| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-176L13.T7 (MSMg01no176_l13.b1) | MSMg01-176L13.TJ (MSMg01no176_l13.g1) |
|---|
| ACC | AG371334 | AG371335 |
|---|
| length | 1,272 | 1,294 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 636 (140 - 775) | 380 (70 - 449) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_l13.b1 PHD_FILE: MSMg01no176_l13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:49 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no176_l13.g1 PHD_FILE: MSMg01no176_l13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:48:49 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | CATATCCNNNNNNNGACACTGGGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTAAAATTGCAAAGCTTCCGTTAGGCGCCCGATACTTTCA
ATAATACAAAAAGGCCACCCCCTGATTGGAAAAGGACCTTTAACCAATCC
TAAATCTGAAAGGGGACTAATATCAAATATATACAAAGAGCTCAAGAAGC
TGGACTCCAGAAATTCAAATAACCCCATTAAAAACTGGGGTACGGAGCTA
AACAAAGAATTCTCAACCGAGGAAGACCGAATGGCTGAAAAGCATCTGTA
AAAAAATGTTCAACATCCTTAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAAC
CTTGAGATTTCACCTCACTCCAGTCAAAATGGCTAAGATCGAAAATGTAT
CTGTGGAGAAAGAGTATCACTCCTCCATTGCTGGTGGGATTGCAAGCTGG
TACAACCACTCTGGAAGTCAGTCTGGAGATTCCTCAGAAAATTGGACATA
ATACTACTGGAAGATCCCGCAATATCTCTCCTGGGCATATACCCAGAAGA
AGTTCCAACTGGTAATAAGAACACATGCTCCACTATGTTCATAGAAGCCT
TATTTATAATAACCAGAAGCTAGAAAGAACCCAGATGTCCTTCAACAGAA
GAATGGATACAGAAAATGTGGTACATTTACACAATGGAGTACTACTCAGC
TATTAAAAACAATTAATTCATGAAATTCTTAAGCAAATGGATGTATCTTG
AAGATATCATCCTGAGTGAAGTAACCCAAATCCACAAAAGAAGTCACTTG
ATGTGCACTCACTGATAAGTGGATATTAGCCCAAAAACCTAGAATACCCC
AGATACAATTTGGCAAAACACAAGAAAATCCAGAAGAGGGAAGACCAATG
GGTGGATACTTCTTTCCTCCTTAGAATAGGGAACAAAATACCCCTGACAG
GAATTACCGAGACCAAGTTTGCAGCTAAAAAAAAGGATGCACTATGTGGA
GATTACCCCCCCCCGGGATCCATCCCCTAATCACCCCCAACACCAGAACT
ATTGTTTATGGCCCCCAGATTGTGGAAGCAACCTCCCTTACTTGCCCCGA
AAAAGTATTGCCATGCCCCGTAAAAACCAAAGGGAGTGTTCACCCCCTCT
TTGGAGGGAACCTCTCCCCCCTTGCAAAATATTCAACCCCTCCGGCCCTT
AGGTTCTGTTCTCTTTCTCAATCCTCTTTTCTATCCCCTCTCCCCACCCT
TTTTCCTGCCATATCCTACTAA
| NNCCCTGATGCGAGGCTGGGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTCAGAGCTTGAGAAATCACCTTCCTAATG
AGATTTGATGGATAGCAGTGCTCACCACCCTCGGATGAAGCTGTCAGTGG
AGGCTCCTTTGCCCAGCACAGTGTATCCCTGCTGATCTCACATTGAGGCA
CAGTGACACTTATCCAAAAGCACAGGGAATATGAAGAGCTCCTTCTGGCT
GTGGGGACAGTTGACTCAGGATCGAGGTCTTGGACAGACAGCAGAGACCT
TGTGGCTGGTGGCAGGGAGTGATGGTGCTCAGGGCTGCTGCCTGCAGGAC
TCCTCCAAGAGGCCTGTGCCTCTTTCAACCAGCCAGTGCTGTTTCCTGTT
TTCTGCAGCCACTACTCTTGGTGGATGTACCCTGACCCTCAGGACCTGCA
TTTTTTTTTCTCCCCCCCCACAGGTATTACCCCCCCACCCCAAAAAAAGT
CCCCGTGTCAGGCAAGCACTCTACCACAGAGCTGTAGCTCCAGATCCTGA
CCAACGCTTTTAAAACGCCCTTTAGTCAAGGACAACTTTTCCTTAAATGA
ACTCTTCCATGGCAGCAGTTTCCAACCTGTGGGTTGAGGCCCCTTTGGGA
ATCAAATGATCCTTTTACAGGGGTCACATATCAGGTATCAACCATATCAG
ATATCTACATTACGATTCATAACAGTAGCCCAGTTACTGTTATGAAGTAT
CCACAACAATAATTTTATGGCGTTGGTAGGCTGTCTCTTCTCGATCTACT
GTCTTATTCCTTCCTATCATTTGCTTCCTTTTACACCCATCTTTTTTACT
TTCCACCCTCATACCCTGTTTTTATTATCACCTCTCCTTCTCTTCTATCT
TCTTCTTTTTGTTTTTCTTTGCTTCTTCTTTTTTTCACTCTTCCTCTTTT
TTCTCTTTCGTACACTTTTTTTTCCCCTCTTCTCTCCTTCTACTCTTCTT
CTCCGCTCTTTCTTATTTTCTTTTCTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTC
TTTATCTCTATTCTCTTTTATCTTCTCTCTTCTCCTCTGTCCCTACTCTG
CTCTCTTTCACCTCTTATATTTTCCTCTTTTCTCCCCTTCTTTTCTTCTT
CTACTTCTCCTTCTTCTATCCCCTTTCTTCTTCTATCTTTTCCTCTTTCT
CTCCTTCTTTTCCCTCATTCTATTCTTCCCTTCTTCTCTCTTTTTTCTAT
TTCCCCTTCACTCTTCTTCTTCCCTCCAATCCCGCATCTCACCT
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 9 9 6 6 6 6 6 7 10 10 8 6 6 6 6 8 10 13 8 8 8 11 12 14 19 19 33 28 23 28 28 33 33 37 37
37 36 28 28 28 28 39 23 22 10 10 10 15 21 36 53 53 50 50 50 50 47 37 23 27 9 10 6 7 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 13 12 16 25 30 33 33 39 44 50 47
47 50 36 36 36 36 35 50 59 59 59 59 59 47 47 47 27 25 12 15 12 11 11 12 16 19 26 18 14 14 14 14 15 23 23 10 10 10 10 17 21 29 37 37 33 33 33 36 36 33
39 39 44 37 43 37 37 37 43 43 59 59 59 59 59 48 43 47 42 48 48 48 46 39 43 36 46 46 51 50 54 44 44 37 37 37 48 59 59 59 39 36 36 25 25 44 44 44 44 35
37 42 48 57 48 42 44 35 33 33 44 44 59 44 44 32 32 32 44 44 59 59 57 59 57 47 47 43 50 50 57 57 59 59 57 59 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 52 52 52 52 59 59 68 59 44 59 37 32 32 32 32 43 42 43 45 57 44 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 52 52 52 59 59 59 59 57 57 43 38 43 36 36 23 44 44
57 68 68 59 59 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 44 44 42 42 28 42 44 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 57 54 54 59 59 59 48 59 48 54 54 54 54 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48
48 48 48 57 48 59 59 59 59 41 30 19 18 11 8 8 8 8 8 13 31 37 47 59 59 48 59 48 57 57 57 57 57 59 43 43 43 43 48 48 48 57 57 57 59 59 59 59 59 59
59 54 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 54 54 54 48 48 47 43 44 43 47 47 43 43 39 37 37 37 43 46 54 54 44 44 37 44 48 57 68 68 68 68 59 59 54 57 57 57 57
57 59 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 54 52 52 59 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 43 52 52 57 57 59 57 57 52 57 57 57 57 57 57
57 57 57 52 57 52 52 52 57 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 57 50 50 50 52 52 52 52 59 59 57 57 57 57 52 52 48 50 57 57 57 57 43 43 50 57
57 57 59 68 59 59 59 59 59 59 59 59 43 43 41 37 44 48 57 47 57 47 57 57 57 46 48 47 46 44 42 39 39 42 57 44 44 43 43 43 42 40 32 30 36 36 39 39 39 36
39 33 33 29 28 25 28 23 34 28 43 43 43 48 48 48 59 43 39 36 35 24 28 19 19 28 34 30 41 46 46 41 37 37 36 31 31 43 43 59 59 37 37 46 47 37 37 37 39 39
39 39 57 57 57 30 28 8 10 8 14 13 29 33 28 28 25 30 28 28 28 34 22 28 27 37 32 37 39 32 32 32 35 35 39 37 43 43 37 37 37 32 28 28 25 30 34 41 41 34
25 25 30 30 37 37 41 41 41 37 39 37 37 29 30 24 35 39 39 39 36 28 22 24 19 22 11 15 15 27 19 14 16 11 10 12 10 13 16 30 32 32 23 21 10 10 10 17 17 15
11 11 22 21 30 24 26 14 24 14 14 14 19 19 14 12 12 12 15 20 19 20 28 37 37 25 24 10 10 8 8 11 13 14 16 22 18 17 13 15 15 17 10 12 10 12 15 17 16 13
17 16 13 16 15 8 8 9 10 9 10 9 9 8 10 10 10 10 10 10 12 11 11 15 17 16 15 17 10 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 13 14 18 15 11 11 9 9 9
14 14 24 11 11 9 12 9 8 8 8 11 8 9 10 12 19 19 22 22 15 15 9 9 9 9 9 14 18 24 23 19 20 18 15 10 8 8 8 10 10 15 10 14 10 12 8 8 8 12
8 8 8 8 8 10 10 11 11 6 6 6 6 8 8 10 8 9 8 14 8 8 8 12 8 10 8 8 11 9 10 12 16 11 9 9 6 6 6 6 6 8 8 10 10 8 10 10 10 12
13 9 13 10 10 12 17 26 25 28 16 19 11 11 10 11 10 10 10 12 11 11 11 16 22 10 10 8 8 8 8 11 10 11 10 9 13 8 6 6 6 6 8 10 6 6 8 8 8 8
9 10 8 8 9 9 8 8 11 11 11 10 10 9 9 8 8 8 8 9 9 10 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 11
12 12 13 13 8 8 6 6 6 6 8 6 6 8 6 10 10 9 8 7 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 13 14 8 9 9 9 9 9 10 11 13 13 17 17 10 10 10 10 10
8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 10 8 10 11 11 10 10 8 6 6 8 8 12 10 10 10 10 10 10 10 10 9 9 9 10 9 9 10 12 11 11 8 8 8 8 8
8 13 6 6 6 7 8 6 7 13 7 9 9 10 8 8 6 6 10 8 7 6 8 8 8 8 8 10 12 10 6 6 8 6 7 11 12 12 8 8 8 8 13 10 11 9 8 8 6 7
12 10 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 6 6 8 9 6 6 6 6 6 10 8 9 9 9 9 10 15 15 16 9 9 8 8 15 19 19 10 10 10 17 21 29 22 22 29 36 33 35 31 30 29 33 31 31
32 42 47 57 48 57 57 43 48 43 39 37 43 43 42 42 32 46 43 47 39 32 32 28 32 36 48 48 50 50 50 68 68 68 68 48 57 43 29 29 24 29 42 38 30 41 41 41 42 48
48 59 59 59 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 50 50 50 38 38 20 20 21 19 27 20 20 20 38 38 52 52 52 52 57 57 57 57 57 54 54 52 57 57 42 37 35 50 37 50
52 44 43 37 37 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 45 45 45 57 57 57 57 57 57 57 45 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 52 52 52 43 43 62 62 62 62 57 68 68 57 59 57 57 43 43 42 45 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 52 52 57 59 57 57 57 57 57 57 39 37 43 44 43 52 52 52 52 54 57 57 57 52 52 43 37 32 43 43 43 43 52
57 43 52 52 52 52 48 50 59 59 57 57 54 50 50 43 43 43 50 50 54 59 59 44 44 33 29 32 27 32 20 32 32 48 44 47 47 47 54 57 54 48 57 57 57 57 48 39 44 40
39 47 47 43 44 43 48 57 57 57 48 43 43 43 46 46 46 43 43 43 48 48 59 57 57 57 57 57 43 43 39 39 59 43 59 48 48 59 59 59 59 59 41 47 37 59 46 41 28 23
13 11 11 11 16 15 19 23 34 40 46 59 59 59 59 48 48 57 59 59 59 32 32 23 20 23 28 32 26 39 39 43 43 43 43 40 40 43 37 37 48 48 40 40 46 43 27 21 11 11
9 10 12 12 19 16 9 15 6 6 8 8 13 16 18 14 11 9 8 8 11 21 28 28 23 21 21 15 16 15 16 10 15 9 11 9 9 11 13 12 13 14 15 14 10 10 8 8 8 8
8 8 18 22 18 18 11 9 10 23 24 23 23 23 34 34 47 46 46 47 59 57 57 57 57 46 46 43 43 43 43 37 37 43 39 43 33 39 39 42 43 43 43 43 43 43 48 34 41 18
18 18 30 30 47 35 35 35 41 32 28 20 20 32 31 28 28 24 24 34 37 30 30 20 20 20 32 32 48 47 37 39 36 36 36 43 43 39 39 40 39 39 34 36 32 36 41 41 39 39
28 26 10 10 11 11 16 18 22 25 37 37 37 35 28 28 30 30 30 39 39 43 43 43 43 43 40 40 28 25 29 22 22 22 30 26 34 25 22 16 19 22 26 41 32 32 21 18 13 13
26 28 30 26 13 13 13 24 28 36 37 43 43 43 39 29 29 23 21 36 19 16 13 11 11 17 18 30 43 40 32 24 20 20 24 24 23 22 10 10 10 10 10 19 23 28 22 22 12 13
13 22 20 11 12 11 16 11 11 11 23 22 19 12 12 18 18 11 11 11 12 12 17 17 15 21 12 12 9 9 9 9 9 10 19 15 12 12 10 15 8 8 8 17 17 11 11 11 11 11
13 16 16 8 12 8 8 8 19 19 19 10 10 8 8 10 11 21 9 8 8 8 8 8 10 12 12 10 8 8 8 8 11 10 12 9 9 10 9 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 9
10 10 10 7 7 7 9 12 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 7 7 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 6 9 9 9 8 8 8 9 9 9 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 13 13 10 10 7 7 8 8 9 10 16
10 10 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 11 8 8 8 8 9 9 9 9 9 10 9 9 9 10 11 8 10 10 10 15 15 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 10 15 12 12
10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 10 8 6 6 8 8 7 6 8 8 8 8 6 6 10 8 8 8 8 8 9 8 8 10 12 8 8 8 8 8
10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 11 11 11 11 13 16 10 11 11 8 8 7 6 8 8 8 8 6 6 8 8 10 8
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 11 10 10 10 8 8 7 7 8 8 8 8 9 8 8 8 10 6 6 8 8 8 10 9 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 6 6 8 10 9 9 6 6 10 8 8 8 10 8 8 10 8 8 7 7 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 11 12 8 8 10 8 10 8 8 8 8 10 11 8
10 8 8 6 7 12 12 22 15 9 8 8 6 7 8 8 9 9 9 9 8 8 8 10 8 7 7 10 10 8 8 8 8 7 6 8 8 7 10 10 9 8 8 8 7 8 8 8 8 12
12 8 8 8 9 9 14 15 9 10 9 6 6 6 7 8 8 8 6 6 8 8 10 11 8 8 6 6 8 8 11 10 11 8 8 7 8 8 8 10 10 10 10 13 13 8 8 8 8 8
8 12 12 18 15 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 7 7 8 8 8 15 10 9 8 8 8 8 |
|---|
