTCTTT
AACGTTCTATGTCCCATAAAATTAAAAAGCTTGAATCAAGGCACCTTAGC
TTGTCCAATCTGGGACAGAGGCAAGCAAAGGTGGGTCAAAACATATACCC
AATTCAGCTTTTCTGTCACCACTGTCAGGGCACTCAGCGAACTCACAGGT
CAACTTGGTCTACGAATCCTTCTGACAGTTGTCTGCTTCTACAAAATTCT
GTTGGAAAGAACCTAAATTTTCTCCTTTTCCCCATAAGGTAATTGTTCTT
GATTCATCCCTATTTCCATTAATAAAATCCTTTTTTTCTCCCGCAAAACT
TAATTATGTCCATTTTTCTAAAACTATAAGGCTTTTTATAAAATTTTTTG
TCATTCCCATTTCTAAATTTTTATAAATAAAAATAGATTTAACTAATGGT
GCGGGGGTATATAATCTCCCCCTTCTTTGTTTTTAGAATAATTAAAATAA
ATACTTTCTCTTACACTTTTAAATTTTTACAACACCCCTCCCATCTACGT
T
| NNTTTTAGAAGTGAGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTAATAGAGGACATAGGAGGTGCCTACTGA
AGGTTAGTAGACTGAGCCAGGAACTGTGAAGAATTTTAAAGTAGAGAGAA
AAGTAAAAGCAAAAGTCATAGTATATAAAATAGCCCAGAAATGTGAAATC
TCTTATTAAATTAGAAAACAAGGCACATAGTTCATTAGAAATAGCAGTCT
ATAATTGTGGGAGGAACATCAGATGGACTATGACATCTGTGAGGATTTGG
AATTTTAAAAACTGAATTTATTGCAAAAGTATCTGGATGATTTTTTTTTC
TATCTAAGTAAAGAACTTTGAGGAGAAACATGTGCCAAAGAATGTTGTAT
AATGTTCCTCTGGAGCTGTGGACTGGAGGTCTAAAGGAGAAACAAACTAG
GTTTTTTTTCCCCCCCCCCCAAGAAAAGCAAACCACCTCAAAAAAAAGGA
CCTATGGGTATAGGTGAGGAAATTAATTCTTGGGAAAATTCCCCTAGGAC
ATGATTGATAGGACACTTTGTGCATCATTTCAACAAACATAGCTGACTTT
CTGAAACTTGATTTTACTTTATTTAAAAAAGAAATCTGTTATTTTTTTCT
CCATAAGTGATTATACATTTTTTCCTATTTGTTGAATTCTTTGTAATTCA
CTGAACTCATTGAATCAGGAAAATCATCAGAGTCTCAAGAATATCTGTGG
ATTCCTTCCAAGATCAAGAAATTAATATCATCTGTTGAACTCATGCCATT
GCAGCATGTTCTTATCTTGCAGTTCTGGGAAAATGCCAAAAGCTGGATTA
TGGGTGACAGCCAGTGAGCTTGGCATAGAGACAGAGTAGGGAGCTATCAA
GACTGTTTGGTTTTCACAGAATAGCTCTTGATCTTGGTCTCCTGCCAGGA
TGTGGACCTGATTGTTAATGGCCATATGTTGTTTCCCAATAAAAACTCCC
TTATTTTTTTTGTCTTGAACCATTCTTTGTATAATAAAAAAATTTTGGTT
CTGGACAGCCTAATCAAAATTGTCTCTGGTTTTCTTTACCTCCCGGTTTC
TTTTTTTTTTAACACCNATTTTATTGCCCCTTTTTTCCTTCTGTTTTATC
CCAAGTGTTTTGTGGGTTAATTTCCATACATGATCTCTTTGTGGTTCCTT
CTTCTTTATCTTCTTTTTTTATNTATTTAGCTTCATTATATTATTCACTC
TATCTTGC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 9 9 10 10 16 16 12 8 8 8 8 8 9 13 15 9 8 8 12 14 18 22 21 36 36 36 36 33 30 28 28 28 28 33 41 44 44 37 32 32 37 41
37 37 33 33 33 33 48 53 53 57 59 57 57 53 53 26 26 12 12 12 18 16 12 15 24 41 43 57 43 43 43 47 68 68 68 68 68 68 53 48 46 41 39 39 39 37 37 42 43 43
43 43 43 57 43 43 21 12 9 9 9 19 19 42 47 47 43 43 48 48 50 50 41 27 28 19 18 12 11 13 25 28 33 33 33 31 31 41 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53
53 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 68 68 68 68 68 68 48 44 28 26 14 14 15 32 41 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 46 43 43 43 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 57 59 59 59 59 59 59 59 53 50 50 50 41 41 39 17 17 10 10 10
10 11 11 12 17 18 30 30 41 41 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 31 29 12 12 12 12
25 19 24 24 21 14 14 11 9 9 9 10 18 17 29 21 13 11 9 3 0 3 3 0 3 25 25 34 32 21 18 14 21 21 11 11 9 9 11 10 9 10 10 11 10 9 11 11 12 12
21 23 37 41 39 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 53 53 50 50 50 53 53 57 57 59 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 59 59 68 68 59 59 68
68 68 68 57 57 48 48 48 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 59 59 59 59 57
54 48 48 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 48 48 47 47 47 47 47 41 59 59 59 47 47 47 39 39 37 37 39 39 59 59 59 59 50 50 44 44 40 40 22 27 12 11 11 23 23
47 48 43 43 43 43 39 39 39 48 41 39 36 36 35 43 39 37 37 41 41 40 47 36 36 36 43 34 34 34 24 24 28 28 41 41 44 44 44 47 41 41 41 46 46 47 59 48 48 48
59 59 48 57 57 48 47 47 47 48 50 57 57 57 48 40 39 39 39 39 43 57 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 41 37 22 22 12 19 19 34 32 37 37 39 39 37 43 48 48 53
57 59 57 50 50 50 48 48 48 48 47 47 47 47 44 32 18 9 9 9 9 9 16 32 32 37 41 41 40 39 37 39 37 31 31 34 37 37 37 37 37 37 41 37 37 37 23 18 10 10
13 21 18 18 19 22 24 39 37 37 26 19 17 25 12 19 15 15 8 9 12 24 21 18 20 20 19 20 30 34 28 24 11 11 9 9 9 12 16 12 14 17 21 23 26 28 37 32 32 23
18 12 16 16 13 11 10 17 17 12 9 9 10 19 15 13 11 13 17 14 20 24 28 21 21 21 21 15 10 9 11 10 8 10 10 10 10 10 9 9 9 10 13 9 10 14 15 15 16 21
21 12 20 18 28 12 9 9 10 8 8 8 8 9 9 10 12 12 17 18 8 10 10 11 6 6 6 6 8 17 10 8 9 12 9 9 14 10 10 9 10 8 8 10 8 8 10 16 14 15
9 8 8 8 8 8 10 6 6 6 7 8 8 8 8 10 8 8 8 19 10 8 8 8 8 12 15 18 16 13 10 8 8 8 8 8 7 7 7 8 10 10 13 16 13 17 9 9 8 8
8 7 7 9 12 11 12 10 15 10 8 7 7 8 8 10 10 10 11 16 10 12 9 8 8 10 10 8 8 8 8 17 17 21 11 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8 10 13 8 8 8
10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 16 18 23 15 8 8 8 10 15 14 11 6 8 6 7 8 8 8 8 6 6 8 13 13 8 8 8 6 8 8 8 8 11 12 16 19 10 10
10 10 8 8 11 10 8 8 10 10 7 8 6 6 8 8 10 11 14 8 8 8 8 8 8 10 12 13 12 12 10 10 8 8 8 10 9 12 19 16 10 10 9 9 7 10 12 14 10 15
8 8 8 8 14 8 8 8 6 6 6 7 7 12 12 12 10 10 10 12 8 8 8 8 8 11 13 8 8 8 15 10 14 8 6 6 6 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 8
8 7 6 6 6 10 8 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 12 12 9 9 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 12 10 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8
8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 8 10 13 7 6 8 6 8 10 12 19 23 22 22 15 21 21 29 29 32 24 28 23 24 24 35 37 47 43 43
43 43 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 43 46 43 57 43 42 39 42 42 41 46 40 46 40 39 39 42 42 43 44 44 47 47 47 47 42 38 28 24 24 30 32 37 37 37 37 37 42
44 48 47 47 41 41 30 30 28 24 24 32 32 37 32 43 50 57 57 48 47 43 43 24 24 13 11 11 19 13 32 36 57 57 57 57 57 57 52 52 33 43 32 35 35 47 47 57 59 59
52 52 52 57 57 57 52 57 52 57 59 59 57 57 57 57 45 45 39 36 57 41 41 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 35 35 35 43 35 35 35 43 43 57 57 57 57 57
57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 43 43 62 43 43 43 43 52 62 57 57 57 57 57 43 44 43 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57
57 57 57 57 35 43 33 42 42 43 43 52 57 57 57 57 57 57 44 43 23 23 23 43 43 57 52 52 52 52 52 50 43 43 43 43 43 43 35 43 43 52 52 54 52 57 52 52 43 52
52 57 57 57 57 57 54 57 57 50 43 39 37 43 43 43 44 57 44 57 42 36 33 44 44 57 47 42 42 35 35 42 42 43 43 44 43 48 48 48 57 57 57 68 68 59 59 48 48 48
48 46 48 48 47 47 47 43 43 40 40 39 43 43 43 43 43 46 43 48 48 43 43 43 43 43 48 40 40 28 28 28 32 32 47 59 59 43 35 30 30 28 28 28 30 30 30 21 20 12
8 8 8 8 8 10 12 20 24 32 32 32 34 34 39 30 35 35 37 36 33 33 28 28 28 40 40 43 43 43 43 47 47 39 39 39 43 43 48 48 48 48 59 59 59 41 37 30 24 12
12 12 12 11 13 11 11 10 10 10 10 15 17 17 17 16 20 12 13 11 23 25 41 46 46 46 47 37 28 28 20 20 23 23 23 18 21 18 23 23 28 24 22 18 23 10 10 10 10 10
10 16 28 32 30 34 41 28 35 39 39 48 57 48 48 48 57 48 48 48 48 48 48 57 48 59 43 42 43 41 41 32 41 41 41 43 42 54 54 57 57 59 48 48 47 47 43 43 43 43
37 43 43 44 43 43 43 44 44 48 48 47 44 44 43 43 43 42 42 37 42 42 47 44 48 48 48 48 57 57 48 57 57 57 59 59 57 48 44 44 43 43 41 35 43 38 43 43 57 52
52 52 52 52 57 57 57 52 50 50 54 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 57 57 44 44 35 35 35 47 42 43 43 43 43 43 44 44 57 59 59 59 59 57 57 43 39
39 37 30 25 21 19 19 23 28 44 37 43 43 43 43 43 43 54 59 59 59 54 43 43 43 43 43 43 42 43 43 43 43 43 43 43 48 48 43 59 30 30 18 26 26 39 30 37 30 30
30 32 34 31 31 35 37 36 39 36 39 39 41 39 30 25 25 22 22 24 39 39 47 47 36 36 28 28 14 14 14 21 19 15 21 18 24 16 19 16 18 23 25 30 28 28 23 18 16 16
17 28 30 24 26 32 34 31 31 28 23 13 13 14 23 23 30 28 21 13 12 15 25 17 22 28 34 34 28 30 30 33 33 36 39 37 27 24 16 15 15 25 22 28 34 28 30 30 32 32
33 28 19 19 11 11 11 16 21 17 15 10 10 10 12 16 16 21 18 27 24 24 18 25 35 25 12 11 11 14 22 20 28 28 14 14 15 11 15 13 25 20 20 20 12 14 15 10 12 16
19 12 10 10 11 17 16 19 19 24 18 18 14 10 11 11 16 19 19 12 12 11 9 9 10 13 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 17 16 12 12 12 12 14 11 11 8 8 8
8 10 9 9 9 10 10 10 10 10 10 18 21 12 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 7 7 9 9 9 9 9 9 10 10 10 9 9 9 9 9 9 9 9 10 14 9 10 10 10 8
8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 10 12 12 13 13 13 16 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 15 10 8 8 8 8 8 13 13 17 15 18 10 10 10 8 8 8
11 8 8 11 13 22 21 25 21 23 16 9 7 7 7 8 8 18 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 6 6 7 6 8 8 22 22 12 8 8 11 11 21 21 18 11 10 11
10 17 12 12 11 11 11 11 12 12 12 9 12 9 8 8 8 10 10 10 8 11 8 8 8 6 6 8 8 18 21 11 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 10 12 10 15 11 15
15 19 27 34 34 28 18 12 10 10 11 9 9 9 9 3 0 3 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 11 9 8 13 12 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 9 8 8 8 8
8 8 8 8 6 6 8 8 11 11 8 8 8 8 6 8 13 12 14 12 19 16 8 8 6 6 6 6 10 9 9 8 9 10 12 10 12 9 9 10 9 9 10 11 14 12 16 8 8 7
9 12 14 14 7 7 8 8 8 8 10 10 10 14 13 13 15 11 11 10 10 3 0 3 7 8 11 8 8 8 9 8 8 6 6 8 6 7 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8
8 12 8 10 8 8 6 6 |