BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-155E21
Chromosome1 (Build37)
Map Location 30,455,686 - 30,567,931
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneEG433283, LOC100040665, LOC665944
Downstream geneEG624138, LOC100040699, Phf3, EG638995, Ptp4a1, EG435615, LOC669402, EG435616, 4931428L18Rik, LOC666020, Gluld1, 4930521A18Rik, EG226957, EG624262
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-155E21.bB6Ng01-155E21.g
ACCDH950126DH950127
length1,097472
definitionDH950126|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155E21, 5' end.DH950127|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-155E21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(30,566,825 - 30,567,931)(30,455,686 - 30,456,165)
sequence
gaattctctactacaataacccatgatagcacttgcactgttactgtagc
cttggtaacatgtaatcatgttatgctgtagctgcaagggatgactttca
ggaaatacatatgactcattaacaaatagcatctcttttgtctcatttag
agcttgttaagatctggggttacacagagaagctctctgatttcttctca
ttctccttctacttttcaataaattatttgcaatgatccatctattgtct
cttagttcatcacctcttttgggaatttgtatttgaattctatcagtctc
ttccactgggggaaccttatatttattattatagtaatttatgtttgttt
gtagatgagattgtgttgtctgaagcaaaagtgctctagaaacaaattag
acatcatctcacatatatcatctaggggcttatctaactgtatgaccttt
atgcctttcaagtaatggttgaggtcaactgagtctaatgaattaaagac
tccaggatcatattttgaaatatccgttgacaatctgagtgatcttaggc
aaaaccacttaacctttcttccctgaagtgcgattattcacagaagggag
ataaccactctcagctcataaatggttagtgagaatcacactattttaat
gtacataaatcattcagtgctaatatttaaatccatgataaagcaattat
ttgctgactagacagggatctccaaagaggtttttatgaaaataaatcac
acagttatgttgaagtgttcatctgcttctcctaatagagcttgtaatga
aattcaaatcaaacacttgagttatattatgcttaaaacacatacttgat
aaaattgacatgttctcaatggtgtgggcatttttgttcttcatctctgt
aatcttgaggtatgttaaaccttataggctgagatattttgatctgaaaa
gacacctgttgtaaaactttgttcagttaaaagttcagtgtcctcaaaac
acaaaaaattaagagtcagaatggattgattagccaagggcttcatatga
tttgataatgctatcagccttttagcaagagttgtaaagtagctgta
cattcatagaacccagtggtgcaagacgcaaactgacttctacaattatc
ctctaatgtccatgacctatacatgcatgagcacacatactgagacatac
ccatgtgcatgcgcacacacaaacatacacatacacacaccaaataaaag
tttgttaaaagaaatgtttttaaaatgttttttaaaaatgtttgtgatgt
attcagcagtatggtcctactctcaacctctgagaagcaactgagagctg
tgtgtaaaacctatactgtctggggagttatttggactacccccgactaa
ccatttgaaaggaggtttctcatgcctactactgaggtgtttgctagtct
atggctcttgaagaaagactatgcatcttccatatactattttatagata
tagatatagacatagacatagatatcgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_30566825_30567931
seq2: B6Ng01-155E21.b_46_1142 (reverse)

seq1  TACAGCTACTTTACAACTCTTGCTAAAAAGCTGGATAGCATTATCAAATC  50
      |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||
seq2  TACAGCTACTTTACAACTCTTGCTAAAAGGCT-GATAGCATTATCAAATC  49

seq1  ATATGAAGCCCTTGGCTTAATCAATCCATTCTTGACTTCTTAATTTTTTT  100
      |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||||
seq2  ATATGAAGCCCTTGGC-TAATCAATCCATTC-TGAC-TCTTAA-TTTTTT  95

seq1  GTGTTTTGGGGACACTGAACTTTTAACTTGAACAAAGTTTTTACAAACAG  150
      |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||
seq2  GTGTTTTGAGGACACTGAACTTTTAAC-TGAACAAAG-TTTTAC-AACAG  142

seq1  GTTGTCTTTTTCAGATCAAAATATCTCAGCCTATAAGGTTTAACATACCT  200
      | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-TGTC-TTTTCAGATCAAAATATCTCAGCCTATAAGGTTTAACATACCT  190

seq1  CAAGATTACAGAGATGAAGAACAAAAATGCCCACACCATTGAGAACATGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATTACAGAGATGAAGAACAAAAATGCCCACACCATTGAGAACATGT  240

seq1  CAATTTTATCAAGTATGTGTTTTAAGCATAATATAACTCAAGTGTTTGAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTTTATCAAGTATGTGTTTTAAGCATAATATAACTCAAGTGTTTGAT  290

seq1  TTGAATTTCATTACAAGCTCTATTAGGAGAAGCAGATGAACACTTCAACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAATTTCATTACAAGCTCTATTAGGAGAAGCAGATGAACACTTCAACA  340

seq1  TAACTGTGTGATTTATTTTCATAAAAACCTCTTTGGAGATCCCTGTCTAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACTGTGTGATTTATTTTCATAAAAACCTCTTTGGAGATCCCTGTCTAG  390

seq1  TCAGCAAATAATTGCTTTATCATGGATTTAAATATTAGCACTGAATGATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGCAAATAATTGCTTTATCATGGATTTAAATATTAGCACTGAATGATT  440

seq1  TATGTACATTAAAATAGTGTGATTCTCACTAACCATTTATGAGCTGAGAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGTACATTAAAATAGTGTGATTCTCACTAACCATTTATGAGCTGAGAG  490

seq1  TGGTTATCTCCCTTCTGTGAATAATCGCACTTCAGGGAAGAAAGGTTAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTATCTCCCTTCTGTGAATAATCGCACTTCAGGGAAGAAAGGTTAAG  540

seq1  TGGTTTTGCCTAAGATCACTCAGATTGTCAACGGATATTTCAAAATATGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTTGCCTAAGATCACTCAGATTGTCAACGGATATTTCAAAATATGA  590

seq1  TCCTGGAGTCTTTAATTCATTAGACTCAGTTGACCTCAACCATTACTTGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGGAGTCTTTAATTCATTAGACTCAGTTGACCTCAACCATTACTTGA  640

seq1  AAGGCATAAAGGTCATACAGTTAGATAAGCCCCTAGATGATATATGTGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGCATAAAGGTCATACAGTTAGATAAGCCCCTAGATGATATATGTGAG  690

seq1  ATGATGTCTAATTTGTTTCTAGAGCACTTTTGCTTCAGACAACACAATCT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATGTCTAATTTGTTTCTAGAGCACTTTTGCTTCAGACAACACAATCT  740

seq1  CATCTACAAACAAACATAAATTACTATAATAATAAATATAAGGTTCCCCC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTACAAACAAACATAAATTACTATAATAATAAATATAAGGTTCCCCC  790

seq1  AGTGGAAGAGACTGATAGAATTCAAATACAAATTCCCAAAAGAGGTGATG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAAGAGACTGATAGAATTCAAATACAAATTCCCAAAAGAGGTGATG  840

seq1  AACTAAGAGACAATAGATGGATCATTGCAAATAATTTATTGAAAAGTAGA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAAGAGACAATAGATGGATCATTGCAAATAATTTATTGAAAAGTAGA  890

seq1  AGGAGAATGAGAAGAAATCAGAGAGCTTCTCTGTGTAACCCCAGATCTTA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGAATGAGAAGAAATCAGAGAGCTTCTCTGTGTAACCCCAGATCTTA  940

seq1  ACAAGCTCTAAATGAGACAAAAGAGATGCTATTTGTTAATGAGTCATATG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCTCTAAATGAGACAAAAGAGATGCTATTTGTTAATGAGTCATATG  990

seq1  TATTTCCTGAAAGTCATCCCTTGCAGCTACAGCATAACATGATTACATGT  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTCCTGAAAGTCATCCCTTGCAGCTACAGCATAACATGATTACATGT  1040

seq1  TACCAAGGCTACAGTAACAGTGCAAGTGCTATCATGGGTTATTGTAGTAG  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAAGGCTACAGTAACAGTGCAAGTGCTATCATGGGTTATTGTAGTAG  1090

seq1  AGAATTC  1107
      |||||||
seq2  AGAATTC  1097

seq1: chr1_30455686_30456165
seq2: B6Ng01-155E21.g_65_542

seq1  GAATTCCATTCATAGAACCCAGTGGTGCAAGACGCAAACTGACTTCTACA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCATTCATAGAACCCAGTGGTGCAAGACGCAAACTGACTTCTACA  50

seq1  ATTATCCTCTAATGTCCATGACCTATACATGCATGAGCACACATACTGAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATCCTCTAATGTCCATGACCTATACATGCATGAGCACACATACTGAG  100

seq1  ACATACCCATGTGCATGCGCACACACAAACATACACATACACACACCAAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATACCCATGTGCATGCGCACACACAAACATACACATACACACACCAAA  150

seq1  TAAAAGTTTGTTAAAAGAAATGTTTTTAAAATGTTTTTTAAAAATGTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAGTTTGTTAAAAGAAATGTTTTTAAAATGTTTTTTAAAAATGTTTG  200

seq1  TGATGTATTCAGCAGTATGGTCCTACTCTCAACCTCTGAGAAGCAACTGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGTATTCAGCAGTATGGTCCTACTCTCAACCTCTGAGAAGCAACTGA  250

seq1  GAGCTGTGTGTAAAACCTATACTGTCTGGGGAGTTATTTGGACTACCCCC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTGTGTGTAAAACCTATACTGTCTGGGGAGTTATTTGGACTACCCCC  300

seq1  GACTAACCATTTGAAAGGAGGTTTCTCATGCCTACTACTGAGGTGTTTGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTAACCATTTGAAAGGAGGTTTCTCATGCCTACTACTGAGGTGTTTGC  350

seq1  TAGTCTATGGCTCTTGAAGAAAGACTATGCATCTTCCATATACTATTTTA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTCTATGGCTCTTGAAGAAAGACTATGCATCTTCCATATACTATTTTA  400

seq1  TAGATATAGATATAGACATAGACATAGATATCGTGTGTGTGTGTGTGTGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATAGATATAGACATAGACATAGATATCGTGTGTGTGTGTGTGTGT  450

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGAATGTGTGT  480
      |||||||||||||||||||||  |||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTG--TGTGTGT  478