BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-146J15
Chromosome1 (Build37)
Map Location 68,963,526 - 69,008,111
singlet/doubletdoublet
Overlap geneErbb4
Upstream genenone
Downstream geneLOC667842, EG241084, Ikzf2, Spag16
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-146J15.bB6Ng01-146J15.g
ACCDH943702DH943703
length1,1421,080
definitionDH943702|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146J15, 5' end.DH943703|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-146J15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(68,963,526 - 68,964,678)(69,007,023 - 69,008,111)
sequence
gaattccatctctgggcaatatggtccagagaacactaactcataatgtc
tgccatcctccctttaagtaccagcagaatttgtatctgtcacaaagtgc
ttatcggtttaggaggaaccatgtataactaatagaaaagaagataattt
ttaatcaaaagcaagcttatagatggtcaagaaataaatgcaaattatat
gatttatctttccttagaaatagatatttaatataaactctgacctaata
atgaggtcagagttaatatgagggcttttcagtttgtcttttttatgtat
ttatgtatcatctatctatctatgtatctatctatctatctatctatcta
tctatgtatctatctatctacctgtctatctacctactatagctatctat
atctatctttctatcacttatctaaaattcttagagcataaccatgttaa
tacatgttaacattcatgatgagctaaaaccaaactgggggatttgctta
aaaccagacagagctgttttgagatcttggcatgtgactgtgagccaaaa
cacagaaaaggcacagtgctcctgtgaaacttcaggtaaattggcttgat
attaaagtccagaatttctaataacctggaaaaggaggctgaaacactga
tcaatctaccatccttatgtggttattactatcttaactattttaagagg
tattttaatccaggaacactttagaacacatatcacatttgttgaatctc
agttacccatcaggggagagtttattagaggaaaataagcctgttataaa
agattcccttgcaattactctgctgttattatctgggccacatgttcatt
cagcttttcaaattaatatgcttagattacttagcaagtaatcatagcta
tggaattctatgaggactaaattactaagaaaatgatcactcaagcattt
gagaaatcgaggctatatatgattttgatagagggtcattattgacatca
cagaagcattcagtctagcacttggacgtgtcacacagacgcggttagat
acatgtagttaaacaggacttactgctgctaatatctatgtggaggtatt
cagctatgggataaaagagaataatattcatctgattggtac
gaattctttattagcagtggtaggagtcaaggggctttggactgaaattc
attttttttaaaggacaaaatcaggttctaattgggcacaggacaacttg
gaaaaacatagcgtgcacagtgtaaaaatttggcaatccatgctctgaat
cactagttttatcccacgtcccttccctcccatctccctagacaatctag
tagctgtgtgctaagttgattgagaagaaaggctaataacagagtgaact
agaagtactaatgaaagcaaggaagtcatagatcagcatggacatatgca
atagttcagatttaaagtaaatgtctacaacgtatagattcaataataaa
ctaacatttgccaaagctgtgtggaactattcaatccaagtgctcactag
atgttgttggggggattataatattcaataactcaacatctctaagcaca
atttcccctgttcttgcttctgttattcttattgcatgtttggcagctga
gaattagttcgagtccatggacaatagtgaactagtgcttctgtaagttt
ataaatctgtgtattagtatgtatagaggtttctttagttgtgatgacaa
caataaaagaaaagggaaaactgaacgcaaatattgagactatgcttctt
aaaataaatactgtgaccatgaaattaaacgtttactttgtaatgtttcg
attagttaggctgttttaacttgaaaatagtatagtgatttaaatattaa
aatagcaattattctctataagtaaataggttttattgtccacatgaatg
taatgttttagacaaataaagcttacatatttatttgtgctattctaagt
taaagaaaaaatatatttccactacaaattttagtacatgtgaattttag
gacatttagtacaagttgaattttatacaaagtttttatgtatgagttat
tcagttacatttatgaaagatgtcatagttccattgtgggcattacttat
tctgcaataattttcattttgttcagaaagataattctctttattttatt
tgtatccagagtgtaggaaataatgaatac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_68963526_68964678
seq2: B6Ng01-146J15.b_47_1188

seq1  GAATTCCATCTCTGGGCAATATGGTCCAGAGAACACTAACTCATAATGTC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATCTCTGGGCAATATGGTCCAGAGAACACTAACTCATAATGTC  50

seq1  TGCCATCCTCCCTTTAAGTACCAGCAGAATTTGTATCTGTCACAAAGTGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATCCTCCCTTTAAGTACCAGCAGAATTTGTATCTGTCACAAAGTGC  100

seq1  TTATCGGTTTAGGAGGAACCATGTATAACTAATAGAAAAGAAGATAATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCGGTTTAGGAGGAACCATGTATAACTAATAGAAAAGAAGATAATTT  150

seq1  TTAATCAAAAGCAAGCTTATAGATGGTCAAGAAATAAATGCAAATTATAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCAAAAGCAAGCTTATAGATGGTCAAGAAATAAATGCAAATTATAT  200

seq1  GATTTATCTTTCCTTAGAAATAGATATTTAATATAAACTCTGACCTAATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTTATCTTTCCTTAGAAATAGATATTTAATATAAACTCTGACCTAATA  250

seq1  ATGAGGTCAGAGTTAATATGAGGGCTTTTCAGTTTGTCTTTTTTATGTAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGTCAGAGTTAATATGAGGGCTTTTCAGTTTGTCTTTTTTATGTAT  300

seq1  TTATGTATCATCTATCTATCTATGTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATGTATCATCTATCTATCTATGTATCTATCTATCTATCTATCTATCTA  350

seq1  TCTATGTATCTATCTATCTACCTGTCTATCTACCTACTATAGCTATCTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTATGTATCTATCTATCTACCTGTCTATCTACCTACTATAGCTATCTAT  400

seq1  ATCTATCTTTCTATCACTTATCTAAAATTCTTAGAGCATAACCATGTTAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCTTTCTATCACTTATCTAAAATTCTTAGAGCATAACCATGTTAA  450

seq1  TACATGTTAACATTCATGATGAGCTAAAACCAAACTGGGGGATTTGCTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACATGTTAACATTCATGATGAGCTAAAACCAAACTGGGGGATTTGCTTA  500

seq1  AAACCAGACAGAGCTGTTTTGAGATCTTGGCATGTGACTGTGAGCCAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCAGACAGAGCTGTTTTGAGATCTTGGCATGTGACTGTGAGCCAAAA  550

seq1  CACAGAAAAGGCACAGTGCTCCTGTGAAACTTCAGGTAAATTGGCTTGAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGAAAAGGCACAGTGCTCCTGTGAAACTTCAGGTAAATTGGCTTGAT  600

seq1  ATTAAAGTCCAGAATTTCTAATAACCTGGAAAAGGAGGCTGAAACACTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAGTCCAGAATTTCTAATAACCTGGAAAAGGAGGCTGAAACACTGA  650

seq1  TCAATCTACCATCCTTATGTGGTTATTACTATCTTAACTATTTTAAGAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAATCTACCATCCTTATGTGGTTATTACTATCTTAACTATTTTAAGAGG  700

seq1  TATTTTAATCCAGGAACACTTTAGAACACATATCACATTTGTTGAATCTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTTAATCCAGGAACACTTTAGAACACATATCACATTTGTTGAATCTC  750

seq1  AGTTACCCATCAGGGGAGAGTTTATTAGAGGAAAATAAGCCTGTTATAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTACCCATCAGGGGAGAGTTTATTAGAGGAAAATAAGCCTGTTATAAA  800

seq1  AGATTCCCTTGCAATTACTCTGCTGTTATTATCTGGGCCACATGTTCATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTCCCTTGCAATTACTCTGCTGTTATTATCTGGGCCACATGTTCATT  850

seq1  CAGCTTTTCAAATTAATATGCTTAGATTACTTAGCAAGTAATCATAGCTA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTTTCAAATTAATATGCTTAGATTACTTAGCAAGTAATCATAGCTA  900

seq1  TGGAATTCTATGAGGAACTAAATTACTAAGAAAATGATCACTCAAGCATT  950
      ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTCTATGAGG-ACTAAATTACTAAGAAAATGATCACTCAAGCATT  949

seq1  TGAGAAATCGAGGCTATATATGATTTTGAATAGAGGGTCATTATTGACAT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  TGAGAAATCGAGGCTATATATGATTTTG-ATAGAGGGTCATTATTGACAT  998

seq1  CACAGAAGCATTCAGTCTAAGCACTTGGACGTGTCACAACAGAAGGCGGT  1050
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||
seq2  CACAGAAGCATTCAGTCT-AGCACTTGGACGTGTCAC-ACAG-ACGCGGT  1045

seq1  TAGATACATGTAG-TAAACAGGACTTAACTGCTTGCTAATATCTATGTGA  1099
      ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||| 
seq2  TAGATACATGTAGTTAAACAGGACTT-ACTGC-TGCTAATATCTATGTG-  1092

seq1  AGTGTTATTCAGCTTATGTGAT-AAAGAGAATAATATCAATCTTGGAATT  1148
       | | |||||||| |||| ||| ||||||||||||||  ||||    |||
seq2  -GAGGTATTCAGC-TATGGGATAAAAGAGAATAATATTCATCT---GATT  1137

seq1  GGTAC  1153
      |||||
seq2  GGTAC  1142

seq1: chr1_69007023_69008111
seq2: B6Ng01-146J15.g_66_1145 (reverse)

seq1  GTATTCTATATATTTCCTACACATCTGGATACAAATAAAATAAGGAGAAT  50
      |||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||
seq2  GTATTC-AT-TATTTCCTACAC-TCTGGATACAAATAAAATAAAGAGAAT  47

seq1  TATCTTTCTGAAACAAAATGAAAATTAATTTGCAGAATAAGTAATGCCCA  100
      |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||
seq2  TATCTTTCTG-AACAAAATGAAAATTA--TTGCAGAATAAGTAATGCCCA  94

seq1  CAATGGAACTATGACATCTTTCATTAAATGTAAACTGAATAACTCATTAC  150
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||
seq2  CAATGGAACTATGACATCTTTCA-TAAATGT-AACTGAATAACTCA-TAC  141

seq1  ATAAAACTTTTGTTATAAAATTCAACTTGTACTAAATGTCCTAAAATTCA  200
      ||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAACTTTG-TATAAAATTCAACTTGTACTAAATGTCCTAAAATTCA  190

seq1  CATGTACTAAAATTTGTAGTGG-AATATATTTTTTCTTTAACTTAGAATA  249
      |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGTACTAAAATTTGTAGTGGAAATATATTTTTTCTTTAACTTAGAATA  240

seq1  GCACAAATAAATATGTAAGCTTTATTTGTCTAAAACATTACATTCATGTG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAAATAAATATGTAAGCTTTATTTGTCTAAAACATTACATTCATGTG  290

seq1  GACAATAAAACCTATTTACTTATAGAGAATAATTGCTATTTTAATATTTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATAAAACCTATTTACTTATAGAGAATAATTGCTATTTTAATATTTA  340

seq1  AATCACTATACTATTTTCAAGTTAAAACAGCCTAACTAATCGAAACATTA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCACTATACTATTTTCAAGTTAAAACAGCCTAACTAATCGAAACATTA  390

seq1  CAAAGTAAACGTTTAATTTCATGGTCACAGTATTTATTTTAAGAAGCATA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGTAAACGTTTAATTTCATGGTCACAGTATTTATTTTAAGAAGCATA  440

seq1  GTCTCAATATTTGCGTTCAGTTTTCCCTTTTCTTTTATTGTTGTCATCAC  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCAATATTTGCGTTCAGTTTTCCCTTTTCTTTTATTGTTGTCATCAC  490

seq1  AACTAAAGAAACCTCTATACATACTAATACACAGATTTATAAACTTACAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAAAGAAACCTCTATACATACTAATACACAGATTTATAAACTTACAG  540

seq1  AAGCACTAGTTCACTATTGTCCATGGACTCGAACTAATTCTCAGCTGCCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACTAGTTCACTATTGTCCATGGACTCGAACTAATTCTCAGCTGCCA  590

seq1  AACATGCAATAAGAATAACAGAAGCAAGAACAGGGGAAATTGTGCTTAGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACATGCAATAAGAATAACAGAAGCAAGAACAGGGGAAATTGTGCTTAGA  640

seq1  GATGTTGAGTTATTGAATATTATAATCCCCCCAACAACATCTAGTGAGCA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTTGAGTTATTGAATATTATAATCCCCCCAACAACATCTAGTGAGCA  690

seq1  CTTGGATTGAATAGTTCCACACAGCTTTGGCAAATGTTAGTTTATTATTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGATTGAATAGTTCCACACAGCTTTGGCAAATGTTAGTTTATTATTG  740

seq1  AATCTATACGTTGTAGACATTTACTTTAAATCTGAACTATTGCATATGTC  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTATACGTTGTAGACATTTACTTTAAATCTGAACTATTGCATATGTC  790

seq1  CATGCTGATCTATGACTTCCTTGCTTTCATTAGTACTTCTAGTTCACTCT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGCTGATCTATGACTTCCTTGCTTTCATTAGTACTTCTAGTTCACTCT  840

seq1  GTTATTAGCCTTTCTTCTCAATCAACTTAGCACACAGCTACTAGATTGTC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATTAGCCTTTCTTCTCAATCAACTTAGCACACAGCTACTAGATTGTC  890

seq1  TAGGGAGATGGGAGGGAAGGGACGTGGGATAAAACTAGTGATTCAGAGCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGAGATGGGAGGGAAGGGACGTGGGATAAAACTAGTGATTCAGAGCA  940

seq1  TGGATTGCCAAATTTTTACACTGTGCACGCTATGTTTTTCCAAGTTGTCC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTGCCAAATTTTTACACTGTGCACGCTATGTTTTTCCAAGTTGTCC  990

seq1  TGTGCCCAATTAGAACCTGATTTTGTCCTTTAAAAAAAATGAATTTCAGT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGCCCAATTAGAACCTGATTTTGTCCTTTAAAAAAAATGAATTTCAGT  1040

seq1  CCAAAGCCCCTTGACTCCTACCACTGCTAATAAAGAATTC  1089
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCCCCTTGACTCCTACCACTGCTAATAAAGAATTC  1080