BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-040K14
Chromosome1 (Build37)
Map Location 91,322,379 - 91,437,296
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCentg2
Upstream geneSpp2, Glrp1, Arl4c, LOC100040127, 2410088K16Rik, LOC208347, Sh3bp4, LOC383542, EG665688
Downstream geneGbx2, Asb18, Iqca, Cxcr7
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-040K14.bB6Ng01-040K14.g
ACCDH867553DH867554
length7181,031
definitionDH867553|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-040K14, 5' end.DH867554|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-040K14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,436,578 - 91,437,296)(91,322,379 - 91,323,411)
sequence
gaattcaccccaaatctagatgccaactaaagctcagggctgtaacatag
acagctgttctccatacctggcttggtctcctgctccacgggttagcacc
cttggcctccttgttgagagaactcacagagggggtctctaattacacct
gcatggggctaaatgtgcaggcattgtaaatcacagcctgaaggggatga
gagccacccaggtggcagagtggctatgcagccagcttcaggaggactac
tcctgagtgcccattcattatgacaatgcttcggatgatgtgacccagaa
atactgtccaccgctcaccctgacttcacaaggctcaccatctgaaaggg
tgaatttcttgcctccggagtgttatgtgggtcacaggggctcttactct
ggagcatcagcctggaaaggcgtctgggtaacagtgaggtgccaggagcc
gggtgtgggacacagcaagtggcaaaataacaagtgaggctgaggtcaaa
tgatagaatcttcacccaggaactgtggccgatcacggttccaagcctag
aagaaagccaatatccagggaggctacaaggtccaggagagaggaagact
cctgtgggagtcagatgaaaggaccagaaggagaacaaggggaggaaggg
ctcctcagaggtgaggccttctaggatatcagcagccctactgtgtgtcg
ctcctctctacctagact
gaattccctttttctatcaaaggtggttagcttgccatgggccaacattc
catacatcttcccccgacctggtaagacattcctttacacaaagcccctg
ctacagttccagagcttggtggtctggaatggcccgcccctccacctccc
ctttatttccttcacactgcttttcaaacggtccagactatgaggttgaa
ccgcagccgatgagaaacaaccaggctcttccttgcctggccatccacgt
gctctgcttgccagcctgcttcgggtcacagcacatcatttttacataaa
ggaagtgttttgcctgcttacttccactttgcttggcggtgggatgctgg
aatatgaatatacaggcatgcagacggcagcagtctctgttcttaaggaa
gcgaggagagagaggttttgtatacttaacgggctgctgtcaagaaaagc
agcttctgaacacgacttgagaactggcctccaggagataaacatggtgc
acagaccctaaaacaaccacatgatgtcacccctggatgaccacacctca
caccttcatgtggccgcctctttatgcgtatgggcaggaactgtgactca
cttccatgcaacagaacacagctgaggtgatgggatgtcacactatggtt
ataaatactgtcagcagatgggagatggctgtgacttctgcctccaccgg
ccactccatgcaaccttgagtaaggcttttaatctcactcacaaaacttc
attttctgcaaagtaagcacaatgccggtcagctctttggctagcagcac
taggagggtcaggagatgtctttgtacctgttgtttaacagcctcatccc
tctgccttgccctctctgtgtctcgatcctatgtctttccctgggctctc
tcaccagttccatggcctaaataagatggaggtgggatcctctgtctgac
cagagatgaacttgcaactgagacggtgatgtttatcatccattccatga
ctttaattcacaagagctatgatggacatgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_91436578_91437296
seq2: B6Ng01-040K14.b_45_762 (reverse)

seq1  AGTCTAGGTAGAGAGGAGCGACACACAGTAGGGCTGCTGATATCCTCTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
seq2  AGTCTAGGTAGAGAGGAGCGACACACAGTAGGGCTGCTGATATCCT-AGA  49

seq1  AGGCCTCACCTCTGTGGAGCCCTTCCTCCCCTTGTTCTCCTTCTGGTCCT  100
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCCTCACCTCTGAGGAGCCCTTCCTCCCCTTGTTCTCCTTCTGGTCCT  99

seq1  TTCATCTGACTCCCACAGGAGTCTTCCTCTCTCCTGGACCTTGTAGCCTC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCTGACTCCCACAGGAGTCTTCCTCTCTCCTGGACCTTGTAGCCTC  149

seq1  CCTGGATATTGGCTTTCTTCTAGGCTTGGAACCGTGATCGGCCACAGTTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGATATTGGCTTTCTTCTAGGCTTGGAACCGTGATCGGCCACAGTTC  199

seq1  CTGGGTGAAGATTCTATCATTTGACCTCAGCCTCACTTGTTATTTTGCCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGGTGAAGATTCTATCATTTGACCTCAGCCTCACTTGTTATTTTGCCA  249

seq1  CTTGCTGTGTCCCACACCCGGCTCCTGGCACCTCACTGTTACCCAGACGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTGTGTCCCACACCCGGCTCCTGGCACCTCACTGTTACCCAGACGC  299

seq1  CTTTCCAGGCTGATGCTCCAGAGTAAGAGCCCCTGTGACCCACATAACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTCCAGGCTGATGCTCCAGAGTAAGAGCCCCTGTGACCCACATAACAC  349

seq1  TCCGGAGGCAAGAAATTCACCCTTTCAGATGGTGAGCCTTGTGAAGTCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGGAGGCAAGAAATTCACCCTTTCAGATGGTGAGCCTTGTGAAGTCAG  399

seq1  GGTGAGCGGTGGACAGTATTTCTGGGTCACATCATCCGAAGCATTGTCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGCGGTGGACAGTATTTCTGGGTCACATCATCCGAAGCATTGTCAT  449

seq1  AATGAATGGGCACTCAGGAGTAGTCCTCCTGAAGCTGGCTGCATAGCCAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGAATGGGCACTCAGGAGTAGTCCTCCTGAAGCTGGCTGCATAGCCAC  499

seq1  TCTGCCACCTGGGTGGCTCTCATCCCCTTCAGGCTGTGATTTACAATGCC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCACCTGGGTGGCTCTCATCCCCTTCAGGCTGTGATTTACAATGCC  549

seq1  TGCACATTTAGCCCCATGCAGGTGTAATTAGAGACCCCCTCTGTGAGTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCACATTTAGCCCCATGCAGGTGTAATTAGAGACCCCCTCTGTGAGTTC  599

seq1  TCTCAACAAGGAGGCCAAGGGTGCTAACCCGTGGAGCAGGAGACCAAGCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCAACAAGGAGGCCAAGGGTGCTAACCCGTGGAGCAGGAGACCAAGCC  649

seq1  AGGTATGGAGAACAGCTGTCTATGTTACAGCCCTGAGCTTTAGTTGGCAT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATGGAGAACAGCTGTCTATGTTACAGCCCTGAGCTTTAGTTGGCAT  699

seq1  CTAGATTTGGGGTGAATTC  719
      |||||||||||||||||||
seq2  CTAGATTTGGGGTGAATTC  718

seq1: chr1_91322379_91323411
seq2: B6Ng01-040K14.g_68_1092

seq1  GAATTCCCTTTTTCTATCAAAGGTGGTTAGCTTGCCATGGGCCAACATTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCCTTTTTCTATCAAAGGTGGTTAGCTTGCCATGGGCCAACATTC  50

seq1  CATACATCTTCCCCCGACCTGGTAAGACATTCCTTTACACAAAGCCCCTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACATCTTCCCCCGACCTGGTAAGACATTCCTTTACACAAAGCCCCTG  100

seq1  CTACAGTTCCAGAGCTTGGTGGTCTGGAATGGCCCGCCCCTCCACCTCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGTTCCAGAGCTTGGTGGTCTGGAATGGCCCGCCCCTCCACCTCCC  150

seq1  CTTTATTTCCTTCACACTGCTTTTCAAACGGTCCAGACTATGAGGTTGAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTATTTCCTTCACACTGCTTTTCAAACGGTCCAGACTATGAGGTTGAA  200

seq1  CCGCAGCCGATGAGAAACAACCAGGCTCTTCCTTGCCTGGCCATCCACGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGCAGCCGATGAGAAACAACCAGGCTCTTCCTTGCCTGGCCATCCACGT  250

seq1  GCTCTGCTTGCCAGCCTGCTTCGGGTCACAGCACATCATTTTTACATAAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCTGCTTGCCAGCCTGCTTCGGGTCACAGCACATCATTTTTACATAAA  300

seq1  GGAAGTGTTTTGCCTGCTTACTTCCACTTTGCTTGGCGGTGGGATGCTGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAGTGTTTTGCCTGCTTACTTCCACTTTGCTTGGCGGTGGGATGCTGG  350

seq1  AATATGAATATACAGGCATGCAGACGGCAGCAGTCTCTGTTCTTAAGGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATGAATATACAGGCATGCAGACGGCAGCAGTCTCTGTTCTTAAGGAA  400

seq1  GCGAGGAGAGAGAGGTTTTGTATACTTAACGGGCTGCTGTCAAGAAAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGAGGAGAGAGAGGTTTTGTATACTTAACGGGCTGCTGTCAAGAAAAGC  450

seq1  AGCTTCTGAACACGACTTGAGAACTGGCCTCCAGGAGATAAACATGGTGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTTCTGAACACGACTTGAGAACTGGCCTCCAGGAGATAAACATGGTGC  500

seq1  ACAGACCCTAAAACAACCACATGATGTCACCCCTGGATGACCACACCTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACCCTAAAACAACCACATGATGTCACCCCTGGATGACCACACCTCA  550

seq1  CACCTTCATGTGGCCGCCTCTTTATGCGTATGGGCAGGAACTGTGACTCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCTTCATGTGGCCGCCTCTTTATGCGTATGGGCAGGAACTGTGACTCA  600

seq1  CTTCCATGCAACAGAACACAGCTGAGGTGATGGGATGTCACACTATGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCATGCAACAGAACACAGCTGAGGTGATGGGATGTCACACTATGGTT  650

seq1  ATAAATACTGTCAGCAGATGGGAGATGGCTGTGACTTCTGCCTCCACCGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAATACTGTCAGCAGATGGGAGATGGCTGTGACTTCTGCCTCCACCGG  700

seq1  CCACTCCATGCAACCTTGAGTAAGGCTTTTAATCTCACTCACAAAACTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTCCATGCAACCTTGAGTAAGGCTTTTAATCTCACTCACAAAACTTC  750

seq1  ATTTTCTGCAAAGTAAGCACAATGCCGGTCAGCTCTTTGGCTAGCAGCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTCTGCAAAGTAAGCACAATGCCGGTCAGCTCTTTGGCTAGCAGCAC  800

seq1  TAGGAGGGTCAGGAGATGTCTTTGTACCTGTTGTTAAACAGCCTCATCCC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  TAGGAGGGTCAGGAGATGTCTTTGTACCTGTTGTTTAACAGCCTCATCCC  850

seq1  TCTGCCCTTGCCCTCTCTGTGTCTCGTATCCTATGTCTTTCCCTGGGCTC  900
      |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TCTG-CCTTGCCCTCTCTGTGTCTCG-ATCCTATGTCTTTCCCTGGGCTC  898

seq1  TCTCACCAGTTCCATGGCCTAGAGTAAGATGGAGGTGGGGATCCTCTGTC  950
      ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||
seq2  TCTCACCAGTTCCATGGCCTA-AATAAGATGGAGGT-GGGATCCTCTGTC  946

seq1  TGAGCCAGAGATGAACTTGCAACCTGGGACGGTGATGTTTATCATCCATT  1000
      ||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TGA-CCAGAGATGAACTTGCAA-CTGAGACGGTGATGTTTATCATCCATT  994

seq1  CCCTTGACTTTTAATTCACAGGAGCTCTGATGG  1033
       || |||| ||||||||||| ||||| ||||||
seq2  -CCATGAC-TTTAATTCACAAGAGCTATGATGG  1025