BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-036A19
Chromosome1 (Build37)
Map Location 71,795,496 - 71,940,003
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC675667, EG667931
Upstream geneA830006F12Rik, LOC100043210, EG667884, EG666083, LOC100042804, LOC100042809, Bard1, LOC667900, Abca12, LOC629101, Atic, Fn1, LOC100042814, Gabarapl2-ps1_652.1, LOC383528
Downstream geneEG433319, LOC667937, LOC100043255, Mreg, Pecr, Tmem169, Xrcc5, March4, Smarcal1, Ankar, Rpl37a, Igfbp2, Igfbp5
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-036A19.bB6Ng01-036A19.g
ACCDH864349DH864350
length1,037999
definitionDH864349|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036A19, 5' end.DH864350|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-036A19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,938,951 - 71,940,003)(71,795,496 - 71,796,520)
sequence
gaattcaggttgccacactttggcggtaggggcttttgtccactaagcca
tcttaccagcctatggtaactacatgcgaaatgacatcattaagattcta
taccaatcaaaacttttctctggctctgaaaggaccagttggttctctgg
tattctcaactccctctgaaacatatgggctaagcaaagtgtgattagat
tcccctggacccgtggcttaggagacagaccagcaatgcagggatatttt
tctggcaaaatttatcattgaatttagatgcttaaaagaagttgaagaga
ggctggagagatggctcagccgtgaagagcacttgtgagtcttctagaga
actgggggttcaattcccggcatccacataattgctgacaatggtctgta
aggtcaggtccagagttagaggattcgagtccttcttccagccttcacca
gtactgaatgcacaaagtgagcagacacacagacaagaaaacactcatag
gtataaaataaaaataaataaaccttaaaacatatgtagttagagagtgt
aaagacatagccagaggatcctcctaacccagtgggaaatgatgacatct
tataacgcatggagaagggtaaggtgggctgtttgtaggaactttcacat
ggaaacattgccacaatgataacataggaccagagtaggacaaactactt
cctgcaaagcaggggttctcaacctgtggagcgcgaccccctaaggggtt
gagggagcctttcacagaggtgaccttcagaccattggaaaacacaaaca
cttacattatgattcacaacagtaacaagttatagttatgaagtagcaag
gaaaatgatattatggttggggctcacacaagggagcatattaaagggtc
acatcatcatgaaggtaggagcactgctgaaggatagaatgccttttgaa
tccatttcactgtcttctatagcatctttaacactgatactgctgagtca
gacaactgagcacggaggcttctcttttcgctggtgt
gaattccaaggaactcctcaccagctcctgcaacctagtctttggactta
tcagcctttaggattgtgaggaaatacgttctttataagctaccagtttc
agagatgttgtcagagcaatacatagcaggaaaagatgatcactcaggtg
attatgtggagaatataaatttaaaaatacatatttattttatgactatg
actgctttgcctgtgtgcacatgtgtgcaccatacacatacctggtgtct
ttttaagtcagaagaggcattgaatcccataatgctgaaattatgaatgg
gccaccatgcaaatgctggaaaccaaatcagggtcctgtgcaagagcaac
aggtgttcttaactgctgacccatctctccagactctagagagacactct
ttatatgtttatatgctcaaagaatagaaggccctggtcataaaaggcag
ataaccatttccgtatacacaaaggacagacccatctcacatcacacacc
aaaccctatatctccttccagaacttattaaggcaaactagacaccaatt
tcagtctatacacaagcacagcactgtggtggcttgaataggaatgtcct
tcacgggctcatgtatttaaatgtgtggtcattagagagtggtgctattt
gaaaggactgggaggtactctgttggagtaatgtgtcccttgggagtggg
ctttgggtttctgaagcccaaaccaggcccagtggctctctttctccctt
cctggagctctggatgtagcgctttcaacttttctagcaccatgtctgtc
tgtataccaccatgcttcctgccgtgtggattacaggctaaacttctgaa
actagcagcccataaatctttgcttttgaagagtgcttggtcatgtgtct
cttcacagcatagacactgactagacagcataaaacaaatttacacagac
gattagatctggaattagttggtggatgaggagagactgtctgcaaagt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_71938951_71940003
seq2: B6Ng01-036A19.b_43_1079 (reverse)

seq1  ACACCAGCGGGGAAGAGAAGCCTCACTGCTCAGTTTAGTCTGCATCACCA  50
      |||||||| |  ||||||||||||  |||||||||  |||||  ||| ||
seq2  ACACCAGC-GAAAAGAGAAGCCTCCGTGCTCAGTT--GTCTGACTCAGCA  47

seq1  GGTATCAGAGGCTAAGAGATTGCTATAGGAAGACAGAGGAAATGGGATAT  100
       ||||||| |   ||||   ||||||| ||||||||  ||||| |||| |
seq2  -GTATCAGTGTTAAAGA---TGCTATA-GAAGACAG-TGAAAT-GGAT-T  89

seq1  CAAAAGGCATTCTATCCCTACAGCAGTGGCTCCCAACCTTCCTGATGCTG  150
      ||||||||||||||| ||| ||||||| ||| || |||||| ||||| ||
seq2  CAAAAGGCATTCTAT-CCTTCAGCAGT-GCT-CCTACCTTCATGATGATG  136

seq1  TGACCCTTTAATATGCTCCCTTGTGTGAGCCCCCAACCATAATATCATTT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TGACCCTTTAATATGCTCCCTTGTGTGAG-CCCCAACCATAATATCATTT  185

seq1  TCCTTGCTACTTCATAACTATAACTTTGTTACTGTTGTGAATCATAATGT  250
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTGCTACTTCATAACTATAAC-TTGTTACTGTTGTGAATCATAATGT  234

seq1  AAGTGTTTGTGTTTTCCAATGGTCTGAAGGTCACCTCTGTGAAAGGCTCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGTTTGTGTTTTCCAATGGTCTGAAGGTCACCTCTGTGAAAGGCTCC  284

seq1  CTCAACCCCTTAGGGGGTCGCGCCCCACAGGTTGAGAACCCCTGCTTTGC  350
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAACCCCTTAGGGGGTCGCGCTCCACAGGTTGAGAACCCCTGCTTTGC  334

seq1  AGGAAGTAGTTTGTCCTACTCTGGTCCTATGTTATCATTGTGGCAATGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTAGTTTGTCCTACTCTGGTCCTATGTTATCATTGTGGCAATGTT  384

seq1  TCCATGTGAAAGTTCCTACAAACAGCCCACCTTACCCTTCTCCATGCGTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATGTGAAAGTTCCTACAAACAGCCCACCTTACCCTTCTCCATGCGTT  434

seq1  CTAAGATGTCATCATTTCCCACTGGGTTAGGAGGATCCTCTGGCTATGTC  500
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGATGTCATCATTTCCCACTGGGTTAGGAGGATCCTCTGGCTATGTC  484

seq1  TTTACACTCTCTAACTACATATGTTTTAAGGTTTATTTATTTTTATTTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACACTCTCTAACTACATATGTTTTAAGGTTTATTTATTTTTATTTTA  534

seq1  TACCTATGAGTGTTTTCTTGTCTGTGTGTCTGCTCACTTTGTGCATTCAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTATGAGTGTTTTCTTGTCTGTGTGTCTGCTCACTTTGTGCATTCAG  584

seq1  TACTGGTGAAGGCTGGAAGAAGGACTCGAATCCTCTAACTCTGGACCTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGTGAAGGCTGGAAGAAGGACTCGAATCCTCTAACTCTGGACCTGA  634

seq1  CCTTACAGACCATTGTCAGCAATTATGTGGATGCCGGGAATTGAACCCCC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTACAGACCATTGTCAGCAATTATGTGGATGCCGGGAATTGAACCCCC  684

seq1  AGTTCTCTAGAAGACTCACAAGTGCTCTTCACGGCTGAGCCATCTCTCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTCTCTAGAAGACTCACAAGTGCTCTTCACGGCTGAGCCATCTCTCCA  734

seq1  GCCTCTCTTCAACTTCTTTTAAGCATCTAAATTCAATGATAAATTTTGCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCTCTTCAACTTCTTTTAAGCATCTAAATTCAATGATAAATTTTGCC  784

seq1  AGAAAAATATCCCTGCATTGCTGGTCTGTCTCCTAAGCCACGGGTCCAGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAAATATCCCTGCATTGCTGGTCTGTCTCCTAAGCCACGGGTCCAGG  834

seq1  GGAATCTAATCACACTTTGCTTAGCCCATATGTTTCAGAGGGAGTTGAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATCTAATCACACTTTGCTTAGCCCATATGTTTCAGAGGGAGTTGAGA  884

seq1  ATACCAGAGAACCAACTGGTCCTTTCAGAGCCAGAGAAAAGTTTTGATTG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACCAGAGAACCAACTGGTCCTTTCAGAGCCAGAGAAAAGTTTTGATTG  934

seq1  GTATAGAATCTTAATGATGTCATTTCGCATGTAGTTACCATAGGCTGGTA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAGAATCTTAATGATGTCATTTCGCATGTAGTTACCATAGGCTGGTA  984

seq1  AGATGGCTTAGTGGACAAAAGCCCCTACCGCCAAAGTGTGGCAACCTGAA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGCTTAGTGGACAAAAGCCCCTACCGCCAAAGTGTGGCAACCTGAA  1034

seq1  TTC  1053
      |||
seq2  TTC  1037

seq1: chr1_71795496_71796520
seq2: B6Ng01-036A19.g_65_1063

seq1  GAATTCCAAGGAACTCCTCACCAGCTCCTGCAACCTAGTCTTTGGACTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAAGGAACTCCTCACCAGCTCCTGCAACCTAGTCTTTGGACTTA  50

seq1  TCAGCCTTTAGGATTGTGAGGAAATACGTTCTTTATAAGCTACCAGTTTC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCCTTTAGGATTGTGAGGAAATACGTTCTTTATAAGCTACCAGTTTC  100

seq1  AGAGATGTTGTCAGAGCAATACATAGCAGGAAAAGATGATCACTCAGGTG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATGTTGTCAGAGCAATACATAGCAGGAAAAGATGATCACTCAGGTG  150

seq1  ATTATGTGGAGAATATAAATTTAAAAATACATATTTATTTTATGACTATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGTGGAGAATATAAATTTAAAAATACATATTTATTTTATGACTATG  200

seq1  ACTGCTTTGCCTGTGTGCACATGTGTGCACCATACACATACCTGGTGTCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTTTGCCTGTGTGCACATGTGTGCACCATACACATACCTGGTGTCT  250

seq1  TTTTAAGTCAGAAGAGGCATTGAATCCCATAATGCTGAAATTATGAATGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAGTCAGAAGAGGCATTGAATCCCATAATGCTGAAATTATGAATGG  300

seq1  GCCACCATGCAAATGCTGGAAACCAAATCAGGGTCCTGTGCAAGAGCAAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCACCATGCAAATGCTGGAAACCAAATCAGGGTCCTGTGCAAGAGCAAC  350

seq1  AGGTGTTCTTAACTGCTGACCCATCTCTCCAGACTCTAGAGAGACACTCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGTTCTTAACTGCTGACCCATCTCTCCAGACTCTAGAGAGACACTCT  400

seq1  TTATATGTTTATATGCTCAAAGAATAGAAGGCCCTGGTCATAAAAGGCAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATATGTTTATATGCTCAAAGAATAGAAGGCCCTGGTCATAAAAGGCAG  450

seq1  ATAACCATTTCCGTATACACAAAGGACAGACCCATCTCACATCACACACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCATTTCCGTATACACAAAGGACAGACCCATCTCACATCACACACC  500

seq1  AAACCCTATATCTCCTTCCAGAACTTATTAAGGCAAACTAGACACCAATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCCTATATCTCCTTCCAGAACTTATTAAGGCAAACTAGACACCAATT  550

seq1  TCAGTCTATACACAAGCACAGCACTGTGGTGGCTTGAATAGGAATGTCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCTATACACAAGCACAGCACTGTGGTGGCTTGAATAGGAATGTCCT  600

seq1  TCACGGGCTCATGTATTTAAATGTGTGGTCATTAGAGAGTGGTGCTATTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACGGGCTCATGTATTTAAATGTGTGGTCATTAGAGAGTGGTGCTATTT  650

seq1  GAAAGGACTGGGAGGTACTCTGTTGGAGTAATGTGTCCCTTGGGAGTGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGACTGGGAGGTACTCTGTTGGAGTAATGTGTCCCTTGGGAGTGGG  700

seq1  CTTTGGGTTTCTGAAGCCCAAACCAGGCCCAGTGGCTCTCTTTCTCCCTT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGGGTTTCTGAAGCCCAAACCAGGCCCAGTGGCTCTCTTTCTCCCTT  750

seq1  CCTGGAGCTCTGGATGTAGCGCTTTCAACTTTTCTAGCACCATGTCTGTC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGAGCTCTGGATGTAGCGCTTTCAACTTTTCTAGCACCATGTCTGTC  800

seq1  TGTATACCACCATGCTTCCTGCCGTGTGGATTACAGGCTAAACTTCTGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATACCACCATGCTTCCTGCCGTGTGGATTACAGGCTAAACTTCTGAA  850

seq1  ACTAAGCAAGCCCCAATAAAATCTTTTGCTTTTGAAGAGTTGCCTTGGTC  900
      ||| ||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||   |||||||
seq2  ACT-AGC-AGCCC--AT-AAATC-TTTGCTTTTGAAGAGT--GCTTGGTC  892

seq1  ATGGTGTCTCTTCACAGCAATAGAACACTGACTAAGACAAGCATAAACAC  950
      || ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||| |||||||| ||
seq2  AT-GTGTCTCTTCACAGC-ATAG-ACACTGACT-AGAC-AGCATAAA-AC  936

seq1  CAAATTTTACACAGACAGATTTAGGATCTGGAGATGTAGTTGTGTGATGA  1000
        || ||||||||||| ||||   |||||||| || ||||||   |||||
seq2  --AAATTTACACAGAC-GATT--AGATCTGGA-AT-TAGTTGGTGGATGA  979

seq1  AGTGAGAGACTGGTCTGTGCAAAGT  1025
         |||||||||   | ||||||||
seq2  --GGAGAGACTG---TCTGCAAAGT  999