BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-118J13
Chromosome1 (Build37)
Map Location 73,189,948 - 73,325,250
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMreg, Pecr, Tmem169, Xrcc5, March4, Smarcal1, Ankar, Rpl37a, Igfbp2, Igfbp5, LOC672187, LOC100042860, Tnp1, 1700027A15Rik
Downstream genePinc, LOC672208, LOC100043291, Tns1, Rufy4, Il8rb, Il8ra, Arpc2, Gpbar1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-118J13.bB6Ng01-118J13.g
ACCDH923031DH923032
length1,1091,069
definitionDH923031|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118J13, 5' end.DH923032|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-118J13, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(73,324,127 - 73,325,250)(73,189,948 - 73,191,015)
sequence
gaattccaaagaggggctagctttactttgtaaatcaaggcgcagcttga
gcacggactgctctcttcacacctctgcctcatcctgctaataagagtgt
catggaggacaccaaaccctttgtatacttcagccatttaaattcctctc
ccaggtgaaacccagatgagtgcacagagtatcaataactggtcagatgg
ctcagcaggtaaaaccaatcgcctgacaacctgggtttgatccctgaaac
ctagagtagcaaaagatgagaaccaactccctgaaattgccctctcactt
tcatgatcatgctgtagaattcgggtacccttcacacacacactgtacat
gcacaccaccacgtatttaccccacacatacacaccacacatatatcaga
catcacacatatatacacatacacacacaaaactcatacatcaggtgtca
cacatatatacacacaaaacacatatgcactcacacatcagatgtcacac
atatatacacacaaaaaacacacatgcactcacacatcacacccacacat
acacactacacaccttacacacactacacatacacacacattcacatgca
caccacatatttacctcacacatacacacacacacacacacacacacaca
cacacacatgcatacctgtcaacatgtagctttgactactgtggatagtg
tttacttccattcccatgattctcctctctgcttccacaaccttcctcct
gcttccactaactcaattccactgcatgaattacgtaagaaactcctgat
ccatgcaaataacttggtaatataattttggacaattaacagagtccagg
ttttccaaaattcatgttgtggagtatcactaaaaaacaaaactgtctca
gtgaagcaactgctgagttttaattactctcaaaagaagaaagaactaag
tgacatatttcagtagtcacagtgttgaagaagtgggtaactatatctga
tgtcagactaaatgtagcttagattttcatagatagcaaaaaataatgaa
atcaagtttgatatgagagtgcagctccctctctggctagctgaatgact
gtcttgact
gaattctttctgtgtatttgagtctcatcccctccattgcatcttccctt
agctactccacagggcgcttgctgtgcttccatttctctaaaatggtgtg
gtcaaggtacccaaaggagcgtagccagtacaattccatttaaaaaaaaa
ttttttttttttttgtaaattttcattcatcatgggcctggtactcttga
tgcataagaatcccatgcagccaaagagttacaatccagaaagagagaat
gcgatggttaattaattaatgccccatagaaattacggatgtgcctttaa
gatggccccttaaagtactaactgaccctctctgtctgagagaatgtttg
tatatttgcatgctacacactaggtcttaaggaaaggagagtggctagtt
tggaagactacgtagtgtcgtgaacagcatggaccaaggcctatagcata
ttcataaatgagattgctggatggtaggagatgaccctgggaagctaagt
tgaggtcagactatgtagaaccataccaaagagttgaggaagagatgata
ttaaataatggatgcaaaagaactgcataatatggatcacgcaggggaca
tactcaagttatagcaaccattatggcaccattattgtctttatttaaca
catcttttaaggagtatacaggatctcatggtatctctcactagcctgga
gtctatgtagacttggatgagcaagactagaatccccttcctgagaatgg
gattaaggcatgtgcccctatagccagtgctggggattgaacccagggct
tcatgcttcctaggcaagcactctactgagctacatcctcagctttagaa
ctgttttggagtcttctttagcttatgtgtgttgaagcacacttctttcc
tgggaagaaaaagcaaagctatttggcatactactttcaagaaatgccac
agcttccccatacacaagaatgagagaattcttttggctcttctagcaag
gccatgtgggcgatcctgcaaagaacaagatccaatgtggacttgagtga
cagctctcatggcaggctc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_73324127_73325250
seq2: B6Ng01-118J13.b_43_1151 (reverse)

seq1  AGTCAAAGACAGTCATACCAAGCCTAGGCAGAGAAGGGAGCTTGCAACTC  50
      |||| ||||||||||| |  || |||| ||||| ||||||| ||| ||||
seq2  AGTC-AAGACAGTCATTC--AG-CTAGCCAGAG-AGGGAGC-TGC-ACTC  43

seq1  TTCATTATCAAAACCTTTGATTTCATTATTTTTTGCTATCTATGAAAATC  100
       ||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  -TCA-TATCAAA---CTTGATTTCATTATTTTTTGCTATCTATGAAAATC  88

seq1  TAAGCTACATTTTAGTCCTGACATCAAGATAATAGTTACCCACTTC-TCA  149
      ||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||||||||||||| |||
seq2  TAAGCTACA-TTTAGT-CTGACATC-AGAT-ATAGTTACCCACTTCTTCA  134

seq1  ACACTGTGACTACTGAAAATATGTCACTTAGTTCTTTCTTCTTTTGAGAG  199
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACTGTGACTACTG-AAATATGTCACTTAGTTCTTTCTTCTTTTGAGAG  183

seq1  TAATTAAAACTCAGCAGTTGCTTCACTGAGACAGTTTTG-TTTTTAGTGA  248
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TAATTAAAACTCAGCAGTTGCTTCACTGAGACAGTTTTGTTTTTTAGTGA  233

seq1  TACTCCACAACATGAATTTTGGAAAACCTGGACTCTGTTAATTGTCCAAA  298
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCCACAACATGAATTTTGGAAAACCTGGACTCTGTTAATTGTCCAAA  283

seq1  ATTATATTACCAAGTTATTTGCATGGATCAGGAGTTTCTTACGTAATTCA  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATTACCAAGTTATTTGCATGGATCAGGAGTTTCTTACGTAATTCA  333

seq1  TGCAGTGGAATTGAGTTAGTGGAAGCAGGAGGAAGGTTGTGGAAGCAGAG  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAGTGGAATTGAGTTAGTGGAAGCAGGAGGAAGGTTGTGGAAGCAGAG  383

seq1  AGGAGAATCATGGGAATGGAAGTAAACACTATCCACAGTAGTCAAAGCTA  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAATCATGGGAATGGAAGTAAACACTATCCACAGTAGTCAAAGCTA  433

seq1  CATGTTGACAGGTATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTTGACAGGTATGCATGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG  483

seq1  TGTATGTGTGAGGTAAATATGTGGTGTGCATGTGAATGTGTGTGTATGTG  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTATGTGTGAGGTAAATATGTGGTGTGCATGTGAATGTGTGTGTATGTG  533

seq1  TAGTGTGTGTAAGGTGTGTAGTGTGTATGTGTGGGTGTGATGTGTGAGTG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGTGTGTAAGGTGTGTAGTGTGTATGTGTGGGTGTGATGTGTGAGTG  583

seq1  CATGTGTGTTTTTTGTGTGTATATATGTGTGACATCTGATGTGTGAGTGC  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTGTGTTTTTTGTGTGTATATATGTGTGACATCTGATGTGTGAGTGC  633

seq1  ATATGTGTTTTGTGTGTATATATGTGTGACACCTGATGTATGAGTTTTGT  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGTGTTTTGTGTGTATATATGTGTGACACCTGATGTATGAGTTTTGT  683

seq1  GTGTGTATGTGTATATATGTGTGATGTCTGATATATGTGTGGTGTGTATG  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTATGTGTATATATGTGTGATGTCTGATATATGTGTGGTGTGTATG  733

seq1  TGTGGGGTAAATACGTGGTGGTGTGCATGTACAGTGTGTGTGTGAAGGGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGGTAAATACGTGGTGGTGTGCATGTACAGTGTGTGTGTGAAGGGT  783

seq1  ACCCGAATTCTACAGCATGATCATGAAAGTGAGAGGGCAATTTCAGGGAG  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCGAATTCTACAGCATGATCATGAAAGTGAGAGGGCAATTTCAGGGAG  833

seq1  TTGGTTCTCATCTTTTGCTACTCTAGGTTTCAGGGATCAAACCCAGGTTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTTCTCATCTTTTGCTACTCTAGGTTTCAGGGATCAAACCCAGGTTG  883

seq1  TCAGGCGATTGGTTTTACCTGCTGAGCCATCTGACCAGTTATTGATACTC  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCGATTGGTTTTACCTGCTGAGCCATCTGACCAGTTATTGATACTC  933

seq1  TGTGCACTCATCTGGGTTTCACCTGGGAGAGGAATTTAAATGGCTGAAGT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCACTCATCTGGGTTTCACCTGGGAGAGGAATTTAAATGGCTGAAGT  983

seq1  ATACAAAGGGTTTGGTGTCCTCCATGACACTCTTATTAGCAGGATGAGGC  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACAAAGGGTTTGGTGTCCTCCATGACACTCTTATTAGCAGGATGAGGC  1033

seq1  AGAGGTGTGAAGAGAGCAGTCCGTGCTCAAGCTGCGCCTTGATTTACAAA  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGTGTGAAGAGAGCAGTCCGTGCTCAAGCTGCGCCTTGATTTACAAA  1083

seq1  GTAAAGCTAGCCCCTCTTTGGAATTC  1124
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAGCTAGCCCCTCTTTGGAATTC  1109

seq1: chr1_73189948_73191015
seq2: B6Ng01-118J13.g_70_1138

seq1  GAATTCTTTCTGTGTATTTGAGTCTCATCCCCTCCATTGCATCTTCCCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCTGTGTATTTGAGTCTCATCCCCTCCATTGCATCTTCCCTT  50

seq1  AGCTACTCCACAGGGCGCTTGCTGTGCTTCCATTTCTCTAAAATGGTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTACTCCACAGGGCGCTTGCTGTGCTTCCATTTCTCTAAAATGGTGTG  100

seq1  GTCAAGGTACCCAAAGGAGCGTAGCCAGTACAATTCCATTTAAAAAAAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAAGGTACCCAAAGGAGCGTAGCCAGTACAATTCCATTTAAAAAAAAA  150

seq1  TTTTTTTTTTTTTTGTAAATTTTCATTCATCATGGGCCTGGTACTCTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTTTTGTAAATTTTCATTCATCATGGGCCTGGTACTCTTGA  200

seq1  TGCATAAGAATCCCATGCAGCCAAAGAGTTACAATCCAGAAAGAGAGAAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATAAGAATCCCATGCAGCCAAAGAGTTACAATCCAGAAAGAGAGAAT  250

seq1  GCGATGGTTAATTAATTAATGCCCCATAGAAATTACGGATGTGCCTTTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGATGGTTAATTAATTAATGCCCCATAGAAATTACGGATGTGCCTTTAA  300

seq1  GATGGCCCCTTAAAGTACTAACTGACCCTCTCTGTCTGAGAGAATGTTTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGCCCCTTAAAGTACTAACTGACCCTCTCTGTCTGAGAGAATGTTTG  350

seq1  TATATTTGCATGCTACACACTAGGTCTTAAGGAAAGGAGAGTGGCTAGTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATTTGCATGCTACACACTAGGTCTTAAGGAAAGGAGAGTGGCTAGTT  400

seq1  TGGAAGACTACGTAGTGTCGTGAACAGCATGGACCAAGGCCTATAGCATA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAAGACTACGTAGTGTCGTGAACAGCATGGACCAAGGCCTATAGCATA  450

seq1  TTCATAAATGAGATTGCTGGATGGTAGGAGATGACCCTGGGAAGCTAAGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATAAATGAGATTGCTGGATGGTAGGAGATGACCCTGGGAAGCTAAGT  500

seq1  TGAGGTCAGACTATGTAGAACCATACCAAAGAGTTGAGGAAGAGATGATA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGTCAGACTATGTAGAACCATACCAAAGAGTTGAGGAAGAGATGATA  550

seq1  TTAAATAATGGATGCAAAAGAACTGCATAATATGGATCACGCAGGGGACA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATAATGGATGCAAAAGAACTGCATAATATGGATCACGCAGGGGACA  600

seq1  TACTCAAGTTATAGCAACCATTATGGCACCATTATTGTCTTTATTTAACA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTCAAGTTATAGCAACCATTATGGCACCATTATTGTCTTTATTTAACA  650

seq1  CATCTTTTAAGGAGTATACAGGATCTCATGGTATCTCTCACTAGCCTGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTTTTAAGGAGTATACAGGATCTCATGGTATCTCTCACTAGCCTGGA  700

seq1  GTCTATGTAGACTTGGATGAGCAAGACTAGAATCCCCTTCCTGAGAATGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTATGTAGACTTGGATGAGCAAGACTAGAATCCCCTTCCTGAGAATGG  750

seq1  GATTAAGGCATGTGCCCCTATAGCCAGTGCTGGGGATTGAACCCAGGGCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTAAGGCATGTGCCCCTATAGCCAGTGCTGGGGATTGAACCCAGGGCT  800

seq1  TCATGCTTCCTAGGCAAGCACTCTACTGAGCTACATCCTCAGCTTTAGAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCATGCTTCCTAGGCAAGCACTCTACTGAGCTACATCCTCAGCTTTAGAA  850

seq1  CTGTTTTGAAGTCTTCTTTAGCTCATGTGTGTTGAAGCACAC-TCTTCCC  899
      |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||
seq2  CTGTTTTGGAGTCTTCTTTAGCTTATGTGTGTTGAAGCACACTTCTTTCC  900

seq1  T-GGAAGAAAAAGCAAAGCTATTTGCCATACTAC-TTCAAGAAATGCCAC  947
      | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||
seq2  TGGGAAGAAAAAGCAAAGCTATTTGGCATACTACTTTCAAGAAATGCCAC  950

seq1  AGCCTTCCCCATACACAAGAATGAGAGAAGTCCTTTTGGCTCTTTCTAGC  997
      || |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||||
seq2  AG-CTTCCCCATACACAAGAATGAGAGAA-TTCTTTTGGCTC-TTCTAGC  997

seq1  ACAGGGCATGT-GGCGATCCTGCAGAGAACAAGAGTCACATGTGGACTTG  1046
      | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||
seq2  A-AGGCCATGTGGGCGATCCTGCAAAGAACAAGA-TCCAATGTGGACTTG  1045

seq1  AGTGACAGCTC-CAT-GCAGGCTC  1068
      ||||||||||| ||| ||||||||
seq2  AGTGACAGCTCTCATGGCAGGCTC  1069