BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-377B17.T7 (MSMg01no377_b17.b1) | MSMg01-377B17.TJ (MSMg01no377_b17.g1) |
ACC | AG482266 | AG482267 |
length | 791 | 769 |
length of high quality (start - end) | 449 (47 - 495) | 365 (77 - 441) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no377_b17.b1 PHD_FILE: MSMg01no377_b17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:17:11 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no377_b17.g1 PHD_FILE: MSMg01no377_b17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:17:11 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NTTCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCTCAACTGACCGATACCGAATGGGCTGAGAAGCACCTGAAAAAAT
GTTCAACATCCTTAATCATTGGGGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGA
TTCCACTTCACACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAA
CAGATGCTGGCAGGGATGTGGAGAAAGAGGAACACTCCTCCATCACTGGT
GGGATTGCAAGCTTGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGCAGTTCCTC
AGAAAATTGGACATAGTACTACCGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTAGT
CATATATCCAGAAGATGTTCCAACTGGTAATAAGAACACATGCTCCACTA
TGTTCATAGCAGCCTTATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAAAGAACCCAGA
TGTCCCTCAACAGAGGAATGGATACAGAAAATGTGGAACATTTACCCAAT
TGGAGTACTACTCAGCTATTAAAAACAATGAATTGATGAAATTCTTACGC
AAATGGAAGGACCTGGAAGGGATCATCCTGAAGCGAGGTACCTAACCCCA
AATTTGCCTTCTTTGATATTCTTTCCCTCGATATGGGCATATTAACCCTC
AACATTATAATACACCACTATACCCATTTGGCCACACTTTGTTACCCCTC
CAAAAAAGACATTATATATAGTGTGGCAATACTTTTTCTCCCTCCCTTAA
AAATTCCGTAATTACCACTCCTTTTCCCCTATTTCCTATTG
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAGAGGCGTGGACATGGGCCTGACT
TAAGTTCCACAGTTTGGAACTCATCCTTCCTTCAAGAAAGGCTGTTGAGT
CAAGGCCTTTCCCACTCATCCCTAACTATGTCTTGCACTAATTAGGTGCT
ACTCTAGGTGGTGGATATGTGGCAATTGGTAAGACACAGTTCTTTCTCTC
AAGGGCCATATATTGTAGTGTGTGTTGGGAGGCACAGTCGATTGCATGGG
ATAACTGTTTCCCAGGTAACTGCAGTACAGAGGCTTGGTGTCTTGCTAAA
GAGTTTCCCGTGCTTTAGCTTGACAAGTCTTGGTTCCGTGTGGAGGATGG
CCACAGACTGCCTTAGTATGAGATCCTTTATCTGGATTATGTGGTTAATG
CTTGCACACCTTTCCAAACTCTAGGTCTCTTCCTACTTGTTGGAAGGGGA
AATGAACCGACATTTTAAAATTTATGATACCTACTTGGTAATCACCCCTT
TCCAACGTGATTTGAGAACCTTCAGATTTCACTTACATTTTCTGCTTACT
TACTTGTTTTATAACATAAATGTTATTTTTCCCCCCCACTTTTCCACCCT
TTCCTTTTTTTCTCTTTTTTTCTTCTCCTATTTTCTACTTCTTACAATTT
TTCTTTTTCCCTTTTTCTCCCCCTCTTTCTCCCCCCTCATCACTTTTTTT
CTTTTTATTTTTCTCCCCC
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 7 8 8 8 8 11 10 16 17 27 30 20 18 18 27 29 37 39 37 37 37 37 30 22 13 20 16 19 9 16 11 11 11 9 11 11 22 20 21 21 22 22 21 28 28 37 36
24 23 22 28 30 30 30 27 24 13 10 8 13 8 8 7 8 9 9 19 19 40 37 41 41 53 47 50 57 57 57 57 57 57 50 53 53 57 57 57 50 48 48 48 48 48 53 47 42 42
42 47 47 47 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 50 50 50 50 50 57 57 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 42 48 41
50 50 50 59 68 57 57 57 50 50 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 57 57 52 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 31 38 43 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57
57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 44 44 35 42 42 47 44 48 48 48 54 59 59 59 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 48
48 43 48 48 59 57 57 57 57 48 48 39 42 39 42 46 57 48 57 57 50 50 48 43 40 32 32 30 39 32 39 41 47 47 47 43 43 46 46 46 43 37 37 32 29 27 32 37 37 36
37 37 37 37 37 37 37 37 35 33 37 37 39 37 41 25 24 24 28 24 24 41 30 25 22 18 21 19 28 32 26 24 15 15 15 17 21 27 27 28 33 33 22 19 10 8 8 9 8 11
11 16 17 29 30 30 30 28 20 24 15 15 12 16 12 14 17 26 26 17 14 10 15 10 11 12 14 14 28 28 37 25 26 16 13 13 22 19 17 25 35 28 22 10 10 9 9 9 10 13
14 11 11 17 15 17 11 11 10 11 14 13 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 9 10 12 13 15 15 11 12 13 19 10 8 10 9 9 9 9 7 6 6 6 6 8 11 16 13 10
8 8 8 8 8 8 11 11 11 11 13 12 14 12 13 9 9 8 10 10 10 13 16 16 14 9 9 9 10 8 10 10 8 8 8 8 12 15 15 15 10 9 9 9 15 8 8 10 8 8
6 6 7 10 7 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 7 8 10 10 10 11 11 12 15 11 11 8 11 10 8 9 9 10 8 8 8 8 8 10 13 10 8 8 10 8 10
8 8 9 9 14 13 10 10 10 11 11 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 11 8 10 8 8 8 10 10 13 13 18 15 16 13 11 9 9 8 10 10 8 8 8
7 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 10 10 10 15 15 13 12 15 10 12 9 8 8 10 14 8 10 9 7 10 6 6 | Open.Hide. 8 8 8 10 8 8 8 6 8 15 9 9 9 14 14 22 24 37 31 37 39 39 39 39 37 31 31 37 30 27 31 18 17 17 17 30 27 28 28 22 28 28 37 30 39 39 39 39 35 37
37 37 37 37 39 50 48 44 39 39 39 21 24 24 24 29 42 43 57 57 47 47 42 42 42 42 48 50 53 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 68
68 68 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 59 59 57 57 52 52 52 57 50 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 44 44 32 32 23 32 32 35 35 32 32 18 18 30 41 48 57 48 42 37 28 23 27 37 44 59 54 57 57 54 59 59 42 42 35 35 32 36 30 37 37 37 32 30 33
43 43 48 48 57 37 37 28 28 30 32 37 28 30 28 24 24 17 25 25 23 17 18 25 25 35 47 43 47 47 43 39 39 39 39 28 22 16 11 11 11 12 14 10 10 10 10 10 19 12
14 10 13 13 9 9 9 12 12 27 27 48 30 30 14 14 14 21 21 30 34 34 25 25 18 22 12 18 18 29 30 30 30 30 30 30 24 18 15 10 10 10 10 12 18 18 12 21 14 17
13 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 21 28 27 15 14 14 15 13 11 12 12 12 12 10 10 10 12 9 9 11 11 11 19 16 17 17 14 19 10 10 8 8 8 10 11 12 15
15 15 11 11 11 11 13 12 12 14 15 13 9 10 10 12 11 10 8 8 8 8 8 8 6 6 8 7 11 10 10 10 10 11 11 12 12 17 20 20 19 19 10 10 8 10 8 8 8 8
10 10 7 7 8 8 10 12 13 12 14 20 16 15 11 8 8 8 9 10 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 14 11 11 15 13 10 9 8 8 8 8 7 7 10 10 24 21
15 12 8 8 8 9 10 10 13 11 8 6 8 6 6 8 8 10 12 10 12 12 19 10 10 7 7 8 10 12 12 11 13 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 13 19 19
22 20 20 18 20 10 12 14 8 10 10 15 13 12 25 23 26 12 14 12 11 13 14 15 17 19 11 8 8 10 10 17 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 10 10 15 18 22 17 19 8
8 8 8 9 7 6 6 6 10 10 10 8 8 8 8 8 7 7 7 |