BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-237M01.T7 (MSMg01no237_m01.b1) | MSMg01-237M01.TJ (MSMg01no237_m01.g1) |
ACC | AG402611 | AG402612 |
length | 794 | 810 |
length of high quality (start - end) | 267 (130 - 396) | 381 (123 - 503) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no237_m01.b1 PHD_FILE: MSMg01no237_m01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:55:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no237_m01.g1 PHD_FILE: MSMg01no237_m01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:55:39 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | AAAANNAAATTTTTCTTTTTNGGGGTCTTATCCTTTCCCNCCNCCCCNCN
CTTNNCCATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXCGCGGAATTCAGGTATTTCCCTGAATCCATTTCACATTTCAGTGTT
TGAGATCCAGCTGTGTATGGTTTTGTTGACCCCACCTCCGTTCATTAAAT
CCTGGTTCCTCATCTGTGGGGTGGGTAAACGACCACAGTAAACACCTCAC
ATGGTGTTGTGAGGATTAAACGGATCAGTGCCTAGAAAGCTTATCATTGC
CTCTGACCCATGCTAGGTACTCAGGTACGACTAGTCATCATTGTGGGTGT
GGATTTGAGGATGATAAGTACTCATTTTCTTAAGGTCTTCCACATGTGGG
CTGTTCTGGTAGAATAATTTATATATCACAGTAAAAAATTTAGTGTGAGG
GTGATGATGGTGACTATGATGGCGACCACAGTGAAAACTAGGGTTACTAA
ACTCGGTTTAGGCTTCCTAATGCTTTTCTCTGAAGGTTAGGGTTTGAGCC
CCTAGTCCCATGGGAGAGGTAGGCCGGGCAGAATCACTCAGCTGCATAAT
TACTCCGCTATGTGCTGTCCCGTTATTGGTGGTGCTGGACCTGCTTTTTG
CTTCTTTCTCTTCTCAATAATCTCCCTACTGCAGTAATGATATACTAAGA
CCTATAGGTAGGGAGGCCTGATAGAGTCCCGTATCATGTAGATACGTAGA
TAGATACATAGATTGATAGATAGTTTTATCTTTCTATCACCATC
| NCTCCCCCCCCNNNTTCACTTCCTTCTTCCTTTTCTTCTTAAATCCNNNT
CCACAATGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXTTTTCAGAAAAATTCTTCGCGGAGCGTACAGTACTTCA
CTTCGTTTTCTGGCAATGTTTTCACTCCCTGCTGCAAGCCTGGAGTCCCT
GGCAAAGCCACCAGATTATAAAGAGCGACCTATGCAGCCCGTGCACTTCA
CTGAAAGCGACAGAGACTATAGAGGACATTGCCCTACAGATGGATACACT
GAGTCCCACTTGGCACACAAGCAAGCCACCTTTCCTTCTCCCTCCAAAAC
TCCAAAGAAACCGCCAAACTCCTGTGCCACAGATCTATCTCGGGCACACT
AATCAATCGCTTCTAAAGCCAAGCAGCCCCTGCTGGGCATTCTGCCAGCC
CCGGGTTAAGGTGCAAGCAAGAAGCCACTTTCCCCAGTTATCTTTGGGAA
AGGGCGCGAGGGGTGGCTGTTGGGGTGTTGAACAGAAGCCAGACTGACCT
GAGCCGGAGGTGATATACGGAGCGGGCGTCCAGCAGCCTGTGCGAGGGAT
CCCCCGGGTCTGGTAGGTCGTTGCGCTCTGGTAGCACCTGATGTCCGCCG
GTGTGTAAAAGGCCATGTTATCACTTATTAATTACCGCCTTATTGTCCAG
AGCGAGCGGAAAGCAGAGTACACTGAAATGTATCTTGCATGCACGGATGT
TATACTGCTATCTATCCTGACTTTTGTCCGTATTGAATTAATAATACTTC
CTTCGTCCTG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 3 0 0 3 6 6 6 6 6 8 8 10 11 8 6 6 3 0 3 8 8 8 8 7 8 6 6 6 8 8 10 15 11 11 17 3 0 3 3 0 3 21 21 3 0 3 0
3 18 3 0 0 3 6 6 6 8 8 8 9 9 12 10 11 23 26 37 37 28 28 28 25 27 28 28 31 41 27 29 33 28 29 28 37 37 26 21 16 12 15 10 10 10 10 10 10 14
15 20 20 24 28 37 33 33 28 28 22 22 22 20 22 19 19 11 11 9 10 10 15 18 11 23 14 12 15 19 21 30 37 37 39 39 47 47 47 47 53 47 47 47 42 42 47 48 48 57
48 48 33 33 30 33 28 28 37 43 43 43 57 57 48 48 43 39 37 35 32 25 27 12 12 12 11 9 11 14 17 28 32 37 39 40 40 40 43 43 47 47 47 37 30 26 15 15 35 32
40 40 39 39 30 32 30 34 32 43 43 43 48 47 57 57 57 42 42 32 32 24 23 12 11 11 11 18 17 24 36 23 25 23 28 18 27 19 23 23 36 32 42 30 35 35 42 37 37 42
42 46 43 36 36 23 23 23 37 36 42 42 35 35 35 43 43 43 43 32 29 29 27 38 18 15 13 21 21 35 43 38 38 18 18 18 38 38 37 37 26 38 14 14 14 27 32 43 33 33
33 43 43 43 43 32 36 23 27 24 28 28 28 43 43 43 43 27 27 24 30 22 23 23 18 26 18 20 20 20 24 36 34 15 15 15 19 17 17 17 20 20 28 32 27 27 33 29 33 33
33 35 35 43 43 43 43 42 32 28 32 43 43 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 52 38 38 13 13 13 12 16 12 11 24 24 43 43 50 50 32 30 20 20 20 32 24 25 12 12 12
11 17 10 10 10 14 24 24 18 19 11 11 11 24 19 17 17 11 10 10 13 22 26 24 24 10 10 10 10 8 12 10 20 20 20 20 23 23 30 26 23 11 11 12 16 12 14 15 15 15
19 14 18 24 28 35 28 24 14 13 12 12 17 11 12 12 23 19 12 12 11 11 11 10 10 8 9 9 10 10 18 23 15 19 17 20 20 21 21 14 14 18 21 31 32 22 20 17 16 11
11 11 18 21 19 13 18 18 25 19 11 11 15 20 24 16 19 15 21 19 28 28 28 25 37 37 35 30 30 35 32 30 21 15 12 10 10 12 17 13 10 10 10 13 19 22 23 20 20 20
23 19 22 12 9 9 9 14 13 19 24 19 18 14 14 18 26 28 19 19 12 12 12 15 23 24 18 14 14 15 15 11 15 12 11 11 12 16 15 11 11 12 11 12 12 22 10 10 8 8
8 8 19 17 10 10 10 10 11 22 22 28 21 14 13 21 15 12 12 11 11 10 10 9 10 14 16 19 16 15 12 12 11 12 18 21 10 11 13 13 18 24 30 28 26 24 19 8 10 6
6 8 15 16 28 28 24 24 24 28 27 23 13 8 8 8 8 8 10 12 11 12 12 12 19 15 11 6 6 8 8 9 10 9 8 8 8 8 10 8 8 8 10 13 11 12 12 12 11 11
9 9 9 9 9 10 10 9 9 12 15 9 10 11 15 12 11 11 11 11 16 15 13 12 11 11 11 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 11 11 11 11 10 8 8
8 8 8 8 17 10 11 11 12 11 11 11 12 10 10 10 10 10 10 11 11 9 9 9 11 15 19 22 15 11 10 8 8 6 6 10 6 8 8 8 8 8 8 7 | Open.Hide. 0 3 10 10 8 9 8 6 7 7 3 0 0 0 3 13 8 8 8 19 19 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 17 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 3 0 0 0 3
8 8 9 9 8 8 9 9 8 6 8 8 10 22 23 24 28 33 33 33 33 35 28 28 28 26 24 33 36 37 19 19 8 8 8 9 8 9 9 12 15 19 15 25 18 28 22 28 37 36
36 36 36 33 43 39 41 34 27 16 9 13 9 9 9 12 9 9 10 10 10 9 15 19 28 33 33 59 59 48 48 48 38 38 38 34 34 39 57 57 57 57 57 57 57 43 43 48 48 48
48 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 48 48 48 28 25 12 16 12 12 15 8 7 7 7 8 8 23 25 41 41 41 40 40 48 37 37 30 30 28 36 36 37 39 39 39 47 59 59 59
48 48 48 48 43 40 43 43 43 43 39 39 32 32 32 43 43 57 59 47 47 43 43 43 59 46 44 43 43 43 44 59 57 44 42 42 42 42 41 47 43 59 43 43 37 39 39 44 43 37
37 37 57 44 47 47 54 54 57 57 57 43 43 32 43 23 43 43 38 38 43 43 52 57 57 54 54 52 57 59 52 52 52 52 57 44 50 43 39 39 43 50 52 52 52 52 52 52 52 43
44 36 36 20 27 32 43 37 52 43 44 44 52 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 59 52 52 52 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 62
52 52 45 43 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 44 62 41 41 39 43 38 26 23 27 28 36 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 35 39 39 43 43 52 57 57
57 57 52 52 52 52 57 57 52 38 38 22 15 17 17 15 15 13 18 21 33 27 23 23 20 20 27 38 38 43 43 43 43 43 44 38 38 33 33 43 44 44 44 29 27 27 32 32 27 41
43 32 28 14 14 14 38 38 35 35 35 44 35 32 32 32 43 43 44 43 32 22 17 17 17 30 30 35 35 42 42 43 43 42 42 47 42 42 31 42 42 47 46 46 44 32 18 18 18 30
30 26 15 12 12 12 12 11 12 12 11 12 12 18 18 12 11 11 12 21 27 15 14 14 16 16 11 11 11 15 17 16 16 11 11 12 12 11 11 12 15 15 25 25 28 28 24 23 23 16
22 11 11 11 11 11 19 15 18 18 19 17 8 8 8 8 8 8 8 12 10 13 13 10 10 11 11 22 17 11 13 11 11 11 11 12 12 22 25 23 23 19 19 15 15 15 13 13 11 12
12 15 12 15 15 13 8 8 8 8 11 8 9 10 10 10 8 8 8 8 13 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 11 8 8 10 10 10 8 10 10 11 11 11
11 11 15 19 15 14 14 13 13 17 19 13 12 12 12 14 9 8 8 7 7 8 8 8 9 9 9 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 15 11 13 10 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 9 16 11 9 9 9 9 9 6 8 7 8 8 9 11 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 12 8 8 11 13 19 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 11 8 8 6 6
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 9 10 9 9 11 11 10 17 13 10 9 9 9 10 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 10 13 11 7 7
6 6 6 8 6 6 8 8 6 6 |