MoG+ -Mouse Genome database with high added value-

BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-048M09
Chromosome	1 (Build37)
Map Location	67,902,290 - 67,903,391
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	none
Upstream gene	Acadl, Myl1, LOC100043192, Lancl1, Cps1, Kif22-ps
Downstream gene	Erbb4
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-048M09.b	B6Ng01-048M09.g
ACC	DH873232	DH873233
length	1,081	1,076
definition	DH873232\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048M09, 5' end.	DH873233\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-048M09, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattctctgtttagctctgtactccatttttgaaattaagatatttgct ttcttggtgcctaatttcttaagttctttatatatttgaatattagacct ctgtcagatgtatgattggtgaagatattttcacattttgtaggctgtta ttctgtcctattgacggtgttctttgctttagagaaacttttcagttcca tgaagtcccatttattaatttttgatcttagtgcttgagcaattggtgtt ctgttcaggaatttgtctcctgtaccaatgagttcaaggctattctccac ttcttatcctatgagttagtggatctggttttatgttgaggcctttgatc cacatggactcgagctttgtggcgggtgatagatatgggtctatctgaat tcttctacatgccaacatccagtaagagcagcactatttgttaaagatgt tctctctgttccctcatgtggtttgggcttctttgtcaaaaatcaagtgt ctgtatgtatatgggtttatttgattctattccattgatcaagctgtctg actctataccagtaccatgcagttttattattattgcttggaagtacaac ttgaagttaggaatggtgatacgtccaaatgttctttttttgtacaattg ttttagctatccctagtttcttggttttctacatgaagttggaatttaca tatgtgttggaattttgatgggaattgcactgaatctgtagattgctttt ggtaaaatgggcattttcactatgttaatcttaccaatccatgggcatgg gagatctttccatcttctgatatcttcttcagtttctttcttcagagact tgcagttcttgttataaccaggcttttatttgcttggttacagtcacaca agatattttatatgagttgtggcttgtaatttgtagctattgtgaaaggg tgttgtcttccctagcttgtttctattcccattatccatttgtatgaacc caatataaagaagctcaagaagatgtcttgagtctttcttagaagagaga attatagattccgagtggagggggagagtga	gaattctgatagattctgtgcccagcattgtgctatctggctgattttaa agtgttagaactccctggtgatttccatctacagaacaaaagtgggcaga gaaagggcacagctggggtggtcattggcggtctggcgggagttagctgc agggtgactggcctgtgtagagcgatgatcaaagctcccaattgatcata gttcataatcatagctcctggtattcatgggaaaagtgtcagggctggct gcttggaggagctcgctgcaagaagttaaggggttagggaaccagccatt gaaggagcaatgtcagaggtgggaccagctgcagagtgttctcggggctg agagtccaaccctgtgaaggcattagtgtgtgttttaaaattacaggcaa caaattagccactcaatcagtgcccttcccagtagacacaacatgtctta gttcatcatgataaactcttcttaggaacttgattcagtttgtccttcct tcctccttgattgctagtcacagttcattagggacaagactacagacaac tctatcacccctgtgattatgaaacactttatcctatttacttaaagttc agatctctaataaaaaaacaaaaacctaaacgttctcttctgtgtttctg gagccccctccaccattatcattattattattaataacttccaaatacag agtttgccattctatttcctcattaaaataccagtttattgaaatacgat gtcactttataaggctgtagatctgtccatatcaaactagatgagaggtc ctcaacttgtaagttgtaacatttttgcagaggttgaaggaccctttcac tgaggtctcctaagaccatgctgcatatcagtatttacattacgatttat agagtcaaactatagtataaagtagcacacattaaatttatgtgaggtca cacacacagtactttattaaagggacaagcattacgagtgagagtcacct gactagactaggagaatagcaaagagagagagtcttcctctagtttctta gaaatcattgaaccatggaagctgga
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr1_67902290_67903391 seq2: B6Ng01-048M09.g_66_1141 seq1 GAATTCTGATAGATTCTGTGCCCAGCATTGTGCTATCTGGCTGATTTTAA 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCTGATAGATTCTGTGCCCAGCATTGTGCTATCTGGCTGATTTTAA 50 seq1 AGTGTTAGAACTCCCTGGTGATTTCCATCTACAGAACAAAAGTGGGCAGA 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGTGTTAGAACTCCCTGGTGATTTCCATCTACAGAACAAAAGTGGGCAGA 100 seq1 GAAAGGGCACAGCTGGGGTGGTCATTGGCGGTCTGGCGGGAGTTAGCTGC 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAAAGGGCACAGCTGGGGTGGTCATTGGCGGTCTGGCGGGAGTTAGCTGC 150 seq1 AGGGTGACTGGCCTGTGTAGAGCGATGATCAAAGCTCCCAATTGATCATA 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGGGTGACTGGCCTGTGTAGAGCGATGATCAAAGCTCCCAATTGATCATA 200 seq1 GTTCATAATCATAGCTCCTGGTATTCATGGGAAAAGTGTCAGGGCTGGCT 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTTCATAATCATAGCTCCTGGTATTCATGGGAAAAGTGTCAGGGCTGGCT 250 seq1 GCTTGGAGGAGCTCGCTGCAAGAAGTTAAGGGGTTAGGGAACCAGCCATT 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GCTTGGAGGAGCTCGCTGCAAGAAGTTAAGGGGTTAGGGAACCAGCCATT 300 seq1 GAAGGAGCAATGTCAGAGGTGGGACCAGCTGCAGAGTGTTCTCGGGGCTG 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAAGGAGCAATGTCAGAGGTGGGACCAGCTGCAGAGTGTTCTCGGGGCTG 350 seq1 AGAGTCCAACCCTGTGAAGGCATTAGTGTGTGTTTTAAAATTACAGGCAA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGAGTCCAACCCTGTGAAGGCATTAGTGTGTGTTTTAAAATTACAGGCAA 400 seq1 CAAATTAGCCACTCAATCAGTGCCCTTCCCAGTAGACACAACATGTCTTA 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CAAATTAGCCACTCAATCAGTGCCCTTCCCAGTAGACACAACATGTCTTA 450 seq1 GTTCATCATGATAAACTCTTCTTAGGAACTTGATTCAGTTTGTCCTTCCT 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTTCATCATGATAAACTCTTCTTAGGAACTTGATTCAGTTTGTCCTTCCT 500 seq1 TCCTCCTTGATTGCTAGTCACAGTTCATTAGGGACAAGACTACAGACAAC 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCCTCCTTGATTGCTAGTCACAGTTCATTAGGGACAAGACTACAGACAAC 550 seq1 TCTATCACCCCTGTGATTATGAAACACTTTATCCTATTTACTTAAAGTTC 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TCTATCACCCCTGTGATTATGAAACACTTTATCCTATTTACTTAAAGTTC 600 seq1 AGATCTCTAATAAAAAAACAAAAACCTAAACGTTCTCTTCTGTGTTTCTG 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGATCTCTAATAAAAAAACAAAAACCTAAACGTTCTCTTCTGTGTTTCTG 650 seq1 GAGCCCCCTCCACCATTATCATTATTATTATTAATAACTTCCAAATACAG 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGCCCCCTCCACCATTATCATTATTATTATTAATAACTTCCAAATACAG 700 seq1 AGTTTGCCATTCTATTTCCTCATTAAAATACCAGTTTATTGAAATACGAT 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGTTTGCCATTCTATTTCCTCATTAAAATACCAGTTTATTGAAATACGAT 750 seq1 GTCACTTTATAAGGCTGTAGATCTGTCCATATCAAACTAGATGAGAGGTC 800 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GTCACTTTATAAGGCTGTAGATCTGTCCATATCAAACTAGATGAGAGGTC 800 seq1 CTCAACTTGTAAGTTGTAACATTTTTGCAGAGGTTGAAGGACCCTTTCAC 850 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 CTCAACTTGTAAGTTGTAACATTTTTGCAGAGGTTGAAGGACCCTTTCAC 850 seq1 TGAGGTCTCCTAAGACCATGCTGCATATCAGGTATTTACATTACGATTTA 900 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGAGGTCTCCTAAGACCATGCTGCATATCA-GTATTTACATTACGATTTA 899 seq1 TAAGAGTCAAACTTATAGTTATAAAGTAGCAACAACATTAAATTTATGGT 950 \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 T-AGAGTCAAAC-TATAG-TATAAAGTAGCA--CACATTAAATTTATG-- 942 seq1 TGAGGGTCACCACAACACAAGGTACTTTATTAAAGGGACAAAGCATTACG 1000 \|\|\| \|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGA-GGTCAC----ACACACAGTACTTTATTAAAGGGAC-AAGCATTACG 986 seq1 AAGGTTGAGAGTCACTGAACTAGACTAAGGAAGAAATTAGC--ACAGAGA 1048 \| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| \| \|\|\|\| \|\|\|\| \| \|\|\|\|\| seq2 A---GTGAGAGTCACCTGACTAGACTA--GGAGAA--TAGCAAAGAGAGA 1029 seq1 GAGTCTT-CTCTAAGTCTCTAAAGAAAAATTCAATGAAACCCCATGGAAG 1097 \|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\| \|\|\| \|\|\| \|\|\|\|\| \|\|\| \|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAGTCTTCCTCT-AGTTTCT-TAGAAA---TCATTGAA---CCATGGAAG 1071 seq1 CTGGA 1102 \|\|\|\|\| seq2 CTGGA 1076

BAC End 1

BAC End 2

seq1: chr1_67902290_67903391
seq2: B6Ng01-048M09.g_66_1141

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGGGCACAGCTGGGGTGGTCATTGGCGGTCTGGCGGGAGTTAGCTGC  150

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGACTGGCCTGTGTAGAGCGATGATCAAAGCTCCCAATTGATCATA  200

seq1  GTTCATAATCATAGCTCCTGGTATTCATGGGAAAAGTGTCAGGGCTGGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATAATCATAGCTCCTGGTATTCATGGGAAAAGTGTCAGGGCTGGCT  250

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGGAGGAGCTCGCTGCAAGAAGTTAAGGGGTTAGGGAACCAGCCATT  300

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGGAGCAATGTCAGAGGTGGGACCAGCTGCAGAGTGTTCTCGGGGCTG  350

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTCCAACCCTGTGAAGGCATTAGTGTGTGTTTTAAAATTACAGGCAA  400

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATTAGCCACTCAATCAGTGCCCTTCCCAGTAGACACAACATGTCTTA  450

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCCTTGATTGCTAGTCACAGTTCATTAGGGACAAGACTACAGACAAC  550

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATCACCCCTGTGATTATGAAACACTTTATCCTATTTACTTAAAGTTC  600

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  GAGCCCCCTCCACCATTATCATTATTATTATTAATAACTTCCAAATACAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||
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      | |||||||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||  
seq2  T-AGAGTCAAAC-TATAG-TATAAAGTAGCA--CACATTAAATTTATG--  942

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      ||| ||||||    |||||  |||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TGA-GGTCAC----ACACACAGTACTTTATTAAAGGGAC-AAGCATTACG  986

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      |    ||||||||||   |||||||||  | ||||  ||||  | |||||
seq2  A---GTGAGAGTCACCTGACTAGACTA--GGAGAA--TAGCAAAGAGAGA  1029

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      ||||||| |||| ||| |||  |||||   ||| ||||   |||||||||
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seq1  CTGGA  1102
      |||||
seq2  CTGGA  1076

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