BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-392E06.T7 (MSMg01no392_e06.b1) | MSMg01-392E06.TJ (MSMg01no392_e06.g1) |
ACC | AG493840 | AG493841 |
length | 758 | 754 |
length of high quality (start - end) | 484 (50 - 533) | 430 (71 - 500) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_e06.b1 PHD_FILE: MSMg01no392_e06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:44 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no392_e06.g1 PHD_FILE: MSMg01no392_e06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:36:44 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNAATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXC
GCGGAATTCCTTCTATAGCTACATGGAACATGTATTGTGATTTGGGAGTT
GAGCAGATACCACCTGTACCAAGCTGTTTCGACTGTGATATTGAAACTAA
CTCAGTTAAAATCCTTATCTTCCCTTTTTCATCTAGAGAATCATCAAGAC
TACCAACAGTCTAGAATTAAATTCATTCAGGTGTAGAGATTCTGTCCTAC
CCTCTCACTGATATGAAATACCTATGCAGTGGTCAGAATCTTAAACATGG
TGCCAGCAGATTTTCAGAGACTTTCCCTTTGTGTTTAGAATGGTGTATAT
CTGTTGGGTGTCATGAGGAGGGTTCCAGGTGGTGTGAGGGCTCACTCAGG
TCAATTCTAGTGTCATCTGTCTCTTGAACCCCACAACCTTTACTGAAATG
CTGCTGAGCAAAGTGGTGCACTATATTCAGAGCAAGGACTTCTGGGATTA
TCTCATGGGTATGCAATTTTGGGGTGTACCAACTGGGGACTCGCCATTGC
TGCTATCAATGATGTGAAGAAGTATCCAGAGTGTAATACCACTTGGAACA
TGGCTTATGGTTGCATGCCTGCAAACCATGAAGTAGCTCTGTTTCTCTCC
GGAGGACCACTCCCTCCATTATGACATGAATAGCACGTTTTCCGCCAAGC
ACGGTTTCCAAAACCTCTTTCAGGGGAACGCACTCTGGGCCCCGGGATCC
CACGGTCC
| GAAGTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCTGGTCCCCACCTACCATCTCAGCATAGG
AATGATTTGACTAAAAATGTGTGCTGCCAAGTCCAGCTTTACTCACATGT
GTTGGAAATCCAAACTCAAGCAGTCCCATGTGTGCAGCAAGTGCTTCACC
CACTGAGATATCACCCTAGCCCGAATTTAACTGTTAAATTCCATACTCTG
AATGCTCAGAGACAATGTAGCAAAGGCAAAACCAAAATGCTGATGACCCA
TGTCTCTGGCATTATTCTTTTTTAAAATCATGTTTCCAGACAGGAATGAC
AAAAGAAGAAAAAACCACCCTCAGTGTGGGCATTGTCACCCCAGGGCTTG
AAGTCAGGAACTGAATAAATAGGCAAAAGGAAAGACCATGGGAAGTGTCA
CTTCCATGTATATTAGATTTGTTCCATCTCCCCCTACCATGCTCCATGGT
TTTATTCTGCGAGAGCAAAACTGAAGGATGAAACCGGTCCTCACTACACG
AACTGAAGAAGGAACTGGCCAACACCCCTGAATCTTTCCCAAGGTCTTTA
TATTCATCCTCCGCATCCGAACCTATTACTTTATACCTGAACTCCCCAGA
TTCTTATTCTTTCTCCTCCCGTTTATATACCCCCCCCCCTCTTCATATTC
TTTCCTACCTCATATTCCCCCCCCCTTCCCTCTTACTTCCTTCTTATTTC
CCTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 10 8 8 8 8 11 20 27 31 34 37 37 30 22 18 23 15 23 22 24 24 24 43 43 23 17 14 12 12 9 12 12 11 11 11 17 24 34 34 28 28 28 28 28 28
39 39 39 30 30 30 31 33 33 39 40 25 25 12 12 11 15 23 31 37 37 33 28 28 30 47 32 36 36 36 36 36 57 57 59 57 48 47 47 48 48 48 48 48 48 48 48 54 54 57
59 57 57 43 41 41 46 46 46 48 47 47 47 47 57 54 57 57 57 47 47 47 48 57 57 57 59 59 57 48 54 54 57 57 48 57 57 68 68 51 51 50 50 68 50 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 57 59 57 57 57 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 57
57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52 43 59 59 68 68 68 62 68 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62
62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 52 54 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 52 62 62 62 52 52 52 52 62 44 59 52 62 62 62 57 57 57 44 44 43 43 39 43 43 52 57 59 57 57 57
57 57 52 43 43 43 57 57 43 43 41 41 43 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 47 43 52 43 44 43 52 52 52 52 52 57 57 59 59 54 50 50 43 43 52 57 43 43 35 50 50
52 52 52 57 57 57 57 57 57 52 52 48 57 57 57 50 44 43 27 27 43 44 50 57 59 57 57 47 43 43 44 42 42 42 42 46 43 43 47 59 59 59 57 57 57 57 59 48 48 48
59 59 57 57 57 59 42 42 37 39 39 46 46 48 48 57 59 57 57 57 57 59 59 68 59 59 47 37 35 35 39 47 47 48 48 48 57 57 57 57 48 43 34 31 31 31 28 33 37 41
47 47 37 31 30 30 28 37 43 37 36 32 32 20 20 20 32 32 59 59 39 37 30 28 28 37 33 28 33 27 27 25 16 9 9 9 9 15 14 23 23 22 10 8 8 8 8 17 28 41
41 41 47 47 37 37 35 31 32 43 35 32 32 23 23 23 36 28 35 28 20 22 11 11 17 15 12 12 15 22 19 19 15 19 11 12 12 13 11 12 10 10 10 16 21 12 11 7 7 7
13 11 9 10 10 16 17 26 17 17 17 23 28 11 8 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 10 19 18 25 8 8 6 6 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8
9 10 13 10 9 11 8 8 9 9 9 9 15 10 11 10 12 10 10 10 10 10 10 8 10 10 13 14 18 12 10 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 11 13 18 16 12 9 9 9
9 8 8 8 12 9 9 17 17 12 13 12 8 8 8 8 8 8 11 11 11 15 15 16 15 19 12 12 11 11 12 8 7 8 8 8 8 11 12 16 13 10 11 10 10 10 10 10 10 10
9 9 8 8 8 8 8 8 | Open.Hide. 6 8 8 8 7 7 7 7 9 18 34 37 34 39 39 37 39 39 39 39 34 34 34 36 25 20 11 9 9 9 9 9 9 9 10 10 15 10 17 22 22 37 37 33 33 36 36 36 33 44
42 42 42 25 27 13 9 10 10 12 10 12 15 12 10 10 19 19 33 33 43 43 44 57 57 57 57 53 53 53 53 53 53 59 53 53 53 53 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 50 50 50 50 50 57 57 57 59
68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 47 57 59 57 57 57 57 52 52 52 52 52 52 57 57 59 59 59 68 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57
59 68 68 51 51 50 50 50 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 46 44
43 42 42 42 42 44 44 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 57 57 57 54 54 57 57 57 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 47 34 33 23 12 9 9 8 8 8 8 8 8 14 25 37 47 50 50 50 59 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 48 48 50 53 57 57 48
48 57 59 59 40 34 23 18 18 28 28 36 43 43 48 47 54 54 59 57 57 57 57 57 57 48 48 43 59 41 41 43 43 46 43 46 46 57 57 59 59 59 59 57 68 59 59 68 68 59
59 59 59 35 39 37 47 43 43 44 43 48 43 46 43 43 43 48 39 40 39 43 43 43 43 43 47 43 43 43 47 59 37 37 37 37 37 37 34 34 34 44 43 59 41 41 39 39 37 43
43 41 31 31 30 22 19 14 10 11 17 21 34 34 21 17 14 28 23 34 37 39 41 37 37 44 59 59 59 44 41 41 44 34 34 25 20 20 34 34 41 41 37 30 14 16 16 12 11 20
20 27 19 27 24 27 15 15 12 12 12 18 18 12 13 11 8 8 10 11 12 15 15 10 10 10 9 10 10 13 8 8 8 11 12 16 20 15 16 6 6 6 7 10 10 10 8 8 8 8
8 8 13 17 12 10 9 9 9 11 10 10 10 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 12 9 10 8 8 6 8 6 6 6 6 10 11 11 11 11 11 11 11 12 11 13 11 11
11 11 11 11 9 9 9 9 8 8 8 9 9 7 9 13 13 8 8 8 8 10 11 11 8 8 10 8 15 12 10 8 8 8 8 8 8 11 12 12 10 10 10 9 10 13 14 9 8 8
8 7 8 8 11 11 12 15 21 8 8 6 6 6 6 8 10 15 22 11 11 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 17 17 25 19 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 10
9 9 10 10 10 10 11 11 8 8 6 6 8 6 8 9 13 9 9 8 10 13 19 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 11 10 9 9 9 16 12 10 13 13 12 10 10 10 10 10
10 10 11 11 |