BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-091F13
Chromosome1 (Build37)
Map Location 179,468,835 - 179,596,382
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC100040770
Upstream geneCep170, Sdccag8, LOC666235, Akt3, Zfp238, EG631449
Downstream gene1700016C15Rik, Adss, EG631584, EG545391, LOC666262, 5830417C01Rik, LOC666284, 4930527J03Rik, LOC666295, B230369F24Rik, LOC669454, 2310005N03Rik, Hnrpu, Efcab2, D230039L06Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-091F13.bB6Ng01-091F13.g
ACCDH903394DH903395
length1,1321,048
definitionDH903394|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091F13, 5' end.DH903395|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-091F13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(179,468,835 - 179,469,977)(179,595,337 - 179,596,382)
sequence
gaattcataatggtgggaacaggtgtccagagcaggaagctgagagatca
cctcttccagagcatgtagaaagcagacagactgaactagaagtgggttg
aagctataaattctcaaagcctacccccagtgattcataccctccagcaa
ggctccacctcctaataattcaataacctccccaaacagtaccaacaggc
tgggacaaaacattcaagtttatgagcctatgcctcagtgctcttgtcag
ttttctttgaagctagtctgctgacatcccaggggccaacttcagagata
aacaaactctgttttctgcctaagaagaagggctgtttctggagctaatg
attatgggatgatggttatgaaatagcaagtcttcagaggatgccctagt
cagcttctctataactgataagcaccacaatcaaaatcaatttggagaga
aaagactttatttcatctcacagtcactcactgagggaagctggagcatg
aactccagcagagcaagaacttgaaacagaaaccatggagggatgctacc
tactaacttgctctcagcttcatgttcagatatgtttcttacaattccct
gtcccacctgcccagagatgccaccacctatagtggtcttggccctccca
catctattagaatcaagagaatgttccacagacatgttcacaagccaatc
tgactcacgaaatctcctaaattgagaccctctcagataactcgggtctg
gctcaagttggctgctgaagctaactagaaaagaagctcttcacccacag
agtgttttgaccctcaaatgcctttccaatgtcagaaaagaaggttccaa
tctttaacaaaaggaaagatccatccacgcatctttattttatactctct
cgttatctatgggtgggaggactccatgctggcaagtggtggtgatgtta
catccgtctcagatacctctaccagctctgtgttccttcccgtctccagt
tcccattctcacattcatgccctgttcaatcttcttgtctacgtcagtct
ctaccttgagcgtatagaatctcagtctgctatagatactaatccaggag
ggattccgaatgtaatctcagctctgtgatcc
gaattcttgggactccagcaggaccgtaagtttattgtggagagaggagt
tgtcttccctgctacatattctgaatacttgccgtgacattttcctgacc
actataacacgtcactctgtgctcagaacctgcaggacctctcagggatc
aatactatatggtattgtcttctacctgccgcctggtaagcaggcacatt
ctagtcacataggagaaatacaagttgacattattttagtcttgagaact
tcatggcatctttctctaaagctggctggagaatcccaggggtgtggagg
agcataaaatcaggaaatggtgtagagttcatagtgttcaaattgagaat
gttagtaagagcagaccgctgttcttcactaattttttcaggtccatggt
gcccactggaactggccttgccctgtgcacagccatgctggactcgggac
acttgtgttcgggattctttaggaaaggcacctttgcatccatcctttgg
cattcttagagataagcccatgctcacacaggtacacattggattcccag
cttgggcttatctttcctttattccttggtcacagttcttgagatgctta
tctatggctggcagggaggttatatccaaggggagattaaaatcctggtt
ttgtgatttctgcctctgcctatatgtacttgcttgggcaccctaggaag
cagtatccacagtgtccatccccacccctgtccactttcagtcttgccct
ggacaattccctacaacttgaaagccaaagaatctgccctctggatctga
gtctccagatcttttctagaaccagaacccaagcaccagactcatgaaca
cactcacaggattgtctgagcttccattctcaggagctctgaagctttgt
gagtgatgtcagcttgagtgcaccagactttcctggaggactgcagagat
cttaggcttcaatgcttgttccacatgttttcttcactgacattatttca
gagatgtttctgggcctttcttcttcactgagtttttcagtggaactt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_179468835_179469977
seq2: B6Ng01-091F13.b_44_1175

seq1  GAATTCATAATGGTGGGAACAGGTGTCCAGAGCAGGAAGCTGAGAGATCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATAATGGTGGGAACAGGTGTCCAGAGCAGGAAGCTGAGAGATCA  50

seq1  CCTCTTCCAGAGCATGTAGAAAGCAGACAGACTGAACTAGAAGTGGGTTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTTCCAGAGCATGTAGAAAGCAGACAGACTGAACTAGAAGTGGGTTG  100

seq1  AAGCTATAAATTCTCAAAGCCTACCCCCAGTGATTCATACCCTCCAGCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTATAAATTCTCAAAGCCTACCCCCAGTGATTCATACCCTCCAGCAA  150

seq1  GGCTCCACCTCCTAATAATTCAATAACCTCCCCAAACAGTACCAACAGGC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCCACCTCCTAATAATTCAATAACCTCCCCAAACAGTACCAACAGGC  200

seq1  TGGGACAAAACATTCAAGTTTATGAGCCTATGCCTCAGTGCTCTTGTCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACAAAACATTCAAGTTTATGAGCCTATGCCTCAGTGCTCTTGTCAG  250

seq1  TTTTCTTTGAAGCTAGTCTGCTGACATCCCAGGGGCCAACTTCAGAGATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTTTGAAGCTAGTCTGCTGACATCCCAGGGGCCAACTTCAGAGATA  300

seq1  AACAAACTCTGTTTTCTGCCTAAGAAGAAGGGCTGTTTCTGGAGCTAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAACTCTGTTTTCTGCCTAAGAAGAAGGGCTGTTTCTGGAGCTAATG  350

seq1  ATTATGGGATGATGGTTATGAAATAGCAAGTCTTCAGAGGATGCCCTAGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGGGATGATGGTTATGAAATAGCAAGTCTTCAGAGGATGCCCTAGT  400

seq1  CAGCTTCTCTATAACTGATAAGCACCACAATCAAAATCAATTTGGAGAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTCTCTATAACTGATAAGCACCACAATCAAAATCAATTTGGAGAGA  450

seq1  AAAGACTTTATTTCATCTCACAGTCACTCACTGAGGGAAGCTGGAGCATG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGACTTTATTTCATCTCACAGTCACTCACTGAGGGAAGCTGGAGCATG  500

seq1  AACTCCAGCAGAGCAAGAACTTGAAACAGAAACCATGGAGGGATGCTACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCCAGCAGAGCAAGAACTTGAAACAGAAACCATGGAGGGATGCTACC  550

seq1  TACTAACTTGCTCTCAGCTTCATGTTCAGATATGTTTCTTACAATTCCCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTAACTTGCTCTCAGCTTCATGTTCAGATATGTTTCTTACAATTCCCT  600

seq1  GTCCCACCTGCCCAGAGATGCCACCACCTATAGTGGTCTTGGCCCTCCCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCACCTGCCCAGAGATGCCACCACCTATAGTGGTCTTGGCCCTCCCA  650

seq1  CATCTATTAGAATCAAGAGAATGTTCCACAGACATGTTCACAAGCCAATC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTATTAGAATCAAGAGAATGTTCCACAGACATGTTCACAAGCCAATC  700

seq1  TGACTCACGAAATCTCCTAAATTGAGACCCTCTCAGATAACTCGGGTCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGACTCACGAAATCTCCTAAATTGAGACCCTCTCAGATAACTCGGGTCTG  750

seq1  GCTCAAGTTGGCTGCTGAAGCTAACTAGAAAAGAAGCTCTTCACCCACAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCAAGTTGGCTGCTGAAGCTAACTAGAAAAGAAGCTCTTCACCCACAG  800

seq1  AGTGTTTTGACCCTCAAATGCCTTTCCAATGTCAGAAAAGAAGGTTCCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTTTTGACCCTCAAATGCCTTTCCAATGTCAGAAAAGAAGGTTCCAA  850

seq1  TCTTTAACAAAAGGAAGGATCCATCCACGCATCTTTATTTTATACTCTCT  900
      |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTTAACAAAAGGAAAGATCCATCCACGCATCTTTATTTTATACTCTCT  900

seq1  CGTTATCTATGGGTGGGAGGACTCCATGCGGGCAAGGTGGTGGTGATGTT  950
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||
seq2  CGTTATCTATGGGTGGGAGGACTCCATGCTGGCAA-GTGGTGGTGATGTT  949

seq1  ACATCCGTCTCAGATACCTCTACCAGCTCCTGTGGTTCCTCCCCTCTCCC  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||| ||| ||
seq2  ACATCCGTCTCAGATACCTCTACCAGCT-CTGTGTTCCTTCCCGTCT-CC  997

seq1  AGTTCCCCATTCTCACATCCATGCCCTGTTCCAATCTTTCTGTCTACGTA  1050
      |||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||| 
seq2  AGTT-CCCATTCTCACATTCATGCCCTGTT-CAATCTTCTTGTCTACGTC  1045

seq1  AGTCTCTACCCTGAGCTTATAG-ATCTCCAGTCCTGGCTTATAGATACTA  1099
      |||||||||| ||||| ||||| |||| |||| |||   |||||||||||
seq2  AGTCTCTACCTTGAGCGTATAGAATCT-CAGT-CTG--CTATAGATACTA  1091

seq1  TATTCAAGAGGGGATTTCAGATGTCATCTCAGCCTCTGTGATCC  1143
       || || || |||||| |  |||| ||||||| |||||||||||
seq2  -ATCCAGGA-GGGATTCCGAATGTAATCTCAG-CTCTGTGATCC  1132

seq1: chr1_179595337_179596382
seq2: B6Ng01-091F13.g_69_1116 (reverse)

seq1  AAGTTCCACTTGGAAAACTCAGTGAAGAAGAAAGGCCAAGAACATTCTCT  50
      ||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||   |||||
seq2  AAGTTCCAC-TGAAAAACTCAGTGAAGAAGAAAGGCCCAGAAACATCTCT  49

seq1  GGAAATAATGTCAGTGAAG-AAACATGT-GAACAAGCATTTGGAGCCT-A  97
       |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||| |
seq2  -GAAATAATGTCAGTGAAGAAAACATGTGGAACAAGCA-TTGAAGCCTAA  97

seq1  GATCTCTGCAGTCCTCCAGG-AAGTCTGGTGCACTCAAGCTGACATCACT  146
      |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTGCAGTCCTCCAGGAAAGTCTGGTGCACTCAAGCTGACATCACT  147

seq1  CACAAAGCTTCAGAGCTCCTGAG-ATGGAAGCTCAGACAATCCTGTGAGT  195
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAAAGCTTCAGAGCTCCTGAGAATGGAAGCTCAGACAATCCTGTGAGT  197

seq1  GTGTTCATGAGTCTGGTGCTTGGGTTCTGGTTCTAGAAAAGATCTGGAGA  245
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTCATGAGTCTGGTGCTTGGGTTCTGGTTCTAGAAAAGATCTGGAGA  247

seq1  CTCAGATCCAGAGGGCAGATTCTTTGGCTTTCAAGTTGTTAGGGAATTGT  295
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CTCAGATCCAGAGGGCAGATTCTTTGGCTTTCAAGTTG-TAGGGAATTGT  296

seq1  CCAGGGCAAGACTG-AAGTGGACAGGGGTGGGGATGGACACTGTGGATAC  344
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGGCAAGACTGAAAGTGGACAGGGGTGGGGATGGACACTGTGGATAC  346

seq1  TGCTTCCTAGGGTGCCCAAGCAAGTACATATAGGCAGAGGCAGAAATCAC  394
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTCCTAGGGTGCCCAAGCAAGTACATATAGGCAGAGGCAGAAATCAC  396

seq1  AAAACCAGGATTTTAATCTCCCCTTGGATATAACCTCCCTGCCAGCCATA  444
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACCAGGATTTTAATCTCCCCTTGGATATAACCTCCCTGCCAGCCATA  446

seq1  GATAAGCATCTCAAGAACTGTGACCAAGGAATAAAGGAAAGATAAGCCCA  494
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAAGCATCTCAAGAACTGTGACCAAGGAATAAAGGAAAGATAAGCCCA  496

seq1  AGCTGGGAATCCAATGTGTACCTGTGTGAGCATGGGCTTATCTCTAAGAA  544
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGGGAATCCAATGTGTACCTGTGTGAGCATGGGCTTATCTCTAAGAA  546

seq1  TGCCAAAGGATGGATGCAAAGGTGCCTTTCCTAAAGAATCCCGAACACAA  594
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAAAGGATGGATGCAAAGGTGCCTTTCCTAAAGAATCCCGAACACAA  596

seq1  GTGTCCCGAGTCCAGCATGGCTGTGCACAGGGCAAGGCCAGTTCCAGTGG  644
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCCGAGTCCAGCATGGCTGTGCACAGGGCAAGGCCAGTTCCAGTGG  646

seq1  GCACCATGGACCTGAAAAAATTAGTGAAGAACAGCGGTCTGCTCTTACTA  694
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCATGGACCTGAAAAAATTAGTGAAGAACAGCGGTCTGCTCTTACTA  696

seq1  ACATTCTCAATTTGAACACTATGAACTCTACACCATTTCCTGATTTTATG  744
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATTCTCAATTTGAACACTATGAACTCTACACCATTTCCTGATTTTATG  746

seq1  CTCCTCCACACCCCTGGGATTCTCCAGCCAGCTTTAGAGAAAGATGCCAT  794
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTCCACACCCCTGGGATTCTCCAGCCAGCTTTAGAGAAAGATGCCAT  796

seq1  GAAGTTCTCAAGACTAAAATAATGTCAACTTGTATTTCTCCTATGTGACT  844
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGTTCTCAAGACTAAAATAATGTCAACTTGTATTTCTCCTATGTGACT  846

seq1  AGAATGTGCCTGCTTACCAGGCGGCAGGTAGAAGACAATACCATATAGTA  894
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGTGCCTGCTTACCAGGCGGCAGGTAGAAGACAATACCATATAGTA  896

seq1  TTGATCCCTGAGAGGTCCTGCAGGTTCTGAGCACAGAGTGACGTGTTATA  944
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGATCCCTGAGAGGTCCTGCAGGTTCTGAGCACAGAGTGACGTGTTATA  946

seq1  GTGGTCAGGAAAATGTCACGGCAAGTATTCAGAATATGTAGCAGGGAAGA  994
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCAGGAAAATGTCACGGCAAGTATTCAGAATATGTAGCAGGGAAGA  996

seq1  CAACTCCTCTCTCCACAATAAACTTACGGTCCTGCTGGAGTCCCAAGAAT  1044
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCCTCTCTCCACAATAAACTTACGGTCCTGCTGGAGTCCCAAGAAT  1046

seq1  TC  1046
      ||
seq2  TC  1048