BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-466G10.T7 (MSMg01no466_g10.b1) | MSMg01-466G10.TJ (MSMg01no466_g10.g1) |
ACC | AG550356 | AG550357 |
length | 749 | 1,161 |
length of high quality (start - end) | 430 (76 - 505) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_g10.b1 PHD_FILE: MSMg01no466_g10.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no466_g10.g1 PHD_FILE: MSMg01no466_g10.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:41:52 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTTTTTTCTAAAATTGCGGCCGCAAAACGAGGCACAATTGCGACACGAGC
CGCGGAANNCTTCCTTTCGGACATGGAGAGATGCGTTCTGACAGGGTCGA
CAGAAGATACTGCAATATGGATGTATAATCAGGCTCTTGCTTCCTTCAAC
TTCAAGGTTCTTCAATGTGAACAACGCCAAGTCTAGATTTTGCAAAGAGA
TCAAATTTAGTGTGTACCCATCATGTCATGATTGCTGGGTAGATAATTTT
TATCTGACTCTGGCCCATTCTAATGTGCCAGAATTGTGTTCCCTTATTCT
ATACAGCTTATATTCTTTGTGAACTTGTGACAACCCTTTTCAGGGATCTT
GGGGGAAAGAGACTGCAGGTATATGTGATGGTGTAGGAGCAGCGCCGCCC
CCGCCCCGCCCTCAGCAAGATTCAGATCACCCCTGGCGCAGCGCAGCTGT
AGCTCAAGCAAAGACCAGGTAACAGCTTGTGCTGAGCAACTCTCCAGAGA
TGGTTGATAATCAGGATCAGCAATGGACATCACTCATCCATGATTGGATG
ACTCCAGGCAAAGGTGACAGCTCCCAGATACAGACAAGAAGATCCTCCCT
AGCAAGAAACAGAATCAAGAACCCCCTCACCACTATCCCATGTGCAATCT
GTCCTTGCTGTAAACTTTTGTCACTCTAATTTGCCTTCTCTCTCTGTTTG
AAAAATTGTCTGTTATCTTCCGTCCCAAATAGAGCCTCTCTCTTATTTT
| TTTATTTCTAATGTCAGCCGGAGACCGGCCTGCGCGTGTCGGCAGGTTTT
CTTCAACAGTGGAGGGGTGAGGCGTAGTAGATTTTCTCTCGCAGCGCAGA
GCAGCCACGGTGTCCAGGTTGTTTCGTAACCCCAGCAGCCCTCGCCGTTG
GCTGGTTGGACATCGCGTGAGTCTAGTTGTGGAGCTACAGAGGATGTCTG
CTCCAGGACGGATTTGGACTCCACTCTTAGACCCCCACGATAGCCAGGGC
TCATCATGTCTTTCGCGTTCAAGAGACCGTAATTGGGCTTATTCTACTGG
TCCATCTAGCCACGGCCACCCGAATTCTCAGCGGCGCCAGTAATACGCAA
TAGCAATATCAATAACATATCACATATATAGTTTCTATTCTGCCTTCCAT
ACTTCTCCTCCTCCGAGTGGTAACTACTGTTTGTTTTTGGCCAGCAGATT
GTAGCTGGGTAGGGTTGCTCACAGTATCGTGGCCGTGTGTTGCGCTTTTG
TTCTCCCTCAGGCTTCCTTGGAGCGCGCATCACTTCCCAGAGCCTAGTCA
ACTCTTGCATTGGTTGTTGAAATTATATATGTGTGTGGTTTAGTGCTTGG
TGTCTTGGTTTGTCTCTCGTTTGTTGCCAGGTGGTGTTTGCCGTCTTCTC
TTCAGTTGAGCTAAGTTGTATATTTAAAGTATATTGATTTATATGCTTCT
CCTGATGTCGCTTGATATTACTCTCTACCTCTCTCATGTCTTATTCATCT
GATTCGCGGCTTCGCGTGATATATATGTCCGCCCTGCATTCCTCTTATAT
TATATGTGTCGTTTGTTATTGTGATATTTGGATTGCGACGTTCGCTTATC
ATTCTCAGTCGCATCATCTTATACACATTTCCTGCATACTTCTCTCTCTC
TTATCTCGCTCTTTCTTTTCGCGCCCTCTTTTCTTTCTCTTCCTCGCTCT
CTATTCTACCTCGCTTACCCCTCGTATATGTATATAAATCGCCGCGACCG
CCTGTGGTCATCCTTCTCGTATATGTATGTGTTCTTGCTGTTCTCGCCGT
CGCCTCCTCTACTACTCACCTCTGCCTGCGGCACGCTCGTGTGGTTAGTC
CGTTGCATATGCGTTACTCGTTCGCGCGGGTAGTCTCCGCTCTCTACTCT
AATCGTCACGN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 7 7 6 6 6 8 9 9 10 10 10 10 15 19 19 11 6 6 8 19 19 12 8 8 13 15 17 13 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 10
10 9 23 23 21 21 3 0 0 3 20 11 11 11 7 9 9 10 6 6 6 6 6 8 10 10 28 31 29 28 28 28 28 35 43 48 48 43 39 40 39 37 39 39 39 39 41 39 39 41
41 42 41 48 33 36 33 33 33 36 43 43 48 39 39 26 28 28 12 12 19 26 34 37 48 48 48 54 48 48 48 48 48 57 47 57 57 57 54 54 54 59 57 57 47 47 47 50 48 47
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 57 57 57 57 57 54 54 54 59 57 44 43 43 44 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 50 50 50
50 50 47 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 54 57 54 57 57 57 57 57 57 54 50 57 57 57 68 57 59 57 44 43 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 59
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 44 44 43 43 57 44 57 54 48 48 57 44 57 54 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 46 48 46 48 48 48 57 57 57 57 48 48 48
59 59 59 48 48 59 59 59 50 50 50 34 34 21 21 12 13 12 12 11 12 12 12 15 22 28 34 41 48 48 48 48 57 48 48 57 59 59 47 47 47 37 37 37 43 48 48 48 57 59
59 59 42 35 35 32 43 32 42 32 30 30 37 44 40 43 39 47 37 37 35 47 47 57 44 43 37 32 25 17 17 32 32 57 48 57 57 48 48 44 47 42 42 35 35 35 35 37 35 42
42 42 42 33 33 24 32 24 14 14 30 32 32 19 18 41 41 57 57 57 57 42 42 35 24 24 24 24 30 32 37 39 44 44 41 35 32 30 30 18 15 30 21 30 17 24 22 33 36 34
31 23 22 28 31 28 28 42 37 39 43 37 37 30 24 24 22 24 12 12 24 28 32 33 30 30 28 34 34 34 25 32 22 18 10 11 11 14 19 32 23 28 26 22 15 12 15 15 32 32
31 31 17 23 11 19 13 19 19 26 20 12 11 10 11 11 13 13 11 12 12 15 11 9 8 8 15 8 8 10 16 12 13 18 13 16 19 14 11 14 12 17 11 9 9 9 9 12 15 23
39 41 32 30 16 15 15 15 11 11 11 10 14 10 10 10 15 13 12 9 8 8 8 8 10 9 11 9 10 10 10 10 12 10 11 11 10 10 10 10 10 10 14 12 9 8 8 8 10 10
10 10 10 11 11 10 10 13 12 13 12 9 9 10 10 9 8 8 12 8 8 9 12 19 11 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 11 10 10 10 9 9 13 8 8
8 8 10 11 15 15 10 8 12 7 7 8 10 10 12 20 24 19 15 10 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8
8 8 10 8 6 6 8 8 8 8 15 10 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 12 10 10 8 8 6 6 6 6 7 10 8 6 | Open.Hide. 8 8 6 6 8 10 8 12 12 13 18 14 10 10 8 10 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 10 11 9 15 21 14 10 14 15 13 16 16 9 8 8 10 8 8 9 11 11 15 14 16
8 9 9 9 9 8 9 8 8 8 8 8 9 9 10 8 10 13 10 8 8 8 8 10 11 13 10 10 10 10 6 6 7 9 9 10 10 9 9 9 10 10 12 11 8 8 6 6 8 8
8 10 8 8 8 8 9 10 8 6 6 6 6 9 9 8 8 6 6 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 11 11 12 11 10 10 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6
6 6 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 8 8 6 7 10 10 11 12 8 8 6 6 8 6 6 8 8 9 9 8 8 6 7 10 7 6 8 8 8
8 10 13 11 11 8 11 8 8 8 10 9 11 9 8 8 7 8 6 9 13 12 14 14 10 10 8 10 10 8 8 8 8 10 9 9 9 9 10 13 11 8 8 10 8 8 8 8 11 11
10 10 10 11 10 7 7 8 8 6 7 8 8 8 6 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 10 11 11 11 10 8 6 6 10 10 10 8 8 7 6 6 6 8 8 11
8 8 6 6 8 8 8 6 6 7 6 9 8 8 8 10 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 7 7 6 6 11 11 10 10 11 8
8 8 8 8 11 8 8 6 6 8 8 13 13 10 10 10 8 7 6 8 8 8 8 8 8 12 8 8 10 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8
8 10 10 10 12 8 8 8 8 10 8 11 9 9 6 6 6 8 8 8 8 8 8 10 13 10 9 8 13 10 12 10 9 9 12 14 17 12 13 11 11 11 11 11 11 12 10 10 10 10
10 8 8 6 8 8 8 13 10 10 10 10 9 9 9 8 8 6 6 8 6 8 8 8 10 8 7 7 7 8 8 8 8 8 8 10 11 11 8 8 6 6 6 6 8 8 18 19 12 11
8 12 13 10 10 9 6 8 8 8 8 8 8 8 7 7 7 6 12 10 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 13 12 22 18 17 17 10 8 8 8 8 8 11 16 10 8 8 8 8 7
8 9 16 18 8 12 8 7 8 8 10 10 8 9 9 9 9 9 9 8 8 6 6 10 6 6 8 8 8 8 8 8 11 11 11 12 8 7 7 10 11 10 10 10 8 8 8 10 8 8
8 8 8 8 8 11 9 11 13 13 14 10 13 11 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 9 9 10 10 10 13 13 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 11
11 10 10 10 12 12 19 16 15 13 10 8 8 8 8 8 8 8 9 9 7 10 8 10 10 8 8 6 6 8 8 8 8 9 13 10 10 10 9 8 8 8 6 6 6 6 6 8 6 8
8 8 8 9 9 9 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 7 6 8 8 8 8 9 9 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 10 10 8 8 9 9 9 10 10 10
10 8 11 11 10 10 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 6 8 8 9 9 8
8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 13 9 9 7 9 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 8 8 7 8 8 7 8 8 8 8 6 6 8 8 9 8 9
9 10 9 9 10 8 8 8 8 8 8 9 7 8 8 8 8 8 11 18 25 15 16 10 10 10 10 8 8 6 6 10 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6
6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 10 14 13 9 9 8 8 8 8 11 12 24 10 9 10 6 6 6 6 6 8 8 8
8 8 9 9 9 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 10 12 10 9 9 8 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9
9 9 10 6 6 8 6 8 8 8 6 8 6 6 10 7 9 11 10 12 9 10 8 8 8 8 10 8 8 9 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 6 6 8 8 10 8 8
8 8 8 8 9 10 9 9 9 9 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 8 10 8 8 8 8 8 8 6 8 7 6 8 6
12 10 9 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 14 8 10 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 9 9
9 9 9 9 8 6 6 6 6 3 0 |