BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-041P02
Chromosome1 (Build37)
Map Location 66,445,857 - 66,499,651
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMtap2
Upstream geneLOC100042716, EG628894, LOC100043165, LOC383520, EG667775, Crygf, LOC667781, EG667786
Downstream geneC030018G13Rik, Rpe, 1110028C15Rik, Acadl, Myl1, LOC100043192, Lancl1, Cps1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-041P02.bB6Ng01-041P02.g
ACCDH868459DH868460
length1,014863
definitionDH868459|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-041P02, 5' end.DH868460|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-041P02, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(66,445,857 - 66,446,868)(66,498,790 - 66,499,651)
sequence
gaattctctgatcctaaaattattttttaataccattgggcaattcttga
agctacctaattagactcctggtcattatatgttctctcactgcttttct
ttgcagaggaggtatctgcaaggatagttcaagtagtcacagctgaagct
gtagcagtcctgaaaggtgaacaagagaaggaagcccaacacaaggacca
gcctgcagctctgcctctaggtaaatgagaagagcctaacacagggcaag
cctttgatgcccctcgtcccagtataaagtatacatgctgaagagatata
ttctactttgtacatactttgtgtatatgtcattcacctgtcacctctac
tagaagcagacaggcctgcctgttgagccctcagtggtttcactggggtg
ttttggcaggttttagggtgaaaacctgggtgttagatgtgatggccctc
cttttatttactaaatagggatttgatgagtccgtgcacaaaagaaagtg
aactgaaacttcagatgcaaatgacaggctctgctcatggattcatcaac
ccacatctgagatctagagatagaaccgtcagtgacttgactcacacagg
agagacggaccgtggggtttgagaattgtctaagggcacttcagtagcct
tgccctctcccatggtcgtaaatgccctttagtgccatggtggtatgtaa
cacataatcactgagaagggcactcagccaaggtttgctgccatgcacag
agagatagattgatccagaatttaaatatagatatgtaagtagatatata
aatacatagatgcatacatgatagataggtcatagatgcaatgacaaatt
acaaattcataaatgattgattgattgattgatttgattgattgatacat
agcctaaatgatagacacagatgcatggaagatacatagcttgcatatac
aaattatagatagagaattgatagattatatatatattatatatatatat
atatatatatatga
gaattcctgcctttgtttttctccatgctgtatgttcccagtagaacaga
ggaaccctccttctcctagtttctctttgtcatgatatttattgcagtta
tgttggcctcaaattttttttttacccctgatatttaatgagaaaattct
cttttaccaatggttataagacccatttaaatcgaaatgtaaaattttga
ttaatcaaatgtaaatgtcaattaaaaaaatccatgggagggcagtatct
tctgattgtggtgataaaaactggtacctggttttcagaaatgatatggc
tgtaggtataaaaaaaatcctcataaaaatgaatatctttctttgactca
ataacttttaggagttttaattaaggactattttaaagacaggatctcat
tttgaagcccaggttcttttggaattcactatttaacccatgttggcttg
agcctggtgcaatctgagtttcaaatgccctagtgctggggttacagtca
tgtgctactattcctggctctgttaatactagtaagctataatttctggc
ctttgatttttattttaatattagtggaatatttccttccaaagaaaaag
taaattgcccatttccagctggatttttcctgcttttcttaaagtgtgtg
tttgtgaacaggctgcttgaatagtgtgctattgccttggcaccttagca
cctgagaacggttgtaggaaggaataataaatttctatacaagagctaag
agcatgcaaacttatcctctccattttcatagtgagctgacagagatatt
tcactaaccaagaaattaaaaactcacttaatgttagaatttttttggtg
aaatataggttat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_66445857_66446868
seq2: B6Ng01-041P02.b_42_1055

seq1  GAATTCTCTGATCCTAAAATTATTTTTTAATACCATTGGGCAATTCTTGA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCTGATCCTAAAATTATTTTTTAATACCATTGGGCAATTCTTGA  50

seq1  AGCTACCTAATTAGACTCCTGGTCATTATATGTTCTCTCACTGCTTTTCT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACCTAATTAGACTCCTGGTCATTATATGTTCTCTCACTGCTTTTCT  100

seq1  TTGCAGAGGAGGTATCTGCAAGGATAGTTCAAGTAGTCACAGCTGAAGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCAGAGGAGGTATCTGCAAGGATAGTTCAAGTAGTCACAGCTGAAGCT  150

seq1  GTAGCAGTCCTGAAAGGTGAACAAGAGAAGGAAGCCCAACACAAGGACCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCAGTCCTGAAAGGTGAACAAGAGAAGGAAGCCCAACACAAGGACCA  200

seq1  GCCTGCAGCTCTGCCTCTAGGTAAATGAGAAGAGCCTAACACAGGGCAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCAGCTCTGCCTCTAGGTAAATGAGAAGAGCCTAACACAGGGCAAG  250

seq1  CCTTTGATGCCCCTCGTCCCAGTATAAAGTATACATGCTGAAGAGATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTTGATGCCCCTCGTCCCAGTATAAAGTATACATGCTGAAGAGATATA  300

seq1  TTCTACTTTGTACATACTTTGTGTATATGTCATTCACCTGTCACCTCTAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTACTTTGTACATACTTTGTGTATATGTCATTCACCTGTCACCTCTAC  350

seq1  TAGAAGCAGACAGGCCTGCCTGTTGAGCCCTCAGTGGTTTCACTGGGGTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGAAGCAGACAGGCCTGCCTGTTGAGCCCTCAGTGGTTTCACTGGGGTG  400

seq1  TTTTGGCAGGTTTTAGGGTGAAAACCTGGGTGTTAGATGTGATGGCCCTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGGCAGGTTTTAGGGTGAAAACCTGGGTGTTAGATGTGATGGCCCTC  450

seq1  CTTTTATTTACTAAATAGGGATTTGATGAGTCCGTGCACAAAAGAAAGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTATTTACTAAATAGGGATTTGATGAGTCCGTGCACAAAAGAAAGTG  500

seq1  AACTGAAACTTCAGATGCAAATGACAGGCTCTGCTCATGGATTCATCAAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTGAAACTTCAGATGCAAATGACAGGCTCTGCTCATGGATTCATCAAC  550

seq1  CCACATCTGAGATCTAGAGATAGAACCGTCAGTGACTTGACTCACACAGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATCTGAGATCTAGAGATAGAACCGTCAGTGACTTGACTCACACAGG  600

seq1  AGAGACGGACCGTGGGGTTTGAGAATTGTCTAAGGGCACTTCAGTAGCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACGGACCGTGGGGTTTGAGAATTGTCTAAGGGCACTTCAGTAGCCT  650

seq1  TGCCCTCTCCCATGGTCGTAAATGCCCTTTAGTGCCATGGTGGTATGTAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCTCTCCCATGGTCGTAAATGCCCTTTAGTGCCATGGTGGTATGTAA  700

seq1  CACATAATCACTGAGAAGGGCACTCAGCCAAGGTTTGCTGCCATGCACAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATAATCACTGAGAAGGGCACTCAGCCAAGGTTTGCTGCCATGCACAG  750

seq1  AGAGATAGATTGATCCAGAATTTAAATATAGATATGTAAGTAGATATATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGATAGATTGATCCAGAATTTAAATATAGATATGTAAGTAGATATATA  800

seq1  AATACATAGATGCATACATGATAGATAGGTCATAGATGCAATGACAAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATACATAGATGCATACATGATAGATAGGTCATAGATGCAATGACAAATT  850

seq1  ACAAATTCATAAATGATTGATTGATTGATTGA-TTGATTGATTGATACAT  899
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  ACAAATTCATAAATGATTGATTGATTGATTGATTTGATTGATTGATACAT  900

seq1  AG-CTAAATGATAGACACAGATGCATGGAAGATACATAGC-TGCATATAC  947
      || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGCCTAAATGATAGACACAGATGCATGGAAGATACATAGCTTGCATATAC  950

seq1  AAATTATAGATAGAGAATTGATAGATTATATATATATATATATATATATA  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  AAATTATAGATAGAGAATTGATAGATTATATATATAT-TATATATATATA  999

seq1  TATATATATATATGA  1012
      |||||||||||||||
seq2  TATATATATATATGA  1014

seq1: chr1_66498790_66499651
seq2: B6Ng01-041P02.g_71_933 (reverse)

seq1  ATAACCTATATTTCACCAAAAAAATTCTAACATTAAGTGAGTTTTTAATT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAACCTATATTTCACCAAAAAAATTCTAACATTAAGTGAGTTTTTAATT  50

seq1  TCTTGGTTAGTGAAATATCTCTGTCAGCTCACTATGAAAATGGAGAGGAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGGTTAGTGAAATATCTCTGTCAGCTCACTATGAAAATGGAGAGGAT  100

seq1  AAGTTTGCATGCTCTTAGCTCTTGTATAG-AATTTATTATTCCTTCCTAC  149
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTTGCATGCTCTTAGCTCTTGTATAGAAATTTATTATTCCTTCCTAC  150

seq1  AACCGTTCTCAGGTGCTAAGGTGCCAAGGCAATAGCACACTATTCAAGCA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCGTTCTCAGGTGCTAAGGTGCCAAGGCAATAGCACACTATTCAAGCA  200

seq1  GCCTGTTCACAAACACACACTTTAAGAAAAGCAGGAAAAATCCAGCTGGA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGTTCACAAACACACACTTTAAGAAAAGCAGGAAAAATCCAGCTGGA  250

seq1  AATGGGCAATTTACTTTTTCTTTGGAAGGAAATATTCCACTAATATTAAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGGCAATTTACTTTTTCTTTGGAAGGAAATATTCCACTAATATTAAA  300

seq1  ATAAAAATCAAAGGCCAGAAATTATAGCTTACTAGTATTAACAGAGCCAG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAATCAAAGGCCAGAAATTATAGCTTACTAGTATTAACAGAGCCAG  350

seq1  GAATAGTAGCACATGACTGTAACCCCAGCACTAGGGCATTTGAAACTCAG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATAGTAGCACATGACTGTAACCCCAGCACTAGGGCATTTGAAACTCAG  400

seq1  ATTGCACCAGGCTCAAGCCAACATGGGTTAAATAGTGAATTCCAAAAGAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCACCAGGCTCAAGCCAACATGGGTTAAATAGTGAATTCCAAAAGAA  450

seq1  CCTGGGCTTCAAAATGAGATCCTGTCTTTAAAATAGTCCTTAATTAAAAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGCTTCAAAATGAGATCCTGTCTTTAAAATAGTCCTTAATTAAAAC  500

seq1  TCCTAAAAGTTATTGAGTCAAAGAAAGATATTCATTTTTATGAGGATTTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAAAAGTTATTGAGTCAAAGAAAGATATTCATTTTTATGAGGATTTT  550

seq1  TTTTATACCTACAGCCATATCATTTCTGAAAACCAGGTACCAGTTTTTAT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTATACCTACAGCCATATCATTTCTGAAAACCAGGTACCAGTTTTTAT  600

seq1  CACCACAATCAGAAGATACTGCCCTCCCATGGATTTTTTTAATTGACATT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCACAATCAGAAGATACTGCCCTCCCATGGATTTTTTTAATTGACATT  650

seq1  TACATTTGATTAATCAAAATTTTACATTTCGATTTAAATGGGTCTTATAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATTTGATTAATCAAAATTTTACATTTCGATTTAAATGGGTCTTATAA  700

seq1  CCATTGGTAAAAGAGAATTTTCTCATTAAATATCAGGGGTAAAAAAAAAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATTGGTAAAAGAGAATTTTCTCATTAAATATCAGGGGTAAAAAAAAAA  750

seq1  TTTGAGGCCAACATAACTGCAATAAATATCATGACAAAGAGAAACTAGGA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGGCCAACATAACTGCAATAAATATCATGACAAAGAGAAACTAGGA  800

seq1  GAAGGAGGGTTCCTCTGTTCTACTGGGAACATACAGCATGGAGAAAAACA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAGGGTTCCTCTGTTCTACTGGGAACATACAGCATGGAGAAAAACA  850

seq1  AAGGCAGGAATTC  862
      |||||||||||||
seq2  AAGGCAGGAATTC  863