BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-298A18.T7 (MSMg01no298_a18.b1) | MSMg01-298A18.TJ (MSMg01no298_a18.g1) |
ACC | AG425204 | AG425205 |
length | 708 | 748 |
length of high quality (start - end) | 575 (46 - 620) | 354 (66 - 419) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no298_a18.b1 PHD_FILE: MSMg01no298_a18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:34:38 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no298_a18.g1 PHD_FILE: MSMg01no298_a18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:34:38 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCAAGAGGAGCCGCGGA
ATTCCAGGTTTCTCGCACATTTAATTGAAGATGACATATGGTGTATGTTG
GGAGCCTATCAAAACTTGGGTACCCACAGATGTATGGGCCCATATCTGGG
GACTCTGTATGATTCTATTGACCTTCATGTCTATTTGTATCAGGATCATG
CCATTTTTATTATCATAAATCTTTGGTGTTAGTTTTGGTAATAACTCCTG
CAGTATCCGTTGCTTGATCTTTTATTCTTCCATATAAATTTGGAGGTTTT
TTTTTTTCTTTCTGTATTTGTGAGGAATGGTTCTAGAACTTTGAATACAT
TTGAATGTACAGATTGCTCTCTTTTTTCTTTCGTATGATAGCCATTTTCA
AATGTTTAATTCTAACCCATGAGCATGGGAGGTCTTTCTACTTTCTAATG
TCTTTTAGAAATTTTTTTCTCAGTGACTTANAAGCTTCATTGTAGAGGTC
TTTTGTTTCATTAGTTATAATCATTCTTTGTCATTATATCTGGGTTATTG
TGAATGGGATATTTTCTTGATTTCTTTTTCAGTGTATTTATCATAGGTAT
AGAGGAAAGGTAACTTTAACATTGTTAAAATTGTGTATTGTTATTCGCTA
AACATATTCCTCAACATCAAGAGTTTTTTGTTGTGGTCCCATAAAATACA
TGATATTG
| CGATGATGTGGGAGGCCTGGAGGCCGCCTGTTCACAGAGGGAGGTGAACT
ATAGAATTTCAGCGGAATTCTGCTGAATGAATGAATACTGACTCGCCACA
GGACGAACTGACAGATGAATGAGGGAGAGAATGGAGAAATGAGTGGATTG
CAAGAACTTCTTGTTTTTTAACTAATACGGAGGCTTTCAAGTTGTTGGAA
CTGTTAGTTCAGTTGAGGTTCAGTCTTCTTTGAAGTTATCTCTTTTTCAA
GGTAGCTAAGATTGTATGGCTGGATATTAATTTCAGGTGCGTGGATTACT
TACAAAAAGATTAACCCAAGGCTAGTTTTTCCTTTTTCGTACTTCCAGTG
TTGATTGTATTTATTCTCAAGATATTGCCTACATGAGAACGGGGATGTGT
GCGGGGGGGGGGGGGCCGTTCTGTTCCCTCCCCTTTTTCCTCCTTCTCCC
TTTTCTTTCTTTTCCTTCCTTCTTCCTCCTCCTCATTATCTTCTGCTCCT
TTATGATTCTATTTTCATCTCTCCTGTTTTGTACTTTTTTTCTTTTATTC
TTCATTTATTTTCTCTATCCTCTCTCTCAACATTCCCTACCCTTACTTCC
CTCTCCATCTACTGTCCTCCTTTTTTTTTTCTCATCCCACTATATCTATC
TTTTTGTCCCCAAATATATTTCTCTTTCCTCCCTCTTCCGTCCTCTATCA
TATTCCTGTCCTTATCCCGATTCTTCTCCATATCTATTACATTCTTCG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 12 28 34 29 29 27 27 22 22 32 37 32 32 32 37 37 37 47 42 27 27 19 12 12 8 13 8 11 11 9 9 8 13 11 12 8 8 8 8 10 10 27 33 28 30
31 31 31 31 28 28 28 25 29 27 12 9 9 9 9 9 23 23 37 37 37 41 40 48 48 53 48 57 36 36 36 36 37 37 47 57 57 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59
57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 57 44 41 30 30 41 42 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 48 44 36 28 28 44 44 57 57 68 68 68 68 57 68 57 50
50 50 50 51 57 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68
57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 38 38 43 39 28 28 17 17 19 34 43 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52
59 59 59 59 57 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 57 52 52 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 50 59 50 54 54 59 59 68 68 68 68 68 57
57 57 59 54 59 59 59 59 59 54 57 57 57 54 54 54 57 57 54 44 57 44 44 48 59 59 59 54 54 54 59 54 54 54 59 59 59 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 54 54 54
57 59 59 57 43 43 43 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 43 39 35 35 32 39 39 39 23 23 3 0 3 23 25 39 41 41 40 41 48 48 39 43 43 43 43 47 47 48 57
57 57 48 48 48 48 48 42 36 36 36 42 48 32 32 19 25 28 43 43 48 48 48 48 48 57 57 57 43 34 34 39 39 37 47 48 48 41 41 40 34 32 28 27 24 17 23 31 33 34
34 30 37 35 34 30 31 37 37 39 39 37 37 41 43 43 41 39 39 34 34 25 28 28 34 34 28 12 12 9 9 9 9 18 31 28 25 25 30 28 24 28 15 13 10 11 10 10 11 21
12 22 24 31 28 25 31 36 27 26 32 32 37 37 37 33 24 21 14 12 12 12 11 14 9 10 11 15 11 18 19 25 23 23 22 28 26 27 26 20 20 22 26 18 18 11 11 16 19 24
20 20 20 24 12 17 16 18 17 9 13 8 8 8 10 10 12 11 11 8 8 8 13 12 16 19 24 19 25 22 15 16 18 15 12 10 8 7 8 8 10 10 10 10 10 10 10 14 10 19
14 21 9 10 10 10 8 8 | Open.Hide. 6 6 6 13 9 9 9 9 15 12 16 10 10 10 22 34 37 26 28 13 13 13 24 28 39 41 27 27 9 8 8 10 9 8 10 9 9 9 10 10 10 11 15 29 25 28 12 10 10 22
25 37 23 19 9 10 10 9 6 6 6 6 10 10 13 15 27 29 31 31 44 53 53 57 53 53 53 53 42 42 37 40 40 47 53 57 53 53 57 57 68 68 68 68 53 53 50 50 50 42
50 50 68 68 68 68 68 59 59 48 48 41 37 36 36 36 39 35 39 43 57 57 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 48 50 57 57 48 47 50 50 50 50 57 57 46 46 48 48 48 48
57 57 57 57 57 57 68 68 57 68 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57
57 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 57 57 57 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68
57 57 57 57 57 57 59 57 57 47 38 27 12 12 12 12 12 12 12 21 32 44 59 59 57 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 48 42 44 40 43 43 44 44 39 44 44 54 54 54 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 54 54 46 43 43 48 48 57 59 59 43 34 34 34 37 34 47 48 48
39 30 25 17 17 19 26 28 33 32 28 30 28 26 18 9 9 8 8 8 10 12 13 13 9 9 8 8 7 6 10 8 11 10 16 11 11 8 8 8 8 8 8 12 10 10 11 11 12 12
15 15 26 22 30 20 13 10 9 9 10 10 8 8 8 10 9 9 8 8 6 6 6 7 8 8 11 10 13 15 10 8 8 6 6 8 8 11 10 10 10 9 8 8 8 8 6 6 8 8
10 8 8 8 8 6 6 8 8 7 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 12 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 12 13 14 19 10
10 8 8 8 8 10 8 6 8 8 13 10 9 9 9 9 12 10 10 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 8 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 13 10 10
10 8 8 8 8 10 9 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 8 10 13 10 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10
9 10 10 12 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 13 14 9 10 10 17 12 19 19 16 13 10 9 12 8 10 8 8 8 6 6 11 8 8 8 9 9 9 10 10
10 7 8 8 13 13 8 8 6 7 8 8 8 8 8 15 15 9 9 10 8 11 7 9 10 10 10 10 10 8 8 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 9 9 12 9 9 |