BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-316F02.T7 (MSMg01no316_f02.b1) | MSMg01-316F02.TJ (MSMg01no316_f02.g1) |
ACC | AG436698 | AG436699 |
length | 778 | 750 |
length of high quality (start - end) | 319 (71 - 389) | 524 (75 - 598) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no316_f02.b1 PHD_FILE: MSMg01no316_f02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:58:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no316_f02.g1 PHD_FILE: MSMg01no316_f02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:58:02 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCTATCCAGCTATCAAAAATGAGGACATCATGAGTTTTTCAGGAAAA
TGGATGGGATATCCAAATATCATCCTGAGTAAGATAACTCAGACTCAAAA
GGATATGCATGGTATGTACTCACGAATAAGTGGATATTAGCCAAAAAGGC
ACAGAATACCTAAGATACAATCCACAGAACTCAAGAAGGTTAACAAGCAG
AAGGGCCCAGGTGAGGATGCTTCAATCACACTTGGGAGGGAGAAGAAAAC
AATCAAGGGAGGCAGAGGGAGAGAGGGAGCTGGATGGGAGAAGAGAGGGG
GAGGGGAAAGGGGAAACAAGATTAGGTAAGGGGGAGGTANNNNNNNNTNN
NTTTNTNNTTTTTTTTTTTCCCCCCCCTTTNTCTTTCTCCCCCCTCTTTC
TTCTTTCCCTATCCTTCTTTTTGCCCCTCCGCCCTCGGCCTTTCTTTTCT
CTTTCGCCCTTCCTTATCTCTCCTCTCTGTTTCTTTTCTTTCGCTCTCTC
TTTTTCCTATGTGTCTTCCTCTTCTCCTTTTCTGTCCTGCTCTTTTCTCT
GCCCTTCTCTCCTCCCGTCCGGCTGCCCTCCTTGTTCTCCCCCTATTATC
CTGCATGCCAACGATTTCTTCTTTCTTTTTTCCCCTAACCCTGCTTTTAA
CTTCCGCTCCCTCCAATTGTTCTTATACCCTTCTTCTTTTTACCACCCTC
CCCTCCCTTGCTTTCCCCCTCCTTCCTT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXTTCCGAAATTCTATATTCATACTCATACTTTCAAG
TATCATCCAATTCTAGCCAGATCTCACAGCCACAACCTCTTCTCCTTCAG
CAGAACTTCGCTGGTCCCTCCCCTCCCTTCTGTCTTCCCAAGGCAATCTC
TACACGCTTTCCAGTGAAGGTTTCAAAACCCATCTTGCTTCCTTTCACCT
TTTTGCTTCTGGTTTTCCAATTTCCTCTGCTTAAAAGCCTCCCCCATTTG
CGATTGAGTGACCTCCTCTTTGTCTTTAAGGAGTCAGCTGGAGGGATGTT
CCAGTAACAAAGCAATCCACCCTGGGTTTCTGCTTGAGACAAATGTATTC
CTTCATGACCCCATGGTATTGCGCGCCTTTTCCCTACCCCAATAATGCAG
GGATTTGCAAACCTAAACAGTGTTCATCCACCAGAGGGTAGACTGATTAT
TGAGGCTGATCTTACTTCTATTGATGGCCTTAATTTCTAGATAAACTACT
GGAAATTGGGTAAATATGTGGGGAGCTGCACTCACATTTGCCATTACAAG
ATGGCGCTGACAGCTGTGTTCTAAGTAGTAAATAATCTGCACATGTGCAG
GGGCAGTTTTCTCACCATGTGGTTTGCCTTTCTCGTGATGACAACTGGGC
GGATGGGCTGCAGCCAATCAGGGAGTGACACATCCTAGGCGGAGGATAGT
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 8 13 16 28 39 39 33 32 32 28 28 37 39 28 26 25 32 32 33 41 46 33 33 33 33 33 27 22 8 8 6 6 6 8 14 18 16 16 16 22 22 26 37 47 43 35
35 35 35 36 36 48 48 33 33 24 24 16 15 16 16 12 12 11 11 11 21 23 31 31 31 44 41 47 33 33 33 42 34 35 42 57 57 57 59 59 47 43 39 39 43 43 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 46 46 42 42 37 37 48 48 48 48 47 47 47 47 47 47 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 47 57 37 37 32 43 36 44 37 35 32 44 44 68
48 48 46 46 46 48 50 50 54 57 57 68 68 68 68 57 57 52 50 43 39 37 43 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 43 33 42 42 59 59 68 59 59 57 57
52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 45 42 44 43 43 52 52 57 52 57 57 57 57 43 43 35 57 57 57 57 68 68 68 57 57 52 52 52 57 57 57 52 57
57 57 57 57 43 43 45 52 43 59 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 52 43 50 39 43 43 52 52 52 52 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 47 43
43 44 43 35 35 59 59 68 68 59 59 57 57 54 59 59 68 68 68 59 59 48 48 47 47 43 43 43 47 47 48 57 57 68 57 57 57 57 54 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 48 44 43 39 36 43 43 50 43 39 35 35 35 39 39 43 43 33 37 37 39 22 15 9 9 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 0
0 3 15 3 0 3 0 0 3 9 10 17 12 10 10 10 9 9 9 9 15 8 8 8 8 8 8 11 8 3 0 3 6 6 10 8 8 8 9 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 6 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 7 6 8 8 9 9 17 11 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 11 10 10 8 8
7 6 6 6 6 7 7 8 8 7 7 9 15 10 8 8 8 6 6 10 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 9 10 10 12 12 15 11 8 8 10 8 8 8 10 10
10 13 10 10 9 10 8 10 9 9 8 8 6 6 6 8 8 10 10 8 8 10 10 13 13 12 12 15 10 10 15 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6
6 6 8 8 11 8 8 11 8 8 8 9 9 11 13 16 19 10 9 6 6 6 6 8 8 8 10 10 10 8 8 8 10 12 24 11 11 9 12 10 11 8 8 8 8 8 8 10 10 15
15 13 10 10 10 10 10 12 8 8 8 8 8 8 11 8 10 8 9 10 10 16 10 14 14 17 17 21 20 20 14 11 10 8 8 8 10 10 9 11 8 8 6 6 8 12 15 8 8 8
10 15 15 12 10 8 8 13 9 6 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 16 13 13 13 11 11 11 11 10 10 10 10 10 10 11 11 12 8 6 6 6 8 8 12 10 13 9 9
15 12 10 9 9 9 11 11 11 13 11 15 15 19 12 12 13 11 8 8 10 10 8 9 10 9 9 9 | Open.Hide. 9 9 9 13 15 8 8 8 8 15 19 31 28 36 37 39 40 46 40 43 44 48 53 53 50 48 41 40 40 39 25 23 9 9 9 8 8 6 6 6 6 11 11 11 11 20 20 37 37 37
39 39 37 39 39 37 37 50 50 35 30 19 16 19 12 9 9 11 11 9 9 10 10 12 17 19 23 32 36 37 31 31 31 36 36 50 57 57 57 57 57 57 57 57 47 40 40 42 47 50
57 50 50 43 43 40 40 41 41 51 47 54 54 48 57 50 47 47 48 46 48 47 47 47 38 38 28 28 22 23 38 38 57 57 57 47 47 47 47 48 57 48 54 54 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 68 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 59 59 59 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 50 50 43 57 57 57
57 59 59 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 44 44 43 43 29 35 32 47 47 43 43 50 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 59 59 40 36 31 20 20 20 24 24 34 34 41 37 35 32 32 36 36 39 39 33 40 30 39 42 48 57 54 68 68 50 50 57 59 48 48
48 57 57 48 48 59 59 59 48 48 57 59 59 59 59 39 34 26 26 18 11 11 11 11 13 25 32 47 47 46 59 48 48 43 43 39 39 39 43 47 43 48 48 48 48 48 48 48 48 57
48 48 48 48 48 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 54 54 54 57 57 47 59 43 39 42 23 23 11 11 11 26 26 50 32 27 12 11 11 25 25 43 48 48 37 34 23 23 23 34
30 48 43 43 43 43 43 57 59 57 48 48 43 43 40 39 39 43 39 46 46 37 37 36 30 25 25 30 30 37 37 47 42 41 43 43 39 28 30 13 13 13 19 28 36 25 25 11 11 11
21 21 38 39 39 41 36 21 19 12 12 12 27 28 40 37 37 32 37 35 39 39 39 39 47 47 43 43 40 37 37 28 26 19 23 19 28 28 39 39 37 37 41 41 39 25 25 12 12 12
18 14 10 10 12 16 19 30 37 28 28 28 33 28 28 25 22 21 17 15 22 28 34 30 28 28 31 31 27 13 14 19 19 20 20 32 23 14 12 12 12 16 20 33 24 24 24 28 28 24
26 24 30 28 36 37 32 20 14 15 9 9 9 20 15 14 12 21 10 9 9 16 16 19 14 9 8 7 8 9 14 12 12 13 17 11 11 13 15 16 12 11 11 12 19 17 18 11 12 10
10 11 17 17 12 10 8 10 8 8 6 6 8 8 21 14 18 16 16 14 11 18 17 16 8 8 8 8 8 10 10 10 16 18 16 18 16 12 16 14 16 21 23 15 14 9 9 9 9 9
|