BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-128P19
Chromosome1 (Build37)
Map Location 170,796,522 - 170,920,577
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039879, Pbx1
Downstream geneEG383613, Nuf2, Rgs5, Rgs4, LOC100039960, 1700084C01Rik, Hsd17b7, Ddr2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-128P19.bB6Ng01-128P19.g
ACCDH930692DH930693
length4611,099
definitionDH930692|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128P19, 5' end.DH930693|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-128P19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(170,796,522 - 170,796,988)(170,919,474 - 170,920,577)
sequence
agatgttctaagcactggccagctagaatgttaggtattgatttaacaaa
acaaaaaacaaagcaaaaaaagcttcaagctaagggtggccccatgccca
tcagtggattgcccatataaaatcaactcaatgatatctttggacatttt
ttgcctcataatatttgtcagggtatttaaaattattattaaccttaaag
atccactgtatctatattctggcttctggttttgtggttttatgtgatgc
ctgtgtgtgtgtgaatgtgtgtgtcttttgtctttgtgtctttatgtctt
tcttgtgccttttcttgggttcatttccttatgtttatttcttttgttct
tttctcatgttttgttataccttatcttattttattattctttagatttc
tatttgttttccaatgagagatagacacagtgtggattaggatggaatgg
gaggtggtgat
gaattctctctgaaaaacacactttgctcttatctttatcttctaacatt
taccgtatatctctctatcctcccttccatatccatcactacattccttt
acttattcaacaaatacttattaagcccatagtacatgctgagcacattc
catgcctcggtaagacccagagcaggagcaaagttacctatgccttggag
agcttatactgtcctgaaggaggaagatgtagtatgccaaatagaagtaa
atcccagagcaagatgaagtaaaaaggcaggtgaatacaaggttctggaa
ggacttcctgttcataggctatttaattcataggtacggattactctgaa
ggagagagtcccgggaatgtttatggaggctggtctggctacagcatacc
atgagaagaacaatgggcatgtgcttggggaagtgagaaaggagctgtga
tggggatgcatatcccactgtacacatgatagctttaaaaggagaagctg
catgacccagggaatacaattaaagatgtttggctctaaagtcgagaaca
cactgcaggacaccaaaacagagggccaacttggaggttattagagtaac
ccagggaagacaacaacagaacctcaaaggtcacagtgggaaagaactaa
tctacagacacttccatatgcgcgcatatatttaagatttagattctttt
tttccattttttattaggtatttagctcatttacatttccaatgctatac
caaaagtcccccatatccacccacccccactcccctgcccacccactccc
cctttttggccctggtgttcccctgtactggggcatataaagtttgcaag
tccaatgggcctctctttcagtgatggccgactaggccatctttttgata
taatatgcagctagagtcagagcttcgggtactggttagttcataatgtg
ttccacctatagggttgcagatcctttagctccttggtacttctctagct
cttcattggggagccctatgatcaatccatagctgactgttgagcatcca
ctttccgtgttttgctagtccggcatagtctcacaagagacagctatat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_170796522_170796988
seq2: B6Ng01-128P19.b_48_514

seq1  GAATTCAGATGTTCTAAGCACTGGCCAGCTAGAATGTTAGGTATTGATTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGATGTTCTAAGCACTGGCCAGCTAGAATGTTAGGTATTGATTT  50

seq1  AACAAAACAAAAAACAAAGCAAAAAAAGCTTCAAGCTAAGGGTGGCCCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAACAAAAAACAAAGCAAAAAAAGCTTCAAGCTAAGGGTGGCCCCA  100

seq1  TGCCCATCAGTGGATTGCCCATATAAAATCAACTCAATGATATCTTTGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCCATCAGTGGATTGCCCATATAAAATCAACTCAATGATATCTTTGGA  150

seq1  CATTTTTTGCCTCATAATATTTGTCAGGGTATTTAAAATTATTATTAACC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTTTTGCCTCATAATATTTGTCAGGGTATTTAAAATTATTATTAACC  200

seq1  TTAAAGATCCACTGTATCTATATTCTGGCTTCTGGTTTTGTGGTTTTATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAGATCCACTGTATCTATATTCTGGCTTCTGGTTTTGTGGTTTTATG  250

seq1  TGATGCCTGTGTGTGTGTGAATGTGTGTGTCTTTTGTCTTTGTGTCTTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCCTGTGTGTGTGTGAATGTGTGTGTCTTTTGTCTTTGTGTCTTTA  300

seq1  TGTCTTTCTTGTGCCTTTTCTTGGGTTCATTTCCTTATGTTTATTTCTTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCTTTCTTGTGCCTTTTCTTGGGTTCATTTCCTTATGTTTATTTCTTT  350

seq1  TGTTCTTTTCTCATGTTTTGTTATACCTTATCTTATTTTATTATTCTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCTTTTCTCATGTTTTGTTATACCTTATCTTATTTTATTATTCTTTA  400

seq1  GATTTCTATTTGTTTTCCAATGAGAGATAGACACAGTGTGGATTAGGATG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTCTATTTGTTTTCCAATGAGAGATAGACACAGTGTGGATTAGGATG  450

seq1  GAATGGGAGGTGGTGAT  467
      |||||||||||||||||
seq2  GAATGGGAGGTGGTGAT  467

seq1: chr1_170919474_170920577
seq2: B6Ng01-128P19.g_68_1166 (reverse)

seq1  ATATAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCCGGGGCCTAGC-AAACACAG-AA  48
      ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||| | ||
seq2  ATATAGCTGTCTCTTGTGAGACTATGCC--GGACTAGCAAAACACGGAAA  48

seq1  GTGGATGCTC-ACAGTCAGCTAATGGATGGATCATAGGGCTCCCAATGGA  97
      |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||| |  ||
seq2  GTGGATGCTCAACAGTCAGCT-ATGGATTGATCATAGGGCTCCCCAATGA  97

seq1  GGAGCTAGAGAAAGTACCCAAGGAGCTAAAGGGATCTGCAACCCTATAGG  147
       ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||
seq2  AGAGCTAGAG-AAGTA-CCAAGGAGCTAAA-GGATCTGCAACCCTATAGG  144

seq1  TGGAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTCTTGACTCTAGCT  197
      |||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||
seq2  TGGAAC-ACATTATGAACTAACCAGTA-CCCGAAGCTC-TGACTCTAGCT  191

seq1  GCATA-TATATC-AAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACTGGAAAGAGAGG  245
      ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GCATATTATATCAAAAAGATGGCCTAGTCGGCCATCACT-GAAAGAGAGG  240

seq1  CCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACACCAGGG  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATTGGACTTGCAAACTTTATATGCCCCAGTACAGGGGAACACCAGGG  290

seq1  CCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGATATGGG  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAAAGGGGGAGTGGGTGGGCAGGGGAGTGGGGGTGGGTGGATATGGG  340

seq1  GGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTTTTGGTATAGCATTGGAAATGTAAATGAGCTAAATACCTAATAAA  390

seq1  AAATGGAAAAAAAGAATCTAAATCTTAAATATATGCGCGCATATGGAAGT  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGAAAAAAAGAATCTAAATCTTAAATATATGCGCGCATATGGAAGT  440

seq1  GTCTGTAGATTAGTTCTTTCCCACTGTGACCTTTGAGGTTCTGTTGTTGT  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGTAGATTAGTTCTTTCCCACTGTGACCTTTGAGGTTCTGTTGTTGT  490

seq1  CTTCCCTGGGTTACTCTAATAACCTCCAAGTTGGCCCTCTGTTTTGGTGT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCTGGGTTACTCTAATAACCTCCAAGTTGGCCCTCTGTTTTGGTGT  540

seq1  CCTGCAGTGTGTTCTCGACTTTAGAGCCAAACATCTTTAATTGTATTCCC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGCAGTGTGTTCTCGACTTTAGAGCCAAACATCTTTAATTGTATTCCC  590

seq1  TGGGTCATGCAGCTTCTCCTTTTAAAGCTATCATGTGTACAGTGGGATAT  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTCATGCAGCTTCTCCTTTTAAAGCTATCATGTGTACAGTGGGATAT  640

seq1  GCATCCCCATCACAGCTCCTTTCTCACTTCCCCAAGCACATGCCCATTGT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATCCCCATCACAGCTCCTTTCTCACTTCCCCAAGCACATGCCCATTGT  690

seq1  TCTTCTCATGGTATGCTGTAGCCAGACCAGCCTCCATAAACATTCCCGGG  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTCATGGTATGCTGTAGCCAGACCAGCCTCCATAAACATTCCCGGG  740

seq1  ACTCTCTCCTTCAGAGTAATCCGTACCTATGAATTAAATAGCCTATGAAC  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCTCTCCTTCAGAGTAATCCGTACCTATGAATTAAATAGCCTATGAAC  790

seq1  AGGAAGTCCTTCCAGAACCTTGTATTCACCTGCCTTTTTACTTCATCTTG  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAAGTCCTTCCAGAACCTTGTATTCACCTGCCTTTTTACTTCATCTTG  840

seq1  CTCTGGGATTTACTTCTATTTGGCATACTACATCTTCCTCCTTCAGGACA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGGGATTTACTTCTATTTGGCATACTACATCTTCCTCCTTCAGGACA  890

seq1  GTATAAGCTCTCCAAGGCATAGGTAACTTTGCTCCTGCTCTGGGTCTTAC  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATAAGCTCTCCAAGGCATAGGTAACTTTGCTCCTGCTCTGGGTCTTAC  940

seq1  CGAGGCATGGAATGTGCTCAGCATGTACTATGGGCTTAATAAGTATTTGT  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGGCATGGAATGTGCTCAGCATGTACTATGGGCTTAATAAGTATTTGT  990

seq1  TGAATAAGTAAAGGAATGTAGTGATGGATATGGAAGGGAGGATAGAGAGA  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATAAGTAAAGGAATGTAGTGATGGATATGGAAGGGAGGATAGAGAGA  1040

seq1  TATACGGTAAATGTTAGAAGATAAAGATAAGAGCAAAGTGTGTTTTTCAG  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACGGTAAATGTTAGAAGATAAAGATAAGAGCAAAGTGTGTTTTTCAG  1090

seq1  AGAGAATTC  1104
      |||||||||
seq2  AGAGAATTC  1099