BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-045F12
Chromosome1 (Build37)
Map Location 74,175,332 - 74,281,766
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRufy4, Il8rb, Il8ra
Upstream genePinc, LOC672208, LOC100043291, Tns1
Downstream geneArpc2, Gpbar1, Aamp, Pnkd, Tmbim1, 2410125D13Rik, Gm216, Slc11a1, Ctdsp1, Vil1, Usp37, Rqcd1, Plcd4, Zfp142, Bcs1l, Rnf25, Stk36, Ttll4, Cyp27a1, Prkag3, Wnt6, Wnt10a, LOC100042901, Cdk5r2, Fev, Cryba2, Ccdc108, Ihh, Nhej1, Slc23a3, 1810031K17Rik, BC038286, Zfand2b, Abcb6, Atg9a, D1Ertd161e, Stk16, Tuba4a, A630095N17Rik, Dnajb10, Ptprn, Resp18
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-045F12.bB6Ng01-045F12.g
ACCDH870826DH870827
length9431,118
definitionDH870826|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045F12, 5' end.DH870827|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-045F12, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(74,280,823 - 74,281,766)(74,175,332 - 74,176,477)
sequence
gaattctaagatttattattatagggagagtacatgtgcatcgtggttgt
tgagtggaggctggaggacagcttttggacattggttatcttcttccact
gtggaatcctgggatgaaagtcaggtcatcagccttgcctagcaagtact
ttacctgctgagccatctctcaaaccccaaagcacaaatgtgtatgctaa
gcaatagagtcccactagctttgctaaagatgacacctacgacgtgtcta
atctttgcctgagttattatttttttttcaagaagttgacaacagcatcg
tctttctcacactgaggccataggcccctcaggtttaggcaggtttctga
cagctgacctgtcacctacagagggacaagactccacccttagaaggtat
ttgtgctgcccttttctgagcatgcacaatctgaagagaagtaaagtttg
ctttggaaagcacagcctaccggttcttacttgctttttcttgcttgagt
caccttagcccaatccttagactacttccttccttattccataaatatcc
ctgagatccctcttctggactccacactgggttgcccaaggaacagattt
tagcaaataaggccattcaatgactgatatactgcgaaatgagcaaatat
ggacccgatttggtcagaacacctacaaacattgcctgtatcaccttacc
ccaaacatcccattccacagcacaattgtttagaaggaataaaagtcttt
aaagcaggacatggtgcctatgcctcagtcttcagaagctgaccaggagg
atcatggtgagtttgagtctaccctgggctaagaagtaagctcaggacag
cttgggctgctgtgttgagaacctggccccaaatcagtaacaacaaacaa
acaaataattttaattattcaattgatatatgtatgtgtgtgt
gaattcaggctcagagaaattaagtatcttgtccctatcacacagccagg
aagggcagaggaagatcccccaacaaaaaggcctatatgagccctttctt
ctcccgtgtgcctccccagcacgccagggtgctacgtaggttccagaagg
agccactgacatgtgtttctttctctcatcttggtcctagtttgatcaga
aagagcagaggagcttcctgggggcccggaaggattactgggacttccta
ttcactgcccttcgacggcaccggggatacacagagcagatgagcttcat
atgctcacaggacaaggtaatgggagcaggggatgggaaagcaggtggac
tttgtccaggccttccctaggtcccttgtccctcagacctgctccacaaa
caggaggcttttcccctgagaggtgaggacctctcattagccctggtttt
gcctcccatttctcctctgaccttggcccactctttctccctcactctca
ttccctctgtactctctctcatttggcccagctcccccgccctgatttca
tgctctctttggccctccccacaccctgcagctgaagacctcactaggaa
aaggtcgtgcctttatccgactctgccttgcccgaggccagctggctgag
tcgatgcagctgtgcctcctgaacccacaactcaccaggtgggtttgcca
ggccatcatcccatatacagtacttgaacccactactgctaaatgggtga
caggggtaaaggactgagtgtcagcaaggagaaaggtctgagagttcctg
catgcagtttggcatacttgggcctctgccctttggaggctgagctcaac
cacaacctgcctgggaaggtccctttggtacgctgatttctcagaggtca
agggtgcaatggctggatgtgttgggtctctctccacacaaggaatgttt
gccctcgagccctctgtgtgcgctgagctcaggagacatctttgaccctc
tatgcctcaatggagttgctcaacttgaactgcagcgccagacctgataa
gcctgtcatttctctggtgaagagctccagcctagcacctctcctcctta
agttactttttgaggtta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_74280823_74281766
seq2: B6Ng01-045F12.b_44_986 (reverse)

seq1  ACACACACATACATATATTCAAATTGTATAATTAAAA-TATTTGTTTGTT  49
      ||||||||||||||||||   ||||| |||||||||| ||||||||||||
seq2  ACACACACATACATATAT--CAATTGAATAATTAAAATTATTTGTTTGTT  48

seq1  TGTTGTTACTGATTTGGGGGCAGGTTTCTC-ACACAGCAGCCCAAGCTGT  98
      ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTTACTGATTTGGGGCCAGG-TTCTCAACACAGCAGCCCAAGCTGT  97

seq1  CCTGAGCTTACTTCTTAGCCCAGGGTAGACTCAAACTCACCATGATCCTC  148
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGAGCTTACTTCTTAGCCCAGGGTAGACTCAAACTCACCATGATCCTC  147

seq1  CTGGTCAGCTTCTGAAGACTGAGGCATAGGCACCATGTCCTGCTTTAAAG  198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTCAGCTTCTGAAGACTGAGGCATAGGCACCATGTCCTGCTTTAAAG  197

seq1  ACTTTTATTCCTTCTAAACAATTGTGCTGTGGAATGGGATGTTTGGGGTA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTTATTCCTTCTAAACAATTGTGCTGTGGAATGGGATGTTTGGGGTA  247

seq1  AGGTGATACAGGCAATGTTTGTAGGTGTTCTGACCAAATCGGGTCCATAT  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTGATACAGGCAATGTTTGTAGGTGTTCTGACCAAATCGGGTCCATAT  297

seq1  TTGCTCATTTCGCAGTATATCAGTCATTGAATGGCCTTATTTGCTAAAAT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCTCATTTCGCAGTATATCAGTCATTGAATGGCCTTATTTGCTAAAAT  347

seq1  CTGTTCCTTGGGCAACCCAGTGTGGAGTCCAGAAGAGGGATCTCAGGGAT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTCCTTGGGCAACCCAGTGTGGAGTCCAGAAGAGGGATCTCAGGGAT  397

seq1  ATTTATGGAATAAGGAAGGAAGTAGTCTAAGGATTGGGCTAAGGTGACTC  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTATGGAATAAGGAAGGAAGTAGTCTAAGGATTGGGCTAAGGTGACTC  447

seq1  AAGCAAGAAAAAGCAAGTAAGAACCGGTAGGCTGTGCTTTCCAAAGCAAA  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAAGAAAAAGCAAGTAAGAACCGGTAGGCTGTGCTTTCCAAAGCAAA  497

seq1  CTTTACTTCTCTTCAGATTGTGCATGCTCAGAAAAGGGCAGCACAAATAC  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTACTTCTCTTCAGATTGTGCATGCTCAGAAAAGGGCAGCACAAATAC  547

seq1  CTTCTAAGGGTGGAGTCTTGTCCCTCTGTAGGTGACAGGTCAGCTGTCAG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAAGGGTGGAGTCTTGTCCCTCTGTAGGTGACAGGTCAGCTGTCAG  597

seq1  AAACCTGCCTAAACCTGAGGGGCCTATGGCCTCAGTGTGAGAAAGACGAT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGCCTAAACCTGAGGGGCCTATGGCCTCAGTGTGAGAAAGACGAT  647

seq1  GCTGTTGTCAACTTCTTGAAAAAAAAATAATAACTCAGGCAAAGATTAGA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTGTCAACTTCTTGAAAAAAAAATAATAACTCAGGCAAAGATTAGA  697

seq1  CACGTCGTAGGTGTCATCTTTAGCAAAGCTAGTGGGACTCTATTGCTTAG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTCGTAGGTGTCATCTTTAGCAAAGCTAGTGGGACTCTATTGCTTAG  747

seq1  CATACACATTTGTGCTTTGGGGTTTGAGAGATGGCTCAGCAGGTAAAGTA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACACATTTGTGCTTTGGGGTTTGAGAGATGGCTCAGCAGGTAAAGTA  797

seq1  CTTGCTAGGCAAGGCTGATGACCTGACTTTCATCCCAGGATTCCACAGTG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTAGGCAAGGCTGATGACCTGACTTTCATCCCAGGATTCCACAGTG  847

seq1  GAAGAAGATAACCAATGTCCAAAAGCTGTCCTCCAGCCTCCACTCAACAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAGATAACCAATGTCCAAAAGCTGTCCTCCAGCCTCCACTCAACAA  897

seq1  CCACGATGCACATGTACTCTCCCTATAATAATAAATCTTAGAATTC  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACGATGCACATGTACTCTCCCTATAATAATAAATCTTAGAATTC  943

seq1: chr1_74175332_74176477
seq2: B6Ng01-045F12.g_68_1185

seq1  GAATTCAGGCTCAGAGAAATTAAGTATCTTGTCCCTATCACACAGCCAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGCTCAGAGAAATTAAGTATCTTGTCCCTATCACACAGCCAGG  50

seq1  AAGGGCAGAGGAAGATCCCCCAACAAAAAGGCCTATATGAGCCCTTTCTT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGGCAGAGGAAGATCCCCCAACAAAAAGGCCTATATGAGCCCTTTCTT  100

seq1  CTCCCGTGTGCCTCCCCAGCACGCCAGGGTGCTACGTAGGTTCCAGAAGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCGTGTGCCTCCCCAGCACGCCAGGGTGCTACGTAGGTTCCAGAAGG  150

seq1  AGCCACTGACATGTGTTTCTTTCTCTCATCTTGGTCCTAGTTTGATCAGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCACTGACATGTGTTTCTTTCTCTCATCTTGGTCCTAGTTTGATCAGA  200

seq1  AAGAGCAGAGGAGCTTCCTGGGGGCCCGGAAGGATTACTGGGACTTCCTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGCAGAGGAGCTTCCTGGGGGCCCGGAAGGATTACTGGGACTTCCTA  250

seq1  TTCACTGCCCTTCGACGGCACCGGGGATACACAGAGCAGATGAGCTTCAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCACTGCCCTTCGACGGCACCGGGGATACACAGAGCAGATGAGCTTCAT  300

seq1  ATGCTCACAGGACAAGGTAATGGGAGCAGGGGATGGGAAAGCAGGTGGAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTCACAGGACAAGGTAATGGGAGCAGGGGATGGGAAAGCAGGTGGAC  350

seq1  TTTGTCCAGGCCTTCCCTAGGTCCCTTGTCCCTCAGACCTGCTCCACAAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTCCAGGCCTTCCCTAGGTCCCTTGTCCCTCAGACCTGCTCCACAAA  400

seq1  CAGGAGGCTTTTCCCCTGAGAGGTGAGGACCTCTCATTAGCCCTGGTTTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGGCTTTTCCCCTGAGAGGTGAGGACCTCTCATTAGCCCTGGTTTT  450

seq1  GCCTCCCATTTCTCCTCTGACCTTGGCCCACTCTTTCTCCCTCACTCTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTCCCATTTCTCCTCTGACCTTGGCCCACTCTTTCTCCCTCACTCTCA  500

seq1  TTCCCTCTGTACTCTCTCTCATTTGGCCCAGCTCCCCCGCCCTGATTTCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTCTGTACTCTCTCTCATTTGGCCCAGCTCCCCCGCCCTGATTTCA  550

seq1  TGCTCTCTTTGGCCCTCCCCACACCCTGCAGCTGAAGACCTCACTAGGAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTCTCTTTGGCCCTCCCCACACCCTGCAGCTGAAGACCTCACTAGGAA  600

seq1  AAGGTCGTGCCTTTATCCGACTCTGCCTTGCCCGAGGCCAGCTGGCTGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTCGTGCCTTTATCCGACTCTGCCTTGCCCGAGGCCAGCTGGCTGAG  650

seq1  TCGATGCAGCTGTGCCTCCTGAACCCACAACTCACCAGGTGGGTTTGCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGATGCAGCTGTGCCTCCTGAACCCACAACTCACCAGGTGGGTTTGCCA  700

seq1  GGCCATCATCCCATATACAGTACTTGAACCCACTACTGCTAAATGGGTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCATCATCCCATATACAGTACTTGAACCCACTACTGCTAAATGGGTGA  750

seq1  CAGGGGTAAAGGACTGAGTGTCAGCAAGGAGAAAGGGCCTGAGAG-TCCT  799
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||
seq2  CAGGGGTAAAGGACTGAGTGTCAGCAAGGAGAAA-GGTCTGAGAGTTCCT  799

seq1  GCATGCAGTTTGGCATACTTGGGCCTCTGCCC-TTGGAGGCTGAGCTCAG  848
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| 
seq2  GCATGCAGTTTGGCATACTTGGGCCTCTGCCCTTTGGAGGCTGAGCTCAA  849

seq1  CCACAACCTGCCTGGGAAGGTCCCCTTTGGTACGCTGA-TTCTCAGAGGT  897
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CCACAACCTGCCTGGGAAGGT-CCCTTTGGTACGCTGATTTCTCAGAGGT  898

seq1  CAAGGGTAGCAATGGCTGGATGTGTT-GGTCTCTCTTCACACAGGGAATG  946
      ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||
seq2  CAAGGGT-GCAATGGCTGGATGTGTTGGGTCTCTCTCCACACAAGGAATG  947

seq1  GTATGGCCCTCGGAGCCCTCTGTTGTGCGCTGAGCTCCAGGAAGACATCT  996
         | |||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||
seq2  --TTTGCCCTC-GAGCCCTCTG-TGTGCGCTGAGCT-CAGG-AGACATCT  991

seq1  TGGACTCTCTCTATGCCCTCAATGGAGTTGCCTTCAACTTGGACCTGCAG  1046
      | ||  | ||||||| |||||||||||||||  ||||||| || ||||||
seq2  TTGA--CCCTCTATG-CCTCAATGGAGTTGC--TCAACTT-GAACTGCAG  1035

seq1  CGGCCAGACCTGGATGAAGCCTGGCCCATGTTCTCAGAGTGAGGAGGCTC  1096
      | ||||||||| ||| |||||||   ||| ||||| | |||| || ||||
seq2  C-GCCAGACCT-GAT-AAGCCTG--TCAT-TTCTCTG-GTGAAGA-GCTC  1077

seq1  CAGCCCAAGCCACTCTTCCCTCCCCCTTTTAAGTTACTTTTGTGAGGTTA  1146
      ||| || |||  ||||  |||||     ||||||||||||| ||||||||
seq2  CAG-CCTAGCACCTCT--CCTCC-----TTAAGTTACTTTT-TGAGGTTA  1118