BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-332H05.T7 (MSMg01no332_h05.b1) | MSMg01-332H05.TJ (MSMg01no332_h05.g1) |
ACC | AG448482 | AG448483 |
length | 1,314 | 1,311 |
length of high quality (start - end) | 639 (134 - 772) | 683 (140 - 822) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_h05.b1 PHD_FILE: MSMg01no332_h05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:54 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no332_h05.g1 PHD_FILE: MSMg01no332_h05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:18:54 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNGGCGATCATNNNNNNCCAATGGGCGCTAAGACTCCTAAGGGAGAGGAT
CCGCGGAATTCTCCATCCTACATTTGCCCTAACTAACCCCCTAGNACCTT
TTGTTGTTGTTGCTGCTCCTTAATTTTTATTCATTTATTTTGACAAAAGG
GACAGTCACTGGCCTGAAGTGATGCCTCAGCCCTTAACATCGCTGGCTTC
CTTTGCAGAGGACCTGGGTTCTATTCCCAGCACTCACATGGCTGCTCACA
ACCATCTGTGACTCCAGTCATAGAGGATCAGATGCTCTCTCCTGTCTTTC
ATGGCCACTGCACATAAATGCTGCATGAACACACATGCAGGCAAAACACT
CAGACATACAAATATATTTTAAAGGCCGGTGAAGGCTTTATCTCTGAGCA
TCATAGAATCAAAAACTTATAGCTACTGTCTAAAACAGTCTGTAGTATTT
CTTTTCTTGTTGACGTGACAAACATCTTTTAAAAGCCCACTGAAGGAATG
AAGAGCTTACCTTGGGACCTAGCAGGGAGGTGTGGTCCATTGTGGTAGGT
AGGCATGGCTATAAAGAGATGTTTCACTTGTGACAGGACTGTGAGCATCT
GGCCACAGTACCCCTGCAGTCAGAGGACAGGAGCAGGTGAATGTCCCTCA
ACTCAACATTTCTCTTTTATTAGCTTGGGGCTCTTGGCTATGGGGTGGTG
TCACTCACATTCAAAGCAGGTCTTTCCTTCTCAGTTAAGCCCCTCTGGGA
ATTCCATCACAGATGTATCCAGAGGTGTCTCCTAGGTGACACCAAACAAA
GTAAGTTGAAAATGAAGATGGACCCTCACAATCTCCAAATAAAACAATGA
GAACCCATTGATAGCCAAAGTCCACTGTTGGTCTGTCTGTCAAGAAACAT
GTCTTCTGACTTCCTTTAACAAAAACCAAAAGAAACACCTGAAAAAACAG
GGACGGCCTCCTAGAAAAAGGAGGGGGAGGCGAGAAGCTAAGGATAAATA
AAGGGTTTCCCCCAGAAGCCTTGTATTTTGAAAAGGTTCCAAACTTTGCA
AGGAACATCCCACCCCAGTTTGTAATAGAAAAAAACAAGTACACTTGGCT
GGGCCCCCAAAGCCCCTGGTTATGGAAAAAAAGTATTTTTACCCAAAATC
CCCCTAACCAAATTCTTTTTTTAGTATTTTGAGTCGAAACATCTCTCCCT
CANCAGGTTCCCTGTGTTGGCANGGGGGGATTAAATATAAAAAAGTATAT
CCCGCCTTTTTTCGTAAGACAATTAATTGGGTTTTCCACTTTGTGCTCAT
ATTTCTTTTATATA
| CCCCGCTTTTNTNNAACCATGTGAGGCTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAAAGTTCCCCAAGTGTAG
AGAACATCTCAGCCTGACACCCTTAAGCTTACCCCCGAGTGCTAACCATC
TGCCATCTTCCTATTGTGGGGAATGCTGAAGGAACTGTGAAGGATGTGGG
CCAGAGACAACCTTGTAGCCCAGGGGGATTAAAGCTTCTGTGCGTCACCT
CTTGTCTGTTTGGATGGATGGCAGAGAAACTGTTGTGCTTGCAGGTTTGT
TAACAGAGGTTAAACAGCACACTGTGGCAGATGGAGGGAGTGGCTTGTGG
ATAGCCCTCTTCCACTCCCTGTAAAAATCTACATAGATCTGAGATGAGAT
CACTTTGTTAATATCTTTCTTCAGTTGCCAAATTGTTGTGGTTTGAATAA
GAGATCCCCTTACAGGCTGAGGTATTTGAACACTCATCCTCAGGTGGGGG
CTGTGAGGAGGAGTGGTCCACCCCTGCTGGAGGAAGTACATCCCTGGGGA
CCAGCTGGCTACAAGGGTTCATAGTCTCCCTCGATTCCAGTTATCTCTGT
CTCTGTCTCTCTCTGTCTCTGCTCATTTTGTGGGGTTAAAGATGCAATCT
CTCAGCCTCTGGTTGCCATATCTCCTCCACCATATGGTCTCTGCCTCTAA
AACCAAACCACAGGCAGAAATAAACTTCCTTTAGTTGCCTTTGGTCATGG
TATTTTATGACAAATATGCAAATCCTTCTCTCTACTTTGCCTCTCTCTGT
TTCTTTCTCTGTCTCTCTGTCTCTCTCTGTCTGTCTATCTCTCTCTTCCC
CTCTCATGTTTAAAGACCAGTTAATAGAATCCCATAGCATCCAGAACATA
GAATTGTTCCGTAAACTTTTTAATTTAAGAATAAATGCAAATTTGATTTA
TTGAAAACCAAGTGTGCACTATACTCTGTTTTTTGAGGGGGCGGCTGAAT
ATGTGCTTATTGACCAAATGAATATCTAATCTGTGCCCCTAACTTAACTT
TACTTTCCTCAAAATTATTCCACTTCTTTCTCCCATCTTCTTGTTTGTGC
TTATTTTTATTCCATCCCGTTCTTCTATACAATTCTCTTTATTGCCTTAT
CCTTCCTACTCTCTTTCTACCTATCTTATATCTAACTCCACTTCATCTCC
TTCTTATTTTAACTTTCTTTCAATTCCATCTTTTTTACCTACTACACTCA
CTTTCTTCTCTTCTTTTCCGTTTTCCTTCTCTTCTTCTCTACCTCTCTGC
TCCCTCCCTTC
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 8 8 7 7 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 8 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 21 19 19 24 19 22 22 29 39
47 50 47 40 47 47 37 42 42 53 53 53 38 38 36 36 33 33 37 33 33 33 33 19 17 7 8 7 7 6 6 6 6 6 7 10 12 11 10 13 15 15 13 3 0 3 23 23 37 33
33 33 28 28 30 31 36 31 31 31 28 27 25 19 19 8 7 8 9 8 10 10 10 10 12 13 19 21 22 16 19 24 28 22 22 22 28 33 33 43 44 59 59 59 59 57 57 57 59 57
57 59 68 68 68 68 48 42 42 42 42 42 48 48 50 50 50 50 50 50 50 50 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 48 57 57 57 57 57 48
57 57 57 57 48 50 37 33 33 43 43 43 57 50 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 43
43 44 44 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 68 68 68 68
68 68 62 62 59 47 26 39 23 14 14 14 23 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 44 44 35 31 31 44 44 62 68
68 62 62 62 62 45 43 43 27 27 43 44 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 57
57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 52 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 57
54 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 52 59 59 59 44 35 35 35 43 37 50 50 57 57 57 57 59 59 54 50 57 44 44 35 35 35 50 44 57 48 42 42 36 36 36 44 47 48 47
59 47 54 54 57 57 57 46 43 43 57 57 57 57 57 44 39 36 40 28 28 19 25 12 15 15 27 27 25 36 36 39 39 39 37 37 30 30 30 42 32 42 30 30 30 43 42 48 48 48
48 59 46 43 43 43 43 43 43 57 59 48 48 48 46 46 39 39 30 20 20 11 11 11 27 27 41 37 44 37 30 29 32 28 28 28 28 37 33 37 31 28 32 32 36 28 24 17 17 17
25 24 34 32 39 36 39 36 43 37 37 32 28 28 28 28 28 25 20 22 25 25 21 21 35 31 26 30 30 33 26 26 21 14 17 30 28 18 25 22 31 34 37 41 41 36 32 32 24 24
18 22 21 26 23 28 28 28 24 28 23 23 18 19 20 28 28 34 29 28 21 21 11 12 11 21 22 26 20 22 18 12 13 9 10 10 15 18 37 37 37 27 21 21 20 29 27 27 29 29
32 36 36 37 34 36 28 32 29 29 30 29 32 24 28 13 23 11 16 12 25 24 17 17 12 18 11 11 11 17 17 19 12 15 12 12 12 15 20 15 10 8 8 8 17 15 31 34 28 19
16 12 11 11 11 12 12 11 19 22 30 30 24 16 11 9 9 9 12 13 13 10 13 15 21 21 14 10 10 10 10 10 10 17 14 11 11 13 10 10 10 10 6 7 6 9 6 6 11 17
16 15 12 10 10 10 10 11 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 11 21 24 11 8 6 6 6 8 8 9 11 11 17 10 10 10 10 10 10 10 11 16 21 8 9 8 8 8 8
9 15 9 10 8 7 6 6 10 10 10 10 9 10 10 15 15 12 9 9 9 8 10 8 8 8 8 7 9 9 8 9 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 9 9
16 14 11 12 12 9 10 11 11 12 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 7 6 6 6 6 6 12 14 12 10 9 10 10 12 10 6 8 10 8 8 6 8 8 8 8 10 11 11 11 10
10 10 10 8 8 8 8 8 8 10 12 10 8 8 8 8 8 8 8 6 8 9 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 7 7 8 8 8 6 6 8 6 9 9 9 9
10 10 10 9 9 16 13 14 12 15 13 13 11 12 11 11 10 10 6 8 6 6 6 8 9 9 11 15 16 15 13 11 11 11 9 10 10 10 10 10 11 12 9 10 10 19 12 8 8 8
8 8 9 9 13 9 8 8 8 8 10 21 10 11 10 9 9 10 8 8 8 9 9 9 10 12 12 20 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 7 7 6 8 8 8 8 6 6
6 3 0 3 9 9 9 10 13 10 12 8 10 6 6 6 8 6 6 8 8 3 0 3 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 10 10 15 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6
9 9 8 8 6 8 6 6 8 8 9 9 9 10 10 9 10 10 10 12 10 10 10 9 8 9 8 10 10 8 9 9 9 9 8 8 8 8 6 6 11 8 8 6 6 6 8 6 6 8
8 8 10 6 6 6 9 14 8 6 6 8 8 6 | Open.Hide. 7 7 6 6 6 6 6 11 11 3 0 3 0 0 3 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 6 6 6 7 9 9 10 11 8 8 9 9 13 12 19 21 17 8 9 9 15 15 19
10 10 19 25 28 32 32 36 36 37 29 28 33 33 35 36 36 50 50 50 50 59 47 27 23 9 9 9 9 8 8 9 8 8 8 9 8 8 8 8 8 12 10 10 19 23 27 31 33 44
44 53 53 53 53 38 36 36 35 35 31 31 31 31 31 30 29 19 17 11 11 11 11 11 10 10 10 10 13 22 22 19 12 10 10 10 10 10 16 23 24 28 28 31 31 36 53 53 53 53
53 53 53 57 57 57 53 53 53 47 53 47 47 47 47 68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 57 57 59 54 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 68 68 57 57 48 47 57 57 48 68 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 57 57 54 54 54 59 57 68 68 57 57 57 57 57 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 47 47 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 59 68 68 57 57 57 54 54 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 48 48 53 50 53 53 57 59 59 59
59 59 59 59 50 50 43 34 25 16 16 11 11 11 12 12 30 30 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 57 54
54 54 57 57 68 59 59 59 48 43 37 36 36 44 59 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57
57 59 57 50 50 50 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 59 52 52 52 52 50 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 43 43 52 59 57 57 57 59 57 57 45 45
57 57 57 45 45 52 57 59 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57
59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 54 57 57 59 59 68 59 59 59 59 54 57 57 57 57 54 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 59 59 47 57 57
59 44 57 43 43 43 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 34 32 15 18 18 34 34 46 43 43 43 59 59 59 59 59 48 43 42 34 34
43 43 57 39 39 35 35 35 39 39 43 43 48 43 37 36 37 30 29 29 22 18 18 21 23 37 59 59 59 59 59 59 39 39 39 37 36 41 41 41 37 26 30 18 18 20 34 34 36 32
28 28 34 36 47 47 42 48 43 39 39 39 39 39 39 43 44 44 57 44 44 43 43 43 43 43 48 48 59 48 34 34 22 13 10 10 13 21 19 24 24 30 30 30 39 40 34 34 36 36
39 37 39 29 29 32 32 32 30 30 22 24 12 19 19 32 23 33 28 33 22 27 12 18 14 26 21 23 14 14 13 15 10 16 16 23 24 39 37 37 36 36 37 39 27 22 10 8 8 8
21 19 11 11 10 16 18 17 19 12 11 11 13 17 15 9 9 9 12 12 14 14 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 10 12 10 10 9 9 9 12 12 12 12
12 12 15 11 11 11 9 8 7 6 8 8 6 8 8 8 9 9 17 8 8 8 8 9 9 9 10 9 9 10 13 10 9 9 10 10 10 8 8 10 10 9 10 8 10 8 8 11 16 15
19 19 19 15 12 8 8 8 8 8 11 21 14 10 10 10 10 15 16 21 13 13 8 8 8 12 12 28 25 20 19 14 9 9 9 9 10 15 19 18 17 8 8 8 8 8 8 8 12 12
11 11 11 12 11 11 10 8 6 6 8 6 9 9 11 11 11 11 11 11 11 8 8 6 6 10 10 8 8 9 10 12 18 23 19 19 19 15 16 11 8 8 8 8 9 11 10 9 15 17
15 18 18 14 17 17 9 8 8 10 10 10 15 13 8 8 6 7 12 8 8 8 8 8 8 19 19 18 10 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8
15 14 9 10 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 12 10 8 8 8 8 8 15 12 11 8 8 6 6 6 8 13 11 11 8
8 8 11 8 8 10 10 8 8 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 9 9 8 8 6 6 8 13 10 10 8 9 9 10 18 12 6 6 8 12 10 10
14 19 12 11 8 8 8 8 11 11 8 8 10 10 10 6 8 8 8 13 7 6 8 10 8 8 8 10 10 12 12 6 10 10 10 10 9 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6
8 12 14 9 8 8 8 10 10 10 8 10 11 10 10 10 13 11 10 11 11 16 16 8 8 8 8 8 15 8 8 12 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 15 17 10 9 9 7 7
9 9 8 11 12 9 9 9 9 12 9 |