BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-095O18
Chromosome1 (Build37)
Map Location 128,415,171 - 128,596,963
singlet/doubletdoublet
Overlap geneE030049G20Rik
Upstream geneSlc35f5, Lypd1
Downstream geneLOC383559, Mgat5, LOC667090, Tmem163
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-095O18.bB6Ng01-095O18.g
ACCDH906728DH906729
length1,145971
definitionDH906728|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095O18, 5' end.DH906729|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-095O18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(128,415,171 - 128,416,345)(128,595,986 - 128,596,963)
sequence
gaattctgtctctgctgcacatctagccccccagagatagcctctttatc
tcctgaagggatttaaaccaactatagttcttattttattctgtgtccac
tgttaaggatgcatgcagagaaagtttgcatgttgccaattaaaatcccc
ctccccagtggaggtctatgattccagcagaggcaagcatttaatactca
tggctccttagtctacgtgcattaaccccatgaggaaagaggcatactaa
cacgtgaagaggctgaataaaataagagccaagatacatgggatgagaat
ctctgggatagtcagagactgatgctaaacaggattaattcttgttcgta
cctgtgctttacaagtgcaagccaaccttttcaatagagcattacaaact
tctcatagcttccagcaggcagttttaatattattttagacatagagaca
gaaacaaacaaacaaacaataaataaataaatacaaaagcaagttttaaa
aaaatatcactttaacatagtctgtatgtgtatatgtgtatgtgccattc
tgtatctgtggaggtctgaaggcaaacaatgggaatcaggtctctccttc
tcctatgtgggtcccagaaacggaactcatgtcaccaagcttaacaacaa
gcaccttcacccactgagatgatctaaaagtggaattctgtctgtgttac
ggaaagaatttctttcctggcagtaacctttagagacatggatgccaaaa
cttctgccggaaaatataaactgacatcactgttacagagagcatggagg
aatatctgggaatatctgggaatgtctgggatgaggtcattttatgtccg
tttccatttcctttgggaagcatacaatccagagaatgaaagcaagtatg
ttaattgtaaatactcttttcttttagagtaggatcacagctaaaccaaa
gagcaaaggagacttctaggttcagatttgtaaaactctttgatgctaga
ggagtgcctccggctctttttctacaggttctgtaatgtggatcatatgg
ctcagtcttctgcatgcaggaactggtgccctcacggagcagagtagtgc
ttccaagcaacagtttgtgtcaaattcttataagatccttggaat
gaattcatgagcagtgcagagacattttgtataaggagtttacttcatgc
agtacatgaaggagggacagagtctttaaaagcaagcctgggagtgaggg
agcagacggtggggaggacacccatagtgctcttgtttctaccctgtaaa
gatgcagctgggatgcctgtctagacaaccactggccacaccatcagact
gtcaatcaggcaagttatccaaggttagccacacccagagacctcctagt
aaaaactaggtgttcattaatgcactattgtcttttatatttcatttgac
tagtcaatttataaatctcttcttagattttaggcttcccagagatttga
acatatgtgagtggctctttccttccctctctttttctttttcctcctct
cttctttcgtccctccctcccatcctcctctctcttccttctttccctcc
ccacctctctactatcttacttccctcctacctattttcctttatcttat
ttcatgagtgtttctgttatagatgtacgaaagcacacatggctatcatc
tatttatctagccatccatccacccacccatccatccactcacccaccca
tccatccacccatccatccatccattgatatctatctatctatctatcta
tctatctatctatctatctatctatgtagtctgtctttgacctgttgtga
tgactttactctgcattttcccatgatcattttctcaggtttatctaacg
tgtgcgtgtgcgcgtgtgtgatatatttgtattggtttatgtgcatgtgt
gtgtcggtatctatccatgcatgtctatgtttgtggaggcctgagatcaa
tgcctagcatcttccactgtccttcttcacttacgtttgagtcagctccc
tcactgaacttgtagctcatcagtttcactagctggctggcagtgactca
gagatgcccctgctctgcgtc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_128415171_128416345
seq2: B6Ng01-095O18.b_47_1191

seq1  GAATTCTGTCTCTGCTGCACATCTAGCCCCCCAGAGATAGCCTCTTTATC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTCTCTGCTGCACATCTAGCCCCCCAGAGATAGCCTCTTTATC  50

seq1  TCCTGAAGGGATTTAAACCAACTATAGTTCTTATTTTATTCTGTGTCCAC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGAAGGGATTTAAACCAACTATAGTTCTTATTTTATTCTGTGTCCAC  100

seq1  TGTTAAGGATGCATGCAGAGAAAGTTTGCATGTTGCCAATTAAAATCCCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAAGGATGCATGCAGAGAAAGTTTGCATGTTGCCAATTAAAATCCCC  150

seq1  CTCCCCAGTGGAGGTCTATGATTCCAGCAGAGGCAAGCATTTAATACTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCCCAGTGGAGGTCTATGATTCCAGCAGAGGCAAGCATTTAATACTCA  200

seq1  TGGCTCCTTAGTCTACGTGCATTAACCCCATGAGGAAAGAGGCATACTAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTCCTTAGTCTACGTGCATTAACCCCATGAGGAAAGAGGCATACTAA  250

seq1  CACGTGAAGAGGCTGAATAAAATAAGAGCCAAGATACATGGGATGAGAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTGAAGAGGCTGAATAAAATAAGAGCCAAGATACATGGGATGAGAAT  300

seq1  CTCTGGGATAGTCAGAGACTGATGCTAAACAGGATTAATTCTTGTTCGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGATAGTCAGAGACTGATGCTAAACAGGATTAATTCTTGTTCGTA  350

seq1  CCTGTGCTTTACAAGTGCAAGCCAACCTTTTCAATAGAGCATTACAAACT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTGCTTTACAAGTGCAAGCCAACCTTTTCAATAGAGCATTACAAACT  400

seq1  TCTCATAGCTTCCAGCAGGCAGTTTTAATATTATTTTAGACATAGAGACA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCATAGCTTCCAGCAGGCAGTTTTAATATTATTTTAGACATAGAGACA  450

seq1  GAAACAAACAAACAAACAATAAATAAATAAATACAAAAGCAAGTTTTAAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAACAAACAAACAAACAATAAATAAATAAATACAAAAGCAAGTTTTAAA  500

seq1  AAAATATCACTTTAACATAGTCTGTATGTGTATATGTGTATGTGCCATTC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATCACTTTAACATAGTCTGTATGTGTATATGTGTATGTGCCATTC  550

seq1  TGTATCTGTGGAGGTCTGAAGGCAAACAATGGGAATCAGGTCTCTCCTTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATCTGTGGAGGTCTGAAGGCAAACAATGGGAATCAGGTCTCTCCTTC  600

seq1  TCCTATGTGGGTCCCAGAAACGGAACTCATGTCACCAAGCTTAACAACAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTATGTGGGTCCCAGAAACGGAACTCATGTCACCAAGCTTAACAACAA  650

seq1  GCACCTTCACCCACTGAGATGATCTAAAAGTGGAATTCTGTCTGTGTTAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCTTCACCCACTGAGATGATCTAAAAGTGGAATTCTGTCTGTGTTAC  700

seq1  GGAAAGAA-TTCTTTCCTGGCAGTAACCTTTAGAGACATGGATGCCAAAA  749
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAAGAATTTCTTTCCTGGCAGTAACCTTTAGAGACATGGATGCCAAAA  750

seq1  CTTCTGCCGGAAAATATAAACTGACATCACTGTTACAGAGAGCATGGAGG  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGCCGGAAAATATAAACTGACATCACTGTTACAGAGAGCATGGAGG  800

seq1  AATATCTGGGAATATCTGGGAATGTCTGGGATGAGGTCATTTTATGTCCG  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATCTGGGAATATCTGGGAATGTCTGGGATGAGGTCATTTTATGTCCG  850

seq1  TTTCCATTTCCTTTGGGAAAGCATACAAATCCAGAGAATGAAAGCAAGTT  899
      ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| |
seq2  TTTCCATTTCCTTTGGG-AAGCATAC-AATCCAGAGAATGAAAGCAAG-T  897

seq1  ATGTTAATTGTAAATACTCTTTTCTTTTAGAGTAGGGATCACAGCTAAAC  949
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
seq2  ATGTTAATTGTAAATACTCTTTTCTTTTAGAGTA-GGATCACAGCTAAAC  946

seq1  CAAAGAGCAAAGGAGAACTTCTAGGTTTCAAGAATTTTGTTAAAACTCTT  999
      ||||||||||||||| |||||||||||   |||  |||| ||||||||||
seq2  CAAAGAGCAAAGGAG-ACTTCTAGGTT--CAGA--TTTG-TAAAACTCTT  990

seq1  TGATGGCTAGAAGGGAGGTGCCTCCGGCCTCTTTTTCTAACAGGTTCTGT  1049
      |||| ||||||  ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  TGAT-GCTAGA--GGA-GTGCCTCCGG-CTCTTTTTCT-ACAGGTTCTGT  1034

seq1  AAATGTTGATCAATTAAGTGCTTCAGTCTTTCTGGCAGTGCAGGAACT-G  1098
       ||||| |||||  ||  ||  |||||| |||| ||| |||||||||| |
seq2  -AATGTGGATCA--TA--TGGCTCAGTC-TTCT-GCA-TGCAGGAACTGG  1076

seq1  TGCCC-CACGGGAAGCAGGAGTTAAGTGCTTTCCCAAGGCAAACAGTTTG  1147
      ||||| |||||  |||| ||||  |||||||  |||||   |||||||||
seq2  TGCCCTCACGG--AGCA-GAGT--AGTGCTT--CCAAG--CAACAGTTTG  1117

seq1  TAGTCAATATCTTAT-AGATTCTTGGAAT  1175
      | |||||  |||||| |||| ||||||||
seq2  T-GTCAAATTCTTATAAGATCCTTGGAAT  1145

seq1: chr1_128595986_128596963
seq2: B6Ng01-095O18.g_69_1039 (reverse)

seq1  GACGCAGAGGCAGGGGCATCTCTGGAGGTCACTGGCCAGCCAGCCTAGTG  50
      |||||||| |||||||||||||||   |||||| ||||||||| ||||||
seq2  GACGCAGA-GCAGGGGCATCTCTG--AGTCACT-GCCAGCCAG-CTAGTG  45

seq1  AAACTGATGAGCTACAAGTTCAGTGAGGGAGCCTGACTCAAAACGTAAGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||
seq2  AAACTGATGAGCTACAAGTTCAGTGAGGGAG-CTGACTC-AAACGTAAGT  93

seq1  GAAGAAGGACAGTGGAAGATGCTAGGCATTGATCTCAGGCCTCCACAAAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAAGGACAGTGGAAGATGCTAGGCATTGATCTCAGGCCTCCACAAAC  143

seq1  ATAGACATGCATGGATAGATACCGACACACACATGCACATAAACCAATAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGACATGCATGGATAGATACCGACACACACATGCACATAAACCAATAC  193

seq1  AAATATATCACACACGCGCACACGCACACGTTAGATAAACCTGAGAAAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATATATCACACACGCGCACACGCACACGTTAGATAAACCTGAGAAAAT  243

seq1  GATCATGGGAAAATGCAGAGTAAAGTCATCACAACAGGTCAAAGACAGAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCATGGGAAAATGCAGAGTAAAGTCATCACAACAGGTCAAAGACAGAC  293

seq1  TACATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATA  343

seq1  TCAATGGATGGATGGATGGGTGGATGGATGGGTGGGTGAGTGGATGGATG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATGGATGGATGGATGGGTGGATGGATGGGTGGGTGAGTGGATGGATG  393

seq1  GGTGGGTGGATGGATGGCTAGATAAATAGATGATAGCCATGTGTGCTTTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGGGTGGATGGATGGCTAGATAAATAGATGATAGCCATGTGTGCTTTC  443

seq1  GTACATCTATAACAGAAACACTCATGAAATAAGATAAAGGAAAATAGGTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACATCTATAACAGAAACACTCATGAAATAAGATAAAGGAAAATAGGTA  493

seq1  GGAGGGAAGTAAGATAGTAGAGAGGTGGGGAGGGAAAGAAGGAAGAGAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGGAAGTAAGATAGTAGAGAGGTGGGGAGGGAAAGAAGGAAGAGAGA  543

seq1  GGAGGATGGGAGGGAGGGACGAAAGAAGAGAGGAGGAAAAAGAAAAAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGGATGGGAGGGAGGGACGAAAGAAGAGAGGAGGAAAAAGAAAAAGAG  593

seq1  AGGGAAGGAAAGAGCCACTCACATATGTTCAAATCTCTGGGAAGCCTAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGAAGGAAAGAGCCACTCACATATGTTCAAATCTCTGGGAAGCCTAAA  643

seq1  ATCTAAGAAGAGATTTATAAATTGACTAGTCAAATGAAATATAAAAGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAGAAGAGATTTATAAATTGACTAGTCAAATGAAATATAAAAGACA  693

seq1  ATAGTGCATTAATGAACACCTAGTTTTTACTAGGAGGTCTCTGGGTGTGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTGCATTAATGAACACCTAGTTTTTACTAGGAGGTCTCTGGGTGTGG  743

seq1  CTAACCTTGGATAACTTGCCTGATTGACAGTCTGATGGTGTGGCCAGTGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAACCTTGGATAACTTGCCTGATTGACAGTCTGATGGTGTGGCCAGTGG  793

seq1  TTGTCTAGACAGGCATCCCAGCTGCATCTTTACAGGGTAGAAACAAGAGC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTAGACAGGCATCCCAGCTGCATCTTTACAGGGTAGAAACAAGAGC  843

seq1  ACTATGGGTGTCCTCCCCACCGTCTGCTCCCTCACTCCCAGGCTTGCTTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATGGGTGTCCTCCCCACCGTCTGCTCCCTCACTCCCAGGCTTGCTTT  893

seq1  TAAAGACTCTGTCCCTCCTTCATGTACTGCATGAAGTAAACTCCTTATAC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGACTCTGTCCCTCCTTCATGTACTGCATGAAGTAAACTCCTTATAC  943

seq1  AAAATGTCTCTGCACTGCTCATGAATTC  978
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGTCTCTGCACTGCTCATGAATTC  971