BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-487L06.T7 (MSMg01no487_l06.b1) | MSMg01-487L06.TJ (MSMg01no487_l06.g1) |
ACC | AG566602 | AG566603 |
length | 747 | 744 |
length of high quality (start - end) | 544 (83 - 626) | 617 (80 - 696) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no487_l06.b1 PHD_FILE: MSMg01no487_l06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:10:23 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no487_l06.g1 PHD_FILE: MSMg01no487_l06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:10:23 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTGCCCATCTATAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCAGAAAAT
CGGCGGAATTCTCTGAAGTTTCCATTGAAGTACCTAAGTCTCTCCTTAGA
TGGAGGCTGTTGAGAGATTGCGGGTGCTTCAGTAGCCTAGCAAAGAACAC
AGAAACTCCCAGAACAACATAATCATAGGGCCCAACTTACTATGATTGTT
TTGAAATTTCATAAATTATATTTGATACTCAAAAAAAAAGCCATGCATAA
TGCCAGCATCTAATAGAATACCTTTTTTGTCCCCCAGAAGAATATTCTTT
GAATAGGATTTTGAAATTTTAAAATGTACATATATTTACTTATGTCCATG
TGTGTGTGTATGTGTGTGTGTGTACATGTGCTATGCATGGCTTTCAAAGG
ACAACTTGTAGGAGTGGGTTTTGTCCCCCCCACCATGTGGGTCCTGGGGT
TCAAACTCAGCTCATCTAGCTTGGCAGCAAAGACCTTTACCTGCTGAGCC
ACCTCACTAGCACACGATATGCTTTAAAGTAAAAACTCAAACTAAACCCC
CAAAATCTTAACAAAACTCAAGTTACCCTCACACACATTTCCCATCTCAC
AACAGTATACGGTGGCAGCTGCCAATACAGAAATGATGCCTTCTTTTTAG
GCAGAAAGTTTTGTTTTGGATCACAGCCTGAGGGTATAGGTTAGAATGGT
AAGGAAGGCAGGTCAAATGGGAGTGGTTCCAGCCGGGCACTCTTGAT
| NTTCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTCACCTGAGGAGTACTGAATG
GCTGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAGCATCCTTAATCATCAGGGAAAT
GCAAATCAAAACAGCCCTGAGGTTCCACCTCACACCAGTCAGAATAGCTA
AGATCAAAAACTCAGGAGACAGCAGATGCTGGTGAGGATGTGGAGAAAAA
GGAATACTCCTCCATTGTTGGTGGGATTGCAGGCTTGTACAACCACTCTG
GAAATCAGTCTAGCGGTTCCTCACTTAATTGGACATAGTACTACTGGAGG
ATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAAGATGTTCCAACCGGT
AAGGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCACCAAACCCAGACACTA
TTGCATATGCCAGCAAGATTTTGATGAAGGGACCCTGGTATAGCTGTCTT
GTATGAGGCTATGCCAGTGCCTGGCAAACAAAGAAGTGGATGCTCACAGT
CATCTATAAGATGGAACACAGGGCCCCCAATGGAGAAGCTAGAGAAAGCA
CCCAAGGAGCTGAAGGGGTCTGCATCCCTATAGGTGAAACAACAATATGA
ACTAAGCAGTACTCCCAGAGCTCATGTCTCTAGCTGCGTATGTAGCAGAA
GATGGCCTAGTTGGCCATCACTGGGAAGAGAGGCCCCATGGTGT
|
quality values | Open.Hide. 6 8 6 6 7 6 8 8 10 13 10 8 8 8 8 22 19 37 37 32 31 29 37 39 30 25 25 30 32 33 47 31 31 31 30 27 21 23 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 10 9
9 9 11 15 12 22 22 29 31 31 30 42 41 35 25 18 9 9 7 8 8 8 7 7 10 16 18 19 19 15 18 18 20 20 26 28 32 43 40 43 47 59 57 57 57 57 59 57 57 48
57 57 57 59 59 59 48 48 48 48 57 54 54 54 50 50 50 50 48 47 44 41 18 18 12 18 18 22 22 23 32 37 48 48 47 57 44 47 42 42 35 42 35 42 42 43 42 42 39 35
35 42 42 37 37 41 50 50 57 57 43 37 37 44 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 52 52 52 59 52 54 54 57 57 57 57 57 54 54 54 59 54 50 50 50 47 47 52 57 52
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 48 50 50 50 43 43 43 50 47 59 50 57 43 50 46
57 57 57 68 59 59 48 48 42 59 42 43 30 34 30 37 37 44 47 57 57 57 57 57 59 59 59 57 54 54 54 59 59 59 59 47 47 43 43 43 43 47 57 68 57 57 54 54 54 59
48 48 43 43 43 43 48 44 57 48 48 48 48 48 59 48 48 48 48 48 48 48 48 47 39 34 26 19 12 12 11 12 11 12 12 29 29 47 47 59 47 47 47 35 35 35 39 39 57 57
59 57 57 57 43 43 43 43 43 43 48 43 43 59 59 68 59 59 48 48 46 46 43 47 47 43 43 48 47 48 57 48 54 48 59 57 57 48 48 48 54 57 57 46 46 43 43 43 43 43
48 57 57 57 48 43 40 32 22 17 17 22 30 37 47 47 43 40 40 59 41 22 15 10 10 10 20 19 18 18 18 19 31 32 29 33 28 28 28 32 37 43 43 47 46 43 39 39 39 39
43 47 47 43 43 43 42 42 30 30 30 43 43 57 57 47 47 35 41 37 39 59 47 47 43 47 47 47 43 39 39 37 37 39 42 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 48 48 48
57 57 57 57 40 40 42 44 47 54 59 59 44 48 48 57 57 57 57 57 50 50 50 44 50 43 43 43 43 24 24 18 19 32 43 32 44 37 37 37 39 44 44 44 43 43 43 46 44 57
48 48 48 57 57 57 57 57 59 50 50 48 42 38 32 36 37 37 37 30 30 36 40 30 39 39 41 37 37 30 30 30 44 40 30 30 30 37 43 43 42 42 35 35 35 42 42 48 47 42
37 37 21 19 11 11 12 21 23 28 28 33 28 28 28 32 32 32 20 24 24 25 22 24 24 24 28 15 14 12 24 15 15 20 24 23 24 30 28 33 30 37 35 31 15 19 16 16 17 15
24 32 25 25 32 34 26 27 21 22 23 25 19 19 16 20 23 32 41 32 32 20 18 18 29 29 36 39 37 35 32 15 16 15 18 16 16 13 10 10 10 13 14 17 15 13 13 10 11 17
19 24 24 27 29 24 24 22 28 24 22 19 21 10 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 9 13 16 13 12 19 22 21 12 11 11 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 9 | Open.Hide. 0 3 6 6 8 8 15 8 8 8 8 8 8 9 12 10 16 14 27 26 29 29 37 37 37 37 37 39 39 39 44 23 21 11 9 9 9 9 7 6 6 8 8 8 8 15 14 16 12 16
27 34 36 36 33 33 33 33 59 59 27 23 9 7 7 7 7 7 7 11 16 22 28 28 31 31 33 33 36 37 36 36 39 30 34 36 42 43 50 43 43 35 35 39 43 48 50 54 54 54
48 48 43 59 43 43 43 46 46 42 44 37 41 43 43 43 54 43 48 36 41 36 33 29 37 37 37 42 57 57 44 44 48 48 57 57 57 57 44 44 32 28 23 36 36 57 42 50 42 42
37 37 35 50 50 50 44 37 57 57 50 50 43 44 35 35 43 42 50 50 50 50 57 52 52 52 52 43 50 43 43 43 52 52 52 52 52 52 43 43 52 57 57 68 57 57 57 59 59 59
52 52 52 57 52 52 57 57 59 43 52 43 43 39 43 43 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 62 52 52 62 62
62 62 62 62 52 52 52 52 52 52 43 43 52 52 43 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 52 52 52 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 45 52 52 62 43 43 43 43 43 43 52 62
62 62 62 62 62 62 52 62 52 52 62 62 52 43 62 43 43 35 39 39 43 29 29 11 11 11 11 29 39 44 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 44 62 52 52 52 62 62 62 62
62 62 52 43 43 43 43 52 43 62 43 52 52 62 62 52 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 43 52 52 62 62 62 43 43 35 35 43 43 43 43 44 44
62 62 62 62 62 62 62 62 62 59 59 59 52 52 52 52 59 59 57 57 57 57 45 52 52 57 57 45 45 45 52 52 52 52 52 57 52 45 45 52 57 57 57 59 59 57 57 57 57 59
59 59 42 38 41 59 59 59 52 52 52 43 43 43 43 52 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 52 52 52 57 57 54 54 54 59 50 57 57 57 57 57 54 54 59 59 43 43 43 43
42 42 43 43 43 44 44 43 57 57 57 47 44 43 42 42 42 44 43 47 47 57 57 48 48 59 57 57 57 47 47 50 48 48 48 57 57 48 48 46 47 42 42 35 35 35 40 40 48 48
54 43 43 43 43 43 42 42 40 59 35 27 27 24 19 20 30 30 48 48 43 59 37 32 30 34 34 33 31 35 28 27 19 20 18 30 30 41 41 41 41 47 47 43 43 37 34 35 37 32
24 24 20 28 28 39 32 37 30 30 30 37 34 37 41 37 33 30 28 25 28 31 25 25 32 32 32 41 37 37 39 34 39 37 37 41 37 31 40 37 37 32 30 30 37 37 41 44 39 31
26 28 28 22 22 32 35 36 39 36 26 30 24 19 19 23 23 25 25 21 21 14 18 18 34 28 35 35 35 35 33 39 39 39 39 39 39 35 39 32 37 28 28 25 25 23 13 12 9 9
9 10 13 24 24 28 21 26 18 28 28 19 23 18 19 16 18 20 23 23 28 34 29 36 36 36 31 39 37 37 30 29 20 20 19 20 25 32 32 30 26 18 18 17 |