BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-092D15
Chromosome1 (Build37)
Map Location 82,902,510 - 83,035,856
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA030005L19Rik, A030014E15Rik, EG621362, A030003K21Rik, LOC665225, LOC100039524, EG665236, LOC665246, Slc19a3, LOC665196
Upstream geneIrs1, Rhbdd1, Col4a4, Col4a3, 5230400G24Rik, Tm4sf20, LOC100039491, Hrb
Downstream geneLOC621495, A030005K14Rik, 5530401N06Rik, EG665272, Ccl20, LOC100039575, 4930563E19Rik, EG621614, 4930544G21Rik, EG622958, 5033414K04Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-092D15.bB6Ng01-092D15.g
ACCDH904046DH904047
length1,0141,076
definitionDH904046|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092D15, 5' end.DH904047|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-092D15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(83,034,843 - 83,035,856)(82,902,510 - 82,903,588)
sequence
gaattctcccacacccaaggcgtggctccacactcacaggcagcctttac
ataaaccacggtggggaggcaggaggaaaatccaaagtagaggtgcggag
gttcaagactgttaaccaaggtcatttctgcttgctggggttgctgtaaa
gtcaagcagtgtttctttggaggactattgtttacttccctaaattaatt
tttaaaattttaagtatttccattttaaccagtaggaaatctatgttaaa
taagtaaagttaaatttaaaagcctttgggagctggtatatatagctcag
tggaacatacctgtggcacaaggacctgggaaccgtttgtgccaaatatg
aactatttgtaccaaaacactcttaaagcgccaggaaaacacccgcccat
aacgttggggtctggagggacagtgcttataaatttggctctgaggccag
aatgtcctaaccgaaagctatgcctctctaagcctaacagctctgcctct
ttagtagtccttttcttcgtttgcaaactggaaatcacagtctacctttc
tcctgattgttagttgaaataaacgaattcataggaagagacaaatggag
cagaggatcagacctggtttcccttcttcttgccctactacgttgacgtg
gagagtcagcacattgcttgaggttgctctcttcaggtactggcttcact
tttttagcgctttacaaactggctgagggacctctgcttctagcctccgg
atcaaagacctgggggcttcattagcatatgcaaagttgggcgcggcttt
ggtcctgcgggactgacccggtgaccaagtccatctttacttgagatcgc
cgacccacatagctgaaagtgctacatatccgggacaagtgagcagcact
agctttctataggtaagacctcccacggagcgtagttaattaaagtccag
aaaccctgggccgcccgcctttcctctcccctctctaatttggagcgggg
tggggggtgggaga
gaattctaagcatttgtagaagatataattgtttgatttctccttttgct
gcttgtgggagtttcttatgtagaatgtcttctaaggcgtagggacacaa
ctgagccacatacttaatgagatcttatgtgtctgatccatatgcatcac
ataagacactctattcttatcatcgctgacatggtaaatggctttaagtg
gattcttgatgacagcaagcagatggtgtcattgcatagaaaggggatga
agtcatttgttcattaaatcttcatggatgccgtttagtgtgaaaggggc
tgggaatttgagactgcccatggtgattccttgattgagctcttcaaggt
cttggaatcaagagttgcactgacattgtttaagaaactatgccagccca
ggggagggaccactggctgtgaagcatgaagaggagagctggtgaaaagc
ctctcagacttgcttgccctgtatccacagagctgttcaggcaccaggaa
gacaggcaagaagcaggaagaaccgcacatcagaatgagacagatagagt
atgtaggttatgtatcttagggtcagtttcagatgagatagatgggctgg
aaagcggactgagacaaggataggtcattttatagcatcaagtgaagcag
gagccagttttgtaaaaggaagaaaatcatagaggaaggagcttgggcaa
gaatgttaaagaaggcacaagatttatgcgtttgaagaatgcgaagaagg
caagagtgggtggcaaggcactctgtgccaggcaggtgggaccaggagct
tgtggatgaaatgacttacagtaaatgcagaatgtaaagggtagtcattg
tgggtgtgatgtggcccagacctcagctgttgggtgcgaatgagcgaggg
cagtggagttggtgccactaagtgcttagcagacatagagggtggggtca
gaagctgatggtagtagggaaaaggattcattggtgaagaaggaattcag
aattacgtatacaacaacagcactagttaaggagcgttcaaatcaaagct
gaccgagagccagtggggcgggctga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_83034843_83035856
seq2: B6Ng01-092D15.b_45_1058 (reverse)

seq1  TCTCCCA-CCCCCACCCCGCCTCCAAATTAGAGAGGGGAGAGGAAAGGCG  49
      ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCACCCCCCACCCCG-CTCCAAATTAGAGAGGGGAGAGGAAAGGCG  49

seq1  GGCGGCCCAGGGTTTCTGGACTTTAATTAACTACGCTCCGTGGGAGGTCT  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCGGCCCAGGGTTTCTGGACTTTAATTAACTACGCTCCGTGGGAGGTCT  99

seq1  TACCTATAGAAAGCTAGTGCTGCTCACTTGTCCCGGATATGTAGCACTTT  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCTATAGAAAGCTAGTGCTGCTCACTTGTCCCGGATATGTAGCACTTT  149

seq1  CAGCTATGTGGGTCGGCGATCTCAAGTAAAGATGGACTTGGTCACCGGGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTATGTGGGTCGGCGATCTCAAGTAAAGATGGACTTGGTCACCGGGT  199

seq1  CAGTCCCGCAGGACCAAAGCCGCGCCCAACTTTGCATATGCTAATGAAGC  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTCCCGCAGGACCAAAGCCGCGCCCAACTTTGCATATGCTAATGAAGC  249

seq1  CCCCAGGTCTTTGATCCGGAGGCTAGAAGCAGAGGTCCCTCAGCCAGTTT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGGTCTTTGATCCGGAGGCTAGAAGCAGAGGTCCCTCAGCCAGTTT  299

seq1  GTAAAGCGCTAAAAAAGTGAAGCCAGTACCTGAAGAGAGCAACCTCAAGC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGCGCTAAAAAAGTGAAGCCAGTACCTGAAGAGAGCAACCTCAAGC  349

seq1  AATGTGCTGACTCTCCACGTCAACGTAGTAGGGCAAGAAGAAGGGAAACC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGCTGACTCTCCACGTCAACGTAGTAGGGCAAGAAGAAGGGAAACC  399

seq1  AGGTCTGATCCTCTGCTCCATTTGTCTCTTCCTATGAATTCGTTTATTTC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTGATCCTCTGCTCCATTTGTCTCTTCCTATGAATTCGTTTATTTC  449

seq1  AACTAACAATCAGGAGAAAGGTAGACTGTGATTTCCAGTTTGCAAACGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAACAATCAGGAGAAAGGTAGACTGTGATTTCCAGTTTGCAAACGAA  499

seq1  GAAAAGGACTACTAAAGAGGCAGAGCTGTTAGGCTTAGAGAGGCATAGCT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAGGACTACTAAAGAGGCAGAGCTGTTAGGCTTAGAGAGGCATAGCT  549

seq1  TTCGGTTAGGACATTCTGGCCTCAGAGCCAAATTTATAAGCACTGTCCCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCGGTTAGGACATTCTGGCCTCAGAGCCAAATTTATAAGCACTGTCCCT  599

seq1  CCAGACCCCAACGTTATGGGCGGGTGTTTTCCTGGCGCTTTAAGAGTGTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGACCCCAACGTTATGGGCGGGTGTTTTCCTGGCGCTTTAAGAGTGTT  649

seq1  TTGGTACAAATAGTTCATATTTGGCACAAACGGTTCCCAGGTCCTTGTGC  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTACAAATAGTTCATATTTGGCACAAACGGTTCCCAGGTCCTTGTGC  699

seq1  CACAGGTATGTTCCACTGAGCTATATATACCAGCTCCCAAAGGCTTTTAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGGTATGTTCCACTGAGCTATATATACCAGCTCCCAAAGGCTTTTAA  749

seq1  ATTTAACTTTACTTATTTAACATAGATTTCCTACTGGTTAAAATGGAAAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAACTTTACTTATTTAACATAGATTTCCTACTGGTTAAAATGGAAAT  799

seq1  ACTTAAAATTTTAAAAATTAATTTAGGGAAGTAAACAATAGTCCTCCAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTAAAATTTTAAAAATTAATTTAGGGAAGTAAACAATAGTCCTCCAAA  849

seq1  GAAACACTGCTTGACTTTACAGCAACCCCAGCAAGCAGAAATGACCTTGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACACTGCTTGACTTTACAGCAACCCCAGCAAGCAGAAATGACCTTGG  899

seq1  TTAACAGTCTTGAACCTCCGCACCTCTACTTTGGATTTTCCTCCTGCCTC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACAGTCTTGAACCTCCGCACCTCTACTTTGGATTTTCCTCCTGCCTC  949

seq1  CCCACCGTGGTTTATGTAAAGGCTGCCTGTGAGTGTGGAGCCACGCCTTG  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACCGTGGTTTATGTAAAGGCTGCCTGTGAGTGTGGAGCCACGCCTTG  999

seq1  GGTGTGGGAGAATTC  1014
      |||||||||||||||
seq2  GGTGTGGGAGAATTC  1014

seq1: chr1_82902510_82903588
seq2: B6Ng01-092D15.g_68_1143

seq1  GAATTCTAAGCATTTGTAGAAGATATAATTGTTTGATTTCTCCTTTTGCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAAGCATTTGTAGAAGATATAATTGTTTGATTTCTCCTTTTGCT  50

seq1  GCTTGTGGGAGTTTCTTATGTAGAATGTCTTCTAAGGCGTAGGGACACAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTGTGGGAGTTTCTTATGTAGAATGTCTTCTAAGGCGTAGGGACACAA  100

seq1  CTGAGCCACATACTTAATGAGATCTTATGTGTCTGATCCATATGCATCAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGCCACATACTTAATGAGATCTTATGTGTCTGATCCATATGCATCAC  150

seq1  ATAAGACACTCTATTCTTATCATCGCTGACATGGTAAATGGCTTTAAGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGACACTCTATTCTTATCATCGCTGACATGGTAAATGGCTTTAAGTG  200

seq1  GATTCTTGATGACAGCAAGCAGATGGTGTCATTGCATAGAAAGGGGATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTCTTGATGACAGCAAGCAGATGGTGTCATTGCATAGAAAGGGGATGA  250

seq1  AGTCATTTGTTCATTAAATCTTCATGGATGCCGTTTAGTGTGAAAGGGGC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCATTTGTTCATTAAATCTTCATGGATGCCGTTTAGTGTGAAAGGGGC  300

seq1  TGGGAATTTGAGACTGCCCATGGTGATTCCTTGATTGAGCTCTTCAAGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGAATTTGAGACTGCCCATGGTGATTCCTTGATTGAGCTCTTCAAGGT  350

seq1  CTTGGAATCAAGAGTTGCACTGACATTGTTTAAGAAACTATGCCAGCCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGAATCAAGAGTTGCACTGACATTGTTTAAGAAACTATGCCAGCCCA  400

seq1  GGGGAGGGACCACTGGCTGTGAAGCATGAAGAGGAGAGCTGGTGAAAAGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAGGGACCACTGGCTGTGAAGCATGAAGAGGAGAGCTGGTGAAAAGC  450

seq1  CTCTCAGACTTGCTTGCCCTGTATCCACAGAGCTGTTCAGGCACCAGGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTCAGACTTGCTTGCCCTGTATCCACAGAGCTGTTCAGGCACCAGGAA  500

seq1  GACAGGCAAGAAGCAGGAAGAACCGCACATCAGAATGAGACAGATAGAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGCAAGAAGCAGGAAGAACCGCACATCAGAATGAGACAGATAGAGT  550

seq1  ATGTAGGTTATGTATCTTAGGGTCAGTTTCAGATGAGATAGATGGGCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTAGGTTATGTATCTTAGGGTCAGTTTCAGATGAGATAGATGGGCTGG  600

seq1  AAAGCGGACTGAGACAAGGATAGGTCATTTTATAGCATCAAGTGAAGCAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGCGGACTGAGACAAGGATAGGTCATTTTATAGCATCAAGTGAAGCAG  650

seq1  GAGCCAGTTTTGTAAAAGGAAGAAAATCATAGAGGAAGGAGCTTGGGCAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCCAGTTTTGTAAAAGGAAGAAAATCATAGAGGAAGGAGCTTGGGCAA  700

seq1  GAATGTTAAAGAAGGCACAAGATTTATGCGTTTGAAGAATGCGAAGAAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTTAAAGAAGGCACAAGATTTATGCGTTTGAAGAATGCGAAGAAGG  750

seq1  CAAGAGTGGGTGGCAAGGCACTCTGTGCCAGGCAGGTGGGACCAGGAGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAGTGGGTGGCAAGGCACTCTGTGCCAGGCAGGTGGGACCAGGAGCT  800

seq1  TGTGGATGAAATGACTTACAGTAAATGCAGAATGTAAAGGGTAGTCATTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGATGAAATGACTTACAGTAAATGCAGAATGTAAAGGGTAGTCATTG  850

seq1  TGGGTGTGATGTGGCCCAGACCTCAGCTGTTGGGTGCGAATGAGCGAGGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGTGATGTGGCCCAGACCTCAGCTGTTGGGTGCGAATGAGCGAGGG  900

seq1  CAGTGGAGGTGGTGCCACTAAGTGCTTAGCAGACATAGAGGGTGGGGTCA  950
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGGAGTTGGTGCCACTAAGTGCTTAGCAGACATAGAGGGTGGGGTCA  950

seq1  GAAGCTGATGGTAGTAGGGGAAAAGGATTCATTTGTGAAAGAGGAATTCA  1000
      |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||||
seq2  GAAGCTGATGGTAGTA-GGGAAAAGGATTCATTGGTGAAGAAGGAATTCA  999

seq1  GAAATACGTATACAAACGACAGCACTAAGTATAGGAGCGTCATAATCAAA  1050
      ||| ||||||||| ||| |||||||| |||  ||||||||   |||||||
seq2  GAATTACGTATAC-AACAACAGCACT-AGTTAAGGAGCGTTCAAATCAAA  1047

seq1  GCTGACCGAGAGCCAGTGGGGCGGGCTGA  1079
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACCGAGAGCCAGTGGGGCGGGCTGA  1076