BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-488I06.T7 (MSMg01no488_i06.b1) | MSMg01-488I06.TJ (MSMg01no488_i06.g1) |
ACC | AG567220 | AG567221 |
length | 756 | 746 |
length of high quality (start - end) | 649 (82 - 730) | 420 (327 - 746) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no488_i06.b1 PHD_FILE: MSMg01no488_i06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:11:28 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no488_i06.g1 PHD_FILE: MSMg01no488_i06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:11:28 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GGCATCAATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAATTCAAAGAGGAGC
CGCGGAANTCAAATTCTACTAAAAAGAGACTTTATTCAGGGAAGCTAACT
GTATAACAATAATCCTTCATGTCTTTATTGAATTGTCTTCAAACAGCTAC
ATTACTTGATTAAAACCATGTTTAAAACAATGACCCCTCCCAGACACGTC
TGGGTTTGTATCAAGCGGACAAAGAACAACTGGGTTGGGGTGGGAGGTGG
GGTGCCACTAAAAGGAAAATCCCTTTGGCCAATCAAATGAGGTATAAAGT
ACAACCGAAAACAAAAATTACTATATTTGGCAGTTGCCAAAGGCAGGTTC
TGCCAGCTCCAACTCACAAGGGGTCTGGCAGCATTTGTAGAAAGACGGAG
GCAAACGGTAGAAGACAACTTAACTGGCTAAAGTCTAGCCAACTAGTCAA
TTGCTTAACTAGTTGTTCACCGCATAATTAGCTAGTTATACTGCCTCCTG
AAGACCAACAAAGTTCAGTTCCTAGGACTGAACTCTCTGTTGGTTCAGTC
TGTGGGGTCTAGGGCATGTTCCAAGTCCAAGTGCAGAGCTTTCCTTCCAT
CAAATAGTAGCTAGCACTACTGTCCCGGTTGGGTTTTCTATTGCAGTTAT
AAAACACCATGACCAAAAGCAACTTGTGAGGGAAAGAGTTTGTTTCTGCT
TCTAGTTCCACATCACAGTTCATCATAGAAAGGAAGTCGGGCAAGAACTG
AAGCAA
| CCATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXTGCTCAAAAAAATTCTATCCCAGGTGGTTCCTGTTAGA
CCTTCTGTGTTTGCATTCCTCTGTTTTATGTAAGATTCCAGTTATCTCAT
TTGTACCTTGTGAATATGTCACCCAACTTCCTTATTGTCCTCTGCATAAA
AAGTCTGATACTCGATTTGAAAAATACATTCAGATTCCACATGACCTCTC
CTGTGTGTGTGTGTCTGTCTGTCAATTCATCCTACACTTTGTCCACTCGA
GACTAGAGACCCGTTCCATATTTATTAAGGGGCCCAGAGGGTCTGCGGCA
AGATTTCCCACTCAGTTTTTTTGTTTGTTTGTTTTGTTTGGAATGTTTCT
GTTAACCTTTTGGTTTCACATAAAATTTAGAAGCAGGTTTTTTTCAAATT
AAAGAAAAAAACCAGAATTTTGATTGACATTGCTTTGAATCTATAGATCA
GTTGGGACAAAGAGCAAAATTTTTCAATCCTGACTTTTCCTGCTCATGTA
TGTGACTTCTAAGGTTCTTTAAAAACTGCTAATGAGGTTTTTTTTCATGT
TCTATACAAAGGTCTTGAACACCTTCTATTAGGTAATGTTTTGGGATGTT
TTTATTAGAGCTTTTGGGTGTCATTTTTCAACTGTTGCTAAGATATAGAA
ATGCAAGTGATTTGTACTCTTAAGTTTAACAAACTATTACCTATGT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 3 6 6 6 6 6 8 8 12 12 19 30 37 37 30 26 22 30 30 23 23 17 17 24 34 28 25 10 10 8 11 6 6 6 6 7 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 7
8 12 27 27 21 21 3 0 3 21 21 18 7 7 6 6 6 6 6 7 7 9 12 9 8 9 9 9 9 10 12 20 22 34 29 30 31 31 31 35 53 53 53 53 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 50 50 50 50 50 50 68 57 57 57 57 43 48 48 47 37 37 32 37 37 39 37 37 37 39 42 57 57 57 57 47 47 47 42 42 39 39 57 57 57 57 57 57 57 57 54
54 57 57 57 57 57 46 50 50 50 50 50 59 59 44 44 44 47 50 50 59 59 68 68 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 54 54 43 50 37 50 43 50 43 52 52 52 57
57 57 52 52 59 59 68 68 57 57 57 52 52 57 57 57 52 57 52 52 52 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 50 59 59 54 57 57 59 59 48 48 48 59 59 59 59 54 54 54 59
57 34 34 27 27 31 31 42 36 59 44 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 54 54 54 48 48 59 57 48 48 47 57 48 48 48 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59
48 48 47 47 43 40 40 44 44 48 48 48 48 48 47 50 47 34 32 18 15 11 8 8 8 8 8 11 11 12 19 21 34 39 39 39 43 48 39 59 59 59 48 48 48 59 59 59 43 43
47 48 42 39 30 33 33 37 40 43 43 33 39 32 32 32 27 27 32 34 57 59 59 43 43 48 57 47 57 47 43 43 47 59 59 68 68 68 68 68 68 68 47 48 43 37 35 44 44 59
35 42 42 59 44 42 42 44 44 59 68 68 57 57 48 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 52 43 43 44 43 29 43 43 57 44 57 59 50 35 43 43 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 54 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 38
44 44 44 33 44 44 57 57 57 57 57 57 59 59 43 43 27 44 44 38 43 43 43 44 44 59 43 50 52 57 57 57 57 52 52 52 43 43 57 50 68 68 57 57 43 50 33 44 29 38
43 43 43 57 52 50 50 43 43 50 59 59 59 59 59 54 57 47 59 43 43 42 42 47 57 47 47 43 43 57 46 48 41 41 27 44 23 36 36 44 44 43 43 43 47 43 44 43 43 39
43 43 46 32 47 39 39 39 37 37 37 44 43 57 57 57 59 59 59 59 59 54 48 48 48 43 43 43 43 48 48 48 59 59 41 41 36 36 36 44 39 48 39 39 30 30 37 37 37 37
37 37 39 39 39 39 40 40 37 37 37 37 37 32 35 28 31 43 36 33 36 34 41 34 34 28 25 25 25 20 26 32 39 59 31 31 35 35 35 47 59 48 41 41 39 39 39 41 39 32
31 28 28 28 24 25 19 25 22 31 35 37 37 39 37 33 30 30 31 27 34 37 37 47 25 25 12 13 6 6 6 7 7 9 14 14 14 12 10 11 17 14 9 10 10 15 15 24 25 16
16 14 11 10 17 16 | Open.Hide. 9 9 9 13 8 8 8 8 10 17 21 20 19 22 32 29 25 32 39 39 37 37 37 37 41 41 34 34 28 15 7 7 6 6 6 6 6 9 8 6 6 6 6 6 6 9 9 27 25 33
33 33 33 33 33 33 27 11 9 9 9 6 6 6 6 8 8 14 15 12 15 10 10 10 10 13 16 30 34 41 37 39 41 50 53 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59
43 43 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 36 28 32 37 37 37 30 39 42 57 57 57 57 54 57 57 50 50 48 48 48 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 68 57 57 57 57 57 57 59 54 57 57 57 68 68 68 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 54 59 59 59 59 57 57 59 59 59 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 37 37 50 50 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 50 43 35 50 50 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 46 46 44 43
43 44 47 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 59 59 59 59 47 47 47 47 47 47 57 57 57 54 54 57 59 59 59 48 48 48 57 43 43 36 36 43
44 57 59 59 59 59 57 44 43 43 43 40 39 41 28 25 20 12 11 11 11 15 12 11 11 11 16 18 30 37 59 59 41 37 37 32 41 59 59 41 59 43 46 47 47 43 48 57 57 57
57 57 57 57 57 57 54 54 54 48 46 37 37 30 44 44 59 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 68 68 68 59 59 59 57 57 59 59 48 44 59 46 46 48 57 57 57 59 59
57 57 57 57 57 47 47 50 59 59 68 68 68 59 57 57 54 54 57 57 59 59 59 68 68 68 57 57 52 52 38 38 32 35 35 47 59 59 59 68 68 59 50 43 32 32 43 43 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 39 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 52 54 52 44 44 68 57 57 57 57 54
57 57 68 68 57 57 54 57 57 57 59 59 59 52 52 50 59 59 68 68 68 59 57 50 44 43 57 43 44 44 57 57 57 57 57 59 59 54 54 48 59 57 57 48 48 47 57 47 54 54
57 54 57 57 59 59 59 47 43 36 44 36 48 32 32 28 41 37 46 46 68 68 57 59 54 54 54 54 54 48 57 48 42 42 39 39 39 43 43 57 59 59 59 44 43 37 37 43 43 59
40 43 43 41 41 47 41 41 41 41 32 32 31 35 37 47 47 41 41 43 43 36 39 39 39 36 36 39 27 34 28 24 25 34 34 41 41 46 46 46 59 59 59 43 43 40 43 40 43 43
39 39 43 43 28 30 21 23 23 31 31 39 43 43 44 36 36 35 35 35 31 31 35 31 36 39 39 37 32 28 28 39 43 41 41 41 37 37 30 26 12 16 11 22 22 25 15 20 17 25
21 32 33 33 33 37 39 37 37 32 25 26 32 43 43 32 32 28 31 31 25 25 35 35 31 32 34 29 26 32 20 20 17 19 19 24 24 30 28 28 31 35 37 37 32 26 |