BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-289J15.T7 (MSMg01no289_j15.b1) | MSMg01-289J15.TJ (MSMg01no289_j15.g1) |
ACC | AG419109 | AG419110 |
length | 725 | 718 |
length of high quality (start - end) | 239 (129 - 367) | 335 (76 - 410) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no289_j15.b1 PHD_FILE: MSMg01no289_j15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:23:57 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no289_j15.g1 PHD_FILE: MSMg01no289_j15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:23:57 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | plural | no hit data |
---|
sequence | CTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCCCAGAGGATCCGC
GGAATTCTCTGCTGTGTCTTTGTGGTTCATTTGGTGGCATCCTGTCTACT
GCTAAAACTAAGTTCTTAGTTTTGCCCGGAATTTTTGTTTTTTTATAAGA
AGAAACTTATGTTTCCCGTGTATGAGATTCTGTCTGCTGTATTCTGTATT
TTTTTATATTTTATTTTATTTTTTTGACTAACTGTATGGAAAATTGTCAG
TAAAGCCTTTGTCAGAGGATGAATTTTTAATCCCGCCAGAGTCCTGGTTT
AATCAGGTTTTTTCGTAAAGAATGTTTGGCTTCACTCAGAGCATGCCGTA
TGTCATGTTTTTGTCTTCTCTGCTTCTAACACCTGTGCTGTGCTGGTCCT
GCGCAGCTCTTTGTGCCACCGGTTGCCCCCACACACTTGTCAAACTTAGC
TGCTGGCCAGCAGGCTTACAAGGCATGGTCCCTGTTTATACTAGCCGAAA
GCTGAGCCCGTTCAGAGGAAAGGCCTGGGCCTAAGACCTGTGCCAACAGC
TACAGGTAGNTTTGTTGTTTTTCACTGCCCTAATTGTGCGCTTTAATTTG
ACCGATGACTGTTGGACAGAGCACCCATTTATAAAACCCTGTTTATCGTA
GGACACATCCTCACATGGTCACACATTGATTTTGTAAATAACAAACAGTT
TCACTATTTATTTTTTTGTTGTTTT
| CCATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGATCTCAGTGAGAGGGTCTCTGGT
AGAGACCAGCAAGAGAATTTTTTCCCATGAGCAGGTGGCCACGAGAGGGT
TAGTCCAGGAGGACACCAACGGAGCAGGAACAGTCAGGGCAAAACCAAGA
TGGCAGGTAACACCATGTGACTGGGAAGTAGCATAGTCAGGTTAGAACAG
ATGAGAACTCTGCCCAGCTATAGTGCAAGGAGCTATTAATAAACACACCA
AGTCTCTGTGTCATTATTTTAGAGTATGAGCAGGCATTGAAAAGCCCCGA
AGTTTTACACATCAATCCTGACTCCCAATCCCACCATGTCCCAAGTAAAC
AGCTGCGTAGATAGCACACCCTTTTTGTTNNNCTATCCACTGTTGAGTGA
GCACCTACTGAGGTGGCTTATTGGGGGTAGATCAGATGAAAACTGCAGAA
TGGCCTACTACTCTTGCAGCTGAGCTGGGACTGGACAACCTAGTGTTCTT
TGCTGGTTCTCTGGCCTGGTTTTACAATAGCTGAGTTGTCTTCTCCCTGA
ACTATACCCCATGATCGTGAAATGACCTTTGATGCTCTCCACATCATTTT
AATGACTCGTTTCTATTTTACAAAATTATTTTCGATTAAATAACTTGAAT
GTCCCCATTGTATCTTTT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 12 15 10 16 32 41 39 33 32 32 28 28 37 44 37 35 31 41 37 37 41 41 30 28 28 28 25 22 22 8 8 8 9 9 16 20 16 19 11 12 13 21 21 30 30 48
57 38 38 36 36 44 44 59 59 59 34 34 12 22 9 9 9 12 12 12 23 20 28 23 28 30 37 44 47 53 53 57 59 59 57 57 59 59 48 59 59 57 59 57 57 57 57 59 57 57
53 53 53 53 57 57 53 53 50 50 50 50 47 59 36 27 23 9 9 9 12 21 15 17 11 11 9 13 18 19 28 30 33 31 37 39 41 53 53 57 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 57 57 59 59 68 57 68 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 48 48 48 53 53 50 50 50 50 47 47 25 22 10 8 8 8 22 33 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 59 50 30 34 21 15 10 10 10 10 10 16 26 34 41 50 50 50 53 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 28 14 10 9 8 8 8 8 8 15 26 28 32 18 15 10 10 10 10 10 13 13 11 12 21 28 43 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59
41 41 40 47 39 40 40 40 59 30 36 34 25 12 7 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 13 13 9 9 9 9 14 19 31 37 28 34 32 34 43 53 59 59 59 59 59 48 48 59
59 59 59 59 59 57 59 57 57 57 57 57 48 48 57 48 48 50 50 50 47 59 47 47 43 36 28 28 43 59 59 47 59 47 42 48 50 53 48 57 32 32 20 32 32 32 30 48 48 48
48 48 39 47 39 39 40 43 44 48 43 39 39 36 36 37 37 37 35 39 24 27 15 15 18 27 31 30 28 22 24 30 34 30 26 16 21 21 30 34 34 32 29 22 30 24 28 28 36 39
33 33 28 28 21 23 21 13 3 0 3 23 23 47 37 23 22 18 19 23 19 10 6 6 6 17 19 24 23 22 23 22 18 17 11 11 11 12 11 11 17 18 15 8 8 8 8 8 15 8
9 9 9 13 9 8 8 8 8 8 19 19 22 11 11 11 13 11 11 10 11 11 14 19 19 12 12 10 12 15 13 12 15 10 10 10 11 9 11 18 16 14 9 8 8 6 8 6 6 8
8 9 10 10 15 8 8 8 8 8 12 12 8 8 10 9 9 9 9 10 13 10 9 9 9 8 8 8 8 8 11 8 11 11 11 12 10 10 12 8 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8
10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 13 15 15 9 10 9 9 9 9 9 11 17 17 13 | Open.Hide. 8 8 8 15 10 8 6 6 8 17 19 32 32 37 41 37 37 50 50 50 50 53 53 53 50 50 50 50 47 41 28 19 10 6 8 8 10 8 14 10 13 13 21 23 39 39 43 28 25 12
11 11 25 25 50 50 47 41 21 19 8 8 8 8 15 10 12 12 18 13 22 29 30 31 31 33 36 36 38 36 38 38 38 42 42 57 57 57 57 57 53 53 53 53 53 57 57 59 57 57
57 59 57 57 53 53 53 53 41 41 50 50 41 36 20 15 13 9 10 10 16 24 12 12 12 22 22 33 36 28 37 37 43 43 43 59 59 57 57 57 53 53 53 50 50 50 53 53 57 57
57 57 59 68 68 68 68 50 51 51 47 47 51 51 51 68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 51 50 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 57 35 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 50 38 26 8 8 8 8 8 8 14 20 32 44 47 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 35 41 22 13 13 12 19 19 30 40 37 47 47 44 44 30 30 30 30 41 59 41 43 43 57 57 57 57 57 48 43 39 35 35 40 59 59 47 37 35
35 32 32 23 25 25 25 24 20 20 20 26 25 10 8 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 3 16 27 34 59 47 59 59 50 59 59 59 57 57 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 57 57 43 48 43 43 43 36 35 35 39 42 46 48 46 44 37 41 41 20 20 20 36 36 48 44 43 43 43 57 57 57 43 39 39 38 38 32 19 18 34 28 39 42
42 37 37 37 37 40 37 39 46 46 59 34 23 12 12 9 14 14 22 37 28 36 30 30 30 33 32 24 28 29 34 29 42 34 34 33 33 28 36 28 32 23 34 29 29 29 29 26 24 21
21 21 21 21 26 14 14 17 30 30 37 39 31 28 30 34 23 12 12 14 14 22 23 12 9 9 12 10 11 11 11 11 16 10 10 8 9 8 8 8 11 10 13 12 8 12 9 9 9 9
10 10 19 23 30 18 18 11 16 11 13 16 8 8 6 6 10 10 10 11 10 12 10 13 10 11 11 12 16 14 14 11 19 15 10 10 11 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 13 15 15
11 11 11 8 8 10 8 8 8 15 10 8 8 12 12 12 13 10 10 10 10 10 9 8 8 8 8 10 10 18 10 9 8 8 10 10 9 8 8 11 8 8 8 15 13 9 9 8 8 8
8 8 9 12 9 9 9 9 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 |