BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-156K18
Chromosome1 (Build37)
Map Location 79,830,893 - 79,978,482
singlet/doubletdoublet
Overlap geneSerpine2, EG433326, LOC665064
Upstream geneEG545332, Scg2, Ap1s3, Wdfy1, Mrpl44
Downstream geneLOC100039325, A830043J08Rik, 2310015K22Rik, Cul3, EG620899, 1700016L21Rik, Dock10, LOC665092
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-156K18.bB6Ng01-156K18.g
ACCDH951114DH951115
length1,1051,066
definitionDH951114|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156K18, 5' end.DH951115|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-156K18, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(79,977,380 - 79,978,482)(79,830,893 - 79,831,955)
sequence
gaattctggatttaatatatatttaatattttgaaccccaagaagtggtt
cacactttggcaaagctttattgtgtataaaatatgagtaatgagttttt
ttatagtgcatgtgtgcatagaatatgtgtgtgactttatgtgtgtgtgt
gcatgcgcacatgtgtgtttacatgcacataagtgcatggggttagtaag
cccatgcatgaacatgaggaggccagaacaggttaacacttgtctttttt
tcatttctttctgccttattgccttgagactaaatcacccctttagtggg
aaactttctttttcagctaagatggctgcccagcaaactcggagtctgtc
tatctctgactcccagctcatccatgtccagctatttccaagggtgctag
ggatttgaactcacaccctcatgcttacagagcacaaactcttatccatt
gaaccatctccctagtttctaaatcataaaaatttccccatgaggttatt
gacttatagaagacaaatatattccaagtgggtgaatatctaactttgaa
tcctactgaccagtgtctaagtttcctggggaaagacaacaaacagccaa
gataattagaactgtacacatagtatgggatttcttatggtgatctgtca
tgctttgattaaggtacaattatcattgcctgctctcctggaacaggctc
tactgtgctgatctgtaaattaagtaccaagtatggaacttgatgccacg
tgaaactcacagtggaagtctgtccaggtctacttttcatcttttctaca
tattcaacatatatacttttcttgatattcattctctctctctctctctc
tctcactgtcactaaaaatcctataatttgaaggctggagagatggctca
ctggttaagagcactgcttttccagaggtcttgaattctattctcagcaa
ccccatctataatgggatccatgccttcttctgtgtgtctgaaaatagtg
agagtttactcatatactcatataaaataataagatccttttttaaaatg
gtttactttgtttgaagaatttcatacatacatatattgggctttgatta
attca
gaattcaaggccagtctcatctacatagtgaatccaggccacccagggat
atatagggaaatgctgtctccatcattatcgtcatcgtcatcattacaga
cagctagccctgattgatgcatgagaaaactagaaggtactgtctgcaag
cagcaagcctttaccaactactgtagatgccagtgtcttaaccatagact
tccctgactcttggaccatgaggaataatttttgttgtttgtaagcttgc
cagttaatggtatttcgttacagcagattaaacgttcaagacatctacta
agcaccagacacggtactttatattgaaaatgctaatatgccacactgat
tcctctggtcgagtttaaaggccaatggaggaaaaggagaagaaacgctg
tgttcctctacctgggcttacctcaccaaacacttggagcaagcaaacaa
gtgaccacagcgttcaagagtgccaaactgaacataatgtttgttactct
agggtggtggcttccattcagggtaggggcaactctgtcctcaggggtta
tttgggaacacttttggttgtctcacttggctaagccatgctatgctgtc
tagtggagactgctccttaggggtataaacacttagggtatgagtcaatt
cccatacctcatacccgagaactccaagaaaacctatgcacatttccatt
ctgcccagatcaccctccatgttgctggcttcccatcatcgagaatcata
ggcagtactgacaccaatttatagcatgattctctctggaatttttaacc
tgaaacttccctgtgtggaagagaaaggaatccagccaattacttctgtg
tatcctagaaggggaggtttatgaccagcaattatagcttagcctgattg
ttcaccccatccaatgtgtcagctccagtttgctgcagccctggaagaac
tttgaggctggaagcagaagatacagacattcctatgagcttctgctttc
agccagaagcatgggggaggaaggtaagactcaggctgactcaccggcag
ttatatccttaaacta
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_79977380_79978482
seq2: B6Ng01-156K18.b_50_1154 (reverse)

seq1  TGAATTTGATCAAAGCACAATATATGTATGTATGAAATTC-TCAAACAAT  49
      |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| 
seq2  TGAA-TTAATCAAAGCCCAATATATGTATGTATGAAATTCTTCAAACAAA  49

seq1  G-ATAACATTTTTAAAAAGGATCTATTTATTTTATATGAGTATATGAGTA  98
      | | | |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAACCATTTTAAAAAAGGATCTTATTATTTTATATGAGTATATGAGTA  99

seq1  AACTCTCACTATTTTCAGACACACCAGAAGAGGGCATTGGATCCCATTAT  148
      ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||
seq2  AACTCTCACTATTTTCAGACACA-CAGAAGAAGGCA-TGGATCCCATTAT  147

seq1  AGATGGGGTTGCTGGGAATTGAATTCAGGACCTCTGGAAAAGCAGTGCTC  198
      |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  AGATGGGGTTGCTGAGAATAGAATTCAAGACCTCTGGAAAAGCAGTGCTC  197

seq1  TTAACCAGTGAGCCATCTCTCCAGCCTTC-AATTATAGGATTTTTAGTGA  247
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
seq2  TTAACCAGTGAGCCATCTCTCCAGCCTTCAAATTATAGGATTTTTAGTGA  247

seq1  CAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGAATATCAAG-AAAGTATATAT  296
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  CAGTGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAATGAATATCAAGAAAAGTATATAT  297

seq1  GTTGAATATGTAGAAAAGATG-AAAGTAGACCTGGACAGACTTCCACTGT  345
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAATATGTAGAAAAGATGAAAAGTAGACCTGGACAGACTTCCACTGT  347

seq1  GAGTTTCACGTGGCATCAAGTTCCATACTTGGTACTTAATTTACAGATCA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTTCACGTGGCATCAAGTTCCATACTTGGTACTTAATTTACAGATCA  397

seq1  GCACAGTAGAGCCTGTTCCAGGAGAGCAGGCAATGATAATTGTACCTTAA  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACAGTAGAGCCTGTTCCAGGAGAGCAGGCAATGATAATTGTACCTTAA  447

seq1  TCAAAGCATGACAGATCACCATAAGAAATCCCATACTATGTGTACAGTTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAAGCATGACAGATCACCATAAGAAATCCCATACTATGTGTACAGTTC  497

seq1  TAATTATCTTGGCTGTTTGTTGTCTTTCCCCAGGAAACTTAGACACTGGT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTATCTTGGCTGTTTGTTGTCTTTCCCCAGGAAACTTAGACACTGGT  547

seq1  CAGTAGGATTCAAAGTTAGATATTCACCCACTTGGAATATATTTGTCTTC  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAGGATTCAAAGTTAGATATTCACCCACTTGGAATATATTTGTCTTC  597

seq1  TATAAGTCAATAACCTCATGGGGAAATTTTTATGATTTAGAAACTAGGGA  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATAAGTCAATAACCTCATGGGGAAATTTTTATGATTTAGAAACTAGGGA  647

seq1  GATGGTTCAATGGATAAGAGTTTGTGCTCTGTAAGCATGAGGGTGTGAGT  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGGTTCAATGGATAAGAGTTTGTGCTCTGTAAGCATGAGGGTGTGAGT  697

seq1  TCAAATCCCTAGCACCCTTGGAAATAGCTGGACATGGATGAGCTGGGAGT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAAATCCCTAGCACCCTTGGAAATAGCTGGACATGGATGAGCTGGGAGT  747

seq1  CAGAGATAGACAGACTCCGAGTTTGCTGGGCAGCCATCTTAGCTGAAAAA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATAGACAGACTCCGAGTTTGCTGGGCAGCCATCTTAGCTGAAAAA  797

seq1  GAAAGTTTCCCACTAAAGGGGTGATTTAGTCTCAAGGCAATAAGGCAGAA  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGTTTCCCACTAAAGGGGTGATTTAGTCTCAAGGCAATAAGGCAGAA  847

seq1  AGAAATGAAAAAAAGACAAGTGTTAACCTGTTCTGGCCTCCTCATGTTCA  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAATGAAAAAAAGACAAGTGTTAACCTGTTCTGGCCTCCTCATGTTCA  897

seq1  TGCATGGGCTTACTAACCCCATGCACTTATGTGCATGTAAACACACATGT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATGGGCTTACTAACCCCATGCACTTATGTGCATGTAAACACACATGT  947

seq1  GCGCATGCACACACACACATAAAGTCACACACATATTCTATGCACACATG  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCATGCACACACACACATAAAGTCACACACATATTCTATGCACACATG  997

seq1  CACTATAAAAAAACTCATTACTCATATTTTATACACAATAAAGCTTTGCC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTATAAAAAAACTCATTACTCATATTTTATACACAATAAAGCTTTGCC  1047

seq1  AAAGTGTGAACCACTTCTTGGGGTTCAAAATATTAAATATATATTAAATC  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTGTGAACCACTTCTTGGGGTTCAAAATATTAAATATATATTAAATC  1097

seq1  CAGAATTC  1103
      ||||||||
seq2  CAGAATTC  1105

seq1: chr1_79830893_79831955
seq2: B6Ng01-156K18.g_68_1132

seq1  GAATTCAAGGCCAGTCTCATCTACATAGTGAATCCAGGCCACCCAGGGAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAAGGCCAGTCTCATCTACATAGTGAATCCAGGCCACCCAGGGAT  50

seq1  ATATAGGGAAATGCTGTCTCCATCATTATCGTCATCGTCATCATTACAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATAGGGAAATGCTGTCTCCATCATTATCGTCATCGTCATCATTACAGA  100

seq1  CAGCTAGCCCTGATTGATGCATGAGAAAACTAGAAGGTACTGTCTGCAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTAGCCCTGATTGATGCATGAGAAAACTAGAAGGTACTGTCTGCAAG  150

seq1  CAGCAAGCCTTTACCAACTACTGTAGATGCCAGTGTCTTAACCATAGACT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCAAGCCTTTACCAACTACTGTAGATGCCAGTGTCTTAACCATAGACT  200

seq1  TCCCTGACTCTTGGACCATGAGGAATAATTTTTGTTGTTTGTAAGCTTGC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGACTCTTGGACCATGAGGAATAATTTTTGTTGTTTGTAAGCTTGC  250

seq1  CAGTTAATGGTATTTCGTTACAGCAGATTAAACGTTCAAGACATCTACTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTTAATGGTATTTCGTTACAGCAGATTAAACGTTCAAGACATCTACTA  300

seq1  AGCACCAGACACGGTACTTTATATTGAAAATGCTAATATGCCACACTGAT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCACCAGACACGGTACTTTATATTGAAAATGCTAATATGCCACACTGAT  350

seq1  TCCTCTGGTCGAGTTTAAAGGCCAATGGAGGAAAAGGAGAAGAAACGCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGGTCGAGTTTAAAGGCCAATGGAGGAAAAGGAGAAGAAACGCTG  400

seq1  TGTTCCTCTACCTGGGCTTACCTCACCAAACACTTGGAGCAAGCAAACAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCTCTACCTGGGCTTACCTCACCAAACACTTGGAGCAAGCAAACAA  450

seq1  GTGACCACAGCGTTCAAGAGTGCCAAACTGAACATAATGTTTGTTACTCT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGACCACAGCGTTCAAGAGTGCCAAACTGAACATAATGTTTGTTACTCT  500

seq1  AGGGTGGTGGCTTCCATTCAGGGTAGGGGCAACTCTGTCCTCAGGGGTTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGGTGGCTTCCATTCAGGGTAGGGGCAACTCTGTCCTCAGGGGTTA  550

seq1  TTTGGGAACACTTTTGGTTGTCTCACTTGGCTAAGCCATGCTATGCTGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGGAACACTTTTGGTTGTCTCACTTGGCTAAGCCATGCTATGCTGTC  600

seq1  TAGTGGAGACTGCTCCTTAGGGGTATAAACACTTAGGGTATGAGTCAATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGGAGACTGCTCCTTAGGGGTATAAACACTTAGGGTATGAGTCAATT  650

seq1  CCCATACCTCATACCCGAGAACTCCAAGAAAACCTATGCACATTTCCATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATACCTCATACCCGAGAACTCCAAGAAAACCTATGCACATTTCCATT  700

seq1  CTGCCCAGATCACCCTCCATGTTGCTGGCTTCCCATCATCGAGAATCATA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCCAGATCACCCTCCATGTTGCTGGCTTCCCATCATCGAGAATCATA  750

seq1  GGCAGTACTGACACCAATTTATAGCATGATTCTCTCTGGAATTTTTAACC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGTACTGACACCAATTTATAGCATGATTCTCTCTGGAATTTTTAACC  800

seq1  TGAAACTTCCCTGTGTGGAAGAGAAAGGAATCCAGCCAATTACTTCTGTG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAACTTCCCTGTGTGGAAGAGAAAGGAATCCAGCCAATTACTTCTGTG  850

seq1  TATCCTAGAAGGGGAGGTTTATGACCAGCAATTATAGCTTCAGCCTGATT  900
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TATCCTAGAAGGGGAGGTTTATGACCAGCAATTATAGCTT-AGCCTGATT  899

seq1  GTTCACCCCATCCAATGTGTCAGCTCCAGTTTGCTGCAGCCCCTGGAAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  GTTCACCCCATCCAATGTGTCAGCTCCAGTTTGCTGCAG-CCCTGGAAGA  948

seq1  ACTTTGAGGCTGGAAGCAG-AGATACAGACATTCTAATGAGCTTCTGCTT  999
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||
seq2  ACTTTGAGGCTGGAAGCAGAAGATACAGACATTCCTATGAGCTTCTGCTT  998

seq1  CCAGCAAGAAGCAT-GGGGAGG-AGGTAAGAC-CAGGCTGACTCACCGGC  1046
       |||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||
seq2  TCAGCCAGAAGCATGGGGGAGGAAGGTAAGACTCAGGCTGACTCACCGGC  1048

seq1  AGTTATATCCTTAAACT  1063
      |||||||||||||||||
seq2  AGTTATATCCTTAAACT  1065