BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-510E22.T7 (MSMg01no510_e22.b1) | MSMg01-510E22.TJ (MSMg01no510_e22.g1) |
ACC | AG583775 | AG583776 |
length | 869 | 758 |
length of high quality (start - end) | 52 (106 - 157) | 673 (74 - 746) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no510_e22.b1 PHD_FILE: MSMg01no510_e22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:39:52 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no510_e22.g1 PHD_FILE: MSMg01no510_e22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:39:52 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ACCAATCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCGCACATCCGCGGA
ATTCCTCTCTGTATTTCCTTGTTGTACAGAAGGTTGCTTCTGGTCCTTAG
ACAGTCACTCTCTTGAGGTCTTTGTACTGGCCTTACCGCTGCTCTCTGAC
CCTCAGCTTGGAGTTGTACCAGAACCATCACTTCACAGCTCTTTCCCAGT
TCCCATGCTCTCTGTGCACGTGCACCTACACAGCTTCTCCTGTCACATGT
CTTCTCTTGCTCATCCACTCAGCCTACCAATATCAGTATTCTAAGGACTA
CTTCCCTTCCAATATGTCTCATCTGTTCAGATCATCATTATCCATATTTG
TGTCTTCCTATTTTCTATCCCCACTCACATATTTTCTTTTGCTTTATTAC
CCTTTAACCCTTGTTTTTCCCACCTTCCCCTTCCTTTTTTTCCCATATAT
TCATCCTTCCACTTTCTCCTCTACCCCATTTATCTTTTCATACTCCATCT
TTTTATATATTCTTACATTTTCCTCTTTCACACCCCCTCCTTTTTCCTCT
CTCACTTTACTCCATATATTTCCTTTCACTTTCACCTCATCTAAATTCAA
TATCTCATCCAATTCTCCTCCTTACTTTCCTTTACCCCCCCCATCTTATT
TCACTCTCCTCCAACACACCATTATACCTTACCTATCTTTCCTATTCCTC
CCATATTTAAATCGCCAATTCGCATCTCTCCCCTCATATTATTCATCTAC
CCCTCTTATCCTCTCCCTAATTATAAAAATACCCATTCTTAATATTCCTC
TCTTTCTTAAATCATACAAATGATAAACCCACCACCCCTCTTCCACTCAT
ATCCCAAAACCTCCCCCTA
| AATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXATAGTTTTATCTCCAGCTTGGGAAACA
TTCTCCAACCGGAGTCTTCCTCAAGTCGTATCCTCAAAGGCACGGAGTTG
GCAAGTGCTCACATTTGGTCTCCGAGCAGAGACCTGAGATGATTGCTGCC
TCTGTTCCCAGTGTGTGCCTGGAGGAGGTCTCCACACTGCTTTCAACACT
TGGTTGGATCCCCAGTGTCAACATGGGGACTTGGAGAGCTGAGATGCTCT
GTGAACATCAGAGCATCAATATCTAGTAAGGCTGGGGGGTCCTTCGAGGT
GGGCTGAATTGAATGCTGTGAGCAGGAGCAGATGTGGGGCTGGCTTCCCC
GAAGCCCCCGCCCCATTGCTTTCCCTGAACAGTCTCTATGTATTTACTTG
GATCTAATAATATTCCTACATCGTTGTATATTGATGCTGAATATATTAGT
GCCACTGAAGCTCCAGAAAGTTTTACGAAAGAAAATCTGAGTGTTCTTCT
ACTGAATGTTAAGAAAATAAAGACTATTGCCTGCCGGAAAGAAAAAAAAA
TGATTTTGCAAAGGGACAAGCATCCGTAGCAAAGGTCAACTCCATTGGGC
TTCTCTTCCTGTTGGGATTTTGCTGGGCCTTATCTCTTGCAGGTTGTGGT
AAGATGTGGGCCAACTTGAGGCACAAATTGGCTCCACGTGTGTTCCCTGT
GGTGGACN
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 7 8 7 9 9 10 18 16 23 23 24 19 18 14 15 15 8 7 7 19 19 37 21 12 9 13 13 17 24 11 9 9 7 6 6 6 8 8 8 8 13 15 21 23 15 22 22
28 28 31 31 59 47 43 27 22 9 9 9 9 9 11 10 19 24 23 30 28 28 28 28 22 31 28 22 22 23 24 12 12 12 21 25 43 59 48 40 27 12 9 9 10 23 26 27 12 12
11 18 18 12 12 17 24 27 33 42 48 42 41 37 37 30 30 39 42 32 39 30 30 14 14 14 24 28 26 21 21 13 21 21 41 32 39 39 29 20 10 10 10 12 23 31 34 39 36 43
39 39 32 31 22 18 21 18 18 12 18 12 15 10 8 8 8 8 8 10 11 11 11 8 8 8 8 8 8 9 15 16 22 13 13 10 8 8 7 8 13 17 30 34 19 19 12 11 11 21
18 19 25 28 28 28 25 25 25 33 30 30 19 17 15 16 12 12 12 12 18 21 12 11 11 15 22 21 18 18 14 14 14 17 15 19 18 18 28 36 40 30 30 28 40 24 22 16 10 11
8 8 8 10 24 24 24 24 14 13 15 15 13 14 14 15 15 16 15 11 11 11 11 12 13 15 28 13 8 8 8 8 8 12 12 12 11 9 9 9 9 12 10 11 11 12 11 10 10 11
11 12 13 28 28 37 25 18 12 12 12 12 24 13 11 8 8 8 8 11 12 11 10 10 12 13 14 10 12 10 9 9 8 8 8 9 9 8 10 8 8 8 8 8 9 11 10 9 9 10
13 16 11 11 12 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 18 25 30 11 10 10 10 8 8 6 6 8 8 8 9 9 9 11 11 10 15 10 10 10 10 12 10 8 8 7 7 10
8 10 10 10 8 10 10 8 8 8 10 10 11 9 10 9 9 9 17 12 8 8 8 11 10 12 11 11 15 13 8 8 8 8 10 14 10 11 10 10 10 10 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 10 8 8 8 8 11 10 8 6 6 6 11 11 11 11 13 13 11 16 12 15 15 8 8 7 7 8 10 8 8 8 10 11 14 21 12 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 15
15 20 20 24 13 10 10 10 8 8 8 8 10 9 9 10 11 13 18 12 12 10 10 10 9 9 12 10 7 7 7 8 8 10 8 10 8 8 8 10 15 15 19 19 15 10 8 8 7 7
10 10 8 10 10 8 11 10 9 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 11 8 9 12 9 9 13 10 10 8 10 8 8 8 8 14 15 19 22 10 11 8 8 8
8 10 11 11 11 11 9 11 9 9 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 8 9 10 8 18 18 24 24 24 22 19 12 13 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10
9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 13 15 10 8 8 8 10 10 12 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 10 8 8 8 8 12 12 12 8 8 8 10 10 10 14 13 10
8 8 8 12 10 8 11 11 15 16 12 15 9 9 9 9 10 9 10 9 9 9 6 10 7 7 8 8 10 10 11 13 14 16 12 8 8 6 6 8 8 12 10 10 10 6 8 6 6 8
7 7 10 10 10 10 10 10 8 7 7 6 8 8 9 12 15 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 12 10 8 6 6 8 8 8 8 10 8 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8
13 10 8 8 8 8 8 8 9 9 10 8 10 8 8 8 8 8 12 11 8 8 8 8 6 8 6 6 10 10 7 6 8 6 6 10 11 12 9 11 10 11 10 10 9 7 8 10 10 8
7 7 8 8 8 9 11 11 14 8 8 6 6 8 8 8 10 10 10 | Open.Hide.10 10 15 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 12 17 15 25 27 32 37 37 39 39 37 39 37 23 23 12 9 7 6 6 6 6 7 8 10 10 20 19 17 17 17 30 30 37 37 37 37
44 39 50 42 41 30 25 10 9 9 9 9 9 9 11 11 25 19 23 20 20 29 25 30 36 37 43 57 57 57 53 53 53 53 42 42 42 42 36 42 59 59 59 57 68 68 51 50 42 42
42 42 57 41 41 32 32 34 41 46 54 54 54 68 68 48 57 57 57 57 57 46 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 47 57 59 59 59 57 57 50 50 50 50 50 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 50 43 43 52 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 50 51 68 50 50 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68
62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 39 44 39 18 15 11 11 11 39 39 43 43 43 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 45 45 62 62 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 52
52 62 62 62 52 62 62 57 57 52 57 57 57 57 57 59 59 68 68 59 59 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 52 52 52 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 57 43 43
42 43 43 47 47 57 57 57 57 57 59 44 47 42 41 41 59 44 57 54 54 54 57 57 57 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 46 47 46 42 42 30 30 30 42 42 43 43 43
43 47 48 48 48 43 43 43 43 33 43 37 59 59 43 32 39 35 32 32 41 37 41 41 41 41 41 41 41 31 31 39 37 37 36 36 37 36 37 41 41 41 59 59 59 50 50 44 47 39
37 37 37 40 40 41 37 37 30 25 25 36 30 37 39 39 30 30 30 37 37 37 32 31 31 28 32 30 32 28 28 28 27 25 22 28 25 28 28 37 34 43 36 37 43 41 41 36 41 37
37 37 33 36 27 25 25 27 22 32 30 25 25 30 24 31 27 25 25 30 39 39 39 37 39 32 32 20 20 28 34 39 41 41 40 41 37 31 24 22 23 18 18 19 19 30 31 25 32 36
31 25 32 25 30 28 34 30 37 32 25 25 25 28 35 37 37 37 30 25 25 27 30 27 27 25 25 32 37 37 37 41 30 28 17 14 14 21 21 28 34 35 17 17 17 18 16 18 23 18
14 13 13 12 15 11 3 0 |