BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-187N17.T7 (MSMg01no187_n17.b1) | MSMg01-187N17.TJ (MSMg01no187_n17.g1) |
ACC | AG379062 | AG379063 |
length | 734 | 742 |
length of high quality (start - end) | 313 (45 - 357) | 288 (77 - 364) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no187_n17.b1 PHD_FILE: MSMg01no187_n17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:03:18 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no187_n17.g1 PHD_FILE: MSMg01no187_n17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:03:18 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTTTGTTCAGCTCTGAGCCCCATTTTTTAATGGGGTTATTTGATTTT
CTGGAGTCCACCTTCTTGAGTTCTTTATATATATTGGATATTAGTCCCCT
ATCCGATTTAGGATAGGTAAAGATCCTTTCCCAATCTGTTGGTGGCCTTT
TTGTCTTATTGACAGTGTCTTTTGCTTTGCAGAAGCTTTGCAATTTTATG
AGGTCCCATTTATTGATTCTCGATCTTACAGCACAAGCCATTGCTGTTCT
ATTCAGGAATTTTTCCCCTGTACCCATATCTTCGAGGCTTTTCCCTACTT
TCTCCTATATTTTTTTCACCCCCCCCGCCTTTATGTGGAGTTCCTTAATA
CACTTAGATGGGCCCCCCCCACAAAAATATATAAATGGATCGGTTGGCAT
TTTTCTACATGATAACAGTCAGTTGTGCCAGCTCCATTCGTTGAAAATGC
TGCTTTTTTTCCACTGTACGGTTTTACTTCCCTATCTTCATACTTTTTGA
CCCCTTGTGTGAGGGTTCCTCCTTTTTTTCTTCCCCTCCGCCCCCTTTCC
CCTTTCCCCCCGTTTCTTTCCACCCCCCTTATCTTTTCTTACCCTTTTCC
TTAACCCCCTTTTTTCTCCCCCTTTCCCACCTTTTTAACTTTTCATTTAA
CCCTTTGCCTTTTTCTATATATTCCATATTTCTT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAGGGACACATGGACAGAAAGGG
AAGACATGGCAGCCACGTGTGTACTTCCATCGTACAGCTGTGAGATGCTG
TCATCCACATGAACATCTACGAACTTTAAAACCTCCATGGAAAAGCAAGC
TTAGGAAGAATACGTAAAGTATGGACTCAGAGCTAGACGAGAGGACCTAG
GAAAACACTGTCCAGCTAACAAGGAAGACCAGACTGTGTGAGAGTGTAGA
AGGAAGCTCAGCTTGTTCCAGCCACCCTTTGTCGCTACCATGGAGGTGAA
TTCAAGTTAGGTGCTGTCCCTGCACCCGCCCCGCCATGAACACACATGAT
TTTTAATCTGGAATGCACCGCCCTATCTTTTGTATGTAAGTAGATTTGAA
ACTAATGAGAAACTTCATCTCTATCCCTGCAAGGCAGTTCTAAAATGTAG
AACTGTCTATATGGACTAAAATGTTGGTTAAAATCATACATTCAAACTAT
TGACTAAATTCTAGCCATAAACCATCCAATCTCAAGATAATTTAGCTTTA
TTTAGAATCATTTATGCTAAAGTTCACTTACTATCACTACATATAACTAT
TAATACGTGTAAATTGATCAGTATTTATGCCTCTGCCACTTAATACCAAT
GTATTTTTGAGTATTTTTGAAAACTTTAATATTATCGACCCT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 11 11 15 11 16 32 41 41 37 37 37 31 21 23 11 3 0 3 13 21 30 43 28 28 24 24 24 35 44 53 47 57 48 48 48 57 57 37 37 34 33 36 42 43 59 59 47 47
47 47 50 51 68 68 68 68 50 43 43 43 43 43 59 59 57 57 68 68 68 68 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 51 51 68 68 68 68 68 57 57 52 52 52 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 57 44 44 31 29 18 18 15 15 18 24 31 43 43 57 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 50 50 59 59
59 59 59 34 34 20 22 11 11 9 12 12 17 19 19 18 9 9 9 9 9 11 14 15 16 15 14 11 9 9 11 15 23 30 47 47 37 37 28 37 37 39 39 43 36 34 25 25 28 32
28 37 37 32 32 15 15 11 12 11 9 11 9 11 21 21 12 12 12 13 12 12 10 14 9 10 8 8 9 9 9 12 11 25 26 26 22 15 12 12 10 9 9 8 8 8 8 10 12 17
17 24 28 15 17 15 15 9 18 12 28 21 28 25 12 12 12 12 15 11 11 11 19 21 23 23 23 32 20 20 20 20 20 20 20 15 23 10 10 10 17 18 19 18 12 11 11 9 15 12
12 8 8 8 24 28 32 28 20 16 15 13 10 9 9 10 8 8 8 8 8 10 22 25 10 9 9 10 12 16 22 24 13 12 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 12 15 12 10 10 10
10 10 8 8 8 8 8 13 10 11 11 11 8 8 8 8 12 10 15 10 14 9 8 8 8 8 13 8 10 9 8 14 11 12 14 16 16 16 10 11 10 17 12 14 15 21 23 23 23 18
11 11 11 11 11 12 10 10 8 8 8 8 8 10 16 17 16 16 10 10 9 9 9 9 9 9 10 15 13 8 8 8 10 11 9 9 10 8 8 8 8 8 8 13 14 10 13 10 10 10
10 8 8 10 10 12 16 11 11 13 17 14 11 11 9 9 9 9 11 11 14 20 25 21 21 8 8 8 8 8 9 7 10 15 17 10 11 11 11 9 9 9 12 12 11 11 9 8 6 7
8 8 8 10 8 7 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 9 6 10 6 6 6 6 | Open.Hide. 9 9 9 13 12 8 8 8 8 11 17 30 26 30 37 37 37 47 37 39 50 50 50 50 50 50 50 57 57 53 53 50 53 53 57 57 48 48 37 36 36 36 40 42 57 57 57 54 57 48
50 48 48 48 50 57 57 57 57 57 57 33 40 33 33 35 40 44 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 41 41 50 50 50 50 68 68 68 57 59 59 59
59 54 54 50 57 48 47 47 57 57 68 68 57 57 57 57 54 54 54 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 62 52 52 52 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62
57 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 48 57 57 48 47 47 50 50 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 57 44 48 48
59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 44 46 48 59 57 68 68 68 57 57 57 43 43 43 43 48 59 59 54 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 43 57 43 57 48 48 48 57 57
57 59 48 48 48 48 57 57 57 34 30 21 13 13 13 19 19 32 32 21 10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 23 34 47 47 59 59 59 59 59 59 43 43 46 57 57
57 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 41 47 34 34 22 12 12 9 9 9 21 15 20 20 32 29 37 35 24 24 14 14 13 28 19 33 36 59 59 59 59 46 39 42 39 43 43 43 43
48 43 48 43 43 32 34 32 43 43 48 48 57 57 57 57 54 54 54 54 57 57 57 57 57 59 48 47 44 59 47 48 57 48 48 48 59 59 54 57 57 57 57 48 42 42 35 44 35 37
32 44 36 47 43 47 47 48 57 57 57 57 54 57 57 59 59 57 44 44 43 44 43 40 40 25 25 28 40 40 46 48 43 43 37 39 39 43 43 43 39 42 36 32 30 32 39 39 59 57
43 43 43 43 43 42 43 43 37 40 37 43 36 39 39 30 30 25 21 19 29 29 32 32 37 43 37 37 37 37 37 32 34 22 28 35 43 43 43 59 59 47 47 40 43 43 41 41 39 43
43 30 28 14 13 15 19 19 25 40 40 59 43 39 35 28 28 29 28 28 24 28 35 33 36 30 30 30 19 19 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 14 15 19 14 22
14 11 9 9 10 10 13 13 23 14 18 24 24 37 37 30 19 24 12 10 10 12 10 12 10 19 19 36 30 23 22 28 17 21 11 8 8 6 6 6 6 13 12 11 12 14 12 12 9 10
9 9 9 10 11 21 24 15 12 12 12 12 12 15 16 19 28 28 28 19 18 12 18 22 16 22 17 20 14 14 9 8 10 10 8 8 8 8 8 10 13 12 |