BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-320H18.T7 (MSMg01no320_h18.b1) | MSMg01-320H18.TJ (MSMg01no320_h18.g1) |
ACC | AG439704 | AG439705 |
length | 744 | 752 |
length of high quality (start - end) | 223 (378 - 600) | 485 (129 - 613) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no320_h18.b1 PHD_FILE: MSMg01no320_h18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:03:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no320_h18.g1 PHD_FILE: MSMg01no320_h18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:03:00 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXGTCAGCTCAAGGACTTTCTAGGACATTGGAACACTGG
CGAAGGCTTAGTTGTGTCCCAATTCAATCTTAAAAGGCACTTATAATAAG
AATACTAAAAGAGATCACGTGGATCCATACACCAGACTAACTCGGGAATA
GGGTATGAGTATGAGAACACAAAAACTCCAGGAGGTGTGCTTCCTTGAAA
CTCTCTGCCTCGTGAGTGGCTTTTAGGCTGCACAGCCTGTCAAGCTGACT
CGACCAGAGTGCATGGTAGATCATATTCTAACAGGGCCTGGGGTAGGAAA
GCTTGCTTGGTATAATTGCTCACTCTGTGTATGTTTGCTGTGGATCTCAA
CATGTACTTCTCATGGGGAAATATTCTACGTATTTAATCTGTCAGTGTCA
GAATCTTAGTTGTGACAGCATTTGAATGTGTCTCCATTGGAAGAAATTGG
GCAAAATGCATGTTGACAGTGTCTATATTATTTTTACAAGCACCTGTCAA
TCTCCTCAAGCTTTATTGCAATCTACAATTGCTTTTTCTTAAAATTTCAA
GTGAAAAACAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGCTTACCAAAGTTTAGAAGCG
CAGGACATATTTTATAAAGAGTTTTGCTCCCAGTAAATTTATTTTACGAA
TACTGAAAATTGGGGAAAATATTGATACAAAACAAGAAAAGCTC
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTATAACCACTCATCTTCTTTTCA
GGAACTCTGAAATACACTTGGACACATTACATATCTGTCTGATAGTTAGG
TACTCCTACCAGAATCAGGCCATTTTCCTTGGTGTGGTTCTTTCTATCAC
TCCCTTGTCCCTAAGATCTAACAAAGGCTGCAAATTCCACCAGGTCTTTG
AATTAAGTCCCGAGGATTTCAAATACTGCCTTAACTGTAGCTGTGAGCAA
AATGCCAAGAGGTGTGGGGGGACTATAGAGGTACCTTGAGAGGGCTCAGA
ACTGGCATGTCTGTTTTTCCCCTGTACCTCTAGCCTGAACAAAAGAATAA
AATGCATCCAACATGTCTGAGGAGAGGGAAGGTGCCAACTGCCTCTGACC
AGTTGTCCCTCCATAGCCAGCACTAGCCTTCTACAGATGTCACACTGCAA
GGCCAGACTGAACTCTTGAGGGGTACCCCATATAGACATCAGAAATGAGT
GATATTTTCCTCCACTTAGCAGGACTAAAGGAAAAACAATTTCCACAATT
TCCCTGGGGAAAAAGCAAACAAGAACAACAGGAAATGACAAGAAATTGAC
ACTTCAATCATATTTGAAGATGATATTGAAACTTCTCAGGGGCACGAGTT
GAGAAATATCCTGATTTAGTAATAATATTAAGAAGGTAGTTAATACAGCC
TT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 9 11 18 37 59 39 33 32 32 28 28 28 30 25 24 24 30 32 37 47 41 28 28 24 20 20 17 25 15 14 14 15 15 32 32 46 31 31 31 26 24 35 59 50 50 31 31
31 29 22 15 13 10 9 9 9 6 6 8 8 8 8 17 23 28 30 30 31 28 33 33 44 47 53 53 53 53 57 57 57 50 50 50 53 53 53 47 57 48 36 36 37 42 38 36 57 57
48 48 59 59 59 59 59 37 29 21 11 8 6 8 8 8 8 10 18 22 23 19 23 23 24 24 30 30 35 26 26 15 24 31 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42
42 42 42 42 42 54 54 57 57 59 59 50 50 50 50 50 50 57 59 54 50 50 50 50 50 68 68 59 59 59 54 54 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 40 40 42 47 50
50 59 57 57 53 53 53 53 53 48 48 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 59 59 59 59 27 29 9 9 9 25 25 39 41 42 50 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57
59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 68 68 43 43 43 43 40 43 43 48 50 48 57 57
57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 59 59 59 28 28 13 13 13 18 18 34 34 43 46 59 59 59 59 59 57 57 57 57 43 44 40 40 43 59 59 48 48 48 59 59 59 59 48 48 48
48 41 39 39 31 24 24 21 12 13 13 18 15 28 24 23 21 13 13 13 15 15 14 23 18 19 12 13 24 28 40 43 48 50 48 50 57 57 57 57 57 54 54 54 68 68 57 57 57 57
57 59 59 59 54 54 59 59 59 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 44 43 43 43 43 37 39 37 47 46 54 48 48 48 48 48 43 43 29 29 28 28 23 32 32 43 43 59
43 57 57 57 57 43 43 36 36 43 47 59 59 48 48 48 48 41 41 46 43 47 43 41 37 37 41 41 41 41 41 41 37 37 37 37 37 37 47 47 41 41 41 24 26 30 28 27 22 25
30 28 37 37 39 39 39 39 36 32 28 33 33 33 33 33 36 35 35 35 30 26 26 28 28 28 34 30 37 39 39 39 37 37 22 20 12 16 16 25 39 39 41 41 41 37 37 40 34 36
28 34 33 35 31 39 32 35 35 39 39 47 47 48 48 48 43 43 39 39 35 39 39 39 37 35 31 31 37 37 41 41 46 40 37 37 33 29 28 28 18 18 22 24 30 34 27 26 18 22
24 16 14 10 10 10 11 8 8 8 15 13 37 37 47 46 46 46 47 43 39 39 39 43 43 37 37 32 31 28 28 33 28 23 12 10 10 13 13 24 22 22 14 10 9 11 11 9 9 9
13 9 10 10 16 19 22 22 28 33 33 30 28 19 12 10 15 10 8 8 8 8 8 19 19 28 28 28 18 17 15 15 21 12 9 9 10 11 16 15 18 18 34 27 17 16 12 16 13 19
18 20 20 19 25 16 16 11 11 12 18 17 20 27 18 17 14 14 16 28 23 8 8 8 10 10 11 8 9 9 9 10 11 11 12 12 12 16 15 13 18 13 11 11 | Open.Hide. 6 6 6 13 8 8 8 8 13 17 39 29 29 32 41 37 37 44 39 39 37 37 37 39 48 41 40 41 41 23 22 13 9 8 8 10 11 18 15 14 16 16 29 23 37 37 37 53 53 36
36 33 33 33 33 42 35 25 17 9 11 11 11 11 11 11 18 20 18 13 10 10 20 23 33 36 59 59 59 59 59 53 53 53 50 50 50 50 50 50 53 57 57 57 57 57 42 42 36 36
36 36 59 59 59 59 50 50 50 42 41 35 23 23 9 9 9 9 11 9 9 9 9 9 9 18 16 23 20 23 23 30 30 43 39 39 43 57 57 42 42 43 43 53 53 59 59 59 59 59
59 57 57 57 68 68 68 68 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 57 57 57
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57
54 54 52 57 57 59 59 52 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 59 57
57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 40 41 24 21 15 15 13 18 24 32 30 40 57 57 68 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 59 44 48 48 43
44 43 47 34 34 19 18 15 16 12 9 8 8 8 8 8 10 14 25 34 59 26 26 13 13 13 13 13 24 26 26 20 28 32 43 59 57 57 57 43 43 39 39 35 35 35 43 43 57 57
43 43 46 43 43 48 48 59 59 68 59 59 59 57 57 59 54 57 57 48 42 42 28 32 23 28 23 25 25 28 28 30 35 36 42 42 43 43 57 57 54 54 57 59 57 57 57 47 47 50
50 57 57 54 57 57 59 59 59 50 50 48 48 48 37 39 39 59 59 48 48 43 44 39 35 35 37 44 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 47 39 39 35 39 39 44 42 43 40 40
40 46 48 48 46 46 43 43 46 57 48 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 48 43 48 43 43 40 37 37 37 37 37 37 41 37 37 30 28 18 18 24 25 27 25 37 30
30 37 37 43 43 57 57 59 59 48 32 32 22 20 20 22 22 11 11 24 29 31 31 32 32 28 28 20 28 28 32 32 35 30 28 25 21 15 15 15 27 30 30 24 28 28 28 28 34 36
41 41 41 37 39 28 25 28 22 16 17 21 15 18 21 25 30 23 23 11 11 11 11 12 19 15 15 15 15 18 12 15 10 10 10 19 19 29 20 20 13 11 8 8 8 8 8 12 19 16
16 14 19 22 14 17 22 29 25 22 22 27 32 36 34 37 27 29 25 20 28 23 21 10 9 9 9 14 11 18 12 14 15 22 8 8 8 11 9 9 9 10 9 13 9 11 11 15 25 18
19 11 19 15 22 17 22 15 14 9 9 9 11 16 21 16 16 11 10 9 10 10 13 13 16 16 9 9 8 10 8 12 12 15 15 18 23 10 8 8 8 8 8 10 15 10 10 9 10 14
18 14 |