BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-158F03
Chromosome1 (Build37)
Map Location 91,440,960 - 91,570,796
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCentg2
Upstream geneArl4c, LOC100040127, 2410088K16Rik, LOC208347, Sh3bp4, LOC383542, EG665688
Downstream geneGbx2, Asb18, Iqca, Cxcr7, Cops8
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-158F03.bB6Ng01-158F03.g
ACCDH952301DH952302
length1,1181,058
definitionDH952301|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158F03, 5' end.DH952302|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-158F03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(91,569,668 - 91,570,796)(91,440,960 - 91,442,022)
sequence
gaattccctgaaggccaaggactctcttgcctgtgagagagggacacaga
cagggtgggcagttgcaaatgaacagcaatgctttcacttgaggacagac
ccacattccctcagcattcctgagggaacaagttgaaacaagctcagcct
cagacatacttcacacagtacaagataccttcgtgtgaggcaaaggttct
catgtctattttaacacatgtaaaacttggggctgaaacaacggcttagt
ggttaagaccacttaatgctcttgcagaggatccaagtgtacacccacat
gtggtggcttgcagcgagctggaactctagttctggggatccaatgcctc
cttctggcctctgtgggtactgcatgtacatggcactgataaactcacac
aggcacacacacagaaaactatctttaaaactgtaacctttgctttagag
gcttcttgtcaccatgtagtggagaaagcacagaagtgaggtgcctagct
ggctagtcctgaatagtcaccctgtttgcattcaacttaagatcaagata
acctaatgggccccactccgctaggggttaaacaggacataagatacata
ggtaacaagctcttattgaaatgtccatttattcaaggaatctacctgtg
ggttttctagaacattctaggcaggtactgcccccttcaggcttcgtcct
cctaatccctatgtttccagaggtcatcacagcacagtgaggacagcaag
gggtgtagctcctctcaaatgatccacacaccttgaaaattcggccacac
acagcgtggagcactctaaccacccagaccacctacaagctgcacttact
ccatagaaggggcaggcgcctctgactggggtacctggaatgccacagct
caaagcctgcagtgtgaatggaatgtaaacatcccctgcagaaagtctag
gggtgggtgatacctgagcacagattacagtggggaccgtgtgggctggg
agcagaccaggcaggagtagtctctggcttcttcatgtggacactaatgg
aggaaatcaagtgctctcgcttctaggagtccaggaacactatttacatc
tcacagagtatcactgaa
gaattctttccttaaaaaagagcctccctgagtgctcgtatgtttttggg
gtagacatcaaaggcagtatataaaaagacttttgctttgacagtatcca
aatgattgaataatttttggctctcacaaatactgtaagcaaaattaaag
ggcaaacttgaagtatttacagcatatgactaggaatggtctttcatatg
taaacagtttttacaaaacaatgagaaaaattccacaacaaaaaaaaatg
gtcatagaacccatgaaaaaagaaatacatggtcaaataagaagtaagta
tatttggttctgttagagaacaattgaaatgattggctgacatttcagta
ctaaaaccaagatcctgaaccagtttagttcatggaacaagttcactgaa
atgtttcctttttacactggtgtatgggaaggaaagtgggataactgtac
agagaagaatataccagactatcaaaaactttaaaagtgtttgcaacttt
cttcctggaaatgttatgtctagattaacctcaccccagcttaattcagc
cttccaatagaccatctgtgtgactgtagagaggatcctggaggctgatg
cttcagccccatctgtggtctcttgctgcccaattggacttttctttgta
atacatgtttttatttatataaaccaatttggccttgaatcttcattttc
cttaggttacaggcatgcaacactactcctggctgacttagaccattaat
aagtggttttgccccaaacagatgtgggaaaaatgaatagtcaggaagga
atcctgagggtgattgtgaagttcacttgtagcttaatgaaagctctggg
aagacatcctcgcattgcatcaattgcggggcaggtgggatgaggggggg
tgcgtaatgcaaatgccattattcagcatctccagtagatgctcagaagt
gacaattgggaatctttattttcttagtttgactgatagtaaagctggag
tcttagctgctctctgagactggcaggctcacatctgatgatttgcaagg
gaaagaga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_91569668_91570796
seq2: B6Ng01-158F03.b_46_1163 (reverse)

seq1  TTCAGTGATACTCTTGTTGAGATGTAAATGGTGGTTTCCTTGTGACTCCT  50
      ||||||||||||||   |||||||||||| |||  |||||   |||||||
seq2  TTCAGTGATACTCT--GTGAGATGTAAATAGTG--TTCCT--GGACTCCT  44

seq1  AGGAGCGGGGAGCACTTGATTTCCTCCACTAGGTGTCCACAATGAGGAGC  100
      || ||| | ||||||||||||||||||| || |||||||||   || |||
seq2  AGAAGC-GAGAGCACTTGATTTCCTCCATTA-GTGTCCACATGAAGAAGC  92

seq1  CAGAGACTAACTCCTGCCTGGTCTGCTCCCAGCCCCACACGGT-CCCACT  149
      |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||
seq2  CAGAGACT-ACTCCTGCCTGGTCTGCTCCCAG-CCCACACGGTCCCCACT  140

seq1  GTAATCTGTGCTCAGGTATCACCCACCCCTAGACTTTCTGCAGGGGATGT  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAATCTGTGCTCAGGTATCACCCACCCCTAGACTTTCTGCAGGGGATGT  190

seq1  TTACATTCCATTCACACTGCAGGCTTTTGAGCTGTGGCATTCCAGGTACC  249
      |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACATTCCATTCACACTGCAGGC-TTTGAGCTGTGGCATTCCAGGTACC  239

seq1  CCAGTCAGAGGCGCCCTGCCCCTTCTATGGAGTAAGTGCAGCTTGTAGGT  299
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTCAGAGGCG-CCTGCCCCTTCTATGGAGTAAGTGCAGCTTGTAGGT  288

seq1  GGTCTGGGTGGTTAGAGTGCTCCACGCTGTGTGTGGCCGAATTTTCAAGG  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGGGTGGTTAGAGTGCTCCACGCTGTGTGTGGCCGAATTTTCAAGG  338

seq1  TGTGTGGATCATTTGAGAGGAGCTACACCCCTTGCTGTCCTCACTGTGCT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTGGATCATTTGAGAGGAGCTACACCCCTTGCTGTCCTCACTGTGCT  388

seq1  GTGGTGACCTCTGGAAACATAGGGATTAGGAGGACGAAGCCTGAAGGGGG  449
      ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGATGACCTCTGGAAACATAGGGATTAGGAGGACGAAGCCTGAAGGGGG  438

seq1  CAGTACCTGCCTAGAATGTTCTAGAAAACCCACAGGTAGATTCCTTGAAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACCTGCCTAGAATGTTCTAGAAAACCCACAGGTAGATTCCTTGAAT  488

seq1  AAATGGACATTTCAATAAGAGCTTGTTACCTATGTATCTTATGTCCTGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATGGACATTTCAATAAGAGCTTGTTACCTATGTATCTTATGTCCTGTT  538

seq1  TAACCCCTAGCGGAGTGGGGCCCATTAGGTTATCTTGATCTTAAGTTGAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACCCCTAGCGGAGTGGGGCCCATTAGGTTATCTTGATCTTAAGTTGAA  588

seq1  TGCAAACAGGGTGACTATTCAGGACTAGCCAGCTAGGCACCTCACTTCTG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAAACAGGGTGACTATTCAGGACTAGCCAGCTAGGCACCTCACTTCTG  638

seq1  TGCTTTCTCCACTACATGGTGACAAGAAGCCTCTAAAGCAAAGGTTACAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTCTCCACTACATGGTGACAAGAAGCCTCTAAAGCAAAGGTTACAG  688

seq1  TTTTAAAGATAGTTTTCTGTGTGTGTGCCTGTGTGAGTTTATCAGTGCCA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAGATAGTTTTCTGTGTGTGTGCCTGTGTGAGTTTATCAGTGCCA  738

seq1  TGTACATGCAGTACCCACAGAGGCCAGAAGGAGGCATTGGATCCCCAGAA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTACATGCAGTACCCACAGAGGCCAGAAGGAGGCATTGGATCCCCAGAA  788

seq1  CTAGAGTTCCAGCTCGCTGCAAGCCACCACATGTGGGTGTACACTTGGAT  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAGTTCCAGCTCGCTGCAAGCCACCACATGTGGGTGTACACTTGGAT  838

seq1  CCTCTGCAAGAGCATTAAGTGGTCTTAACCACTAAGCCGTTGTTTCAGCC  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCTGCAAGAGCATTAAGTGGTCTTAACCACTAAGCCGTTGTTTCAGCC  888

seq1  CCAAGTTTTACATGTGTTAAAATAGACATGAGAACCTTTGCCTCACACGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGTTTTACATGTGTTAAAATAGACATGAGAACCTTTGCCTCACACGA  938

seq1  AGGTATCTTGTACTGTGTGAAGTATGTCTGAGGCTGAGCTTGTTTCAACT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTATCTTGTACTGTGTGAAGTATGTCTGAGGCTGAGCTTGTTTCAACT  988

seq1  TGTTCCCTCAGGAATGCTGAGGGAATGTGGGTCTGTCCTCAAGTGAAAGC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCCCTCAGGAATGCTGAGGGAATGTGGGTCTGTCCTCAAGTGAAAGC  1038

seq1  ATTGCTGTTCATTTGCAACTGCCCACCCTGTCTGTGTCCCTCTCTCACAG  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGCTGTTCATTTGCAACTGCCCACCCTGTCTGTGTCCCTCTCTCACAG  1088

seq1  GCAAGAGAGTCCTTGGCCTTCAGGGAATTC  1129
      ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAGAGAGTCCTTGGCCTTCAGGGAATTC  1118

seq1: chr1_91440960_91442022
seq2: B6Ng01-158F03.g_67_1124

seq1  GAATTCTTTCCTTAAAAAAGAGCCTCCCTGAGTGCTCGTATGTTTTTGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTCCTTAAAAAAGAGCCTCCCTGAGTGCTCGTATGTTTTTGGG  50

seq1  GTAGACATCAAAGGCAGTATATAAAAAGACTTTTGCTTTGACAGTATCCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGACATCAAAGGCAGTATATAAAAAGACTTTTGCTTTGACAGTATCCA  100

seq1  AATGATTGAATAATTTTTGGCTCTCACAAATACTGTAAGCAAAATTAAAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGATTGAATAATTTTTGGCTCTCACAAATACTGTAAGCAAAATTAAAG  150

seq1  GGCAAACTTGAAGTATTTACAGCATATGACTAGGAATGGTCTTTCATATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAACTTGAAGTATTTACAGCATATGACTAGGAATGGTCTTTCATATG  200

seq1  TAAACAGTTTTTACAAAACAATGAGAAAAATTCCACAACAAAAAAAAATG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAACAGTTTTTACAAAACAATGAGAAAAATTCCACAACAAAAAAAAATG  250

seq1  GTCATAGAACCCATGAAAAAAGAAATACATGGTCAAATAAGAAGTAAGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATAGAACCCATGAAAAAAGAAATACATGGTCAAATAAGAAGTAAGTA  300

seq1  TATTTGGTTCTGTTAGAGAACAATTGAAATGATTGGCTGACATTTCAGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTTGGTTCTGTTAGAGAACAATTGAAATGATTGGCTGACATTTCAGTA  350

seq1  CTAAAACCAAGATCCTGAACCAGTTTAGTTCATGGAACAAGTTCACTGAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAAAACCAAGATCCTGAACCAGTTTAGTTCATGGAACAAGTTCACTGAA  400

seq1  ATGTTTCCTTTTTACACTGGTGTATGGGAAGGAAAGTGGGATAACTGTAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTTCCTTTTTACACTGGTGTATGGGAAGGAAAGTGGGATAACTGTAC  450

seq1  AGAGAAGAATATACCAGACTATCAAAAACTTTAAAAGTGTTTGCAACTTT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAAGAATATACCAGACTATCAAAAACTTTAAAAGTGTTTGCAACTTT  500

seq1  CTTCCTGGAAATGTTATGTCTAGATTAACCTCACCCCAGCTTAATTCAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCTGGAAATGTTATGTCTAGATTAACCTCACCCCAGCTTAATTCAGC  550

seq1  CTTCCAATAGACCATCTGTGTGACTGTAGAGAGGATCCTGGAGGCTGATG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCAATAGACCATCTGTGTGACTGTAGAGAGGATCCTGGAGGCTGATG  600

seq1  CTTCAGCCCCATCTGTGGTCTCTTGCTGCCCAATTGGACTTTTCTTTGTA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCAGCCCCATCTGTGGTCTCTTGCTGCCCAATTGGACTTTTCTTTGTA  650

seq1  ATACATGTTTTTATTTATATAAACCAATTTGGCCTTGAATCTTCATTTTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACATGTTTTTATTTATATAAACCAATTTGGCCTTGAATCTTCATTTTC  700

seq1  CTTAGGTTACAGGCATGCAACACTACTCCTGGCTGACTTAGACCATTAAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGGTTACAGGCATGCAACACTACTCCTGGCTGACTTAGACCATTAAT  750

seq1  AAGTGGTTTTGCCCCAAACAGATGTGGGAAAAATGAATAGTCAGGAAGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGTTTTGCCCCAAACAGATGTGGGAAAAATGAATAGTCAGGAAGGA  800

seq1  ATCCTGAGGGTGATTGTGAAGTTCACTTGTAGCTTAATGAAAGCTCTGGG  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCTGAGGGTGATTGTGAAGTTCACTTGTAGCTTAATGAAAGCTCTGGG  850

seq1  AAGACATCCTCGCATTGCATC-ATTGCGGGGCAGGTGGGATGAGGGGTGT  899
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | 
seq2  AAGACATCCTCGCATTGCATCAATTGCGGGGCAGGTGGGATGAGGGGGGG  900

seq1  TGCGTAATGCAAATGCCATTA-TCAGCATCCCCAG-AGATGCTCAGAAGT  947
      ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||
seq2  TGCGTAATGCAAATGCCATTATTCAGCATCTCCAGTAGATGCTCAGAAGT  950

seq1  GAACAAATGGGAATCTTTAATTTTCTTAAGTTTGACTGAATAGTAAAGCT  997
      | |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||
seq2  G-ACAATTGGGAATCTTT-ATTTTCTT-AGTTTGACTG-ATAGTAAAGCT  996

seq1  GGAGTCTTAGCTGCTCTCTGGAGACTGGGCAGGGCTCACATCTGATGAGT  1047
      ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |
seq2  GGAGTCTTAGCTGCTCTCT-GAGACT-GGCA-GGCTCACATCTGATGA-T  1042

seq1  TTGCAGGGAAGAGAGA  1063
      ||||| || | |||||
seq2  TTGCAAGGGAAAGAGA  1058