BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-480G02.T7 (MSMg01no480_g02.b1) | MSMg01-480G02.TJ (MSMg01no480_g02.g1) |
ACC | AG561036 | AG561037 |
length | 732 | 729 |
length of high quality (start - end) | 532 (76 - 607) | 303 (324 - 626) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_g02.b1 PHD_FILE: MSMg01no480_g02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:00:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no480_g02.g1 PHD_FILE: MSMg01no480_g02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:00:40 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCGAGAAGATCCGCGGA
ATTCACATGTGTACCAGATACACTACTCTATCTGGAAGACACTGTTTCCT
TAGAGGCATCCATCACCTCTGGCTCTTATAATTTTTCCACTTCCTTTTCT
GTGTAGATCCCTGAGCTCTGAAGAGAGGGGGTTTGATGATAATGTCCTAT
ACTGATGCTAGCCACAAGACAGTTGCGATGGGTACAATAATACCTGATAA
TACACACATACATACACACACACACACATACATACACACACATACATACA
CACACACACACACACACACTTATATTTACACATATATATATATGATCACT
TAATATTGTTAAGTGGTCAATTAATCAGAAAAACATAATCATCCTAAATA
CCTATGCTTCCAATAACAGCTAAAATGCATGAAACAATACAAGAACTACA
TAAGTTTATAATTATAGCCTTATTTCAATACCCTGCTTTCAATATCTGAT
AAAACAAGTCTATAGAGATCACAAGTATATAGAAGATTGGAAGATGTCCC
AACCAGCATGTTACCTAAACGACCTACAGATGCGATGAAGTTCACATTAA
AAAAAAAAACCAAAAGCAAAAACAAAAACAAACCCATAAACATCATAACA
TACTTACAGAAGGGCCAAGGGGGAAAAATACAGGAATGCAGAGAGAAGCC
TACACACTTACGGTCAGCAGGTTTAACTACCC
| CATGCTGTGGGTAGGCTGGNGGCCGCCTGGTTCCCAAACTGTGGTGACCT
ATAGAAGGTGGCGCAAAATTCTGAGTGGTTTACAGCTTTCTGAAAGGAAA
AGAAAAGCTGGGATTCTTGCAGGAAAATGATGAGAGCAGGCTCCTATAGA
TGAAGTTCCTTGGGAGATGGGAGGTTAGAAGAAACTGATTATGAACAGTC
TGGACTAACAGAAGGGAAGCTGGCTGGAACTGAAGCCAGAGAGAATGTGG
GATGGGCAGGTATTACGAAGAAAGGAATATTTCCAGTCTATCAGAATGGG
TTTTCCTATCCCAATTTTTGATAAATTATACAGTTTCCAGATACTTCTGG
AGCCTGTGGTGCCTGAGTACGCAGCACAAGTTAGACATATGTTGCTGACT
TGTTCCCAGCCTAGAGGAGGGCACAGATCCTTCACAACAGAAATCACCAC
CCAGCATGGAAACCTGAGCAACAGTTTGGCAAAGGACACCATTTCCAGCC
CTGCGCAGAAGCTTGGGGGTCATGAAGCTGGTGGAGAGAATGGTGCAATT
CCACTCAAGAAAGGAACAGCTTCCCTCAATACTGCTTGCTTGGGCCAGAT
CTAACAAGAAAACAAAGAGCAGGTAACTAGTTACAACAGAAATGCTTCTT
AATGAGTTTTCTAAAGAGAGTAAGGAATAACTCTAATGAAGGAACAGAGA
ATGGTAAATTTCTCTTACCGTTGTTTTTG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 10 10 12 17 34 59 41 41 39 39 36 37 30 30 30 30 33 33 33 33 50 50 30 27 20 16 15 9 10 8 11 11 8 8 8 10 10 9 9 12 10 10 12 19 33 41 33 36
29 27 24 15 15 27 21 15 19 9 9 9 9 9 9 6 6 6 6 8 8 9 8 11 12 19 18 28 28 43 48 48 53 57 57 57 53 53 53 53 53 53 53 57 59 57 57 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 32 32 19 22 28 44 44 57 57 57 48 30 32 24 24 19 25 12 12 12 22 27 43 32 32 21 18 18 24 38 39 47 47 57 57 68 68 68
68 68 68 68 51 51 50 50 50 50 68 50 50 50 50 51 57 57 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44
36 36 25 25 26 30 36 42 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57
57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 36 25 16 9 9 9 9 9 9 9 9 13 9 10 11 12 29 34 59 59 59 47 48 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 59 59 37 39 35 37 39 47 43 43 43 43 43 48 59 59 59 48 48 47 47 47 57 59 57 57 54 54 57 57 57 57 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 57 54 54 54 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 54 54 57 57 68 57 57 57 54 54
59 59 48 48 48 48 57 57 68 68 68 68 59 59 59 57 48 48 48 48 48 57 57 44 43 40 40 40 44 59 59 59 59 59 59 59 59 39 39 31 26 26 39 59 39 41 41 41 40 48
48 48 48 43 43 43 43 43 46 46 48 59 59 59 48 48 59 43 43 35 35 35 47 39 48 48 48 48 44 43 36 36 39 23 23 12 19 19 20 26 38 37 37 30 37 30 37 34 37 30
30 30 25 25 37 35 26 28 18 24 24 37 32 34 34 39 43 47 43 30 19 17 15 15 19 37 36 39 36 40 40 40 40 39 39 39 39 31 31 30 23 18 24 28 25 28 31 37 30 28
33 33 28 25 24 19 13 11 13 8 8 8 15 15 28 21 16 16 12 17 16 17 11 11 11 17 17 17 12 14 16 24 14 16 10 10 10 16 19 28 22 24 24 24 24 28 23 23 11 11
11 17 11 11 10 10 9 9 9 10 16 22 30 23 22 18 18 9 9 10 11 11 11 16 10 9 9 9 10 13 10 10 9 15 15 14 10 9 10 9 9 9 12 10 10 9 9 9 9 11
12 19 12 13 13 12 9 11 11 14 12 11 10 10 10 14 13 16 14 14 11 15 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 | Open.Hide.10 10 10 10 10 10 10 18 18 23 24 14 9 9 10 9 13 13 3 0 3 20 11 11 20 27 25 25 9 6 6 7 7 9 6 8 8 8 8 8 8 8 8 21 21 25 14 14 14 26
19 41 39 27 23 9 9 9 9 9 9 9 12 8 8 8 9 10 10 15 13 18 18 28 28 44 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 59 59 59 59 48 48 48 48 48 57 59 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 48 47 32 32 29 37 22 20 10 10 10 13 23 41 48 48 46 46 46 48 50 50 50 68 68 68 68 68 59 57 59 57 57 57 57 59 68 50 50 50
50 50 50 68 48 43 39 39 44 44 44 44 57 57 50 50 50 33 33 14 12 10 22 10 12 12 34 34 68 68 34 34 15 15 17 32 32 32 19 19 19 28 28 11 11 11 25 34 11 11
12 27 30 53 53 50 50 27 25 11 11 11 25 23 37 34 39 39 41 37 37 40 40 43 43 47 39 39 47 48 50 50 57 57 57 48 34 34 30 36 37 37 30 30 21 21 11 11 12 11
11 12 23 30 36 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 57 54 54 54 50 50 57 59 57 57 57 57 53 50 50 50 53 53 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 32 25 15 11 6 6 6 7 7 6 6 6 6 12 11 16 27 33 42 59 50 50 50 50 53 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 39 32 37 37 41 33 32 30 37 43 48 54 48 57 48 48 57 59 59 59 59 57 59 59 59 59 68 68 68 59 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 44 37 37 41 41 41 39 40 40 46 48 48 48 48 48 57 57 48 48 48 57 59 59 57 57 57 57 48 48 48 48 48 48
40 40 40 41 41 59 44 41 41 37 37 37 37 37 37 46 48 46 46 47 39 37 37 35 36 36 37 37 37 39 39 41 41 37 37 43 43 47 47 46 46 46 48 37 47 39 33 33 33 37
41 47 59 47 47 47 41 41 37 36 39 37 39 39 46 46 59 59 59 39 37 37 37 37 34 36 28 28 34 30 30 39 39 41 39 40 40 39 37 39 39 31 31 39 39 41 37 32 30 27
32 32 28 32 28 20 18 9 9 9 9 9 9 17 36 29 32 37 28 30 27 27 30 32 39 35 31 28 31 31 41 39 39 41 39 39 35 35 35 37 37 36 25 28 18 20 15 20 30 30
26 22 8 9 8 8 8 15 20 34 31 27 30 30 26 27 32 41 30 26 15 13 9 8 8 8 10 13 24 20 20 19 15 8 9 9 14 17 14 14 19 14 19 25 31 24 22 8 8 6
6 10 10 16 10 21 17 24 21 23 23 34 30 31 31 34 22 18 19 24 19 18 18 22 19 17 17 17 16 16 14 21 19 14 15 21 25 25 22 22 23 15 14 14 10 10 10 14 14 10
13 15 13 10 10 10 10 10 13 14 13 8 8 8 10 10 11 10 8 8 8 10 17 13 14 14 16 17 15 |