BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-021M24
Chromosome1 (Build37)
Map Location 71,474,314 - 71,623,573
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC629101, Atic
Upstream geneSpag16, A830006F12Rik, LOC100043210, EG667884, EG666083, LOC100042804, LOC100042809, Bard1, LOC667900, Abca12
Downstream geneFn1, LOC100042814, Gabarapl2-ps1_652.1, LOC383528, LOC675667, EG667931, EG433319, LOC667937, LOC100043255, Mreg, Pecr, Tmem169, Xrcc5, March4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-021M24.bB6Ng01-021M24.g
ACCDH854215DH854216
length993614
definitionDH854215|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021M24, 5' end.DH854216|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-021M24, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,474,314 - 71,475,332)(71,622,960 - 71,623,573)
sequence
gaattcactgatgggtctttgtagtggaaatatcttggaatttagcctca
ttatttggcacaaatatgtccaatggcctcagccatttagagatgagtta
aataccaaagtgaatggcatttcagaaaccctgaacccatacatgattag
tgattacgtcatcatgcatgatagcatcatctctaaccagaattgcactg
tgggtgacatgaataaggcaagttctatgaatttttatttttgactgtat
tgttcttattaaatattgataaaattaaagaaagattgaaataaaaacct
gtctgtgtacttgtgttgaaattatgagatatttaaacataaagctgtgt
ttctgacaacagtaaaatgttgctcaaatggtaagccttgaaagctatta
ttaatttaatggacaaaaacaattactaaaagttttaaataggtaaataa
ataagaagctatattgataattaatatgaatattaagcaaaaatgtatga
ccctaacagttaggaagacaattgcaattctaacagagaagttcattaat
aatcactatgaatgtcagacggaaaaatataaccttggcatatatgctaa
gacaggcctgcaacatggcagtgtccctcaccaactacatccatgccttt
ctatcagatttaccacactgagagaaaccaaagagagagcttgcatgaat
actatgtctagggaggaaaggacctatttggtttataggtgacagtctgt
ctttcaaggaagccaaggcaggaagcctggaggaacattgcttactagct
tgctctcatggcttgctcaactcgctttcttatataacccagacactggc
tgggtctctacatcagtctgaaatatgtgtgtgagctgaccgccgtacat
cagtcatgatcagaaagtcactacagcatgcgtgtccttctctggtgact
ccagtttgtccgagttggaaaataatgaattttggaacttagt
gaattcattacccaggaagcagaggtttgtggttcagaggtttgtgggcg
cagcagtgaggttgacaggggtgaggaaggtgttttaagcatttcacact
actgagggttttgagaagcctctctgtggtaggatggtggaagactgtca
tacatgagacgaccgcaacacggtccactgggaagccaatcagtccgcac
ctcaccgatagtgccggtcacatactgatcaatcgcattggagatctctg
ctctcttcaccccggctttaaacttcatggacagcactcgtgggtggtgc
cgaagccaccaagagtttgccttatcacctgcaaggcgagtgcagtgtat
ccgagactgctgtcctgctccgatgccaataacctaaggaacacggacgt
tagcaatcaatgacatttctcccgcaacactgtcttttcaaagaatgaca
gtagtgaagcttccactctgagtggctttgctggctctggagatcctgcc
caaggaccagagaccacagtctgtcaggatttagtgactaaaactggcaa
acttcatagctggcaaccatgaaaatcctgaaaggctcttctgatgagct
gtgtgtgagtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_71474314_71475332
seq2: B6Ng01-021M24.b_49_1041

seq1  GAATTCACTGATGGGTCTTTGTAGTGGAAATATCTTGGAATTTAGCCTCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTGATGGGTCTTTGTAGTGGAAATATCTTGGAATTTAGCCTCA  50

seq1  TTATTTGGCACAAATATGTCCAATGGCCTCAGCCATTTAGAGATGAGTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTGGCACAAATATGTCCAATGGCCTCAGCCATTTAGAGATGAGTTA  100

seq1  AATACCAAAGTGAATGGCATTTCAGAAACCCTGAACCCATACATGATTAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACCAAAGTGAATGGCATTTCAGAAACCCTGAACCCATACATGATTAG  150

seq1  TGATTACGTCATCATGCATGATAGCATCATCTCTAACCAGAATTGCACTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATTACGTCATCATGCATGATAGCATCATCTCTAACCAGAATTGCACTG  200

seq1  TGGGTGACATGAATAAGGCAAGTTCTATGAATTTTTATTTTTGACTGTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGACATGAATAAGGCAAGTTCTATGAATTTTTATTTTTGACTGTAT  250

seq1  TGTTCTTATTAAATATTGATAAAATTAAAGAAAGATTGAAATAAAAACCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTTATTAAATATTGATAAAATTAAAGAAAGATTGAAATAAAAACCT  300

seq1  GTCTGTGTACTTGTGTTGAAATTATGAGATATTTAAACATAAAGCTGTGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTGTACTTGTGTTGAAATTATGAGATATTTAAACATAAAGCTGTGT  350

seq1  TTCTGACAACAGTAAAATGTTGCTCAAATGGTAAGCCTTGAAAGCTATTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGACAACAGTAAAATGTTGCTCAAATGGTAAGCCTTGAAAGCTATTA  400

seq1  TTAATTTAATGGACAAAAACAATTACTAAAAGTTTTAAATAGGTAAATAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTAATGGACAAAAACAATTACTAAAAGTTTTAAATAGGTAAATAA  450

seq1  ATAAGAAGCTATATTGATAATTAATATGAATATTAAGCAAAAATGTATGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAAGCTATATTGATAATTAATATGAATATTAAGCAAAAATGTATGA  500

seq1  CCCTAACAGTTAGGAAGACAATTGCAATTCTAACAGAGAAGTTCATTAAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTAACAGTTAGGAAGACAATTGCAATTCTAACAGAGAAGTTCATTAAT  550

seq1  AATCACTATGAATGTCAGACGGAAAAATATAACCTTGGCATATATGCTAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTATGAATGTCAGACGGAAAAATATAACCTTGGCATATATGCTAA  600

seq1  GACAGGCCTGCAACATGGCAGTGTCCCTCACCAACTACATCCATGCCTTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGCCTGCAACATGGCAGTGTCCCTCACCAACTACATCCATGCCTTT  650

seq1  CTATCAGATTTACCACACTGAGAGAAACCAAAGAGAGAGCTTGCATGAAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATCAGATTTACCACACTGAGAGAAACCAAAGAGAGAGCTTGCATGAAT  700

seq1  ACTATGTCTAGGGAGGAAAGGACCTATTTGGTTTATAGGTGACAGTCTGT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGTCTAGGGAGGAAAGGACCTATTTGGTTTATAGGTGACAGTCTGT  750

seq1  CTTTCAAGGAAGCCAAGGCAGGAAGCCTGGAGGAACATTGCTTACTAGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCAAGGAAGCCAAGGCAGGAAGCCTGGAGGAACATTGCTTACTAGCT  800

seq1  TGCTCTCCATGGCTTGCTCAACTCGCTTTCTTATATAACCCAAGACCACT  850
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||
seq2  TGCTCT-CATGGCTTGCTCAACTCGCTTTCTTATATAACCC-AGA-CACT  847

seq1  GGCTGGGTCCTCTACATCAGTCGTGATATATGTGTGTGAGCTGGACCCGC  900
      |||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||
seq2  GGCTGGGT-CTCTACATCAGTC-TGAAATATGTGTGTGAGCTG--ACCGC  893

seq1  CGTACATCAGTCATGAATCAAGAAAGTCCACTACAGCCATGCCGGTGGTT  950
      ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||| |||||  ||  ||
seq2  CGTACATCAGTCATG-ATC-AGAAAGT-CACTACAG-CATGCGTGTCCTT  939

seq1  CCCTCCTCCTGGGTGACTCCAGTTTGTCTCGAGTTGTGGAAAAATAAATG  1000
      | ||       ||||||||||||||||| |||||  |||||||   ||||
seq2  CTCT-------GGTGACTCCAGTTTGTC-CGAGT--TGGAAAA--TAATG  977

seq1  AAATTTTGTGACACTTAGT  1019
       ||||||| || |||||||
seq2  -AATTTTG-GA-ACTTAGT  993

seq1: chr1_71622960_71623573
seq2: B6Ng01-021M24.g_68_681 (reverse)

seq1  ACACACTCACACACAGCTCATCAGAAGAGCCTTTCAGGATTTTCATGGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACTCACACACAGCTCATCAGAAGAGCCTTTCAGGATTTTCATGGTT  50

seq1  GCCAGCTATGAAGTTTGCCAGTTTTAGTCACTAAATCCTGACAGACTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCAGCTATGAAGTTTGCCAGTTTTAGTCACTAAATCCTGACAGACTGTG  100

seq1  GTCTCTGGTCCTTGGGCAGGATCTCCAGAGCCAGCAAAGCCACTCAGAGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTGGTCCTTGGGCAGGATCTCCAGAGCCAGCAAAGCCACTCAGAGT  150

seq1  GGAAGCTTCACTACTGTCATTCTTTGAAAAGACAGTGTTGCGGGAGAAAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGCTTCACTACTGTCATTCTTTGAAAAGACAGTGTTGCGGGAGAAAT  200

seq1  GTCATTGATTGCTAACGTCCGTGTTCCTTAGGTTATTGGCATCGGAGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTGATTGCTAACGTCCGTGTTCCTTAGGTTATTGGCATCGGAGCAG  250

seq1  GACAGCAGTCTCGGATACACTGCACTCGCCTTGCAGGTGATAAGGCAAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGCAGTCTCGGATACACTGCACTCGCCTTGCAGGTGATAAGGCAAAC  300

seq1  TCTTGGTGGCTTCGGCACCACCCACGAGTGCTGTCCATGAAGTTTAAAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTGGCTTCGGCACCACCCACGAGTGCTGTCCATGAAGTTTAAAGC  350

seq1  CGGGGTGAAGAGAGCAGAGATCTCCAATGCGATTGATCAGTATGTGACCG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGGGGTGAAGAGAGCAGAGATCTCCAATGCGATTGATCAGTATGTGACCG  400

seq1  GCACTATCGGTGAGGTGCGGACTGATTGGCTTCCCAGTGGACCGTGTTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATCGGTGAGGTGCGGACTGATTGGCTTCCCAGTGGACCGTGTTGC  450

seq1  GGTCGTCTCATGTATGACAGTCTTCCACCATCCTACCACAGAGAGGCTTC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCGTCTCATGTATGACAGTCTTCCACCATCCTACCACAGAGAGGCTTC  500

seq1  TCAAAACCCTCAGTAGTGTGAAATGCTTAAAACACCTTCCTCACCCCTGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAACCCTCAGTAGTGTGAAATGCTTAAAACACCTTCCTCACCCCTGT  550

seq1  CAACCTCACTGCTGCGCCCACAAACCTCTGAACCACAAACCTCTGCTTCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACCTCACTGCTGCGCCCACAAACCTCTGAACCACAAACCTCTGCTTCC  600

seq1  TGGGTAATGAATTC  614
      ||||||||||||||
seq2  TGGGTAATGAATTC  614