BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-488P01.T7 (MSMg01no488_p01.b1) | MSMg01-488P01.TJ (MSMg01no488_p01.g1) |
ACC | AG567544 | AG567545 |
length | 690 | 718 |
length of high quality (start - end) | 574 (35 - 608) | 383 (306 - 688) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no488_p01.b1 PHD_FILE: MSMg01no488_p01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:12:00 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no488_p01.g1 PHD_FILE: MSMg01no488_p01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:12:00 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTTCAGAGAGGATCCGCGGAATTCCTCATTAACGCTCTTTCCAGGTGAGT
CTAGCTTAGTTAAGACTAACCAGCACAGGGACCTAGAAGTGTTTCAGTGG
TTGGAAGATATGGCTGCACGGTTGTTTCTCAGCTCCTAATGATGCTGCCC
ATTTAACCACACAGAGGCCTGTACAGCTACCGACAGTCTTGGGAGGATTT
TTAGCATAAGTTATTGAATGCTGTGCATATATACCACACACTTCGGCAGG
AAAGGGGACCTGGAGACTTTCTTCTGTATAAAGAATTGTTCTACTATTTG
CAGCCATCCTAATACTTCAAAACTTTCTGCTGGTTATTGTTACCTGTGGT
GTCTTTCAGCTGTCCTCGGAGTCCACAATTTGCTCAACAATCCGAAGTTT
GATGAAGAGACAACCAACGGCGAAGGTCGCAAGGGGCCTGTGAGGAGTAA
GTTGACGAGGGCTCTGGGAGCATGGGAAGTGCCAGAGCCGGCCTGGTGCA
TGTTCCACCAGGCTCAGTGCCTAGTATCAGCTTCACCTAGTGCGGTTACT
CAGGGCACGCAGAGCCACAGAACACACATTCGTGGCATGTCTTCTAGTGG
GGAAAAAAACAAGTATTCCTGATAAGGTTGCACAGTCAGCTCAAAATGCA
AATAAAGTTTTCTGGTTCAAAGGATATTTTATCAATGAGG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXTCAGCTCTGCCTGCACCATGCCTGTCAAGATGCTGCCATGCTC
CCACCTTGATGATAATTGATTGAACCTCTGAACCTGTAGGCCAGCCCCAA
TTAAATGTCCTTTATAAGACTTGCCTTGATTTTGATGTCTGTTCACAGCA
GTAAAAGCCTAACTAAGATACCCATCTGAACTGGTGGGAATTTGCCTTGT
TATTTTATAGCCTTGGTGAATCTGTTAAGACCCTCTCTTAAGGTTTCCTT
TATTTAACTCAATGCATGCTTCTGAATGATGCTTCTTCACTCTATTGAAC
AAGATAATGCTTTCAGCTGTTATATTAGTCAGGGTTCTCTAGAGTCACAG
AACTTGTGAGTAGTCTCTATTTAGTAAAGGAAGTTATTATGATGACTTGC
AATCTGTAGTCCAACTCCCCAACAATGGTCAGCAGCAGCTGTGAATGGGA
GTCCAAGGATCTAGCAGTTGTTCAGACTCACAAGGCAAGCAGGAGAGGAA
GGGTCTCCCTCTTCTAATGTCCTTAGGTAGGTCTCCAGCAGAAGGTGTGG
CCCAGATTAAAGGTGTGACCACCATGCCTGGACCTGGGACTTGTATTGTC
CCAAATGACCTTGAACTCAGAGCTCTTCTTGCTTTAGTCTCCTGGGACTC
ATAGCCACTATGCCTCAN
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 8 17 21 17 12 10 9 9 12 29 41 59 33 33 33 33 37 33 31 19 11 7 6 6 6 6 6 8 8 21 28 41 40 20 20 17 12 15 26 41 53 53 53 50
50 53 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 43 47 43 43 46 57 48 42 42 47 47 47 47 47 48 48 48 48 42 42 32 30 17 17 17 29 32 46 57 57 57 57 47 47 47 47 57 57
57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 43 44 43 43 43 57 44 57 50 50 43 43 33 43 43 44 43 52 52 57 52 54 57 57 57 57 57 59 57 52 52 52
52 57 57 59 59 57 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 57 52 52 57 59 59 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 59 57 57 57 68 57 57 57 57 57 68
59 59 59 52 52 62 62 62 52 52 52 62 62 62 68 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 45 45 62 62 62 68 68
68 68 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 43 43 39 39 39 35 35 31 43 43 52 62 62 68 62 68
68 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 44 38 28 19 19 34 38 44 62 62 62 62 62 62 62 54 62 62 62 62
52 52 52 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 39 43 35 41 41 43 57 57 59 59
68 59 59 57 57 43 59 32 38 32 28 28 32 43 43 52 52 52 52 52 52 43 43 52 43 43 43 43 43 43 43 52 52 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57
57 57 50 57 46 43 43 43 44 47 48 59 59 59 59 57 43 43 43 44 44 48 59 47 43 43 57 59 43 57 44 39 39 37 43 44 43 43 43 44 46 37 37 43 43 43 47 43 43 43
48 48 57 48 48 48 48 42 48 48 48 32 34 24 26 18 25 30 39 39 37 36 25 25 34 34 37 37 30 37 34 34 31 30 30 31 26 32 18 22 22 21 28 37 28 28 30 34 34 37
37 28 28 28 28 28 35 39 28 32 24 19 20 29 32 39 35 32 32 42 42 37 37 39 39 39 43 40 47 39 35 39 39 43 43 43 37 37 37 35 26 28 10 10 10 12 15 11 17 22
30 27 25 22 22 28 11 11 8 9 9 14 24 19 22 14 15 11 17 17 19 19 16 18 11 8 8 8 13 10 11 11 11 11 13 13 12 12 10 10 10 13 21 32 30 19 10 8 8 8
8 13 12 18 9 10 7 7 7 8 13 8 8 9 8 9 10 19 20 18 22 21 21 15 17 18 23 15 11 11 10 14 13 19 19 16 16 13 13 13 | Open.Hide.11 11 27 25 41 41 41 30 30 30 37 23 25 9 9 9 15 8 9 9 8 9 8 8 9 13 10 11 15 23 23 12 11 11 21 21 39 32 18 15 9 9 9 9 9 9 13 10 11 11
11 11 11 19 19 30 33 32 33 33 33 36 53 53 53 53 57 48 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 48 57 42 42 42 42 42 48 54 54 48 48 57 50 47 47 42 42 37 39 43 39
39 39 46 46 57 57 50 50 50 50 50 57 57 57 68 68 57 68 68 68 68 57 57 57 47 47 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 57 34 32 32 32 35 43 43 46 57 52 52 57
57 57 54 52 52 57 52 57 57 59 59 57 57 68 57 57 52 52 52 57 57 57 59 52 52 52 50 50 50 50 51 68 68 68 68 57 57 54 54 57 59 57 54 54 52 57 57 57 57 54
59 59 68 59 57 57 50 43 44 50 59 59 68 57 57 57 68 57 48 43 57 57 54 54 57 57 57 57 57 43 42 42 37 35 42 44 57 57 57 68 57 68 57 59 54 54 57 59 46 54
57 57 68 68 68 68 68 54 46 46 40 43 46 47 47 59 59 57 48 48 48 48 48 59 59 59 59 59 59 39 43 43 48 57 59 59 59 59 53 48 48 47 42 30 27 20 15 12 12 9
9 9 9 9 9 13 28 30 39 47 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 48 48 48 57 59 59 59 59 54 43 42 39 35 30 30 30 31 39 59 59 68 68 68 68 57
57 54 54 54 57 57 57 57 57 59 59 57 46 44 43 57 57 59 57 57 68 68 68 68 68 68 44 44 28 36 33 59 59 59 59 37 43 43 43 43 44 44 48 50 50 43 43 43 42 42
43 43 43 52 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52 52 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57
57 57 48 50 57 59 59 57 59 43 39 39 44 42 42 42 46 42 42 42 43 43 47 54 54 48 48 57 57 57 54 48 48 48 48 48 54 59 59 59 59 54 54 54 54 54 54 54 57 59
59 43 43 43 43 43 48 48 48 48 43 43 59 59 59 59 59 59 59 59 43 33 37 28 33 24 30 30 35 35 39 37 43 43 41 42 42 41 34 34 28 24 30 34 37 32 39 37 41 41
37 37 41 41 37 47 43 47 46 48 48 48 48 48 48 48 47 43 40 40 40 39 39 41 41 32 31 41 41 29 29 32 32 30 30 17 17 12 23 18 32 26 25 25 31 39 37 37 32 34
24 20 26 15 15 12 20 20 29 27 29 32 25 31 31 24 23 23 19 19 18 21 14 14 17 30 28 37 41 41 41 41 37 37 41 29 27 29 30 30 26 32 32 32 41 37 37 31 31 20
25 19 18 18 22 24 30 24 22 22 30 36 44 37 34 34 23 17 11 11 11 12 18 15 18 20 28 31 28 31 37 37 41 28 28 15 15 12 13 21 24 14 9 9 9 9 15 14 28 23
21 21 13 13 13 17 15 28 32 27 25 25 21 18 15 15 3 0 |