BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | B6Ng01-142H02.b | B6Ng01-142H02.g |
ACC | DH940640 | DH940641 |
length | 1,206 | 1,079 |
definition | DH940640|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142H02, 5' end. | DH940641|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-142H02, 3' end. |
singlet/doublet | doublet | doublet |
---|
BLAST hit | unique | unique |
---|
Map location. | (95,698,505 - 95,699,718) | (95,874,654 - 95,875,762) |
---|
sequence | gaattctgtggcctgcggggaacagcttccggacgtgacgtaatctaggc
ccgggagtctgcagtttagcgagcgccaactcgcggaacttccgttcgcc
gctcccgaagagcaccaatcttaaggactgtggttgcgcaggctctggtc
acgtggaagttcgagacctgtaacggaatcaaatttttatgcccctaagc
gcgctactgaagggttctaaaagtttcttatcacacacacacctgcgcgc
gtacaggagccatgtgatgatcaggctctgaaaggagttaaggataggaa
catcgacccccaagatgtactttctgcagcattttcgaaccgctcaggaa
ttttccttgtcgttttagtgtaagttggtggaaggaaatgggtttatttg
cagcgtgggcagaattgaaaccaccccccccccttttaaattcctttccc
cctagcagtgtttttacagacaaaataaagtcagggaaaatacatgagca
ggaggcgggcaaatctctgtgagtctgaggccacttacatagtttcaggc
cagccagggatacattgtgagacccaggctcaaaaacccaaacaacagta
ctctagaggaagagaaaaaaggatccgcagtcaaaggctgggctgggtta
tgttttgcctaatgaacaaagattccatacccagcacagaataaattgga
tatagtgagtgacatagcctataaacccaacatttgggaggtagatcaag
gtttatgcaaacatttgaactaacacccaaagaagtgacacagatgccag
acacatatgtaaaaatgtgcaacacaaacatattgttaggaatcatgaat
ttaagataatttcacctcttcgagaatagcccaaatctacaattctaacc
cttcatcatgctggtggaggacgtgagcgaaaggagactgtcagttgcag
aggagaatgcaaaaacggtgtgagatagcttggctgtttctcaagaagca
ctcttacttttacatgaagtcatatttaccaaatgggttggaaactatgt
ctgcaccacaaatgattgtatcagcctctagccacatttggcttaatatg
gaagcagctagatgttcctccaacaccgcaactgtataactgtatacaca
gtgaaatatttggaagttaacgtgaatatcggtacttatcagtactggag
gaacct
| gaattcctgcataaaggaaatgaagataggtggtttcctgggcctcactt
accttttagcttagtctaatcaaagattaccaggacaataaaaagccctc
tctcaaacaaagggggacaatgcccaaggttgatctctgatttttacaag
catgcatataaatgtgtacctacacctccacaataattaaaataaataaa
tacaataaagggacacaataggaatcattaactgtgaagagaccatcaaa
cctacagccctagtcctgtggtgtctatgtgggtgtttccagaattattt
aactaaagtagaaaaacttaccttaaaagtagacatcaacaggccccagc
ttgactaaaatggcctgagccataactgatctctttctgcctcctgacac
aggtaaccagctccctccctctgttgcaaacatactgtcccagccttgga
gtgagtcaaagcaaacctttcttccttctagctacttctgccagcatttt
atcacatcagtaagagacggggctcagggaaggggattcaagggtcctgg
aggtgagctggcgggtgcaactccacaccaagttggccttagctaacctt
cctcattttccaatttctgaaagtcaggtacaaggagagcatcactgcct
gagaaaagtgccccctggtggctcctctgtgaactccacgtgtccctgaa
gctcttagagccagaaccattacaataggttcagcagcctcagactgaag
ctagaacacccccggggcaggctttgcacccctttggaatctggctcacc
acttccaggcccagtacagtccctcgaaaggagccatatctctgaatcgc
agccaccagcatttgttgcacatttcccacgatgtggcagctgccctttg
ctcccagtccagtgcatgatgaagtccagctcctgcaagtactgctcagc
tctcagcacacatgctgctggcaaacagattcctacaaggcgactgatta
catcactctgtaactctacggtatgaactcctgctgagactccttgtagg
tagactccagaaggatgcttccacggagc
|
quality values | Open.Hide.61 43 23 23 50 43 30 29 35 49 35 23 37 38 49 34 32 35 41 49 41 52 37 38 36 43 43 33 27 22 22 23 37 38 27 35 41 38 43 38 45 19 33 29 29 39 24 23 52 34
43 43 36 49 36 27 26 35 36 38 38 43 28 28 43 35 26 26 30 33 27 37 36 32 45 43 49 43 36 37 39 39 27 19 23 23 36 23 28 34 44 33 36 38 34 39 39 27 32 39
34 39 43 37 36 36 28 43 31 24 59 43 43 43 38 38 32 31 41 43 43 39 29 36 28 52 43 38 39 52 32 38 39 31 39 45 39 24 43 43 23 59 31 44 59 45 59 52 28 43
24 36 27 31 43 26 30 33 23 44 36 44 27 52 31 43 38 39 45 44 37 31 43 36 36 43 49 39 45 38 36 39 43 59 59 49 50 39 28 38 36 36 36 35 36 39 23 27 18 27
22 36 28 39 39 28 38 36 39 36 27 19 45 43 28 38 27 31 19 19 19 23 19 36 37 36 36 36 36 39 39 39 28 38 22 29 23 30 31 36 18 29 27 30 37 27 19 43 34 43
39 36 28 39 25 29 44 45 32 39 37 32 39 49 30 37 37 36 41 45 43 39 27 27 52 36 41 43 43 36 37 36 36 32 43 49 43 43 38 43 37 27 52 49 43 45 35 43 52 49
52 49 52 52 38 49 52 52 52 52 52 43 36 36 59 49 59 49 37 52 59 59 59 52 49 52 49 36 27 36 43 52 52 55 55 61 43 61 55 55 55 52 41 52 49 41 28 52 52 43
49 52 52 52 52 52 52 52 55 43 52 52 41 52 52 52 41 32 52 55 52 52 41 37 43 41 52 49 49 55 50 50 50 41 55 49 49 49 41 50 49 50 49 50 41 49 50 50 49 43
37 25 26 37 37 23 50 43 43 43 37 36 50 37 35 50 49 49 49 49 50 47 45 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 50 47 43 50 43 37 27 38 43 43 43 43 43 43 43
43 43 36 43 24 31 29 17 31 50 29 32 39 39 43 32 42 28 30 50 50 39 50 50 50 50 50 43 50 39 50 50 43 46 61 42 50 45 42 30 35 27 35 31 39 42 47 27 38 45
31 47 47 27 47 38 45 53 52 45 38 47 47 52 50 52 40 45 45 38 42 52 45 45 45 50 50 53 42 47 39 38 38 47 50 50 42 50 32 50 45 36 43 52 45 53 30 39 47 21
39 36 30 43 47 38 38 50 53 35 52 45 50 45 52 45 53 52 53 57 53 47 32 43 34 38 33 52 35 45 42 28 28 34 39 38 42 42 36 26 32 38 45 29 33 45 34 42 42 45
47 45 50 50 42 34 52 38 50 53 53 45 53 39 50 45 45 47 45 53 38 53 38 38 45 45 32 42 36 28 27 50 20 42 45 33 43 20 53 53 52 47 50 42 52 41 34 33 40 40
52 52 32 50 40 37 50 24 47 50 31 37 34 53 27 46 38 21 37 38 37 38 32 53 41 34 23 52 31 36 44 40 25 41 29 40 28 32 31 57 48 42 37 42 42 29 39 45 29 45
35 27 39 37 40 37 52 53 40 40 37 37 36 24 48 40 34 45 53 40 41 37 30 53 29 24 44 20 8 38 35 29 32 47 48 48 48 44 40 14 30 21 40 37 41 36 30 20 32 30
46 13 45 44 32 35 44 31 26 39 32 39 22 30 44 44 29 30 33 30 28 22 36 39 35 39 47 44 30 39 30 29 37 7 12 29 32 29 29 24 29 29 29 33 28 31 14 44 28 20
43 20 21 29 17 29 25 29 38 29 25 47 46 47 28 29 29 28 29 29 12 26 29 28 29 33 46 30 26 14 19 15 30 26 39 14 18 26 19 15 21 22 23 38 27 28 29 27 36 15
41 12 21 32 23 41 22 19 27 29 39 7 7 7 19 29 23 29 34 35 18 6 13 13 39 28 28 26 16 23 46 17 24 29 29 26 29 28 26 26 19 16 15 41 23 23 28 21 28 41
38 13 39 16 20 30 28 23 28 41 31 35 32 14 14 23 14 10 17 20 22 20 18 13 16 6 9 25 14 7 51 13 16 5 6 5 24 14 21 29 28 33 23 12 16 7 17 27 19 6
32 10 12 27 6 18 10 4 6 15 22 32 38 38 26 13 19 5 12 19 19 8 6 5 17 11 20 23 25 35 8 19 19 16 27 31 15 51 31 26 21 18 25 8 15 31 26 4 6 10
14 14 20 8 13 12 20 25 44 44 21 9 7 22 29 33 14 22 23 26 14 23 11 7 7 44 26 15 11 10 6 35 30 8 29 23 18 5 11 12 13 7 36 12 25 20 12 5 6 8
18 22 25 18 6 6 5 5 5 5 30 29 10 19 31 16 7 27 5 7 13 20 17 17 12 7 11 11 15 17 20 23 21 6 9 9 19 32 20 9 6 25 5 4 11 5 16 10 6 3
8 7 10 11 16 16 13 12 12 16 3 16 5 5 4 5 10 6 4 9 16 8 10 7 9 8 9 7 3 4 3 7 4 8 5 16 11 15 18 14 5 3 1 4 9 4 5 5 12 3
3 3 7 11 24 4 3 3 4 13 9 6 6 15 3 3 6 6 17 6 1 3 6 6 6 4 8 3 2 5 5 4 11 6 13 7 10 8 4 3 5 6 1 2 2 3 6 1 4 12
14 3 3 5 18 5 | Open.Hide.55 47 43 47 50 49 43 43 52 31 25 43 28 27 25 22 28 37 52 59 33 59 52 49 30 59 49 39 59 59 49 59 59 39 59 52 49 39 36 49 37 45 39 39 39 39 28 32 37 37
41 39 35 36 39 39 37 38 39 45 52 43 24 12 23 23 23 25 23 30 27 19 23 27 27 45 39 39 31 34 28 24 19 20 40 45 39 41 39 28 27 39 27 36 38 28 36 29 37 30
45 39 39 49 39 27 33 30 23 27 31 39 52 35 31 41 38 34 23 30 36 52 34 39 36 29 29 27 59 36 39 49 36 45 32 36 32 34 30 30 27 36 36 39 36 22 30 18 29 23
33 23 43 45 39 23 39 33 39 19 35 24 33 49 35 29 23 18 22 22 24 22 37 18 36 37 36 33 30 18 39 39 37 44 39 30 43 43 33 43 39 41 27 23 22 22 30 24 43 43
49 52 49 29 49 30 31 23 27 27 35 32 37 30 23 28 19 31 35 35 22 52 59 59 59 43 33 43 39 27 28 31 52 59 39 37 36 41 30 52 29 45 38 39 27 36 31 27 22 33
31 39 49 45 52 28 28 31 39 36 41 36 23 33 43 43 37 50 36 49 45 31 52 43 36 36 45 52 52 43 43 32 32 30 43 35 36 43 43 36 20 22 35 33 35 37 37 41 36 37
38 38 34 35 23 33 23 28 27 35 18 49 43 43 49 36 36 43 36 31 36 36 41 36 43 36 31 32 24 27 28 17 52 41 28 49 37 28 37 37 28 37 52 28 41 41 37 28 18 31
43 37 43 37 32 24 22 23 15 24 27 49 35 24 32 49 43 32 22 29 32 25 34 34 34 34 34 37 37 37 31 38 31 25 31 31 43 43 39 37 50 43 49 43 43 37 37 31 19 27
23 14 37 19 23 31 28 35 29 27 38 45 35 43 43 36 35 35 35 43 43 35 43 31 33 35 29 22 23 29 27 23 32 24 29 31 38 24 29 29 23 23 19 38 50 39 27 28 22 33
24 24 45 39 33 31 35 31 33 42 20 18 16 19 27 22 34 42 42 32 45 40 45 42 45 38 47 30 34 28 17 24 28 28 36 24 31 24 32 38 29 30 19 22 24 20 29 28 42 50
50 53 30 27 34 28 38 28 20 10 20 24 34 19 47 24 47 38 27 45 35 38 24 38 38 33 25 36 20 26 25 18 33 28 28 43 24 38 36 14 22 34 52 38 24 42 33 36 38 27
39 21 27 21 27 45 35 39 34 32 33 18 19 26 31 23 32 30 14 24 27 37 32 22 15 26 20 29 30 20 22 34 34 37 24 25 14 34 28 27 24 28 34 34 12 27 24 42 30 42
38 31 31 38 24 37 50 27 23 16 14 22 22 38 25 20 38 30 34 34 28 35 29 33 33 36 28 46 28 33 35 18 33 33 37 37 31 42 29 37 25 37 40 31 40 34 34 31 34 38
40 37 22 34 35 34 28 27 24 29 27 32 24 24 32 40 40 24 21 27 16 10 29 31 31 32 40 32 30 25 19 24 31 34 33 30 27 29 23 23 24 37 28 29 33 29 32 29 32 23
16 28 32 48 35 34 31 12 44 12 30 32 15 11 25 13 13 27 21 31 30 34 35 24 29 29 24 13 31 18 17 29 29 28 29 20 15 14 29 28 25 20 11 29 19 27 26 24 24 17
24 27 16 10 13 29 29 25 29 44 29 28 29 18 29 29 34 20 15 20 20 14 29 36 29 25 24 18 27 30 28 30 35 33 8 30 20 30 28 20 29 20 17 34 20 29 23 13 19 22
26 26 26 19 19 14 13 10 16 16 22 23 20 9 9 28 25 21 20 15 20 25 13 17 21 8 15 36 10 21 15 28 10 14 7 5 26 19 30 28 21 16 6 8 9 27 19 27 12 29
18 23 12 27 23 17 19 22 16 22 19 31 43 28 28 14 26 21 10 10 29 15 31 41 27 27 29 29 7 30 12 35 22 31 34 19 14 19 25 9 19 23 22 26 24 22 18 23 22 21
22 23 28 38 23 15 9 6 11 14 16 28 9 25 12 11 28 28 14 15 26 24 19 21 27 38 26 8 16 12 20 13 14 30 34 12 5 5 11 31 9 9 5 21 15 22 11 14 8 13
17 26 9 8 12 13 8 7 9 12 16 9 6 9 24 9 15 20 18 15 26 13 20 35 4 7 7 8 3 5 16 14 18 31 17 12 9 17 11 9 5 8 17 18 17 20 20 12 29 14
21 7 6 14 11 20 13 11 13 26 5 15 17 4 9 20 6 7 9 28 29 5 10 11 13 12 11 7 7 6 7 12 24 15 24 11 12 3 9 7 9 10 25 9 14 24 11 15 18 11
11 25 11 18 10 5 9 16 4 4 7 9 5 7 13 8 10 5 3 4 9 15 5 4 6 4 5 4 12 |