BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-536P14.T7 (MSMg01no536_p14.b1) | MSMg01-536P14.TJ (MSMg01no536_p14.g1) |
ACC | AG604056 | AG604057 |
length | 764 | 775 |
length of high quality (start - end) | 378 (47 - 424) | 564 (59 - 622) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no536_p14.b1 PHD_FILE: MSMg01no536_p14.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:15:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no536_p14.g1 PHD_FILE: MSMg01no536_p14.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:15:14 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | TTCTCATTAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCTTTCATATTGCCTGTCTGTCTGTTCCCCCTTCCCTTTCTGGCAT
GATGGGTAGGCTCTTTTTGACCACCTCTTGTGAACTCTAAATCCCTTAGG
TGTTTGTGAGTGTGATCTGACCAGAGATATCTGGAAGCATAAAGGTGGCT
ATCAAATGAGTTACCATATATGTGTCCTTGTATCTACACATAAATGAGTG
ACTACAATGTTAGTAGCTGTCAAATTACTCATTTAATCCCATTTCATTTA
AATGTTTACAGTACATTTTTCAAGAATTTTACACAATGTGTGTATGTGTG
TGTGTGTGTGTTTGTGCAAGTATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTG
TGTATGGTGGGTGGAATTGACATAATATTCTGCTATTTCTACCTTTGCTT
GATTTTCCTTATCCGTATCATATCATGAACGCACATGATCGTGGATCTCT
ATGAGTTCTTGGTCACACTATTCCACTTCATAAGTTCCCAGCTCGCCTAG
GCCACACTGATGACACTCTCTCTCCATTTCTCTGTCCCTGCCTGTCTTTC
TCTCCGTTCTTTTCTCTGTTTCCCCCTGTTCCCGTCCGTTTTCTGACTTC
TTTCTTTCCTGACCAGACCCTGCCCTCCATTTTTACTTTCTTTCCCACTT
TTTTCCCTTTTGTCCCTTATTTTCTCGCTTTTTCCCCCCTTTTATCCCTA
TTTTTACTTCCTTG
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXCACATAAAACCAGAGACACTAAAACTTATAGAGGAGAAAGAG
GAGCAAAACTTCTAAGATATGGGCACGGGGGAAAATTCCTGAACAGAACA
CCAATGGCTTGTGGTGTAAGACTGAGAATCAACAAATGGGACCTCATAAA
ATTCCAAAGCTTCTGTAAGGCAAAAGACACTGTCAATAATACAAAGAGGA
CCCCAACAGTTTGGGTAAATATTTTTTACCAATCCTAAAACTGATAGGGA
CTAGTATCTAATATATACAAAGAACTCAAGACGCTGGACTCAAGAAAATC
AAATATCCCTATTAAAAATGGGCTACAGAGCTAAACAAAGAATTCTCAAC
TGAGGAATGCCAAATCGCCGAGGAGCACCTGAAAAAATGTTCAACATCCT
TAATCATCAGGGAAATGCAAATCAAAACAACCTTGAGATTCCACTCACAC
CAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAATTCAGGTGACAGTAGATGTTGGTGA
GCATGTGGAGAAAGAGGGACACTCCTCCATTGCTGGTGAGATTGCAAGCT
TGTACAACCACTCTGGAAATCAGTCTGGTGGTTCCACAGAAAATTGGACA
TAGTACTACTGGAGGATCCAGCAATACCTCTCCTGGGCATATATCCAGAA
GATGTTTCCACTGATAATNAGAACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCT
TATTTATAATAGGCAGAAGCTCGAN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 12 13 16 11 11 9 9 10 12 21 14 13 13 18 18 15 21 10 10 10 10 13 10 10 9 9 10 11 18 19 19 19 22 30 30 33 36 34 28
14 11 13 19 19 23 43 30 30 17 17 9 10 11 16 16 23 23 27 36 36 39 43 43 43 39 39 47 39 39 39 43 43 43 47 59 57 57 57 57 57 57 68 68 54 47 47 42 48 42
42 48 50 48 47 54 54 59 54 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 47 50 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 59 59 57 57 57
57 57 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 46 46 48 48 46 46 57 57 57 57 57 52 52 52 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57
59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 52 52 52 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62
62 62 62 62 52 52 62 62 62 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 57 43 42 37 37 43 50 57 57 57 68 68 68 57 57 52 57 52 54 54 59 59 57 54 54 54 57 59 57 57 57 57
57 57 57 57 57 54 48 48 48 48 48 59 59 59 57 57 44 44 43 44 47 59 59 59 59 59 57 57 57 59 48 48 48 48 48 48 48 48 57 57 57 57 54 54 48 48 48 48 54 48
48 48 48 48 57 48 48 37 37 28 25 25 30 28 28 33 33 24 24 19 16 16 11 11 11 14 15 15 25 18 14 8 8 8 8 8 6 9 10 11 10 10 13 13 16 17 14 9 9 9
12 18 24 28 28 24 20 19 12 15 10 8 8 8 8 15 15 16 21 13 17 13 17 12 16 12 11 10 10 10 10 9 10 9 11 11 10 8 8 10 8 10 8 12 12 17 17 10 11 12
17 13 16 11 11 9 14 11 8 8 8 10 10 8 8 8 8 10 10 23 32 17 16 10 10 9 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 11 11 10 10 10 10 6 6 6 6 8 6
9 10 11 11 20 22 25 15 9 8 8 10 10 13 10 9 9 14 9 9 9 11 12 11 12 12 24 20 18 17 17 12 19 13 13 11 11 11 23 22 26 22 16 10 10 10 13 13 13 8
10 10 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 10 15 12 12 12 15 12 13 10 11 11 12 9 9 10 17 15 15 11 11 11 11 11 17 12 14
8 8 8 8 8 8 12 10 12 10 11 8 6 6 6 10 10 11 12 12 11 11 9 9 12 9 15 11 11 11 15 22 17 8 8 8 10 8 13 7 9 8 10 13 10 10 13 9 11 11
10 8 8 8 8 9 9 10 8 10 6 6 6 10 10 8 11 8 6 8 6 7 10 6 6 6 6 8 8 8 13 13 9 8 7 6 9 9 9 9 9 7 6 6 6 10 10 20 20 14
12 18 10 10 6 6 8 8 10 10 12 11 9 9 | Open.Hide.11 11 12 12 23 25 28 28 18 25 35 39 30 23 19 10 10 10 13 16 15 10 10 11 17 21 34 39 39 39 27 28 30 30 37 37 39 39 48 48 53 57 44 29 28 34 37 37 37 48
48 57 42 47 47 48 48 48 48 48 48 57 57 68 68 59 48 41 41 43 43 43 43 48 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57
57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68
57 57 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 54 54 54 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59
59 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57 59 57 68 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 54 57 68 57 57 48 48 48 57 57 57 54 48 48 48 48 48 48 48 48
57 48 48 57 57 48 43 57 43 43 48 48 48 43 59 28 28 13 26 24 37 43 41 41 41 41 34 32 23 20 26 34 39 39 39 40 32 32 30 30 14 30 28 48 48 48 48 43 43 39
39 39 43 43 46 46 43 39 36 36 35 59 26 26 17 17 17 30 29 36 36 39 39 37 36 28 24 20 25 25 34 30 36 28 32 23 22 22 21 21 16 16 14 24 24 25 25 39 37 39
39 36 28 30 24 22 18 22 20 23 23 32 32 35 31 31 31 32 30 21 21 13 13 28 22 23 19 14 14 14 15 15 14 21 12 11 11 12 12 21 24 24 19 19 19 19 25 35 30 23
23 23 23 31 32 32 34 41 41 36 19 18 16 13 13 13 13 12 16 24 31 32 28 25 35 26 28 20 28 23 23 18 10 9 9 9 9 11 13 18 24 22 28 15 20 11 11 11 13 9
9 7 7 7 8 8 9 15 20 24 28 21 21 14 13 12 12 3 0 3 10 10 10 12 12 22 12 15 10 9 9 9 11 17 20 28 25 14 14 14 13 13 11 13 13 11 9 9 9 9
9 10 9 11 10 11 11 16 12 10 6 6 6 6 8 8 13 11 11 11 12 8 8 3 0 |