BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-209J18.T7 (MSMg01no209_j18.b1) | MSMg01-209J18.TJ (MSMg01no209_j18.g1) |
ACC | AG392073 | AG392074 |
length | 744 | 747 |
length of high quality (start - end) | 320 (46 - 365) | 291 (77 - 367) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no209_j18.b1 PHD_FILE: MSMg01no209_j18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:33:47 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no209_j18.g1 PHD_FILE: MSMg01no209_j18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:33:47 2005 |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (107,658,108 - 107,658,423) | (107,554,417 - 107,554,707) |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCATAGGGTATGAAATTTTAGGCATATGCCCTTTGTCTAGGATAAAT
ACTAGCAGCTTTTGCTTTTGTAGTTAGTTATTGAGTTACTGGTGGCTTCA
CTGCTCTAACCCACATGATGACTAGAAAGCCTGGACCAATGTAAGAAATA
ATTACAGATAAAACTTTTTTTTTTCCAGTGCTGCCTTAACAATTTCAGGA
AAAGACTAAAATGCTTCCGATGTGGAGCAGACAAGTTTGGTAAGCGTGGA
TTCAGCTGTTTGGAAAATGCAATTAAACCTGACTTACTGCCTGTAAACCC
GAGGAAAAAAATGTATTTTTCTACCCCCCCCCCCCCTAGGAACTTACATA
ATAATGTAACGCTTTTTACCTTGCCCTAAGTAGATGCTGATGCTGATTGT
GAAAGAACACAAAATTCTTTTCCAAAATTAAGGTGCTGTTCGCCTGGTTT
GCATGCTACGTCTGCTTTTGTTTAATACATAGTGGTACTATCTCCCACTG
GTCCAGTAGTTACATTCCATATTAGCGGTCAGAATTACTAGGTTAAAGTA
TAGCCATAGATTTCCTAAAAGAAAAGACAATATCATGGCGCCTCATACTT
TTGCTGAATTATAATACAAAGTTCACAGCCTACATGGGCTATATAGTAGG
CTTCAAGGTGACCTAAGTTACATAGGAATATTATCAAGGAATGG
| CCGATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCCTTAGCACTGCCCCAGCCCATGG
GCACCAAGGCCCCTCCTACCAGGATTTTAGGGGTGGATCTTGCAGGCTCC
TTGTCAGTGGGCATGATTCGGAAGTAGAAGATGGCAGGGAAGATGAAGAT
GAGGCACGGAGCAGATGTGGCACCTGCAGAGAACAGAACTTAGCAACAGC
TGCTCTCACTCGCCTACTGGCCAAGGTCTGAAGTGGACTCCCAGTGAGAT
CAAGTAGTCTCCGTTGGAGGAGAGCCTATATTCTGGGGGAGCCCACCAGC
CTTTCCCTCTCTTGTTCTCTCTCCACCCCCCCCCCCGGCCGATGGTGTTG
GCGGGTAAGGAAAATATATGACAATGAAGCTAGCCATGAAGAAAAGAAGC
TTATGACAGAATAAACCCCTAAGGAAACTGGGTTCTTTGGGCTGGTGAGC
TGGCTCAGCAGTTTCCAGAGGTCCTAAGTTCAATACCCAGCAAGGGCATG
GTGTCTCACAGCCATCTATAAGTGGATCTGATGCCCTCTTGTGACATTTA
GATATACACACAGTAGAGCACTCACATACATACATACTTACATACCTCAC
TACATACATTCTTACTCCCCTACCTACTTACTAGAATACTGGTTTCCTAA
CACAGTTTTGCTACAGTTTTGTATCTTGAGTGTTCCCCCAGTGCCAG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 13 18 37 34 33 32 32 28 28 37 37 33 33 33 37 37 44 47 46 35 28 30 32 32 36 48 53 48 48 48 48 48 57 57 32 32 22 29 29 34 41 32 41 30
47 47 42 50 48 47 47 47 57 57 68 68 68 53 53 50 50 50 50 50 51 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 68 59 59 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57
57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 52 52 59 59 59 59 68 68 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 50 50 44 43 43 43 57 46 54 54 54 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 54 57 57
57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 48 59 59 68 68 68 68 57 57 48 30 30 30 20 20 20 20 34 32 54 54 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
59 57 46 46 46 46 39 47 40 28 28 15 21 12 12 12 18 24 32 28 15 14 12 12 12 14 15 21 19 18 19 19 16 13 12 11 11 11 19 24 34 47 47 59 59 59 48 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 34 30 19 15 9 9 9 9 10 22 23 12 12 12 11 12 11 18 18 31 33 39 37 39 39 41 43 47 46 43 43 43 43
40 40 40 43 43 43 25 23 11 11 11 27 27 54 57 57 57 59 54 54 48 57 57 46 46 43 43 43 36 36 28 30 30 37 37 47 57 47 48 48 48 48 54 57 57 54 47 47 39 47
43 44 44 47 57 48 46 46 44 44 47 59 59 59 68 68 59 59 43 39 39 50 50 54 57 57 57 57 57 57 44 44 33 35 35 44 47 59 59 68 59 59 59 57 57 57 57 57 43 37
37 37 42 42 42 35 42 43 39 39 39 42 40 43 42 44 39 43 43 46 48 44 43 37 26 30 21 15 15 21 18 20 28 37 40 42 42 28 28 23 28 28 39 39 37 37 36 37 39 34
34 25 25 32 30 28 28 28 23 28 29 31 39 39 37 32 27 21 25 19 20 18 24 32 34 34 24 24 20 25 30 41 47 41 41 41 37 12 17 8 8 8 13 16 32 25 25 24 33 37
41 46 41 47 37 35 28 30 28 22 13 13 15 16 14 10 10 10 15 15 22 24 15 18 9 9 9 22 17 36 31 28 20 28 21 20 13 15 11 15 15 24 21 17 12 11 13 12 15 10
10 10 15 10 12 18 17 15 13 15 18 16 14 21 12 19 24 24 23 28 23 20 20 23 19 12 11 11 12 14 16 28 28 26 13 13 11 10 13 13 12 19 13 13 | Open.Hide. 9 9 7 10 12 8 8 9 12 23 27 33 36 36 48 57 57 59 57 57 57 57 57 57 53 50 50 57 57 57 59 59 59 59 54 57 54 54 42 41 41 41 41 36 44 32 30 30 37 42
42 50 50 48 48 57 47 41 47 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 59 59 57 57 57 57 50 57 59 59 57 68 68 68 68 57 57 57 57 50 50 52
52 57 50 50 57 57 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 68 59 59 57 57 57 52 52 47 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 59 59 59 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 52 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 59 54 54 54 57 57 57 57
54 57 57 57 57 59 57 57 54 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 44 32 27 22 18 23 36 32 23 28 28 43 42 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 37 30 24 24 12 12 12 13 13 23 18 23 11 10 10 15 15 17 17 23 13 17 12 13 11 15 12 19 25 34 39 39 43 43 43 46 43 47 43
43 39 39 30 39 47 43 47 43 48 48 48 48 47 34 27 15 12 12 19 15 18 18 18 15 18 15 28 30 43 39 47 35 35 35 39 37 39 39 39 31 32 20 15 18 21 8 8 8 8
13 15 36 39 32 32 32 28 28 32 32 32 39 30 30 30 39 47 47 47 48 48 48 40 40 35 35 35 40 40 43 43 43 43 43 47 48 59 47 54 54 47 44 39 30 30 39 42 37 43
43 39 37 35 28 36 25 25 25 30 25 28 33 40 42 37 28 28 28 28 23 37 37 40 37 28 28 32 28 34 24 18 18 18 30 30 41 25 19 17 15 14 14 14 15 21 22 28 28 24
18 18 18 19 19 32 36 37 48 48 32 32 20 20 18 30 25 28 19 24 19 34 32 28 23 28 30 31 36 34 28 28 28 29 30 39 44 44 43 41 40 40 28 28 13 13 13 23 27 23
28 23 23 19 19 21 19 32 43 27 23 12 11 11 12 12 12 18 20 28 21 25 11 11 10 10 10 18 10 12 11 12 11 12 11 15 12 19 13 22 13 13 13 19 12 12 9 8 8 8
8 10 9 11 9 12 9 9 9 8 8 13 13 13 10 10 14 9 13 10 10 12 16 25 10 11 10 13 8 6 8 7 7 14 9 16 15 17 22 20 11 10 10 10 10 10 9 15 11 13
14 19 19 15 14 19 20 20 23 19 19 10 11 11 11 11 14 19 13 11 10 9 11 11 11 12 15 10 8 8 8 10 8 14 15 13 11 9 8 8 8 8 8 10 9 9 9 |