BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070K11
Chromosome1 (Build37)
Map Location 180,416,957 - 180,418,079
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneEG631449, LOC100040770, 1700016C15Rik, Adss, EG631584, EG545391, LOC666262, 5830417C01Rik, LOC666284, 4930527J03Rik, LOC666295, B230369F24Rik, LOC669454, 2310005N03Rik, Hnrpu, Efcab2
Downstream geneD230039L06Rik, Kif26b, Smyd3, LOC666354
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070K11.bB6Ng01-070K11.g
ACCDH888592DH888593
length1531,114
definitionDH888592|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070K11, 5' end.DH888593|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070K11, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattcaataaccattcatgaaaaggatacaatgtaagaactagagaaaa
ttattttaacatcataaaattcacagatgaaaatatatgtccttagaggt
atgccagggcaggaaggcaggagtgggtgggtgggtgggtagaggaaagg
tgt
gaattctttaaaagctctaatggatggagtcagttatttatagaaaacca
gctaggcaggcagggagggggtggagtggagctggagacctgctgcctcg
gtgcaaacagccggagtgtgggaaaatagggagccgaaggaaaattcatc
tgtgggatgagggtggtgctgatggagcgataccaagaggtttgctgtca
ttgcactatgaatgatcatctgttatgtttgtgttaaggacttgaaagta
ggagggtttagaaggcttgctctccctccctccctctccctccttccctc
catttctgtattgctatcaatcatagtacatttatagcagcgtgagtcat
tcacttgatctaatgagaaaagacattcattggggctggggctggggctg
ggggtgcagctcacctagcatgctaagtcctggattccaacccatgtaaa
ccaggcatggtgggacatgcttccaatcccagttcttggggttgcaggga
gctggaagaccagaagtttatgtagtgagttctaggccaacctaggatac
aagagaccttcctaactcaagagaataaaagaacataaaatcaggatagt
atgtaattctctggtccaaatatcaaatttaccatgctgtttataaggtt
ttcaactagtcagaaagaagttgtgaaaagatttactgctatttgtgaca
tttaagtatgggttaagtatcatgtcactaccatgtagctttaaagcatg
ccaaagtttgtttctatgtttcaaatgctaagtatttaaatgtcttgcta
tctgtcatagctgtatttcagctctggttgcccgttcagagcctgatgct
catgcaggcaaagttgataatgattgtgggaggcaaatctgtttctggta
gtcttctgatccatgacttttacatttctttatacttattaagtctgatt
atactattattataatcttgtatcacagctggcaagagctcacaggagta
gatttattagctttgccttttacccctgggctgcactccagacactcacc
acttcctaaagctgactgttgcttcagtatcacttttgccttcatcaggt
tacctttgagagag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_180416957_180418079
seq2: B6Ng01-070K11.g_68_1181

seq1  GAATTCTTTAAAAGCTCTAATGGATGGAGTCAGTTATTTATAGAAAACCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTAAAAGCTCTAATGGATGGAGTCAGTTATTTATAGAAAACCA  50

seq1  GCTAGGCAGGCAGGGAGGGGGTGGAGTGGAGCTGGAGACCTGCTGCCTCG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTAGGCAGGCAGGGAGGGGGTGGAGTGGAGCTGGAGACCTGCTGCCTCG  100

seq1  GTGCAAACAGCCGGAGTGTGGGAAAATAGGGAGCCGAAGGAAAATTCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGCAAACAGCCGGAGTGTGGGAAAATAGGGAGCCGAAGGAAAATTCATC  150

seq1  TGTGGGATGAGGGTGGTGCTGATGGAGCGATACCAAGAGGTTTGCTGTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGATGAGGGTGGTGCTGATGGAGCGATACCAAGAGGTTTGCTGTCA  200

seq1  TTGCACTATGAATGATCATCTGTTATGTTTGTGTTAAGGACTTGAAAGTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGCACTATGAATGATCATCTGTTATGTTTGTGTTAAGGACTTGAAAGTA  250

seq1  GGAGGGTTTAGAAGGCTTGCTCTCCCTCCCTCCCTCTCCCTCCTTCCCTC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGTTTAGAAGGCTTGCTCTCCCTCCCTCCCTCTCCCTCCTTCCCTC  300

seq1  CATTTCTGTATTGCTATCAATCATAGTACATTTATAGCAGCGTGAGTCAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTCTGTATTGCTATCAATCATAGTACATTTATAGCAGCGTGAGTCAT  350

seq1  TCACTTGATCTAATGAGAAAAGACATTCATTGGGGCTGGGGCTGGGGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTTGATCTAATGAGAAAAGACATTCATTGGGGCTGGGGCTGGGGCTG  400

seq1  GGGGTGCAGCTCACCTAGCATGCTAAGTCCTGGATTCCAACCCATGTAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTGCAGCTCACCTAGCATGCTAAGTCCTGGATTCCAACCCATGTAAA  450

seq1  CCAGGCATGGTGGGACATGCTTCCAATCCCAGTTCTTGGGGTTGCAGGGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCATGGTGGGACATGCTTCCAATCCCAGTTCTTGGGGTTGCAGGGA  500

seq1  GCTGGAAGACCAGAAGTTTATGTAGTGAGTTCTAGGCCAACCTAGGATAC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGAAGACCAGAAGTTTATGTAGTGAGTTCTAGGCCAACCTAGGATAC  550

seq1  AAGAGACCTTCCTAACTCAAGAGAATAAAAGAACATAAAATCAGGATAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGACCTTCCTAACTCAAGAGAATAAAAGAACATAAAATCAGGATAGT  600

seq1  ATGTAATTCTCTGGTCCAAATATCAAATTTACCATGCTGTTTATAAGGTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAATTCTCTGGTCCAAATATCAAATTTACCATGCTGTTTATAAGGTT  650

seq1  TTCAACTAGTCAGAAAGAAGTTGTGAAAAGATTTACTGCTATTTGTGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAACTAGTCAGAAAGAAGTTGTGAAAAGATTTACTGCTATTTGTGACA  700

seq1  TTTAAGTATGGGTTAAGTATCATGTCACTACCATGTAGCTTTAAAGCATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAAGTATGGGTTAAGTATCATGTCACTACCATGTAGCTTTAAAGCATG  750

seq1  CCAAAGTTTGTTTCTATGTTTCAAATGCTAAGTATTTAAATGTCTTGCTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGTTTGTTTCTATGTTTCAAATGCTAAGTATTTAAATGTCTTGCTA  800

seq1  TCTGTCATAGCTGTATTTCAGCTCTGGTTGCCCGTTCAGAGCCTGATGCT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCATAGCTGTATTTCAGCTCTGGTTGCCCGTTCAGAGCCTGATGCT  850

seq1  CATGCAGGCAAAGTTGATAATGATTGT-GGAGGCAAATCTGTTTCTGGTA  899
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCAGGCAAAGTTGATAATGATTGTGGGAGGCAAATCTGTTTCTGGTA  900

seq1  GTCTTCTTGATCCATGACTTTTACATTTCTTTTATTACTTATTAAGTCTG  949
      |||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||
seq2  GTCTTC-TGATCCATGACTTTTACATTTCTTT--ATACTTATTAAGTCTG  947

seq1  ATTATACTATTATTATTAATCTTGTATCACAGCTGGCAAAGAGCTCACAG  999
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  ATTATACTATTATTA-TAATCTTGTATCACAGCTGGC-AAGAGCTCACAG  995

seq1  GAGTAGATTTATTAGCTTTGCCTTATACCCCTGGGCTGCACTCCCAGTAC  1049
      |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||
seq2  GAGTAGATTTATTAGCTTTGCCTTTTACCCCTGGGCTGCACT-CCAG-AC  1043

seq1  ACTCCACCACTTTCTTAAAGCTGACTG-TGCTTACAGTATCACTTTTGCC  1098
      ||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||
seq2  ACT-CACCAC-TTCCTAAAGCTGACTGTTGCTT-CAGTATCACTTTTGCC  1090

seq1  TTCATTCAAGGTTA-CTTTGAGAGAG  1123
      |||||   |||||| |||||||||||
seq2  TTCAT--CAGGTTACCTTTGAGAGAG  1114