BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-469B19.T7 (MSMg01no469_b19.b1) | MSMg01-469B19.TJ (MSMg01no469_b19.g1) |
ACC | AG552424 | AG552425 |
length | 2,329 | 787 |
length of high quality (start - end) | --- | 240 (72 - 311) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no469_b19.b1 PHD_FILE: MSMg01no469_b19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:45:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no469_b19.g1 PHD_FILE: MSMg01no469_b19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:45:34 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCGCACTNACGTTNCTATNACACACGTACATTNCTGANTCAGTATTTATN
NTGATNTATACAATANACGGAGTGATTTTTNATCCCTATNCTGCGCGCAG
CAGAGCNGACGGTGTCGTNCGGTGNCAGTGGTCGCATGACCAGTAGTAGT
AGTCTCTTCGACGTCTAGAGTACGCCTGCGTATGTAGCGTCGACGCGGCC
GTTTGTGCCCGGAGTGCACTGTAGCGCGCAGCGCGTCAGAATGACATGCT
GTAGTATATTGCTGGCGGCAGTANCTAGATACNNCATACGTCTACACAGA
TCGATCGAGTAGCACCGACAGCCGNCCCGACGCGATACGNGACGTAGTGA
TGATGATATCTCATATTCTATACTCACGCCCATATATATACCGCTAGCAC
TAGTACTATNTNACTAGCGCGCACGTACATCAAACGANCAGCACGCAGCA
CGTCGGCGGTCGNACGCATGATAATNTACTCATATCGAANGAGTACTCGA
CGAGTCGATGCAATCCGGCGNTAGTACAGCGACAGTACATTGACAGTCCT
TNNTCTACGATCGTGCTCGCATACATGATACCTANTGTNGTTTGTGNTNC
ATCAGAGCATGGGCTCGATCGCTGGTNTNGNNTGCACGACNCTTGNTGAC
ACACGCTGNGAGCGAAGCTCNTCTGCGGGTCCTGCTGGCTTGTNGCACGC
GCCCTGTACGNCGTGTTGTGATGAGCCCTGCTAGTCGCAGCGTCGCCCGC
TGAGATNACTACGTACTAATCTAGTGTGACGTANTCAGTNGTCTGCCGNG
CGCANTCTAGCTGACGTAGAGTATCGATATCACAGTGTGTAGCCGGANGG
ACGCAGCAGTGACGATGCGCGGGAGAGCNNACGAGACGAGAGTGATCGTA
CAGAGTGAGGGTGNGTTCGATGATATATAGATGTATGTAGAGCGTACTGT
CGNCAGGANCGAGGNCGACGTAGNTCACGACAGATCATNCGNGCTGCGGA
CGTAGTATATCGCGGACTGATAAGACACGGACGGGACGCGATGATCGAGT
GACAGTATCGACTACATACGATAGAGGCGNTGCACAGTCGCGACNGATGC
TATCGACGTCGAGATTNTAATCACANNCAGCGACAACAGTCATAGNTGCG
CTGANGATGCGCGCGATCNGNAGTGTGTGCGATGCGGGACGCGCATANTA
GCGCGCGTGNATTAGTNGTCGCGCGTCGTCGAGACGTACTCTGTATAGAC
GTCAGCGCCGACGTACANGTCAGCAGCTGATCGCGCAGATATNNTGNATN
ATCGCAGCGCAGCTGTACACGAGCGCCGTACTGNATGCGTATAGATACGT
CGCGCATATGGACGATTGTGATTACCGATCANTNGACGTACTATTANAGT
GCGTGCGTNGTAGTAGTAGTACTCATNGTAGAACTGCGTGGGATNCAGCA
GACGACGCTGACGCGCGATGNAGCGTGCCCCGTACATCTGTACACANTCG
ACTCGGATAGTATTACCGGGGGTCGTATATAGTATGATCGATGTATATCG
TGCTCAACACGCNACACGCCNTCATGATCGATGCGTCGTGACTGAGTNCT
CGTGCTAGCTGNGTCAGCACAGCGCGTACTGCCGGTGAGAGTGTCATCAT
CTNACGACTGCATNGCGCTCAGTCGTCTATTCGTNGATTACCGTNACTAG
ATAGTAGTCNTCGGCCTGCCGACTATAGTCGTCGCTACNGCGACTAGCNC
GATGNGCGACGTAGTATCGTGCNGANTGGGCGNCCNNACNGTATAACGCA
GTGTTGCANGCGANCGNANCGTAGTGACATCTACTCGATTTATCNTNCGA
TNCGCAGCACGTCGTAGTCTGCTGATGATACCGCATGACGTTANCGCCAG
TAGCAGTGCTGTTTNATGTAGNCGACCGCNGANTGANCTGATGTGTGCTG
TAGTGCNCGCAGCGNTGATGNCGGTGTNGACGTGAACTACGTGANATGAT
GGNAGCGTNGTGCGACCACCANTGACTGCAGNTGGANCCGGATGAGTCGT
CANTANGTNGATGTAGGCAGCGANTATTGTTNCGTACGGACGTCGNANGA
CTACTACNATCGTCTGCGTNNCTGAGCTGATGACGATACNGCTGCTCGTC
GTAACTTAATCANNTGATTGANTAGACTGATCAANTGTTCANGCAGACGC
NTCGTTNACNAATNATAGTCGGNCGTACGGTGTNCNGAACCANAGTATAC
TGCTCGTTAGAACGAGCCNGANATTNCCTNCGTGCCGAGGCTGCNGACGT
NGGNNTGATGNTCAGTCATTTNNGTTTGN
| CGTTTTGTTXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTATTAAATCAACAGAATCCTATAAATTA
AAAACATACATATAAAGCAAAATTCTAAAAAGCTACATATGGTATTACTG
AATGTAATTTCATATTGACACACAAAGACCAGAGATGGAGTTTGTAAGTT
CACTAGTTTTATTACAATATTTGGAACTCTTGCTTGTGAATGTACAGATG
ATAGCCAAAACTTTTAAAACTTATTTCAGCTCTAAGCATTACTGTAACTG
AGAACATAATGCCATATTTTTAAAGCTTAGGTTTGAAGTTTGTTGTCTGC
TGGGTTGACAGCACACAAACCTTACCTGTCATCTCCTTCGTCTGCTCCAC
AATGCGGTGGTTGAGGGTCTCCTTTTCCTGCTTCAGCAAAGTATTTTCTT
CCTTCAAGTTTGACACCTCCTATGAAACGAATAATCTTGCTGAGGTCGTT
GCACCATAATGAGATCGTCCATTCGACAGTTAATGACTGTGTCTTATGAC
CTCCCACACTTATTACTTTAGACTTGTCACCTGTCCCATTTGTCCTCCTT
TACCCCCCTTCCTCATTTATCTTTTTTTTCCCCTTTCTTTTTCACCTTTT
CCTCTCTCCCCTTTTTCCCCCATTCTTTTCTTTGCGCCCCTACGCCCCCT
TTTTTTTCTTTTTACCCTTTTCCTTCCATTTTTTTTATTTTCCCCTTTTC
CTCGTTCCCCCCTCTTTTCTTTTTTCTCTTACTTCTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 8 10 9 3 0 3 6 6 6 3 0 3 8 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 3 0 3 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0
0 3 8 8 3 0 3 9 9 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 8 9 8 8 3 0 3 8 7 7 6 6 6 3 0 3 6 6 7 12 6 6 6 6 6
6 8 9 9 9 3 0 3 6 6 6 8 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 3 0 3 7 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8
8 12 16 14 11 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 10 10 10 12 12 9 9 7 6 6 6 6 10 6 9 6 6 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 9 6 8 6 6 6 6 6 6 7 8 7 8 7 6 6 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 7
8 6 8 6 6 6 6 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 8 9 9 3 0 0 3 6 8 11 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 8 9 9 9 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 6 6 6 7 8 6 10 8 8 8 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 7 7 6
6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 8 11 10 10 9 6 6 6 6 6 8 10 8 6 6 6 6 6
6 6 6 10 6 6 6 7 3 0 3 0 3 6 6 8 9 9 9 11 18 13 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6
6 8 6 6 6 6 6 11 11 11 11 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 10 10 3 0 3 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 7 3 0 3 9 6 6 6 6 6 6 6 6
8 6 6 6 9 10 11 10 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 9 9 9 12 8 8 8 8
3 0 0 3 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 10 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 3 0 3 6 3 0 3 6 6 6 8 8 3 0 3 0 3
6 6 6 6 6 6 9 9 16 9 9 9 9 9 9 10 11 9 9 9 10 12 14 10 10 3 0 3 0 3 0 0 3 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 3 0 3 9 9 9
11 10 10 8 10 8 8 3 0 3 7 6 6 6 6 6 6 9 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 8 7 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 11 8
8 8 8 8 8 6 6 6 6 3 0 3 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 11 17 11 11 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 11 9 9 9 9 9 6 6
6 6 6 6 9 3 0 3 6 6 6 6 8 8 6 6 6 7 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 3 0 3 8 8 8 3 0 3 7 7 6 8 8 8 3 0 3
8 8 11 3 0 3 11 11 11 6 8 8 6 6 6 11 8 6 6 6 6 7 8 6 6 6 6 7 7 16 15 11 9 13 13 13 8 8 8 8 12 7 6 6 6 6 3 0 3 6
6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 9 3 0 0 3 6 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 10 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 9
9 3 0 3 7 7 6 3 0 3 10 10 10 3 0 3 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 6 7 6 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6 7 6
6 6 6 8 6 8 10 6 6 6 6 6 9 9 9 6 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 6 6 6 6 7 8 3 0 3 8 8 8 7 7 7 8 8 9 12 9 9 3 0 3 10 10 8 8
8 6 6 6 6 6 7 11 13 10 9 9 9 9 9 3 0 3 6 6 6 8 8 11 3 0 0 3 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 8 8 6
6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 10 10 10 11 11 7 7 3 0 3 0 3 6 6 6 10 10 10 10 10 8 7 8 6 8 6 7 6 6 6 6 6 9 9 9 9 3 0 3 8
7 8 8 10 9 8 8 6 3 0 3 6 6 8 8 3 0 3 12 11 12 8 8 8 8 7 7 7 7 7 8 8 8 11 11 11 11 9 9 9 10 9 9 9 9 9 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 8 11 9 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 10 10 3 0 0 3 3 0 3 3 0
3 8 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 11 8 8 7 7 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 10 10 11 9 6 8 8 8 8 8 8
10 8 13 12 12 11 10 9 11 6 6 6 6 8 6 10 9 9 9 9 9 6 7 6 6 6 6 6 8 9 3 0 3 0 3 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6
6 9 9 9 10 10 10 3 0 3 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6
8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 7 9 10 10 10 10 10 3 0 3 6 6 6 6 8 6 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 10 8
8 8 8 8 9 9 7 8 8 8 8 6 7 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 9 10 11
13 10 6 6 6 6 6 6 6 6 10 3 0 3 8 8 8 8 8 3 0 3 8 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 8 3 0 3 6
6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 10 12 8 8 8 8 8 9 7 7 6 8 6 8 9
9 3 0 3 6 6 6 7 9 7 8 8 3 0 3 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6
8 8 7 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 6 7 7 6 6 8 6 6 6 6 6 6 7 9 11 3 0 3 9 9 9 6 6 6 6 3 0 3
9 9 9 3 0 3 8 7 7 7 10 8 8 8 10 6 6 6 6 6 6 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 3 0 3 3 0 0 3 3 0 3 8 8 6 6 6 6 6 6 7
6 8 6 6 6 6 6 3 0 3 8 7 3 0 3 3 0 3 0 3 10 8 7 8 8 8 8 8 8 8 8 7 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 3 0 3 0 3 6 6
3 0 3 8 8 7 7 6 6 9 10 11 11 11 10 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 7 13 11 3 0 3 9 7 6 6 6
6 6 6 6 7 7 8 7 8 8 8 8 8 3 0 3 8 10 9 9 3 0 3 9 6 6 8 8 3 0 3 3 0 3 8 3 0 3 10 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 6
6 6 6 8 6 3 0 3 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 8 3 0 3 6 6 6 10 3 0 3 8 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 6 12 3 0 3 7 8 8 10
10 3 0 3 9 9 9 3 0 3 10 9 9 9 10 12 12 6 6 6 3 0 3 6 6 6 8 6 8 8 3 0 3 8 8 3 0 3 10 7 6 6 6 6 6 9 6 6 6 6
6 3 0 3 3 0 3 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 3 0 3 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 9 3 0 3 0 3 8
8 10 9 8 8 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 9 9 9 3 0 0 3 7 7 9 9 9 8 6 6 6 6 6 9 9 9 9 10 3 0 3 6 6 6 6 6 6 9 9 9
9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 3 0 0 3 6 7 7 6 6 3 0 3 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 3 0 3 9 9 9 9 3 0 3 6 6 6 6 6 9 3
0 3 10 7 7 3 0 3 3 0 3 8 3 0 3 9 9 9 9 9 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 0 3 8 6 6 6 3 0 3 8 8 8 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 6 6 6 8 3 0 3 3 0 3 6 3 0 3 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 6 6 8 3
0 3 3 0 0 3 7 7 8 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 7 3 0 0 3 6 7 6 3 0 | Open.Hide.11 11 11 12 8 8 8 8 9 9 12 12 18 30 28 23 12 3 0 3 17 14 19 27 23 23 9 9 11 17 8 8 9 9 9 9 13 20 21 27 18 19 3 0 3 17 17 25 33 33
41 30 23 9 9 9 8 8 8 10 9 9 9 18 11 11 11 19 25 37 37 59 47 47 47 43 43 48 48 57 57 43 30 30 24 24 30 31 31 29 37 39 43 34 34 20 20 15 34 28
43 48 42 48 42 42 33 42 30 30 30 42 44 36 27 20 20 28 23 25 28 36 37 46 39 42 44 47 57 43 47 42 42 32 37 28 32 32 42 32 25 25 19 19 32 32 48 48 43 36
36 24 24 16 30 32 44 43 46 46 37 50 50 50 52 52 50 50 37 37 52 52 54 54 43 50 43 52 43 44 43 32 24 28 28 36 36 37 43 43 43 43 43 35 43 43 57 43 43 23
32 32 38 38 33 41 43 50 57 57 57 57 52 52 43 43 44 44 44 50 47 47 50 32 32 32 32 37 43 43 46 44 48 59 57 57 57 47 47 47 47 41 47 44 57 42 36 32 36 36
26 32 24 28 32 37 47 47 44 44 48 59 59 59 59 48 46 43 43 42 42 43 43 46 42 31 42 37 37 37 39 43 43 43 39 39 30 39 40 59 59 43 43 39 39 35 39 43 30 32
20 20 20 34 34 41 41 41 25 23 11 11 11 10 7 8 8 10 8 11 11 13 12 13 15 28 22 28 23 23 28 32 32 43 47 39 37 35 35 34 34 23 23 19 25 22 28 32 31 22
20 12 12 12 12 15 15 10 10 10 19 19 28 19 19 14 15 14 17 17 29 30 37 39 39 35 35 37 37 43 43 34 34 28 39 39 32 28 24 14 14 14 27 26 32 28 33 30 40 40
30 24 28 23 23 20 15 15 14 14 14 18 26 15 18 11 11 11 25 19 22 25 30 36 42 37 36 24 28 22 28 30 32 19 13 12 12 12 12 21 24 30 37 42 32 40 30 23 23 23
27 21 22 22 19 19 11 11 11 16 16 14 15 13 11 10 10 12 11 12 10 15 12 19 13 15 11 10 10 13 10 10 10 9 9 10 9 9 9 12 12 12 11 11 11 11 11 11 12 16
12 12 11 11 8 10 8 8 8 9 12 11 9 8 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 15 11 14 19 18 10 8 8 8 8 10 8 15 19 19 13 10 10 10 10 10 11 11 11 10 10
12 12 10 10 8 8 8 8 10 12 13 13 10 10 11 12 10 11 11 11 9 9 9 13 10 8 8 8 8 8 12 13 13 12 10 11 11 11 11 11 11 11 14 10 10 15 10 10 12 9
11 11 13 15 21 22 10 9 9 10 11 9 10 10 10 15 15 8 8 8 8 8 13 22 21 18 11 11 11 16 25 25 15 15 15 11 9 9 16 19 10 10 6 6 6 12 21 19 17 15
9 8 6 6 6 7 7 9 10 10 8 8 10 8 10 12 12 17 17 9 9 10 10 8 9 10 17 10 10 10 11 8 6 6 6 6 6 15 9 8 6 6 6 6 6 8 15 24 14 13
13 15 17 28 24 14 9 8 8 9 9 9 9 9 11 8 8 8 10 15 13 14 15 19 10 8 6 6 8 8 8 21 27 15 14 10 10 10 15 16 16 24 20 14 15 13 15 10 13 8
8 6 6 6 8 8 11 12 13 19 15 21 21 24 28 17 16 10 10 10 13 10 10 8 8 8 8 8 8 9 9 9 8 10 8 6 6 |