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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-022B15
Chromosome	1 (Build37)
Map Location	96,590,974 - 96,591,571
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Bok, Thap4, Atg4b, Dtymk, Ing5, D2hgdh, Gal3st2, LOC100041596, EG666009, EG619597, Neu4, Pdcd1, LOC666012, LOC666025
Downstream gene	LOC100040685, LOC383603, Tmem157, LOC100041686, Rnu7-ps2, St8sia4
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-022B15.b	B6Ng01-022B15.g
ACC	DH854414	DH854415
length	599	1,237
definition	DH854414\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-022B15, 5' end.	DH854415\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-022B15, 3' end.
singlet/doublet	singlet	---
BLAST hit	unique	no hit data
sequence	gaattccagagataacgctgatatttgcagtcttctgtggagcctacaat agactatattaatttttcatcagattgttgtgattacttttatttactga atagtgtgtttagctggaaatagtttagaaatcaatataaaacatcgtat tagggataaatgttcttagtaagggtatttatctgagtgtaaacattaac tctatttctaagtttctgaagaactttgattttctttccaggttgactca atctaatttgatcttatctatctatctatctatctatctatctatctatc tatctatctatctatctatctatctatcatgtgaggatatctatctttta tttacctaaaaagaagcacagatataaactatgcagtgtgagattgtaag aacaacagtcaaatttgatttagtttgaagaatcattagtatgagagatt tataacttcagtaaaagctcaatctactataactttttcaggtatgtgtg tgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgttattgcgagtactttcattactggaaa tttatgctatgaaagtgaaacctactttaattaggtgttatctgaaaaa	gaattccattgccaatggattatggccagccactgacaagaaagatctca ggacactaaaaagcttgcacactgctaaaacaaaacaaaacaaaacaaaa cagaaaacagaacaaaacaaaaacaacaatcaacaatccactaggggaag aggaagcccataaaattagaatatttatcagttatatctctgatagaagt ttaatatccagtatattgaaagaactcaaagaatagccacgcatgccaca cacactaaacagacccactcaaaaaaggaaaaaaaaataatgagcctcat agttgaataaggagttctcaacagaagaaagacagagtggctaagaaatc tctccagaaatgttaagcattcctggaaattaagaaaaatgtaaatgaaa acaactttgaggtttaatctcataccaatgatcagcaaatggctgataac aaatgctggttcagaggtaggaagaagtgaccctcatttactgtgggttg caaacataagcagtcattatggaaatcagtgtggagaaatattgaaagct aaaagcaaatctacaatatgacccaaatagcatcatcactatctaaagtc agaaaaaatctatttccctgtccacctaagcgccttagaatccagctttg caattgaacagaaatcgggaagtgtagctgctgctgaacactggcatata ttctgtattgatttaggaccccaaagcctttaggtctggcagcacttcgc ctcacaaaaaaactgtggttgcaacagcaaagttctagaatcagtaagca ggccttcttaaacactgaacattttagtgcttgctgcctggggagaaaaa tgcactgcactcggtagtatgtggatccccatactatctattggttataa atttttaagatgaaactcagatgtgagaaatttgatatagttacaaattt tatgcttagtttcttaattgtgagctatttctaaattgattacaaatttg gcatttaacaatactttgtcaagaaatttttatttattgcataacaatga gtaccgttatcactggtactgtttatgtttattggaaattaattacctta tcgacctcttatatgtgcccccagcaatccgaagtatggatttttgatct ttattaaaccggataatttaacttgaacctaactaatggtgaacggaatc attccacattgatgatgagaacataccgtggtatggt
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
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BAC End 1

BAC End 2

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seq1  ATAGTGTGTTTAGCTGGAAATAGTTTAGAAATCAATATAAAACATCGTAT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGTGTTTAGCTGGAAATAGTTTAGAAATCAATATAAAACATCGTAT  150

seq1  TAGGGATAAATGTTCTTAGTAAGGGTATTTATCTGAGTGTAAACATTAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGATAAATGTTCTTAGTAAGGGTATTTATCTGAGTGTAAACATTAAC  200

seq1  TCTATTTCTAAGTTTCTGAAGAACTTTGATTTTCTTTCCAGGTTGACTCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATTTCTAAGTTTCTGAAGAACTTTGATTTTCTTTCCAGGTTGACTCA  250

seq1  ATCTAATTTGATCTTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAATTTGATCTTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATC  300

seq1  TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATGTGAGGATATCTATCTTTTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCATGTGAGGATATCTATCTTTTA  350

seq1  TTTACCTAAAAAGAAGCACAGATATAAACTATGCAGTGTGAGATTGTAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACCTAAAAAGAAGCACAGATATAAACTATGCAGTGTGAGATTGTAAG  400

seq1  AACAACAGTCAAATTTGATTTAGTTTGAAGAATCATTAGTATGAGAGATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAACAGTCAAATTTGATTTAGTTTGAAGAATCATTAGTATGAGAGATT  450

seq1  TATAACTTCAGTAAAAGCTCAATCTACTATAACTTTTTCAGGTATGTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAACTTCAGTAAAAGCTCAATCTACTATAACTTTTTCAGGTATGTGTG  500

seq1  TGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTTATTTCAAGTACTTTCATTACTGG-AA  549
      ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||
seq2  TGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTTATTGCGAGTACTTTCATTACTGGAAA  550

seq1  TTTATGCTATGAAAGTGAAACCTACTTTAATTAGGTGTTATCTGAAAAA  598
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATGCTATGAAAGTGAAACCTACTTTAATTAGGTGTTATCTGAAAAA  599

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