BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-007A04
Chromosome1 (Build37)
Map Location 125,386,612 - 125,517,459
singlet/doubletdoublet
Overlap geneDpp10
Upstream geneLOC666983
Downstream geneLOC666998
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-007A04.bB6Ng01-007A04.g
ACCDH843709DH843710
length1,054908
definitionDH843709|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007A04, 5' end.DH843710|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-007A04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(125,516,402 - 125,517,459)(125,386,612 - 125,387,499)
sequence
gaattctctcctatatagaagaaattaaatatcatcagaaagtgatgtaa
atcctcctcatgaacaagaagtgttttagataagatgaaatcctcatgaa
aagtctttacacccccactcctttgtcctgtggtgatttctttatggagg
gagagaatatatgacaaaatagtttacatttttggaatgtaatctggaaa
acagtatttatatgtagatgtgtaaacagtttttatattcagacatttgt
gtatttggaattagtcaccgtcaagcttctctaaagcaaacacagaaaat
gtctgctgagtccttgtaaactgcttttctcggttttcctaaactgaccc
atacctttaagttcctcattagatgcatctcatgtttcctcccttttcct
aaaagttaacagctgttagtcaaaaacataattgctgtaggcttttccag
ttccgtgaatttttccactgaatcccatatggtagaaagcagctgtcatt
ttatccacctgtatctatgctttaattgactcaactcttttaaatgtgtt
tgtgtgagtacccatgcatgcatcaacacatatctctatgtccctattct
tatacctgtacatctatattaacagcgagaatggtcaaagtgcatctgtc
aagagccatcctcccttttctcgtgcttgaggcaggatctcttgttatgg
taccatgacttcagttcatctggtttgtgagtttctggtctattctactg
cctctgccttccatatgaccaccatggaatggcaggaaatatagatgtgt
accaccacatggagttcttttatgtgctttttgggaatcaaactcaggta
cctaagcttgtatgtaaagagctttttactcactatgccatttactgttt
cagaaatgatattttaaggccaatttattttcaactgtttcttcagttgg
ggctgtgtaatactttcttatgatgaggtacagcctacagaatttggcac
ataaatattcaggctcttcacagtataaaacatcagaagtcatggtgttg
tggg
gaattcttagccagaggcaggtaaattaatgtgggaaagaaatgagtcag
aaaagagaaaagctgaaactgctggctaatgccacccaaatcccacttgt
gtggcacagagccaccaacaaactacaggtgacctatatggtttatgata
ataataaaccacacacatgaggacgtatgtagaattatgtgaagtaatta
gacagagcattgtaagagattccatgttatgcaaatgagcaccaaatttc
atgcaatcccaacagccttaacaaagcatgatatgcaacagacaagcccc
aaatgctttgtacaatgagtctgtttaggtttccaaatgttctcttatat
ccagcctgtttcctatttggaagtgtatctgtttctgatctggctaatat
ctatgccttgccctccagcttcttgttcctggatgcaaaaatgtcagaac
ccatggaagattctccaccttgaccatggctactcagttatccattactt
taacctttttaaacctcatgtcaggaacctggagataaacttgggagtca
ctgaacctgtttgtccttctagtgtgacggtattgcatatatctctttct
ctgattttctccattacttgtaggactaatttgaatattgagactggatg
gctgaatttggcttatcaggatgaccaggactcgagctctgtacctttac
aactccagaaacactgggctgaataagccaaggcttactacagaagcata
ttcctgttctaacaatgatccttaagtcaacctaaggaaatagataatat
ctataatcctaagtgaggctctttaaagcttaaaattaacattgaatgtt
gaagtgagaacagagtctatttgaaccctatctgttgtacagattatctt
tccgaata
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_125516402_125517459
seq2: B6Ng01-007A04.b_45_1098 (reverse)

seq1  CACACACACACACATGACTTCTGATGTTTTATACTGTGAAGAGCCTGAAT  50
      | |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACA-ACAC-CATGACTTCTGATGTTTTATACTGTGAAGAGCCTGAAT  48

seq1  ATTATTGTTGCCAAAATTCTGTAGGCTGTACCTCATCATAAGAAAGTATT  100
      |||  || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATG-TGCC-AAATTCTGTAGGCTGTACCTCATCATAAGAAAGTATT  96

seq1  ACACAG-CCCAACTGAAGAAACAGTTGAAAATAAATTGGCCTTAAAATAT  149
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACAGCCCCAACTGAAGAAACAGTTGAAAATAAATTGGCCTTAAAATAT  146

seq1  CAATTTCTGAAACAGTAAAATGGCATAGTGAGTAAAAAGCTCTTTACATA  199
      | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  C-ATTTCTGAAACAGT-AAATGGCATAGTGAGTAAAAAGCTCTTTACATA  194

seq1  CAAGCTTAGGTACCTGAGTTTGATTCCCAAAAAGCACAT-AAAGAACTCC  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  CAAGCTTAGGTACCTGAGTTTGATTCCCAAAAAGCACATAAAAGAACTCC  244

seq1  ATGTGGTGGTACACATCTATATTCCCTGCCATTCCATGGTGGTCATATGG  298
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTGGTGGTACACATCTATATTTCCTGCCATTCCATGGTGGTCATATGG  294

seq1  AAGGCAGAGGCAGTAGAATAGACCAGAAACTCACAAACCAGATGAACTGA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCAGAGGCAGTAGAATAGACCAGAAACTCACAAACCAGATGAACTGA  344

seq1  AGTCATGGTACCATAACAAGAGATCCTGCCTCAAGCACGAGAAAAGGGAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATGGTACCATAACAAGAGATCCTGCCTCAAGCACGAGAAAAGGGAG  394

seq1  GATGGCTCTTGACAGATGCACTTTGACCATTCTCGCTGTTAATATAGATG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCTCTTGACAGATGCACTTTGACCATTCTCGCTGTTAATATAGATG  444

seq1  TACAGGTATAAGAATAGGGACATAGAGATATGTGTTGATGCATGCATGGG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGGTATAAGAATAGGGACATAGAGATATGTGTTGATGCATGCATGGG  494

seq1  TACTCACACAAACACATTTAAAAGAGTTGAGTCAATTAAAGCATAGATAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCACACAAACACATTTAAAAGAGTTGAGTCAATTAAAGCATAGATAC  544

seq1  AGGTGGATAAAATGACAGCTGCTTTCTACCATATGGGATTCAGTGGAAAA  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGGATAAAATGACAGCTGCTTTCTACCATATGGGATTCAGTGGAAAA  594

seq1  ATTCACGGAACTGGAAAAGCCTACAGCAATTATGTTTTTGACTAACAGCT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCACGGAACTGGAAAAGCCTACAGCAATTATGTTTTTGACTAACAGCT  644

seq1  GTTAACTTTTAGGAAAAGGGAGGAAACATGAGATGCATCTAATGAGGAAC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAACTTTTAGGAAAAGGGAGGAAACATGAGATGCATCTAATGAGGAAC  694

seq1  TTAAAGGTATGGGTCAGTTTAGGAAAACCGAGAAAAGCAGTTTACAAGGA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGGTATGGGTCAGTTTAGGAAAACCGAGAAAAGCAGTTTACAAGGA  744

seq1  CTCAGCAGACATTTTCTGTGTTTGCTTTAGAGAAGCTTGACGGTGACTAA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAGCAGACATTTTCTGTGTTTGCTTTAGAGAAGCTTGACGGTGACTAA  794

seq1  TTCCAAATACACAAATGTCTGAATATAAAAACTGTTTACACATCTACATA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAAATACACAAATGTCTGAATATAAAAACTGTTTACACATCTACATA  844

seq1  TAAATACTGTTTTCCAGATTACATTCCAAAAATGTAAACTATTTTGTCAT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATACTGTTTTCCAGATTACATTCCAAAAATGTAAACTATTTTGTCAT  894

seq1  ATATTCTCTCCCTCCATAAAGAAATCACCACAGGACAAAGGAGTGGGGGT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATTCTCTCCCTCCATAAAGAAATCACCACAGGACAAAGGAGTGGGGGT  944

seq1  GTAAAGACTTTTCATGAGGATTTCATCTTATCTAAAACACTTCTTGTTCA  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGACTTTTCATGAGGATTTCATCTTATCTAAAACACTTCTTGTTCA  994

seq1  TGAGGAGGATTTACATCACTTTCTGATGATATTTAATTTCTTCTATATAG  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGAGGATTTACATCACTTTCTGATGATATTTAATTTCTTCTATATAG  1044

seq1  GAGAGAATTC  1058
      ||||||||||
seq2  GAGAGAATTC  1054

seq1: chr1_125386612_125387499
seq2: B6Ng01-007A04.g_69_953

seq1  GAATTCTTAGCCAGAGGCAGGTAAATTAATGTGGGAAAGAAATGAGTCAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTAGCCAGAGGCAGGTAAATTAATGTGGGAAAGAAATGAGTCAG  50

seq1  AAAAGAGAAAAGCTGAAACTGCTGGCTAATGCCACCCAAATCCCACTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGAGAAAAGCTGAAACTGCTGGCTAATGCCACCCAAATCCCACTTGT  100

seq1  GTGGCACAGAGCCACCAACAAACTACAGGTGACCTATATGGTTTATGATA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGCACAGAGCCACCAACAAACTACAGGTGACCTATATGGTTTATGATA  150

seq1  ATAATAAACCACACACATGAGGACGTATGTAGAATTATGTGAAGTAATTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATAAACCACACACATGAGGACGTATGTAGAATTATGTGAAGTAATTA  200

seq1  GACAGAGCATTGTAAGAGATTCCATGTTATGCAAATGAGCACCAAATTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGAGCATTGTAAGAGATTCCATGTTATGCAAATGAGCACCAAATTTC  250

seq1  ATGCAATCCCAACAGCCTTAACAAAGCATGATATGCAACAGACAAGCCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCAATCCCAACAGCCTTAACAAAGCATGATATGCAACAGACAAGCCCC  300

seq1  AAATGCTTTGTACAATGAGTCTGTTTAGGTTTCCAAATGTTCTCTTATAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGCTTTGTACAATGAGTCTGTTTAGGTTTCCAAATGTTCTCTTATAT  350

seq1  CCAGCCTGTTTCCTATTTGGAAGTGTATCTGTTTCTGATCTGGCTAATAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCCTGTTTCCTATTTGGAAGTGTATCTGTTTCTGATCTGGCTAATAT  400

seq1  CTATGCCTTGCCCTCCAGCTTCTTGTTCCTGGATGCAAAAATGTCAGAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATGCCTTGCCCTCCAGCTTCTTGTTCCTGGATGCAAAAATGTCAGAAC  450

seq1  CCATGGAAGATTCTCCACCTTGACCATGGCTACTCAGTTATCCATTACTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGGAAGATTCTCCACCTTGACCATGGCTACTCAGTTATCCATTACTT  500

seq1  TAACCTTTTTAAACCTCATGTCAGGAACCTGGAGATAAACTTGGGAGTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCTTTTTAAACCTCATGTCAGGAACCTGGAGATAAACTTGGGAGTCA  550

seq1  CTGAACCTGTTTGTCCTTCTAGTGTGACGGTATTGCATATATCTCTTTCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAACCTGTTTGTCCTTCTAGTGTGACGGTATTGCATATATCTCTTTCT  600

seq1  CTGATTTTCTCCATTACTTGTAGGACTAATTTGAATATTGAGACTGGATG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATTTTCTCCATTACTTGTAGGACTAATTTGAATATTGAGACTGGATG  650

seq1  GCTGAATTTGGCTTATCAGGATGACCAGGACTCGAGCTCTGTACC-TTAC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  GCTGAATTTGGCTTATCAGGATGACCAGGACTCGAGCTCTGTACCTTTAC  700

seq1  AACTCCAGAAACACTGGGCTGAATAAGCCAAGGCTTACTACAGAAGCATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCAGAAACACTGGGCTGAATAAGCCAAGGCTTACTACAGAAGCATA  750

seq1  TTCCTGTTCTAACAATGATCCTTAAGTCAACCTAAGGAAATAGATAATAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTGTTCTAACAATGATCCTTAAGTCAACCTAAGGAAATAGATAATAT  800

seq1  CTATAATCCTAAGTGAGGCTCTTTAAAGCTTAAAATTAACATTGAATGTT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATAATCCTAAGTGAGGCTCTTTAAAGCTTAAAATTAACATTGAATGTT  850

seq1  GAAGTGAGAAACAGAGTCCTAATCTGAACCCACATCTGT  888
      |||||||| |||||||||   || |||||||  ||||||
seq2  GAAGTGAG-AACAGAGTC--TATTTGAACCC-TATCTGT  885